More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3574 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_3574  peptidase M50  100 
 
 		 394 aa  783    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1169  peptidase M50  77.92 
 
 		 393 aa  602  1.0000000000000001e-171  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.157533 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12885  transmembrane protein  42.23 
 
 		 404 aa  281  2e-74  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.769587 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4082  peptidase M50  41.05 
 
 		 412 aa  276  3e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.331426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2026  metallopeptidase MEROPS family protein  41.55 
 
 		 404 aa  272  9e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.456946  normal  0.0994336 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2043  metallopeptidase MEROPS family protein  41.55 
 
 		 404 aa  272  9e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.295005  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2089  metallopeptidase MEROPS family protein  41.55 
 
 		 404 aa  272  9e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.468771  normal  0.311943 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2118  peptidase M50  40.58 
 
 		 408 aa  270  2e-71  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.435784  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2261  peptidase M50  40.38 
 
 		 412 aa  271  2e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.240439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7315  membrane-associated Zn-dependent protease 1- like protein  37.76 
 
 		 431 aa  268  2e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09990  predicted membrane-associated Zn-dependent protease  43.8 
 
 		 402 aa  262  6.999999999999999e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.417947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5889  peptidase M50  40.34 
 
 		 403 aa  262  6.999999999999999e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5120  peptidase M50  36.78 
 
 		 428 aa  257  3e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.949013  normal  0.451136 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11310  predicted membrane-associated Zn-dependent protease  38.74 
 
 		 442 aa  250  3e-65  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2528  peptidase M50  37.01 
 
 		 434 aa  248  2e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1523  peptidase M50  40.75 
 
 		 413 aa  246  4e-64  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.36214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1303  peptidase M50  40.24 
 
 		 416 aa  245  8e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.138776 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1351  peptidase M50  39.95 
 
 		 416 aa  244  1.9999999999999999e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.365692  normal  0.842339 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1412  peptidase M50  35.86 
 
 		 443 aa  240  2.9999999999999997e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000000153747 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1012  peptidase M50  36.14 
 
 		 438 aa  238  1e-61  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7761  peptidase M50  40.28 
 
 		 413 aa  235  1.0000000000000001e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1400  peptidase M50  35.4 
 
 		 443 aa  233  4.0000000000000004e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3974  peptidase M50  36.12 
 
 		 454 aa  229  4e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.17805  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2499  peptidase M50  36.71 
 
 		 442 aa  228  1e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.761739  normal  0.702763 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3371  peptidase M50  45.16 
 
 		 397 aa  226  7e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.304774  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23530  predicted membrane-associated Zn-dependent protease  35.21 
 
 		 438 aa  224  2e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.062078 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3203  peptidase M50  35.62 
 
 		 453 aa  223  4e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06930  predicted membrane-associated Zn-dependent protease  34.83 
 
 		 455 aa  219  6e-56  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1428  peptidase M50  37.04 
 
 		 439 aa  219  7e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.442808  normal  0.609667 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0748  PDZ/DHR/GLGF  35.56 
 
 		 450 aa  218  1e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0422826  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1683  peptidase M50  38.53 
 
 		 412 aa  218  2e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.066051  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3624  peptidase M50  34.8 
 
 		 451 aa  218  2e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.670502  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10210  predicted membrane-associated Zn-dependent protease  36.18 
 
 		 447 aa  215  9.999999999999999e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.818743  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2184  peptidase M50  33.94 
 
 		 440 aa  210  4e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0212322  hitchhiker  0.00132975 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3842  peptidase M50  32.94 
 
 		 439 aa  209  5e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.585527  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1201  peptidase M50  34.84 
 
 		 432 aa  208  1e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.436201  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1500  peptidase M50  36.64 
 
 		 438 aa  179  4.999999999999999e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0632  peptidase M50  32.99 
 
 		 428 aa  167  2.9999999999999998e-40  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.39267  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1121  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  33.53 
 
 		 351 aa  142  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0347872  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1181  membrane-associated zinc metalloprotease  33.84 
 
 		 351 aa  141  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1249  membrane-associated zinc metalloprotease  33.53 
 
 		 351 aa  140  3.9999999999999997e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0540521  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0616  putative membrane-associated zinc metalloprotease  31.47 
 
 		 339 aa  138  1e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3509  peptidase M50  33.43 
 
 		 363 aa  139  1e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.042901  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1785  putative membrane-associated zinc metalloprotease  29.17 
 
 		 367 aa  136  6.0000000000000005e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0481  putative membrane-associated zinc metalloprotease  29.86 
 
 		 355 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1705  membrane-associated zinc metalloprotease  32.24 
 
 		 353 aa  132  6.999999999999999e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1161  putative membrane-associated zinc metalloprotease  32.82 
 
 		 347 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.472937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1042  peptidase RseP  30 
 
 		 336 aa  131  2.0000000000000002e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000013997 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07740  putative membrane-associated zinc metalloprotease  28.01 
 
 		 357 aa  130  5.0000000000000004e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3701  membrane-associated zinc metalloprotease  31.1 
 
 		 354 aa  127  5e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000133266  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2914  membrane-associated zinc metalloprotease  29.85 
 
 		 354 aa  125  1e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.123834 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0932  membrane-associated zinc metalloprotease  30.22 
 
 		 342 aa  124  2e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.115167  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0587  membrane-associated zinc metalloprotease  31.16 
 
 		 347 aa  123  5e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1948  membrane-associated zinc metalloprotease  28.53 
 
 		 356 aa  123  6e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1492  membrane-associated zinc metalloprotease  30.86 
 
 		 354 aa  123  6e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00685355 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1786  membrane-associated zinc metalloprotease  31.64 
 
 		 337 aa  123  7e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.250325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4432  putative membrane-associated zinc metalloprotease  31.28 
 
 		 385 aa  122  9.999999999999999e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00893007 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2749  membrane-associated zinc metalloprotease  30.56 
 
 		 354 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1969  putative membrane-associated zinc metalloprotease  30.09 
 
 		 347 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1809  membrane-associated zinc metalloprotease  27.86 
 
 		 349 aa  120  4.9999999999999996e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.489906  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4510  putative Zinc metalloprotease  29.17 
 
 		 383 aa  119  6e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.229371  normal  0.52884 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1135  RIP metalloprotease RseP  27.56 
 
 		 370 aa  119  9.999999999999999e-26  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1436  membrane-associated zinc metalloprotease  27.84 
 
 		 338 aa  117  3e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.23212  normal  0.10285 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3261  membrane-associated zinc metalloprotease  30.47 
 
 		 383 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5193  membrane-associated zinc metalloprotease  29.51 
 
 		 363 aa  117  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000035702 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0890  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  26.51 
 
 		 343 aa  116  5e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000919526  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2117  putative membrane-associated zinc metalloprotease  28.22 
 
 		 354 aa  116  6e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3203  membrane-associated zinc metalloprotease  29.15 
 
 		 341 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000432825  hitchhiker  0.00000345421 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1387  peptidase RseP  30.7 
 
 		 379 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0493232  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3582  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  33.47 
 
 		 561 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.864637  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0370  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  29.97 
 
 		 345 aa  114  3e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2558  putative membrane-associated zinc metalloprotease  30.54 
 
 		 353 aa  114  3e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2356  membrane-associated zinc metalloprotease  29.58 
 
 		 386 aa  114  3e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.65169  normal  0.251617 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2383  membrane-associated zinc metalloprotease  27.79 
 
 		 355 aa  114  3e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2821  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  29.78 
 
 		 383 aa  114  3e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.370481  normal  0.544468 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_314  membrane-associated zinc metalloprotease  29.97 
 
 		 345 aa  114  4.0000000000000004e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2082  membrane-associated zinc metalloprotease  30.58 
 
 		 386 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.366496  normal  0.128586 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3722  membrane-associated zinc metalloprotease  32.64 
 
 		 561 aa  113  6e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.632001  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2042  membrane-associated zinc metalloprotease  29.3 
 
 		 386 aa  113  6e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.101077 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2051  putative membrane-associated zinc metalloprotease  29.18 
 
 		 372 aa  113  6e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00103431  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1122  peptidase RseP  29.03 
 
 		 360 aa  113  7.000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2715  membrane-associated zinc metalloprotease  28.16 
 
 		 376 aa  112  8.000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.747517  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3648  membrane-associated zinc metalloprotease  32.64 
 
 		 561 aa  112  9e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0124  RIP metalloprotease RseP  25.31 
 
 		 369 aa  112  1.0000000000000001e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.195858  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1782  membrane-associated zinc metalloprotease  30 
 
 		 377 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.5938 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0596  membrane-associated zinc metalloprotease  25.32 
 
 		 337 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0352  peptidase M50  29.39 
 
 		 345 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0097  membrane-associated zinc metalloprotease  30.32 
 
 		 453 aa  111  3e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000512767  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0637  membrane-associated zinc metalloprotease  29.75 
 
 		 386 aa  110  3e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0772192 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1589  membrane-associated zinc metalloprotease  29.53 
 
 		 375 aa  110  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2850  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  29.92 
 
 		 383 aa  110  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.786377 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1137  putative membrane-associated zinc metalloprotease  28.36 
 
 		 374 aa  110  5e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.615392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1405  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  27.76 
 
 		 345 aa  110  5e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0467  putative membrane-associated zinc metalloprotease  29.21 
 
 		 377 aa  110  5e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1847  peptidase RseP  29.06 
 
 		 369 aa  110  5e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000683327  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2443  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  29.26 
 
 		 383 aa  109  7.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.267885  normal  0.20072 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0689  peptidase M50  26.57 
 
 		 376 aa  109  7.000000000000001e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000148024  hitchhiker  3.25567e-17 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0448  hypothetical protein  27.73 
 
 		 364 aa  109  8.000000000000001e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2518  zinc metallopeptidase  29.69 
 
 		 373 aa  109  8.000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.436086  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1532  membrane-associated zinc metalloprotease  27.14 
 
 		 386 aa  109  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>