More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_3363 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_3363  peptidase M50  100 
 
 
681 aa  1379    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.25912  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2749  membrane-associated zinc metalloprotease  40.69 
 
 
354 aa  145  3e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1914  putative membrane-associated Zn-dependent protease  36.84 
 
 
446 aa  144  7e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0382298  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1492  membrane-associated zinc metalloprotease  41.95 
 
 
354 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00685355 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0515  membrane-associated zinc metalloprotease  45.25 
 
 
396 aa  136  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0892  membrane-associated zinc metalloprotease  32.3 
 
 
439 aa  133  1.0000000000000001e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000122441  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1387  putative membrane-associated zinc metalloprotease  33.23 
 
 
480 aa  131  3e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.204632  normal  0.0100882 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0664  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  30.99 
 
 
455 aa  130  7.000000000000001e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.399038  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0351  membrane-associated zinc metalloprotease  33.24 
 
 
549 aa  130  9.000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2715  membrane-associated zinc metalloprotease  33.63 
 
 
376 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.747517  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3701  membrane-associated zinc metalloprotease  43.59 
 
 
354 aa  129  2.0000000000000002e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000133266  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3203  membrane-associated zinc metalloprotease  40.64 
 
 
341 aa  128  3e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000432825  hitchhiker  0.00000345421 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1061  membrane-associated zinc metalloprotease  39.36 
 
 
352 aa  128  3e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1948  membrane-associated zinc metalloprotease  36.54 
 
 
356 aa  127  7e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0450  membrane-associated zinc metalloprotease  36.36 
 
 
428 aa  127  7e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000160258  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1947  putative membrane-associated zinc metalloprotease  35.27 
 
 
335 aa  125  2e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1961  membrane-associated zinc metalloprotease  32.12 
 
 
469 aa  125  3e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1665  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  34.78 
 
 
335 aa  124  4e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1785  putative membrane-associated zinc metalloprotease  40.11 
 
 
367 aa  124  4e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1122  peptidase RseP  39.78 
 
 
360 aa  124  5e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1257  peptidase RseP  39.36 
 
 
355 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000258691  hitchhiker  0.00178972 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2051  putative membrane-associated zinc metalloprotease  35.21 
 
 
372 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00103431  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3726  putative membrane-associated zinc metalloprotease  36.15 
 
 
355 aa  121  3.9999999999999996e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0616  putative membrane-associated zinc metalloprotease  34.3 
 
 
339 aa  121  4.9999999999999996e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1167  membrane-associated zinc metalloprotease  31.8 
 
 
452 aa  121  4.9999999999999996e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1451  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  31.8 
 
 
452 aa  121  4.9999999999999996e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0623  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  36.28 
 
 
368 aa  120  6e-26  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2117  putative membrane-associated zinc metalloprotease  34.04 
 
 
354 aa  120  7e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1279  putative membrane-associated zinc metalloprotease  28.47 
 
 
448 aa  119  9.999999999999999e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.196606  normal  0.702874 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1001  membrane-associated zinc metalloprotease  28.21 
 
 
438 aa  119  1.9999999999999998e-25  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0637  membrane-associated zinc metalloprotease  37.39 
 
 
386 aa  118  3e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0772192 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3722  membrane-associated zinc metalloprotease  31.79 
 
 
561 aa  117  5e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.632001  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0587  membrane-associated zinc metalloprotease  35.78 
 
 
347 aa  117  5e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3582  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  31.61 
 
 
561 aa  116  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.864637  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3648  membrane-associated zinc metalloprotease  31.69 
 
 
561 aa  116  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1560  membrane-associated zinc metalloprotease EcfE  30.99 
 
 
452 aa  115  2.0000000000000002e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.294155  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0481  putative membrane-associated zinc metalloprotease  36.9 
 
 
355 aa  116  2.0000000000000002e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2420  protease EcfE  37.43 
 
 
452 aa  115  2.0000000000000002e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0697135  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1488  putative membrane-associated zinc metalloprotease  31.43 
 
 
456 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000665578  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2895  membrane-associated zinc metalloprotease  31.19 
 
 
456 aa  115  3e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000920242  normal  0.27342 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3176  membrane-associated zinc metalloprotease  29.14 
 
 
444 aa  115  3e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.836726 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0570  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  38.42 
 
 
451 aa  115  3e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0114456  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01380  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  32.23 
 
 
450 aa  114  4.0000000000000004e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3703  putative membrane-associated zinc metalloprotease  32.67 
 
 
558 aa  114  5e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.212937  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1914  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  35.85 
 
 
355 aa  114  6e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1969  putative membrane-associated zinc metalloprotease  34.39 
 
 
347 aa  114  8.000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2914  membrane-associated zinc metalloprotease  31.08 
 
 
354 aa  113  9e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.123834 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1705  membrane-associated zinc metalloprotease  36.59 
 
 
353 aa  113  1.0000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3274  membrane-associated zinc metalloprotease  34.83 
 
 
461 aa  113  1.0000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000455239  hitchhiker  0.000441416 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1135  RIP metalloprotease RseP  36.93 
 
 
370 aa  113  1.0000000000000001e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1532  membrane-associated zinc metalloprotease  36.79 
 
 
386 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1459  putative membrane-associated zinc metalloprotease  29.45 
 
 
455 aa  112  2.0000000000000002e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3261  membrane-associated zinc metalloprotease  35.19 
 
 
383 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1490  RIP metalloprotease RseP  30.77 
 
 
450 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0596  membrane-associated zinc metalloprotease  37.82 
 
 
337 aa  111  3e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1523  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  28.03 
 
 
455 aa  112  3e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.24636  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0796  membrane-associated zinc metalloprotease  35.47 
 
 
348 aa  111  4.0000000000000004e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.270174  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1852  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  37.05 
 
 
383 aa  111  4.0000000000000004e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0681454 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2628  putative membrane-associated zinc metalloprotease  29.77 
 
 
453 aa  111  4.0000000000000004e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000538528  normal  0.548541 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1277  putative membrane-associated zinc metalloprotease  31.32 
 
 
456 aa  111  4.0000000000000004e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.358202  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1086  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  34.03 
 
 
372 aa  111  5e-23  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.147315  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0607  RIP metalloprotease RseP  35.05 
 
 
370 aa  111  5e-23  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1086  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  36.9 
 
 
368 aa  110  6e-23  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1452  putative membrane-associated zinc metalloprotease  29.87 
 
 
456 aa  110  6e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00139274  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4510  putative Zinc metalloprotease  36.04 
 
 
383 aa  110  8.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.229371  normal  0.52884 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0467  putative membrane-associated zinc metalloprotease  38.07 
 
 
377 aa  110  8.000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13611  membrane-associated Zn-dependent proteases 1  38.41 
 
 
359 aa  110  9.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1457  putative membrane-associated zinc metalloprotease  32.17 
 
 
456 aa  110  9.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000042456  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0860  RIP metalloprotease RseP  38.95 
 
 
370 aa  110  1e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0366  membrane-associated zinc metalloprotease  34.29 
 
 
367 aa  109  2e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.129144 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03230  protease  27.15 
 
 
452 aa  109  2e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2634  peptidase RseP  30.85 
 
 
456 aa  109  2e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000113842  normal  0.0898661 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2701  peptidase RseP  30.85 
 
 
456 aa  109  2e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000971838  hitchhiker  0.00353487 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17140  putative membrane-associated zinc metalloprotease  29.8 
 
 
450 aa  109  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0323  membrane-associated zinc metalloprotease  28.9 
 
 
444 aa  108  2e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.728311  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4075  membrane-associated zinc metalloprotease  35.84 
 
 
450 aa  109  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.274449 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0655  putative membrane-associated zinc metalloprotease  37.02 
 
 
368 aa  108  3e-22  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5920  membrane-associated zinc metalloprotease  30.5 
 
 
438 aa  108  3e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.928218  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2808  peptidase RseP  30.61 
 
 
456 aa  108  3e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000246609  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2850  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  43.12 
 
 
383 aa  108  4e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.786377 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1636  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  30.27 
 
 
456 aa  107  5e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1447  membrane-associated zinc metalloprotease  32.42 
 
 
469 aa  107  5e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.843225  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2082  membrane-associated zinc metalloprotease  38.82 
 
 
386 aa  107  5e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.366496  normal  0.128586 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2356  membrane-associated zinc metalloprotease  38.82 
 
 
386 aa  107  5e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.65169  normal  0.251617 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2383  membrane-associated zinc metalloprotease  35.44 
 
 
355 aa  107  6e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1234  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  36.78 
 
 
350 aa  107  6e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4179  putative membrane-associated zinc metalloprotease  30.56 
 
 
450 aa  107  6e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.374735  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1598  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  29.55 
 
 
452 aa  107  7e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.91149 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1355  putative membrane-associated zinc metalloprotease  37.71 
 
 
456 aa  107  7e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000225455  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0862  peptidase RseP  36.36 
 
 
380 aa  107  8e-22  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0358  hypothetical protein  27.99 
 
 
444 aa  107  9e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07740  putative membrane-associated zinc metalloprotease  29.79 
 
 
357 aa  107  1e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2590  peptidase RseP  36.32 
 
 
466 aa  107  1e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0359861  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0260  peptidase M50  33.82 
 
 
496 aa  106  1e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.650665  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0469  hypothetical protein  35.5 
 
 
438 aa  106  1e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0689  peptidase M50  27.39 
 
 
376 aa  106  1e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000148024  hitchhiker  3.25567e-17 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1953  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  36.16 
 
 
361 aa  106  1e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.667099  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2878  putative membrane-associated zinc metalloprotease  37.29 
 
 
456 aa  107  1e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000126252  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13901  membrane-associated Zn-dependent proteases 1  33.04 
 
 
359 aa  105  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1653  putative membrane-associated zinc metalloprotease  35.92 
 
 
332 aa  105  2e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>