28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0618 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008701  Pisl_1696  peptidase M50  66.14 
 
 
509 aa  702    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.156328 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0618  peptidase M50  100 
 
 
502 aa  997    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2238  peptidase M50  65.34 
 
 
502 aa  685    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.577346  normal  0.574396 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0717  peptidase M50  67.94 
 
 
497 aa  684    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0845  peptidase M50  32.47 
 
 
418 aa  93.6  7e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.450162  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1066  peptidase M50  40.46 
 
 
364 aa  92.4  2e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.754644  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2160  peptidase M50  38.78 
 
 
362 aa  75.1  0.000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.000514306 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0864  peptidase M50  35.58 
 
 
380 aa  64.7  0.000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1683  peptidase M50  30.96 
 
 
623 aa  62  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.200321  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0314  peptidase M50  22 
 
 
512 aa  60.5  0.00000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1973  peptidase M50  37.5 
 
 
603 aa  57.4  0.0000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.246801  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3477  peptidase M50  30.05 
 
 
607 aa  56.2  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1508  peptidase M50  31.76 
 
 
612 aa  53.9  0.000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF02350  expressed protein  28.19 
 
 
594 aa  53.5  0.000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0107  peptidase M50  34 
 
 
398 aa  53.5  0.000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000498394 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1169  peptidase M50  27.94 
 
 
375 aa  51.2  0.00004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0964  peptidase M50  23.87 
 
 
459 aa  50.4  0.00006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1942  peptidase M50  24.18 
 
 
432 aa  48.9  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.718786 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1506  peptidase M50  34.21 
 
 
375 aa  48.5  0.0003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0781  peptidase M50  32.17 
 
 
375 aa  48.1  0.0004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.605878  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1380  peptidase M50  26.7 
 
 
388 aa  47.4  0.0007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.338907  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0120  membrane-associated zinc metalloprotease  23.06 
 
 
453 aa  46.2  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1174  peptidase M50  35.8 
 
 
375 aa  45.8  0.002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0083  peptidase M50  24.89 
 
 
616 aa  45.8  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0172  peptidase M50  33.01 
 
 
518 aa  45.4  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0098  peptidase M50  37.31 
 
 
269 aa  43.9  0.006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1487  hypothetical protein  35.29 
 
 
441 aa  43.5  0.009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000349158  normal  0.0156065 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0076  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  21.88 
 
 
454 aa  43.5  0.009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>