More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2528 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_2528  peptidase M50  100 
 
 
434 aa  863    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7315  membrane-associated Zn-dependent protease 1- like protein  69.23 
 
 
431 aa  624  1e-177  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3842  peptidase M50  63.83 
 
 
439 aa  532  1e-150  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.585527  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1412  peptidase M50  48.53 
 
 
443 aa  412  1e-114  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000000153747 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1400  peptidase M50  48.42 
 
 
443 aa  412  1e-114  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3203  peptidase M50  47.33 
 
 
453 aa  396  1e-109  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1012  peptidase M50  47.18 
 
 
438 aa  374  1e-102  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0748  PDZ/DHR/GLGF  45.15 
 
 
450 aa  369  1e-101  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0422826  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23530  predicted membrane-associated Zn-dependent protease  47.19 
 
 
438 aa  367  1e-100  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.062078 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11310  predicted membrane-associated Zn-dependent protease  46.47 
 
 
442 aa  368  1e-100  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3624  peptidase M50  44.15 
 
 
451 aa  360  3e-98  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.670502  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1428  peptidase M50  47.37 
 
 
439 aa  354  1e-96  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.442808  normal  0.609667 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2184  peptidase M50  44.52 
 
 
440 aa  354  2e-96  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0212322  hitchhiker  0.00132975 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10210  predicted membrane-associated Zn-dependent protease  44.04 
 
 
447 aa  352  5e-96  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.818743  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2499  peptidase M50  44.03 
 
 
442 aa  345  1e-93  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.761739  normal  0.702763 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06930  predicted membrane-associated Zn-dependent protease  44.67 
 
 
455 aa  345  1e-93  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3974  peptidase M50  43.01 
 
 
454 aa  337  1.9999999999999998e-91  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.17805  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1201  peptidase M50  41.86 
 
 
432 aa  288  2e-76  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.436201  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1500  peptidase M50  45.07 
 
 
438 aa  285  9e-76  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5120  peptidase M50  33.41 
 
 
428 aa  264  3e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.949013  normal  0.451136 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1303  peptidase M50  37.33 
 
 
416 aa  250  4e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.138776 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1351  peptidase M50  37.78 
 
 
416 aa  249  9e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.365692  normal  0.842339 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1169  peptidase M50  37.3 
 
 
393 aa  234  2.0000000000000002e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.157533 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3574  peptidase M50  37.24 
 
 
394 aa  234  3e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09990  predicted membrane-associated Zn-dependent protease  35.99 
 
 
402 aa  229  9e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.417947  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5889  peptidase M50  35.47 
 
 
403 aa  227  3e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4082  peptidase M50  34.37 
 
 
412 aa  217  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.331426  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2261  peptidase M50  34.37 
 
 
412 aa  214  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.240439  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2118  peptidase M50  33.26 
 
 
408 aa  211  3e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.435784  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12885  transmembrane protein  34.61 
 
 
404 aa  210  3e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.769587 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7761  peptidase M50  33.78 
 
 
413 aa  209  7e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2043  metallopeptidase MEROPS family protein  33.78 
 
 
404 aa  202  8e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.295005  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2026  metallopeptidase MEROPS family protein  33.78 
 
 
404 aa  202  8e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.456946  normal  0.0994336 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2089  metallopeptidase MEROPS family protein  33.78 
 
 
404 aa  202  8e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.468771  normal  0.311943 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3371  peptidase M50  36.96 
 
 
397 aa  179  1e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.304774  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1523  peptidase M50  33.55 
 
 
413 aa  171  3e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.36214  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1683  peptidase M50  33.19 
 
 
412 aa  169  6e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.066051  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0587  membrane-associated zinc metalloprotease  30.59 
 
 
347 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0616  putative membrane-associated zinc metalloprotease  30.93 
 
 
339 aa  138  2e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1948  membrane-associated zinc metalloprotease  28.12 
 
 
356 aa  137  4e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1785  putative membrane-associated zinc metalloprotease  26.29 
 
 
367 aa  136  9e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3509  peptidase M50  27.55 
 
 
363 aa  135  9.999999999999999e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.042901  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1161  putative membrane-associated zinc metalloprotease  28.33 
 
 
347 aa  131  3e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.472937  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0632  peptidase M50  28.57 
 
 
428 aa  130  6e-29  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.39267  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2914  membrane-associated zinc metalloprotease  29 
 
 
354 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.123834 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1257  peptidase RseP  28.29 
 
 
355 aa  127  6e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000258691  hitchhiker  0.00178972 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07740  putative membrane-associated zinc metalloprotease  25.46 
 
 
357 aa  126  9e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0796  membrane-associated zinc metalloprotease  28.39 
 
 
348 aa  126  9e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.270174  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1492  membrane-associated zinc metalloprotease  27.43 
 
 
354 aa  125  1e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00685355 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1969  putative membrane-associated zinc metalloprotease  29.63 
 
 
347 aa  124  3e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2117  putative membrane-associated zinc metalloprotease  27.72 
 
 
354 aa  124  3e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3701  membrane-associated zinc metalloprotease  26.7 
 
 
354 aa  124  4e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000133266  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2749  membrane-associated zinc metalloprotease  26.94 
 
 
354 aa  123  5e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0481  putative membrane-associated zinc metalloprotease  27.73 
 
 
355 aa  123  6e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1121  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  27.91 
 
 
351 aa  123  6e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0347872  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2715  membrane-associated zinc metalloprotease  28.01 
 
 
376 aa  121  3e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.747517  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3726  putative membrane-associated zinc metalloprotease  28.22 
 
 
355 aa  121  3e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0467  putative membrane-associated zinc metalloprotease  29.4 
 
 
377 aa  120  3e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3867  putative membrane-associated zinc metalloprotease  25.81 
 
 
418 aa  121  3e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.18687  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0689  peptidase M50  27.75 
 
 
376 aa  121  3e-26  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000148024  hitchhiker  3.25567e-17 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3561  membrane-associated zinc metalloprotease  25.58 
 
 
420 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3579  membrane-associated zinc metalloprotease  25.58 
 
 
420 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1061  membrane-associated zinc metalloprotease  25.64 
 
 
352 aa  120  4.9999999999999996e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4432  putative membrane-associated zinc metalloprotease  28.05 
 
 
385 aa  120  4.9999999999999996e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00893007 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3861  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  25.58 
 
 
420 aa  120  6e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3832  putative membrane-associated zinc metalloprotease  25.58 
 
 
418 aa  120  6e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.5484300000000005e-61 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3203  membrane-associated zinc metalloprotease  26.63 
 
 
341 aa  119  7e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000432825  hitchhiker  0.00000345421 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2383  membrane-associated zinc metalloprotease  26.83 
 
 
355 aa  119  7e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1436  membrane-associated zinc metalloprotease  28.77 
 
 
338 aa  119  7e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.23212  normal  0.10285 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3643  putative membrane-associated zinc metalloprotease  26.74 
 
 
418 aa  120  7e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1249  membrane-associated zinc metalloprotease  28.69 
 
 
351 aa  119  7.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0540521  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3918  putative membrane-associated zinc metalloprotease  25.35 
 
 
418 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.419375  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3671  membrane-associated zinc metalloprotease  25.58 
 
 
420 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.199531  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3958  membrane-associated zinc metalloprotease  25.58 
 
 
420 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1326  RIP metalloprotease RasP  25.35 
 
 
418 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000504967 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2050  peptidase M50  25.61 
 
 
444 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0906941  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2472  putative membrane-associated zinc metalloprotease  24.64 
 
 
418 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1405  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  28.72 
 
 
345 aa  119  1.9999999999999998e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1181  membrane-associated zinc metalloprotease  28.69 
 
 
351 aa  119  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1914  putative membrane-associated Zn-dependent protease  27.25 
 
 
446 aa  117  3e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0382298  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3582  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  31.39 
 
 
561 aa  118  3e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.864637  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2051  putative membrane-associated zinc metalloprotease  28.42 
 
 
372 aa  117  6e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00103431  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3722  membrane-associated zinc metalloprotease  31.39 
 
 
561 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.632001  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1322  putative membrane-associated zinc metalloprotease  26.1 
 
 
428 aa  115  1.0000000000000001e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1348  putative membrane-associated zinc metalloprotease  26.1 
 
 
428 aa  115  1.0000000000000001e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.264026  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3648  membrane-associated zinc metalloprotease  31.39 
 
 
561 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1387  peptidase RseP  28.81 
 
 
379 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0493232  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2681  peptidase RseP  26.1 
 
 
446 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1589  membrane-associated zinc metalloprotease  28.24 
 
 
375 aa  114  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1705  membrane-associated zinc metalloprotease  28.61 
 
 
353 aa  114  3e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1782  membrane-associated zinc metalloprotease  27.95 
 
 
377 aa  114  5e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.5938 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1847  peptidase RseP  29.44 
 
 
369 aa  114  5e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000683327  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0084  membrane-associated zinc metalloprotease  33.2 
 
 
453 aa  113  6e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.47842  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3189  putative membrane-associated zinc metalloprotease  27.08 
 
 
392 aa  111  2.0000000000000002e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0687  membrane-associated Zn-dependent protease  25.59 
 
 
417 aa  111  3e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0829  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  24.88 
 
 
428 aa  110  4.0000000000000004e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0029507  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0890  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  28.46 
 
 
343 aa  110  4.0000000000000004e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000919526  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1914  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  29.27 
 
 
355 aa  110  5e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0097  membrane-associated zinc metalloprotease  31.8 
 
 
453 aa  110  5e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000512767  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1148  membrane-associated zinc metalloprotease  25.35 
 
 
419 aa  109  8.000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0330483  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>