More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1954 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_1954  peptidase S16, lon domain-containing protein  100 
 
 		 289 aa  564  1e-160  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1933  peptidase S16 lon domain protein  49.09 
 
 		 309 aa  219  5e-56  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.041451  normal  0.46628 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1658  ATP-dependent protease La  50.24 
 
 		 307 aa  203  3e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1787  peptidase S16, lon domain-containing protein  32.6 
 
 		 628 aa  90.1  4e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3418  ATP-dependent protease La  37.41 
 
 		 810 aa  82  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.136554  normal  0.0269191 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1033  ATP-dependent protease La  36.96 
 
 		 811 aa  82  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0951111  hitchhiker  0.0000000189689 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0912  ATP-dependent protease La  36.96 
 
 		 796 aa  82  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0315  hypothetical protein  33.77 
 
 		 614 aa  80.1  0.00000000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.463593 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1827  hypothetical protein  32.86 
 
 		 816 aa  77.4  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1823  hypothetical protein  32.86 
 
 		 816 aa  77.8  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1597  hypothetical protein  32.7 
 
 		 614 aa  78.2  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  decreased coverage  0.00000000203225  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0532  hypothetical protein  31.45 
 
 		 614 aa  76.6  0.0000000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.26777  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0941  ATP-dependent protease La  37.14 
 
 		 810 aa  76.3  0.0000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.131328  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3496  ATP-dependent protease La  35.97 
 
 		 812 aa  75.9  0.0000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.473507  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3350  Lon-A peptidase  35.97 
 
 		 812 aa  75.9  0.0000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1411  Lon-A peptidase  31.25 
 
 		 811 aa  73.9  0.000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000104589  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3432  ATP-dependent protease La  34.48 
 
 		 819 aa  73.6  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0575  ATP-dependent protease La  32.85 
 
 		 821 aa  72.8  0.000000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.178151 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1492  ATP-dependent protease La  35.46 
 
 		 785 aa  72  0.00000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000160323  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0601  ATP-dependent protease La  35.25 
 
 		 820 aa  71.6  0.00000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.273158  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1606  ATP-dependent protease La  35.46 
 
 		 784 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000976039  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1629  ATP-dependent protease La  35.46 
 
 		 785 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000414531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1595  ATP-dependent protease La  35.46 
 
 		 785 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000103769  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1838  ATP-dependent protease La  31.34 
 
 		 805 aa  70.9  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.203387  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1211  ATP-dependent protease La  33.58 
 
 		 817 aa  71.2  0.00000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1871  Lon-A peptidase  33.58 
 
 		 805 aa  70.9  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00061331  normal  0.0162065 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1842  ATP-dependent protease La  36.36 
 
 		 811 aa  71.2  0.00000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.523368  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0263  DNA-binding ATP-dependent protease La  35.21 
 
 		 784 aa  71.2  0.00000000002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2748  ATP-dependent protease La  35.46 
 
 		 785 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000341636  normal  0.663967 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0201  ATP-dependent protease La  34.06 
 
 		 815 aa  71.2  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1374  hypothetical protein  32.28 
 
 		 632 aa  70.5  0.00000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.00571338  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1687  ATP-dependent protease La  33.1 
 
 		 801 aa  70.5  0.00000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.0000000000000016663  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2506  ATP-dependent protease La  34.75 
 
 		 785 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000773513  normal  0.491127 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1050  DNA-binding ATP-dependent protease La  33.8 
 
 		 793 aa  70.5  0.00000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.362366  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1725  ATP-dependent protease La  36.43 
 
 		 814 aa  70.5  0.00000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.0000125978  decreased coverage  0.00323118 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1917  ATP-dependent protease La  32.61 
 
 		 808 aa  70.5  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000156821  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3262  DNA-binding ATP-dependent protease La  33.8 
 
 		 793 aa  70.5  0.00000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1796  ATP-dependent protease La  34.75 
 
 		 785 aa  70.1  0.00000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2874  DNA-binding ATP-dependent protease La  33.8 
 
 		 786 aa  70.1  0.00000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2338  ATP-dependent protease La  30.88 
 
 		 803 aa  70.1  0.00000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0304727  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2044  Lon-A peptidase  33.81 
 
 		 802 aa  70.1  0.00000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2286  Lon-A peptidase  32.32 
 
 		 816 aa  70.1  0.00000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.620388  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3111  ATP-dependent protease La  33.8 
 
 		 785 aa  69.7  0.00000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000302601  hitchhiker  0.00000706703 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1467  ATP-dependent protease La  34.75 
 
 		 785 aa  69.7  0.00000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.635914  normal  0.937024 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1543  endopeptidase La  33.8 
 
 		 781 aa  69.7  0.00000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000152333  hitchhiker  0.000667603 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3232  DNA-binding ATP-dependent protease La  34.03 
 
 		 784 aa  69.7  0.00000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3052  DNA-binding ATP-dependent protease La  34.03 
 
 		 784 aa  69.7  0.00000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000101207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3090  DNA-binding ATP-dependent protease La  34.03 
 
 		 784 aa  69.7  0.00000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  0.00000000000000593102  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2557  ATP-dependent protease La  30.14 
 
 		 802 aa  69.7  0.00000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0122618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2561  Lon-A peptidase  34.75 
 
 		 785 aa  69.7  0.00000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000338529  normal  0.0789552 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3009  ATP-dependent protease La  34.53 
 
 		 806 aa  69.7  0.00000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.823527 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0493  ATP-dependent protease La  34.27 
 
 		 797 aa  69.7  0.00000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.229233  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2659  Lon-A peptidase  34.75 
 
 		 785 aa  69.7  0.00000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000097236  normal  0.812724 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1790  ATP-dependent protease La  33.81 
 
 		 807 aa  69.3  0.00000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1274  ATP-dependent protease La  34.53 
 
 		 806 aa  69.7  0.00000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00372497  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2493  Lon-A peptidase  34.75 
 
 		 785 aa  69.7  0.00000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000173516  normal  0.0963956 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0906  ATP-dependent protease La  34.56 
 
 		 810 aa  69.3  0.00000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2679  ATP-dependent protease La  34.04 
 
 		 785 aa  69.3  0.00000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000848642  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23590  Peptidase S16, ATP-dependent protease  30.85 
 
 		 797 aa  69.3  0.00000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4214  endopeptidase La (ATP-dependent protease La 1)  36.17 
 
 		 776 aa  68.9  0.00000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000107008  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4606  ATP-dependent protease La 1  36.17 
 
 		 776 aa  68.9  0.00000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000105653  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4557  ATP-dependent protease La 1  36.17 
 
 		 776 aa  68.9  0.00000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4315  ATP-dependent protease La  36.17 
 
 		 773 aa  68.9  0.00000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0531  ATP-dependent protease La  36.43 
 
 		 809 aa  68.9  0.0000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0680151  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4561  ATP-dependent protease La 1  36.17 
 
 		 773 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4588  ATP-dependent protease La 1  34.53 
 
 		 776 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.349716  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4367  ATP-dependent protease La 1  34.53 
 
 		 776 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000611183  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4203  endopeptidase La (ATP-dependent protease La 1)  34.53 
 
 		 776 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000103757  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3066  DNA-binding ATP-dependent protease La  33.33 
 
 		 787 aa  68.6  0.0000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1675  Lon-A peptidase  31.85 
 
 		 805 aa  68.9  0.0000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0439877 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1097  DNA-binding ATP-dependent protease La  34.03 
 
 		 784 aa  68.2  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000612483  hitchhiker  0.00000716976 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4702  ATP-dependent protease La 1  34.53 
 
 		 773 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1392  ATP-dependent protease La  33.33 
 
 		 800 aa  68.9  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0513  ATP-dependent protease La  34.06 
 
 		 815 aa  68.6  0.0000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00559437  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0646  ATP-dependent protease La 1  34.53 
 
 		 776 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1713  ATP-dependent protease LA protein  35.29 
 
 		 806 aa  67.4  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0908085  normal  0.0334567 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1548  ATP-dependent protease La  38.46 
 
 		 853 aa  67.4  0.0000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.984629  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0384  hypothetical protein  32.28 
 
 		 606 aa  68.2  0.0000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0784776  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3184  ATP-dependent protease La  36.17 
 
 		 773 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.899405  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004042  ATP-dependent protease La Type I  33.33 
 
 		 783 aa  67  0.0000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000129867  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2302  ATP-dependent protease La  34.06 
 
 		 798 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.235792  hitchhiker  0.000494744 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2695  ATP-dependent protease La  34.53 
 
 		 811 aa  67.4  0.0000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3467  ATP-dependent protease La  34.06 
 
 		 798 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.895403  hitchhiker  0.000510926 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1674  peptidase S16, ATP-dependent protease La  33.12 
 
 		 812 aa  67.4  0.0000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.37162  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1904  ATP-dependent protease La  34.06 
 
 		 798 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.798335  hitchhiker  0.000618765 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0525  DNA-binding ATP-dependent protease La  33.33 
 
 		 799 aa  67  0.0000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000828536  normal  0.526776 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1610  Lon-A peptidase  33.82 
 
 		 805 aa  67  0.0000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000614629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0906  DNA-binding ATP-dependent protease La  33.33 
 
 		 784 aa  67  0.0000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000110606  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0509  DNA-binding ATP-dependent protease La  33.33 
 
 		 784 aa  67  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00343413  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0482  DNA-binding ATP-dependent protease La  33.33 
 
 		 784 aa  67  0.0000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000167472  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3193  DNA-binding ATP-dependent protease La  33.33 
 
 		 784 aa  67  0.0000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000724307  hitchhiker  0.000504746 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0838  ATP-dependent protease La  31.39 
 
 		 816 aa  67  0.0000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.486343  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0490  DNA-binding ATP-dependent protease La  33.33 
 
 		 784 aa  67  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000003188  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0516  DNA-binding ATP-dependent protease La  33.33 
 
 		 784 aa  67  0.0000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000129427  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0553  DNA-binding ATP-dependent protease La  33.33 
 
 		 784 aa  67  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00718767  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0499  DNA-binding ATP-dependent protease La  33.33 
 
 		 784 aa  67  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00131573  hitchhiker  0.00467921 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0754  ATP-dependent endopeptidase Lon  32.85 
 
 		 817 aa  67  0.0000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.261769  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1867  ATP-dependent protease La  35.29 
 
 		 804 aa  66.6  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0743782  hitchhiker  0.00647578 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0492  DNA-binding ATP-dependent protease La  33.33 
 
 		 784 aa  67  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00217408  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1534  ATP-dependent protease La  35.29 
 
 		 804 aa  66.6  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.254924 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>