More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5889 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_5889  peptidase M50  100 
 
 		 403 aa  815    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09990  predicted membrane-associated Zn-dependent protease  57.21 
 
 		 402 aa  463  1e-129  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.417947  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2043  metallopeptidase MEROPS family protein  48.29 
 
 		 404 aa  379  1e-104  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.295005  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2089  metallopeptidase MEROPS family protein  48.29 
 
 		 404 aa  379  1e-104  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.468771  normal  0.311943 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2026  metallopeptidase MEROPS family protein  48.29 
 
 		 404 aa  379  1e-104  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.456946  normal  0.0994336 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4082  peptidase M50  48.67 
 
 		 412 aa  374  1e-102  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.331426  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2261  peptidase M50  46.99 
 
 		 412 aa  363  3e-99  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.240439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2118  peptidase M50  44.96 
 
 		 408 aa  353  2.9999999999999997e-96  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.435784  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12885  transmembrane protein  46.19 
 
 		 404 aa  353  4e-96  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.769587 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1351  peptidase M50  47.14 
 
 		 416 aa  351  2e-95  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.365692  normal  0.842339 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1303  peptidase M50  46.78 
 
 		 416 aa  347  3e-94  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.138776 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5120  peptidase M50  41.8 
 
 		 428 aa  319  5e-86  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.949013  normal  0.451136 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1683  peptidase M50  41.11 
 
 		 412 aa  287  2e-76  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.066051  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1169  peptidase M50  41.77 
 
 		 393 aa  261  1e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.157533 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7315  membrane-associated Zn-dependent protease 1- like protein  37.44 
 
 		 431 aa  256  4e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3842  peptidase M50  37.47 
 
 		 439 aa  256  7e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.585527  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3574  peptidase M50  40.34 
 
 		 394 aa  253  5.000000000000001e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3624  peptidase M50  34.67 
 
 		 451 aa  246  6e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.670502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0748  PDZ/DHR/GLGF  37.31 
 
 		 450 aa  243  5e-63  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0422826  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2528  peptidase M50  35.47 
 
 		 434 aa  240  4e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7761  peptidase M50  38.39 
 
 		 413 aa  237  2e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1412  peptidase M50  33.93 
 
 		 443 aa  227  2e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000000153747 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1400  peptidase M50  34.55 
 
 		 443 aa  227  2e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10210  predicted membrane-associated Zn-dependent protease  35.62 
 
 		 447 aa  223  4.9999999999999996e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.818743  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1012  peptidase M50  34.23 
 
 		 438 aa  221  1.9999999999999999e-56  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2499  peptidase M50  34.52 
 
 		 442 aa  220  3e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.761739  normal  0.702763 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3203  peptidase M50  33.99 
 
 		 453 aa  219  6e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11310  predicted membrane-associated Zn-dependent protease  33.48 
 
 		 442 aa  219  8.999999999999998e-56  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1523  peptidase M50  37.15 
 
 		 413 aa  217  2.9999999999999998e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.36214  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3974  peptidase M50  34.14 
 
 		 454 aa  210  3e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.17805  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2184  peptidase M50  32.51 
 
 		 440 aa  206  5e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0212322  hitchhiker  0.00132975 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23530  predicted membrane-associated Zn-dependent protease  32.81 
 
 		 438 aa  204  3e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.062078 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06930  predicted membrane-associated Zn-dependent protease  33.41 
 
 		 455 aa  203  4e-51  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1201  peptidase M50  35.2 
 
 		 432 aa  200  3.9999999999999996e-50  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.436201  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1428  peptidase M50  34.09 
 
 		 439 aa  193  4e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.442808  normal  0.609667 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3371  peptidase M50  37.96 
 
 		 397 aa  191  2e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.304774  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0632  peptidase M50  33.65 
 
 		 428 aa  176  7e-43  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.39267  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1500  peptidase M50  33.96 
 
 		 438 aa  172  6.999999999999999e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1492  membrane-associated zinc metalloprotease  30.87 
 
 		 354 aa  142  9e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00685355 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2749  membrane-associated zinc metalloprotease  30.61 
 
 		 354 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1785  putative membrane-associated zinc metalloprotease  29.63 
 
 		 367 aa  140  4.999999999999999e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1948  membrane-associated zinc metalloprotease  28.33 
 
 		 356 aa  139  7.999999999999999e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3701  membrane-associated zinc metalloprotease  28.08 
 
 		 354 aa  137  4e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000133266  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1914  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  29.03 
 
 		 355 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1257  peptidase RseP  28.69 
 
 		 355 aa  132  7.999999999999999e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000258691  hitchhiker  0.00178972 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07740  putative membrane-associated zinc metalloprotease  26.14 
 
 		 357 aa  129  1.0000000000000001e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1786  membrane-associated zinc metalloprotease  29.82 
 
 		 337 aa  125  9e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.250325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2995  peptidase RseP  28.54 
 
 		 430 aa  125  1e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.207005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2051  putative membrane-associated zinc metalloprotease  28.65 
 
 		 372 aa  125  1e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00103431  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3726  putative membrane-associated zinc metalloprotease  29.58 
 
 		 355 aa  124  2e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0616  putative membrane-associated zinc metalloprotease  31.7 
 
 		 339 aa  124  3e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0932  membrane-associated zinc metalloprotease  28.77 
 
 		 342 aa  120  3e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.115167  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1665  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  25.81 
 
 		 335 aa  120  3e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1436  membrane-associated zinc metalloprotease  27.25 
 
 		 338 aa  120  3.9999999999999996e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.23212  normal  0.10285 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0796  membrane-associated zinc metalloprotease  29.84 
 
 		 348 aa  120  4.9999999999999996e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.270174  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3203  membrane-associated zinc metalloprotease  29.43 
 
 		 341 aa  120  4.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000432825  hitchhiker  0.00000345421 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1947  putative membrane-associated zinc metalloprotease  25.31 
 
 		 335 aa  120  6e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3509  peptidase M50  29.53 
 
 		 363 aa  119  7.999999999999999e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.042901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1969  putative membrane-associated zinc metalloprotease  28.99 
 
 		 347 aa  117  3e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0515  membrane-associated zinc metalloprotease  26.7 
 
 		 396 aa  117  3e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1121  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  29.55 
 
 		 351 aa  117  3e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0347872  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1405  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  29.75 
 
 		 345 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1705  membrane-associated zinc metalloprotease  27.95 
 
 		 353 aa  116  6e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1249  membrane-associated zinc metalloprotease  29.55 
 
 		 351 aa  116  6.9999999999999995e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0540521  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5920  membrane-associated zinc metalloprotease  36.84 
 
 		 438 aa  115  8.999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.928218  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2383  membrane-associated zinc metalloprotease  26.79 
 
 		 355 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1061  membrane-associated zinc metalloprotease  26.49 
 
 		 352 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1234  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  27.27 
 
 		 350 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1181  membrane-associated zinc metalloprotease  28.96 
 
 		 351 aa  114  3e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1122  peptidase RseP  29.86 
 
 		 360 aa  113  6e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2117  putative membrane-associated zinc metalloprotease  28.11 
 
 		 354 aa  113  7.000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3315  membrane-associated zinc metalloprotease  27.66 
 
 		 342 aa  112  8.000000000000001e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000939157  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1960  membrane-associated zinc metalloprotease  28.05 
 
 		 348 aa  111  2.0000000000000002e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.346364  normal  0.305152 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4510  putative Zinc metalloprotease  26.09 
 
 		 383 aa  111  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.229371  normal  0.52884 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1387  peptidase RseP  28 
 
 		 379 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0493232  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1161  putative membrane-associated zinc metalloprotease  33.04 
 
 		 347 aa  109  7.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.472937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0481  putative membrane-associated zinc metalloprotease  28.86 
 
 		 355 aa  109  8.000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1844  hypothetical protein  26.56 
 
 		 452 aa  108  1e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000001193  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3582  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  32.07 
 
 		 561 aa  108  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.864637  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5067  membrane-associated zinc metalloprotease  29.69 
 
 		 367 aa  109  1e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.336988 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1420  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  25.17 
 
 		 446 aa  108  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.130402 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1589  membrane-associated zinc metalloprotease  27.3 
 
 		 375 aa  108  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0587  membrane-associated zinc metalloprotease  30.8 
 
 		 347 aa  108  2e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3703  putative membrane-associated zinc metalloprotease  37.43 
 
 		 558 aa  107  3e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.212937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1852  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  26.95 
 
 		 383 aa  107  4e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0681454 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2821  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  25.9 
 
 		 383 aa  107  4e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.370481  normal  0.544468 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1847  peptidase RseP  27.5 
 
 		 369 aa  107  5e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000683327  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0120  membrane-associated zinc metalloprotease  30.97 
 
 		 453 aa  106  9e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2518  zinc metallopeptidase  26.26 
 
 		 373 aa  105  1e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.436086  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2850  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  26.15 
 
 		 383 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.786377 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2715  membrane-associated zinc metalloprotease  25.95 
 
 		 376 aa  105  1e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.747517  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3363  peptidase M50  30.47 
 
 		 681 aa  105  2e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.25912  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1782  membrane-associated zinc metalloprotease  26.28 
 
 		 377 aa  105  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.5938 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3648  membrane-associated zinc metalloprotease  36.36 
 
 		 561 aa  104  3e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5193  membrane-associated zinc metalloprotease  29.69 
 
 		 363 aa  104  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000035702 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2590  peptidase RseP  28.97 
 
 		 466 aa  104  3e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0359861  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3722  membrane-associated zinc metalloprotease  36.36 
 
 		 561 aa  104  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.632001  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0892  membrane-associated zinc metalloprotease  24.59 
 
 		 439 aa  103  4e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000122441  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0534  peptidase M50  26.4 
 
 		 388 aa  103  5e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000573099  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0097  membrane-associated zinc metalloprotease  34.02 
 
 		 453 aa  103  7e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000512767  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>