More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0260 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009616  Tmel_0260  peptidase M50  100 
 
 
496 aa  976    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.650665  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0951  putative membrane-associated zinc metalloprotease  49.7 
 
 
495 aa  473  1e-132  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000274042  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0037  peptidase M50  40.72 
 
 
501 aa  358  1.9999999999999998e-97  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000100693  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0037  peptidase M50  40.72 
 
 
501 aa  358  1.9999999999999998e-97  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1940  membrane-associated zinc metalloprotease  39.21 
 
 
507 aa  311  2e-83  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000740913  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0892  membrane-associated zinc metalloprotease  29.29 
 
 
439 aa  174  2.9999999999999996e-42  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000122441  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0450  membrane-associated zinc metalloprotease  28.11 
 
 
428 aa  155  1e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000160258  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2590  peptidase RseP  27.11 
 
 
466 aa  155  2e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0359861  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1523  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  27.06 
 
 
455 aa  153  8.999999999999999e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.24636  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3722  membrane-associated zinc metalloprotease  24.68 
 
 
561 aa  152  2e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.632001  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3582  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  24.5 
 
 
561 aa  152  2e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.864637  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3703  putative membrane-associated zinc metalloprotease  26.13 
 
 
558 aa  151  3e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.212937  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1530  peptidase RseP  23.72 
 
 
457 aa  149  9e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00980857 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3648  membrane-associated zinc metalloprotease  25.18 
 
 
561 aa  149  9e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1447  membrane-associated zinc metalloprotease  26.47 
 
 
469 aa  147  3e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.843225  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1914  putative membrane-associated Zn-dependent protease  26.16 
 
 
446 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0382298  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1961  membrane-associated zinc metalloprotease  25.56 
 
 
469 aa  147  5e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1560  membrane-associated zinc metalloprotease EcfE  26.76 
 
 
452 aa  146  8.000000000000001e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.294155  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3274  membrane-associated zinc metalloprotease  27.97 
 
 
461 aa  145  1e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000455239  hitchhiker  0.000441416 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1636  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  26.82 
 
 
456 aa  145  2e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2878  putative membrane-associated zinc metalloprotease  27.45 
 
 
456 aa  145  2e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000126252  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2808  peptidase RseP  26.92 
 
 
456 aa  145  2e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000246609  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1709  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  23.12 
 
 
457 aa  144  3e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.550772  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2341  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  26.72 
 
 
450 aa  143  9e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00281256  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1797  putative membrane-associated zinc metalloprotease  24.9 
 
 
479 aa  142  9e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.88903  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1146  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  27.05 
 
 
456 aa  143  9e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0106908  normal  0.442954 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0998  peptidase RseP  27.45 
 
 
424 aa  142  1.9999999999999998e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000230134  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2634  peptidase RseP  26.04 
 
 
456 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000113842  normal  0.0898661 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2701  peptidase RseP  26.04 
 
 
456 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000971838  hitchhiker  0.00353487 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1277  putative membrane-associated zinc metalloprotease  27.6 
 
 
456 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.358202  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1279  putative membrane-associated zinc metalloprotease  24.35 
 
 
448 aa  141  3e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.196606  normal  0.702874 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1355  putative membrane-associated zinc metalloprotease  27.25 
 
 
456 aa  141  3e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000225455  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1488  putative membrane-associated zinc metalloprotease  27.11 
 
 
456 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000665578  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2895  membrane-associated zinc metalloprotease  27.31 
 
 
456 aa  140  7e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000920242  normal  0.27342 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2420  protease EcfE  27.04 
 
 
452 aa  140  7e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0697135  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1561  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  26.61 
 
 
456 aa  138  3.0000000000000003e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000461405  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2628  putative membrane-associated zinc metalloprotease  27.13 
 
 
453 aa  137  4e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000538528  normal  0.548541 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3154  putative membrane-associated zinc metalloprotease  26.33 
 
 
461 aa  137  4e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000101225  hitchhiker  0.00850689 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1844  hypothetical protein  27.18 
 
 
452 aa  137  5e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000001193  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1638  membrane-associated zinc metalloprotease  27.26 
 
 
454 aa  137  5e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0664  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  27.04 
 
 
455 aa  135  1.9999999999999998e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.399038  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03230  protease  27.6 
 
 
452 aa  135  1.9999999999999998e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1452  putative membrane-associated zinc metalloprotease  26.33 
 
 
456 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00139274  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0180  zinc metallopeptidase RseP  28.54 
 
 
450 aa  134  3e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000271457  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002753  membrane-associated zinc metalloprotease  27.45 
 
 
452 aa  134  3e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.422522  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3783  zinc metallopeptidase RseP  25.58 
 
 
451 aa  134  5e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00251012  hitchhiker  0.00253041 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0570  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  25.73 
 
 
451 aa  133  6e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0114456  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1001  membrane-associated zinc metalloprotease  26.63 
 
 
438 aa  133  6.999999999999999e-30  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1457  putative membrane-associated zinc metalloprotease  25.15 
 
 
456 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000042456  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1490  membrane-associated zinc metalloprotease  25.2 
 
 
453 aa  132  2.0000000000000002e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0178  zinc metallopeptidase RseP  28.34 
 
 
450 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000111428  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3484  zinc metallopeptidase RseP  27.69 
 
 
450 aa  132  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00175231  normal  0.0731606 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1167  membrane-associated zinc metalloprotease  24.76 
 
 
452 aa  131  3e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1451  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  24.76 
 
 
452 aa  131  3e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2798  membrane-associated zinc metalloprotease  23.38 
 
 
494 aa  130  5.0000000000000004e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.000647763  normal  0.117018 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1166  membrane-associated zinc metalloprotease  25.49 
 
 
454 aa  130  5.0000000000000004e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.351032  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3353  zinc metallopeptidase RseP  26.02 
 
 
451 aa  130  6e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0274947  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0187  zinc metallopeptidase RseP  28.14 
 
 
450 aa  130  6e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000756829  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00174  zinc metallopeptidase  28.14 
 
 
450 aa  130  7.000000000000001e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0881068  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3427  membrane-associated zinc metalloprotease  28.14 
 
 
450 aa  130  7.000000000000001e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000034207  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00173  hypothetical protein  28.14 
 
 
450 aa  130  7.000000000000001e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.131717  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0186  zinc metallopeptidase RseP  28.14 
 
 
450 aa  130  7.000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000411751  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0948  zinc metallopeptidase RseP  26.02 
 
 
451 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000214354  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0009  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  26.77 
 
 
453 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000631419  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0084  membrane-associated zinc metalloprotease  25.75 
 
 
453 aa  128  3e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.47842  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1534  protease ecfE  24.75 
 
 
454 aa  127  4.0000000000000003e-28  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000633641  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3428  zinc metallopeptidase RseP  27.36 
 
 
451 aa  127  4.0000000000000003e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000803412  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3158  zinc metallopeptidase RseP  24.9 
 
 
451 aa  127  4.0000000000000003e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00293978  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1490  RIP metalloprotease RseP  23.33 
 
 
450 aa  127  5e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2433  membrane-associated Zn-dependent protease 1  25 
 
 
428 aa  127  5e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1020  zinc metallopeptidase RseP  27.17 
 
 
451 aa  127  7e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000073944  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1073  zinc metallopeptidase RseP  27.17 
 
 
451 aa  127  7e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00125076  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0469  hypothetical protein  25.34 
 
 
438 aa  126  9e-28  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0596  membrane-associated zinc metalloprotease  42.28 
 
 
337 aa  126  1e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1665  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  36.16 
 
 
335 aa  125  1e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1349  membrane-associated zinc metalloprotease  23.26 
 
 
462 aa  125  2e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00245183  normal  0.774325 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1749  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  24.4 
 
 
455 aa  125  2e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.853109  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0169  zinc metallopeptidase RseP  28.15 
 
 
450 aa  125  2e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000438283  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1405  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  39.41 
 
 
345 aa  125  2e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2541  putative membrane-associated zinc metalloprotease  26.82 
 
 
449 aa  125  2e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2606  membrane-associated zinc metalloprotease  25.24 
 
 
456 aa  124  4e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.514268  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1947  putative membrane-associated zinc metalloprotease  35.59 
 
 
335 aa  124  5e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01122  membrane-associated Zn-dependent protease  26.75 
 
 
448 aa  123  6e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.496446  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2749  membrane-associated zinc metalloprotease  40.53 
 
 
354 aa  123  7e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1285  membrane-associated zinc metalloprotease  23.95 
 
 
462 aa  123  8e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.453164  normal  0.348794 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1492  membrane-associated zinc metalloprotease  40 
 
 
354 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00685355 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4131  membrane-associated zinc metalloprotease  26.75 
 
 
438 aa  121  3e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.158582 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2973  zinc metallopeptidase RseP  24.37 
 
 
451 aa  121  3e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2051  putative membrane-associated zinc metalloprotease  31.37 
 
 
372 aa  121  3e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00103431  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1086  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  36.84 
 
 
368 aa  120  6e-26  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0515  membrane-associated zinc metalloprotease  34.5 
 
 
396 aa  120  6e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0076  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  25.15 
 
 
454 aa  120  6e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01380  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  25.44 
 
 
450 aa  120  6e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1256  putative membrane-associated zinc metalloprotease  25.88 
 
 
450 aa  120  6e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000401781  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1211  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  36.84 
 
 
368 aa  120  7.999999999999999e-26  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0261  zinc metallopeptidase RseP  26.13 
 
 
450 aa  120  7.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.522145 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0248  zinc metallopeptidase RseP  26.13 
 
 
450 aa  120  7.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0245  zinc metallopeptidase RseP  26.13 
 
 
450 aa  120  7.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00582579  normal  0.54526 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0245  zinc metallopeptidase RseP  26.13 
 
 
450 aa  120  7.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.249878 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0263  zinc metallopeptidase RseP  26.13 
 
 
450 aa  120  7.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0154737  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>