More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1658 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1658  ATP-dependent protease La  100 
 
 		 307 aa  617  1e-175  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1933  peptidase S16 lon domain protein  49.84 
 
 		 309 aa  287  2e-76  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.041451  normal  0.46628 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1954  peptidase S16, lon domain-containing protein  49.51 
 
 		 289 aa  176  3e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0315  hypothetical protein  31.44 
 
 		 614 aa  99  9e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.463593 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0532  hypothetical protein  30.17 
 
 		 614 aa  94.4  2e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.26777  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1597  hypothetical protein  32.77 
 
 		 614 aa  94  3e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  decreased coverage  0.00000000203225  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1787  peptidase S16, lon domain-containing protein  34.24 
 
 		 628 aa  89.4  8e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0384  hypothetical protein  33.7 
 
 		 606 aa  88.6  1e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0784776  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1374  hypothetical protein  33.33 
 
 		 632 aa  78.6  0.0000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.00571338  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0963  peptidase S16 lon domain-containing protein  29.23 
 
 		 640 aa  68.9  0.0000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2032  Lon-A peptidase  35.25 
 
 		 809 aa  67.8  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.914021  decreased coverage  0.00112725 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1492  ATP-dependent protease La  35.25 
 
 		 785 aa  64.7  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000160323  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1629  ATP-dependent protease La  35.25 
 
 		 785 aa  64.3  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000414531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1606  ATP-dependent protease La  35.25 
 
 		 784 aa  64.7  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000976039  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0941  ATP-dependent protease La  35.97 
 
 		 810 aa  64.3  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.131328  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1595  ATP-dependent protease La  35.25 
 
 		 785 aa  64.3  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000103769  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1033  ATP-dependent protease La  34.78 
 
 		 811 aa  64.7  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0951111  hitchhiker  0.0000000189689 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3418  ATP-dependent protease La  33.57 
 
 		 810 aa  64.7  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.136554  normal  0.0269191 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2955  ATP-dependent protease La  35.25 
 
 		 809 aa  64.7  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0653516 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0912  ATP-dependent protease La  34.78 
 
 		 796 aa  65.1  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1796  ATP-dependent protease La  35.71 
 
 		 785 aa  63.9  0.000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2542  ATP-dependent protease La  35.25 
 
 		 805 aa  63.9  0.000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00142906 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2506  ATP-dependent protease La  35.25 
 
 		 785 aa  63.9  0.000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000773513  normal  0.491127 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3496  ATP-dependent protease La  33.57 
 
 		 812 aa  63.9  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.473507  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3350  Lon-A peptidase  33.57 
 
 		 812 aa  63.9  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4930  Sigma 54 interacting domain protein  33.08 
 
 		 652 aa  64.3  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.327719  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2679  ATP-dependent protease La  32.96 
 
 		 785 aa  64.3  0.000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000848642  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01419  ATP-dependent protease  35.97 
 
 		 783 aa  63.5  0.000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2748  ATP-dependent protease La  35.25 
 
 		 785 aa  63.5  0.000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000341636  normal  0.663967 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2493  Lon-A peptidase  35.71 
 
 		 785 aa  63.2  0.000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000173516  normal  0.0963956 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2561  Lon-A peptidase  35.71 
 
 		 785 aa  63.2  0.000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000338529  normal  0.0789552 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2659  Lon-A peptidase  35.71 
 
 		 785 aa  63.2  0.000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000097236  normal  0.812724 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004042  ATP-dependent protease La Type I  35.25 
 
 		 783 aa  62.8  0.000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000129867  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0873  peptidase S16 lon domain-containing protein  33.08 
 
 		 550 aa  62.8  0.000000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2044  Lon-A peptidase  32.86 
 
 		 802 aa  62.8  0.000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1543  endopeptidase La  34.53 
 
 		 781 aa  62.8  0.000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000152333  hitchhiker  0.000667603 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1713  ATP-dependent protease LA protein  35.04 
 
 		 806 aa  62  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0908085  normal  0.0334567 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1534  ATP-dependent protease La  35.04 
 
 		 804 aa  61.6  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.254924 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0376  ATP-dependent protease La  34.29 
 
 		 776 aa  61.6  0.00000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3111  ATP-dependent protease La  34.53 
 
 		 785 aa  62  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000302601  hitchhiker  0.00000706703 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1411  Lon-A peptidase  34.31 
 
 		 811 aa  62  0.00000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000104589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1867  ATP-dependent protease La  35.04 
 
 		 804 aa  61.6  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0743782  hitchhiker  0.00647578 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2647  ATP-dependent protease La  34.31 
 
 		 804 aa  62  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.272722 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1457  Lon-A peptidase  35.04 
 
 		 808 aa  62  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.181081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0906  ATP-dependent protease La  33.8 
 
 		 810 aa  61.6  0.00000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1687  ATP-dependent protease La  33.33 
 
 		 801 aa  61.2  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.0000000000000016663  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3432  ATP-dependent protease La  32.19 
 
 		 819 aa  61.6  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3134  ATP-dependent protease La  35.25 
 
 		 788 aa  60.8  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000324341  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1510  ATP-dependent protease LA  34.53 
 
 		 786 aa  60.8  0.00000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000293183  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2338  ATP-dependent protease La  34.31 
 
 		 803 aa  60.8  0.00000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0304727  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1467  ATP-dependent protease La  34.53 
 
 		 785 aa  60.8  0.00000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.635914  normal  0.937024 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1838  ATP-dependent protease La  34.31 
 
 		 805 aa  60.8  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.203387  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4373  ATP-dependent protease La  34.31 
 
 		 816 aa  60.5  0.00000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.574007  normal  0.577886 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0053  ATP-dependent protease La  32.14 
 
 		 804 aa  60.1  0.00000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000930171  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0794  peptidase S16, lon domain-containing protein  33.08 
 
 		 553 aa  60.1  0.00000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000691143 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0575  ATP-dependent protease La  34.29 
 
 		 821 aa  59.7  0.00000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.178151 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0531  ATP-dependent protease La  35.46 
 
 		 809 aa  59.3  0.00000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0680151  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0112  ATP-dependent protease La  27.42 
 
 		 820 aa  59.3  0.00000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.187598 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1823  hypothetical protein  32.35 
 
 		 816 aa  59.3  0.00000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4111  hypothetical protein  35.34 
 
 		 337 aa  59.3  0.00000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.404702  normal  0.0634839 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0389  ATP-dependent protease La  33.81 
 
 		 810 aa  59.3  0.00000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00469679  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1827  hypothetical protein  32.35 
 
 		 816 aa  59.3  0.00000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0027  ATP-dependent protease La  31.65 
 
 		 780 aa  59.3  0.00000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0936  ATP-dependent protease La  34.27 
 
 		 810 aa  59.3  0.00000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0263  DNA-binding ATP-dependent protease La  35 
 
 		 784 aa  59.3  0.00000009  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1211  ATP-dependent protease La  34.78 
 
 		 817 aa  58.9  0.0000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3783  ATP-dependent protease La  33.09 
 
 		 782 aa  58.9  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.417007  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0754  ATP-dependent endopeptidase Lon  34.78 
 
 		 817 aa  58.5  0.0000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.261769  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0475  peptidase S16, lon domain-containing protein  48.57 
 
 		 394 aa  58.9  0.0000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1790  ATP-dependent protease La  31.65 
 
 		 807 aa  58.5  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2472  PDZ domain-containing protein  35.29 
 
 		 342 aa  57.8  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000879917 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3066  DNA-binding ATP-dependent protease La  33.81 
 
 		 787 aa  58.2  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1777  ATP-dependent protease La  34.29 
 
 		 802 aa  58.2  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.169591  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23590  Peptidase S16, ATP-dependent protease  36.5 
 
 		 797 aa  58.2  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1130  ATP-dependent protease La  34.31 
 
 		 806 aa  58.2  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2493  ATP-dependent protease La  33.81 
 
 		 783 aa  57.8  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000146156  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0775  Lon-A peptidase  31.94 
 
 		 802 aa  58.2  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.577145  normal  0.0448115 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1842  ATP-dependent protease La  30.15 
 
 		 811 aa  58.2  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.523368  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1725  ATP-dependent protease La  34.29 
 
 		 814 aa  58.2  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.0000125978  decreased coverage  0.00323118 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1249  ATP-dependent protease La  35.25 
 
 		 805 aa  58.2  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1258  Lon-like protease  46.15 
 
 		 364 aa  58.2  0.0000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.383395  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0098  ATP-dependent protease La  31.88 
 
 		 815 aa  57.8  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000146786 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0513  ATP-dependent protease La  32.61 
 
 		 815 aa  58.2  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00559437  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0838  ATP-dependent protease La  30.67 
 
 		 816 aa  58.2  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.486343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1211  Lon-A peptidase  34.31 
 
 		 806 aa  58.2  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.451263 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23310  Sporulation protease LonC  37.11 
 
 		 639 aa  57.8  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2845  ATP-dependent protease La  30 
 
 		 799 aa  57.4  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0128404  normal  0.0142705 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5222  Lon-A peptidase  35.51 
 
 		 807 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1351  ATP-dependent protease La  37.23 
 
 		 808 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.433496  normal  0.183525 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1493  ATP-dependent protease La  35 
 
 		 802 aa  57  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0489479  normal  0.577481 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2518  Lon-A peptidase  35.97 
 
 		 799 aa  57.4  0.0000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.571942  normal  0.381839 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1556  ATP-dependent protease La  37.41 
 
 		 813 aa  57.4  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6158  ATP-dependent protease La  35.51 
 
 		 807 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0469  ATP-dependent protease La  31.16 
 
 		 823 aa  57.4  0.0000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2286  Lon-A peptidase  33.81 
 
 		 816 aa  57.4  0.0000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.620388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1921  ATP-dependent protease La  35.51 
 
 		 807 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1700  ATP-dependent protease La  35.25 
 
 		 867 aa  57  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.311837  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0531  endopeptidase La  31.16 
 
 		 823 aa  57  0.0000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2695  ATP-dependent protease La  30.37 
 
 		 811 aa  57  0.0000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1097  DNA-binding ATP-dependent protease La  33.09 
 
 		 784 aa  57  0.0000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000612483  hitchhiker  0.00000716976 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>