More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_2043 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_2026  metallopeptidase MEROPS family protein  100 
 
 
404 aa  813    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.456946  normal  0.0994336 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2043  metallopeptidase MEROPS family protein  100 
 
 
404 aa  813    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.295005  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2089  metallopeptidase MEROPS family protein  100 
 
 
404 aa  813    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.468771  normal  0.311943 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4082  peptidase M50  71.84 
 
 
412 aa  616  1e-175  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.331426  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2261  peptidase M50  71.6 
 
 
412 aa  610  1e-173  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.240439  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12885  transmembrane protein  73.53 
 
 
404 aa  603  1.0000000000000001e-171  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.769587 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1683  peptidase M50  51.67 
 
 
412 aa  381  1e-104  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.066051  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2118  peptidase M50  48.54 
 
 
408 aa  377  1e-103  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.435784  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5889  peptidase M50  48.29 
 
 
403 aa  366  1e-100  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09990  predicted membrane-associated Zn-dependent protease  49.01 
 
 
402 aa  344  1e-93  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.417947  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5120  peptidase M50  41.32 
 
 
428 aa  303  3.0000000000000004e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.949013  normal  0.451136 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1351  peptidase M50  44.02 
 
 
416 aa  303  3.0000000000000004e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.365692  normal  0.842339 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1303  peptidase M50  44.26 
 
 
416 aa  301  1e-80  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.138776 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1169  peptidase M50  42.31 
 
 
393 aa  263  4e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.157533 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3574  peptidase M50  41.55 
 
 
394 aa  248  1e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3624  peptidase M50  34.64 
 
 
451 aa  227  3e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.670502  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7315  membrane-associated Zn-dependent protease 1- like protein  34.16 
 
 
431 aa  218  2e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3203  peptidase M50  32.46 
 
 
453 aa  204  2e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2528  peptidase M50  33.78 
 
 
434 aa  204  3e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1012  peptidase M50  32.82 
 
 
438 aa  203  5e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1400  peptidase M50  32.89 
 
 
443 aa  201  1.9999999999999998e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0748  PDZ/DHR/GLGF  32.39 
 
 
450 aa  200  5e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0422826  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7761  peptidase M50  36.38 
 
 
413 aa  199  5e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11310  predicted membrane-associated Zn-dependent protease  31.99 
 
 
442 aa  197  3e-49  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2499  peptidase M50  33.48 
 
 
442 aa  192  9e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.761739  normal  0.702763 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1523  peptidase M50  35.9 
 
 
413 aa  191  2e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.36214  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3842  peptidase M50  32.95 
 
 
439 aa  187  4e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.585527  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1412  peptidase M50  31.18 
 
 
443 aa  184  3e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000000153747 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23530  predicted membrane-associated Zn-dependent protease  31.93 
 
 
438 aa  179  4.999999999999999e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.062078 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2184  peptidase M50  32.96 
 
 
440 aa  179  1e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0212322  hitchhiker  0.00132975 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3974  peptidase M50  34.05 
 
 
454 aa  178  1e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.17805  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10210  predicted membrane-associated Zn-dependent protease  31.89 
 
 
447 aa  176  7e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.818743  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3371  peptidase M50  35.82 
 
 
397 aa  171  2e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.304774  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1428  peptidase M50  31.78 
 
 
439 aa  160  4e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.442808  normal  0.609667 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1201  peptidase M50  31.55 
 
 
432 aa  159  8e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.436201  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06930  predicted membrane-associated Zn-dependent protease  29.23 
 
 
455 aa  150  3e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0632  peptidase M50  31.43 
 
 
428 aa  140  6e-32  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.39267  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1500  peptidase M50  32.1 
 
 
438 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1914  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  29.25 
 
 
355 aa  125  2e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1256  putative membrane-associated zinc metalloprotease  32.5 
 
 
450 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000401781  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1492  membrane-associated zinc metalloprotease  28.61 
 
 
354 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00685355 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3509  peptidase M50  30.25 
 
 
363 aa  117  3e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.042901  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2749  membrane-associated zinc metalloprotease  27.85 
 
 
354 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1257  peptidase RseP  28.97 
 
 
355 aa  113  6e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000258691  hitchhiker  0.00178972 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1166  membrane-associated zinc metalloprotease  33.48 
 
 
454 aa  112  8.000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.351032  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1161  putative membrane-associated zinc metalloprotease  29.62 
 
 
347 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.472937  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5920  membrane-associated zinc metalloprotease  35.27 
 
 
438 aa  111  3e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.928218  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0481  putative membrane-associated zinc metalloprotease  29.7 
 
 
355 aa  110  5e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1042  peptidase RseP  28.89 
 
 
336 aa  109  1e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  unclonable  0.000000013997 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1447  membrane-associated zinc metalloprotease  29.55 
 
 
469 aa  109  1e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.843225  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07740  putative membrane-associated zinc metalloprotease  25.56 
 
 
357 aa  108  1e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1969  putative membrane-associated zinc metalloprotease  27.25 
 
 
347 aa  108  2e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2518  zinc metallopeptidase  28.49 
 
 
373 aa  108  2e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.436086  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1560  membrane-associated zinc metalloprotease EcfE  27.95 
 
 
452 aa  107  3e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.294155  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03230  protease  25.69 
 
 
452 aa  107  3e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0932  membrane-associated zinc metalloprotease  28.84 
 
 
342 aa  105  1e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.115167  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1785  putative membrane-associated zinc metalloprotease  27.2 
 
 
367 aa  105  1e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1589  membrane-associated zinc metalloprotease  28.42 
 
 
375 aa  105  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0570  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  37.69 
 
 
451 aa  104  3e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0114456  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3703  putative membrane-associated zinc metalloprotease  36.57 
 
 
558 aa  104  3e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.212937  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1387  peptidase RseP  28.32 
 
 
379 aa  104  3e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0493232  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1947  putative membrane-associated zinc metalloprotease  25.94 
 
 
335 aa  104  3e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3648  membrane-associated zinc metalloprotease  32.51 
 
 
561 aa  103  4e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3582  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  32.1 
 
 
561 aa  103  5e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.864637  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1405  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  26.85 
 
 
345 aa  103  6e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5067  membrane-associated zinc metalloprotease  26.01 
 
 
367 aa  103  7e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.336988 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0815  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  31.84 
 
 
454 aa  103  7e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.225956  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0616  putative membrane-associated zinc metalloprotease  37.38 
 
 
339 aa  103  7e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0534  peptidase M50  27.32 
 
 
388 aa  103  8e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000573099  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0689  peptidase M50  24.45 
 
 
376 aa  102  1e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000148024  hitchhiker  3.25567e-17 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1847  peptidase RseP  28.21 
 
 
369 aa  102  1e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000683327  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1786  membrane-associated zinc metalloprotease  28.12 
 
 
337 aa  101  2e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.250325  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2628  putative membrane-associated zinc metalloprotease  31.51 
 
 
453 aa  101  2e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000538528  normal  0.548541 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0796  membrane-associated zinc metalloprotease  28.25 
 
 
348 aa  101  2e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.270174  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0714  zinc metallopeptidase RseP  32.54 
 
 
450 aa  101  2e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000864253  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3701  membrane-associated zinc metalloprotease  26.85 
 
 
354 aa  102  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000133266  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1436  membrane-associated zinc metalloprotease  26.15 
 
 
338 aa  101  2e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.23212  normal  0.10285 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1665  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  25.93 
 
 
335 aa  101  2e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0587  membrane-associated zinc metalloprotease  34.39 
 
 
347 aa  102  2e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2878  putative membrane-associated zinc metalloprotease  30.49 
 
 
456 aa  102  2e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000126252  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0948  zinc metallopeptidase RseP  31.16 
 
 
451 aa  101  2e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000214354  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3353  zinc metallopeptidase RseP  31.64 
 
 
451 aa  101  2e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0274947  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1782  membrane-associated zinc metalloprotease  27.91 
 
 
377 aa  101  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.5938 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1234  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  25.91 
 
 
350 aa  100  4e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3722  membrane-associated zinc metalloprotease  32.1 
 
 
561 aa  100  4e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.632001  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4510  putative Zinc metalloprotease  26.37 
 
 
383 aa  100  6e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.229371  normal  0.52884 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1135  RIP metalloprotease RseP  26.45 
 
 
370 aa  100  7e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2715  membrane-associated zinc metalloprotease  25.3 
 
 
376 aa  99.8  7e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.747517  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1948  membrane-associated zinc metalloprotease  26.97 
 
 
356 aa  99.8  8e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1121  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  28.53 
 
 
351 aa  99.8  8e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0347872  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1061  membrane-associated zinc metalloprotease  25.97 
 
 
352 aa  99.8  9e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0890  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  27.57 
 
 
343 aa  99  1e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000919526  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2914  membrane-associated zinc metalloprotease  30.03 
 
 
354 aa  99  1e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.123834 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0263  zinc metallopeptidase RseP  30.53 
 
 
450 aa  98.2  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0154737  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3783  zinc metallopeptidase RseP  32.27 
 
 
451 aa  98.6  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00251012  hitchhiker  0.00253041 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0248  zinc metallopeptidase RseP  30.53 
 
 
450 aa  98.2  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0245  zinc metallopeptidase RseP  30.53 
 
 
450 aa  98.2  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.249878 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1561  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  29.25 
 
 
456 aa  98.2  2e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000461405  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0261  zinc metallopeptidase RseP  30.53 
 
 
450 aa  98.2  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.522145 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1844  hypothetical protein  27.95 
 
 
452 aa  97.8  3e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000001193  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>