36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_2160 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009440  Msed_2160  peptidase M50  100 
 
 
362 aa  712    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.000514306 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1066  peptidase M50  49.58 
 
 
364 aa  327  2.0000000000000001e-88  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.754644  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0864  peptidase M50  32.38 
 
 
380 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0107  peptidase M50  29.09 
 
 
398 aa  114  3e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000498394 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0717  peptidase M50  47.78 
 
 
497 aa  83.2  0.000000000000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1696  peptidase M50  44.94 
 
 
509 aa  82.8  0.000000000000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.156328 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1683  peptidase M50  27.66 
 
 
623 aa  82.4  0.00000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.200321  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0845  peptidase M50  28.91 
 
 
418 aa  82.4  0.00000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.450162  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1942  peptidase M50  24.87 
 
 
432 aa  82  0.00000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.718786 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3477  peptidase M50  27.9 
 
 
607 aa  81.3  0.00000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2238  peptidase M50  42.86 
 
 
502 aa  77  0.0000000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.577346  normal  0.574396 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0618  peptidase M50  38.78 
 
 
502 aa  75.5  0.000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1487  hypothetical protein  30.33 
 
 
441 aa  73.9  0.000000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000349158  normal  0.0156065 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0503  peptidase M50  23.89 
 
 
443 aa  72  0.00000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1973  peptidase M50  29.44 
 
 
603 aa  70.1  0.00000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.246801  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1508  peptidase M50  26.35 
 
 
612 aa  67.4  0.0000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0964  peptidase M50  28.22 
 
 
459 aa  66.6  0.0000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0083  peptidase M50  32.87 
 
 
616 aa  65.5  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1215  peptidase M50  26 
 
 
430 aa  57  0.0000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.285104  normal  0.0156035 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0248  peptidase M50  25.34 
 
 
584 aa  56.2  0.0000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.0000000000540477  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0172  peptidase M50  31.19 
 
 
518 aa  54.7  0.000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF02350  expressed protein  29.17 
 
 
594 aa  49.7  0.00007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1292  peptidase M50  27.04 
 
 
587 aa  49.7  0.00008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.894825  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0314  peptidase M50  24 
 
 
512 aa  49.7  0.00009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2356  membrane-associated zinc metalloprotease  27.59 
 
 
386 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.65169  normal  0.251617 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2082  membrane-associated zinc metalloprotease  27.59 
 
 
386 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.366496  normal  0.128586 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1914  putative membrane-associated Zn-dependent protease  29.41 
 
 
446 aa  48.5  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0382298  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2042  membrane-associated zinc metalloprotease  26.72 
 
 
386 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.101077 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1169  peptidase M50  26.61 
 
 
375 aa  47.8  0.0003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1705  membrane-associated zinc metalloprotease  27.38 
 
 
353 aa  46.6  0.0006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00878  protease  37.68 
 
 
455 aa  45.8  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004514  outer membrane stress sensor protease DegQ  40.58 
 
 
455 aa  45.8  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00186375  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0370  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  29.68 
 
 
345 aa  45.4  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0637  membrane-associated zinc metalloprotease  26.85 
 
 
386 aa  43.5  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0772192 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0100  protease DO  34.78 
 
 
456 aa  43.9  0.005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000901293  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_314  membrane-associated zinc metalloprotease  28.39 
 
 
345 aa  43.1  0.008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>