More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3974 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_3974  peptidase M50  100 
 
 		 454 aa  903    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.17805  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0748  PDZ/DHR/GLGF  47.78 
 
 		 450 aa  373  1e-102  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0422826  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1412  peptidase M50  43.32 
 
 		 443 aa  353  2.9999999999999997e-96  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000000153747 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1400  peptidase M50  43.32 
 
 		 443 aa  352  8e-96  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7315  membrane-associated Zn-dependent protease 1- like protein  41.85 
 
 		 431 aa  345  8.999999999999999e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2528  peptidase M50  43.01 
 
 		 434 aa  338  8e-92  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3842  peptidase M50  41.83 
 
 		 439 aa  330  3e-89  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.585527  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1428  peptidase M50  44.16 
 
 		 439 aa  327  2.0000000000000001e-88  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.442808  normal  0.609667 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3624  peptidase M50  39.79 
 
 		 451 aa  324  2e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.670502  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2184  peptidase M50  42.39 
 
 		 440 aa  324  3e-87  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0212322  hitchhiker  0.00132975 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23530  predicted membrane-associated Zn-dependent protease  41.85 
 
 		 438 aa  319  7.999999999999999e-86  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.062078 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11310  predicted membrane-associated Zn-dependent protease  41.45 
 
 		 442 aa  318  1e-85  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1012  peptidase M50  41.9 
 
 		 438 aa  318  1e-85  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06930  predicted membrane-associated Zn-dependent protease  41.61 
 
 		 455 aa  315  9.999999999999999e-85  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2499  peptidase M50  42.18 
 
 		 442 aa  314  1.9999999999999998e-84  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.761739  normal  0.702763 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10210  predicted membrane-associated Zn-dependent protease  40.76 
 
 		 447 aa  300  3e-80  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.818743  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3203  peptidase M50  36.65 
 
 		 453 aa  280  6e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1201  peptidase M50  39.11 
 
 		 432 aa  263  4.999999999999999e-69  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.436201  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5120  peptidase M50  35.67 
 
 		 428 aa  261  2e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.949013  normal  0.451136 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3574  peptidase M50  36.12 
 
 		 394 aa  224  2e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1169  peptidase M50  36.12 
 
 		 393 aa  223  7e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.157533 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1500  peptidase M50  39.06 
 
 		 438 aa  223  8e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09990  predicted membrane-associated Zn-dependent protease  36.23 
 
 		 402 aa  221  1.9999999999999999e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.417947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2118  peptidase M50  36.46 
 
 		 408 aa  218  2e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.435784  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1351  peptidase M50  37.82 
 
 		 416 aa  217  2.9999999999999998e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.365692  normal  0.842339 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7761  peptidase M50  35.5 
 
 		 413 aa  214  1.9999999999999998e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5889  peptidase M50  34.51 
 
 		 403 aa  213  5.999999999999999e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1303  peptidase M50  36.75 
 
 		 416 aa  211  1e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.138776 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4082  peptidase M50  34.98 
 
 		 412 aa  210  4e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.331426  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2261  peptidase M50  34.39 
 
 		 412 aa  209  7e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.240439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12885  transmembrane protein  33.33 
 
 		 404 aa  199  6e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.769587 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1523  peptidase M50  35.04 
 
 		 413 aa  196  6e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.36214  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1683  peptidase M50  35.64 
 
 		 412 aa  186  6e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.066051  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2043  metallopeptidase MEROPS family protein  33.84 
 
 		 404 aa  186  6e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.295005  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2026  metallopeptidase MEROPS family protein  33.84 
 
 		 404 aa  186  6e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.456946  normal  0.0994336 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2089  metallopeptidase MEROPS family protein  33.84 
 
 		 404 aa  186  6e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.468771  normal  0.311943 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3371  peptidase M50  39.01 
 
 		 397 aa  185  2.0000000000000003e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.304774  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0616  putative membrane-associated zinc metalloprotease  31.73 
 
 		 339 aa  139  1e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1405  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  31.3 
 
 		 345 aa  136  8e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1447  membrane-associated zinc metalloprotease  29.82 
 
 		 469 aa  135  9.999999999999999e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.843225  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0587  membrane-associated zinc metalloprotease  30.42 
 
 		 347 aa  135  9.999999999999999e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07740  putative membrane-associated zinc metalloprotease  27.68 
 
 		 357 aa  133  6e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0481  putative membrane-associated zinc metalloprotease  28.2 
 
 		 355 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0632  peptidase M50  28.54 
 
 		 428 aa  132  2.0000000000000002e-29  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.39267  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1492  membrane-associated zinc metalloprotease  29.49 
 
 		 354 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00685355 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1969  putative membrane-associated zinc metalloprotease  30.35 
 
 		 347 aa  131  3e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3203  membrane-associated zinc metalloprotease  30.56 
 
 		 341 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000432825  hitchhiker  0.00000345421 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2749  membrane-associated zinc metalloprotease  28.97 
 
 		 354 aa  127  6e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3701  membrane-associated zinc metalloprotease  29.24 
 
 		 354 aa  126  7e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000133266  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0892  membrane-associated zinc metalloprotease  27.33 
 
 		 439 aa  125  2e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000122441  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1420  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  26.4 
 
 		 446 aa  124  3e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.130402 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1121  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  30.7 
 
 		 351 aa  122  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0347872  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1948  membrane-associated zinc metalloprotease  29.58 
 
 		 356 aa  120  4.9999999999999996e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3582  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  29.55 
 
 		 561 aa  119  7.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.864637  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1161  putative membrane-associated zinc metalloprotease  29.79 
 
 		 347 aa  119  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.472937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1961  membrane-associated zinc metalloprotease  27.67 
 
 		 469 aa  119  1.9999999999999998e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1249  membrane-associated zinc metalloprotease  29.77 
 
 		 351 aa  117  3e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0540521  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1914  putative membrane-associated Zn-dependent protease  27.51 
 
 		 446 aa  117  3e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0382298  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1181  membrane-associated zinc metalloprotease  30 
 
 		 351 aa  117  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3722  membrane-associated zinc metalloprotease  29.55 
 
 		 561 aa  117  5e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.632001  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3648  membrane-associated zinc metalloprotease  29.55 
 
 		 561 aa  117  6e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3726  putative membrane-associated zinc metalloprotease  28.33 
 
 		 355 aa  117  6e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4510  putative Zinc metalloprotease  30.1 
 
 		 383 aa  116  6.9999999999999995e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.229371  normal  0.52884 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2117  putative membrane-associated zinc metalloprotease  29.01 
 
 		 354 aa  116  7.999999999999999e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2628  putative membrane-associated zinc metalloprotease  26.61 
 
 		 453 aa  116  8.999999999999998e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000538528  normal  0.548541 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1785  putative membrane-associated zinc metalloprotease  26.28 
 
 		 367 aa  115  1.0000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03230  protease  24.03 
 
 		 452 aa  115  2.0000000000000002e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2715  membrane-associated zinc metalloprotease  27.82 
 
 		 376 aa  114  4.0000000000000004e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.747517  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1426  membrane-associated zinc metalloprotease  27.93 
 
 		 422 aa  113  9e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.191575  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2601  peptidase M50  27.88 
 
 		 392 aa  112  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0673098  normal  0.583833 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2995  peptidase RseP  24.2 
 
 		 430 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.207005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3703  putative membrane-associated zinc metalloprotease  30.58 
 
 		 558 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.212937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0469  hypothetical protein  26.23 
 
 		 438 aa  112  2.0000000000000002e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5920  membrane-associated zinc metalloprotease  26.58 
 
 		 438 aa  112  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.928218  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3274  membrane-associated zinc metalloprotease  26.19 
 
 		 461 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000455239  hitchhiker  0.000441416 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2914  membrane-associated zinc metalloprotease  29.85 
 
 		 354 aa  111  3e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.123834 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2051  putative membrane-associated zinc metalloprotease  25.9 
 
 		 372 aa  111  3e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00103431  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1436  membrane-associated zinc metalloprotease  28.74 
 
 		 338 aa  110  4.0000000000000004e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.23212  normal  0.10285 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0714  zinc metallopeptidase RseP  25.38 
 
 		 450 aa  110  5e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000864253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1705  membrane-associated zinc metalloprotease  29.06 
 
 		 353 aa  110  5e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002753  membrane-associated zinc metalloprotease  24.89 
 
 		 452 aa  110  7.000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.422522  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1589  membrane-associated zinc metalloprotease  27.68 
 
 		 375 aa  110  8.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1844  hypothetical protein  24.52 
 
 		 452 aa  108  1e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000001193  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3783  zinc metallopeptidase RseP  25.34 
 
 		 451 aa  108  1e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00251012  hitchhiker  0.00253041 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1856  peptidase RseP  27.06 
 
 		 454 aa  109  1e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1782  membrane-associated zinc metalloprotease  28.54 
 
 		 377 aa  108  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.5938 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2383  membrane-associated zinc metalloprotease  28.92 
 
 		 355 aa  108  2e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1146  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  25.61 
 
 		 456 aa  108  2e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0106908  normal  0.442954 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2541  putative membrane-associated zinc metalloprotease  27.29 
 
 		 449 aa  107  3e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0796  membrane-associated zinc metalloprotease  25 
 
 		 348 aa  107  3e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.270174  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1001  membrane-associated zinc metalloprotease  24.17 
 
 		 438 aa  107  4e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0120  membrane-associated zinc metalloprotease  26.86 
 
 		 453 aa  107  5e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0515  membrane-associated zinc metalloprotease  29 
 
 		 396 aa  107  5e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2040  membrane-associated zinc metalloprotease  25.98 
 
 		 417 aa  107  6e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3509  peptidase M50  30.12 
 
 		 363 aa  106  7e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.042901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2878  putative membrane-associated zinc metalloprotease  26.88 
 
 		 456 aa  106  8e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000126252  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0637  membrane-associated zinc metalloprotease  29.38 
 
 		 386 aa  106  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0772192 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0534  peptidase M50  27.83 
 
 		 388 aa  105  1e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000573099  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0079  membrane-associated zinc metalloprotease  25.75 
 
 		 453 aa  105  1e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.736118  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0246  membrane-associated Zn-dependent protease 1  24.89 
 
 		 420 aa  105  1e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>