107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_1487 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008942  Mlab_1487  hypothetical protein  100 
 
 
441 aa  877    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000349158  normal  0.0156065 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1942  peptidase M50  42.66 
 
 
432 aa  363  3e-99  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.718786 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0964  peptidase M50  41.3 
 
 
459 aa  312  6.999999999999999e-84  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0503  peptidase M50  38.2 
 
 
443 aa  283  5.000000000000001e-75  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1215  peptidase M50  34.84 
 
 
430 aa  274  3e-72  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.285104  normal  0.0156035 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3477  peptidase M50  36.92 
 
 
607 aa  146  8.000000000000001e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1973  peptidase M50  39.55 
 
 
603 aa  144  3e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.246801  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1508  peptidase M50  38.49 
 
 
612 aa  143  6e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0172  peptidase M50  28.46 
 
 
518 aa  139  7e-32  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1683  peptidase M50  33.94 
 
 
623 aa  133  7.999999999999999e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.200321  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3114  sterol-regulatory element-binding protein intramembrane protease  30.48 
 
 
598 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.896096  normal  0.810156 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0083  peptidase M50  36.33 
 
 
616 aa  131  2.0000000000000002e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0248  peptidase M50  30.49 
 
 
584 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.0000000000540477  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0314  peptidase M50  35.51 
 
 
512 aa  121  3e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1292  peptidase M50  34.42 
 
 
587 aa  114  2.0000000000000002e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.894825  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0864  peptidase M50  26.2 
 
 
380 aa  85.1  0.000000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1066  peptidase M50  31.67 
 
 
364 aa  80.9  0.00000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.754644  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0107  peptidase M50  25.52 
 
 
398 aa  77.8  0.0000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000498394 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2160  peptidase M50  30.33 
 
 
362 aa  77.8  0.0000000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.000514306 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0845  peptidase M50  29.03 
 
 
418 aa  69.7  0.0000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.450162  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0781  peptidase M50  27.53 
 
 
375 aa  65.1  0.000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.605878  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1436  membrane-associated zinc metalloprotease  25.71 
 
 
338 aa  64.3  0.000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.23212  normal  0.10285 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0796  membrane-associated zinc metalloprotease  23.89 
 
 
348 aa  63.2  0.000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.270174  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1506  peptidase M50  26.45 
 
 
375 aa  62.4  0.00000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1169  peptidase M50  33.8 
 
 
375 aa  61.2  0.00000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3203  membrane-associated zinc metalloprotease  23.33 
 
 
341 aa  60.8  0.00000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000432825  hitchhiker  0.00000345421 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3701  membrane-associated zinc metalloprotease  23.34 
 
 
354 aa  59.3  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000133266  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2472  putative membrane-associated zinc metalloprotease  25.08 
 
 
418 aa  58.2  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4633  membrane-associated zinc metalloprotease  26.1 
 
 
488 aa  57  0.0000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1969  putative membrane-associated zinc metalloprotease  25.25 
 
 
347 aa  54.7  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1380  peptidase M50  33.1 
 
 
388 aa  54.3  0.000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.338907  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1696  peptidase M50  34.48 
 
 
509 aa  53.9  0.000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.156328 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0692  putative membrane-associated zinc metalloprotease  27.04 
 
 
424 aa  53.5  0.000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0120814  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0859  peptidase S1C, Do  32.39 
 
 
477 aa  52.4  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.078917  normal  0.0183856 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1003  peptidase S1C, Do  32.39 
 
 
477 aa  52.4  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0749587  normal  0.0653423 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2238  peptidase M50  32 
 
 
502 aa  52.8  0.00001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.577346  normal  0.574396 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1322  putative membrane-associated zinc metalloprotease  25.28 
 
 
428 aa  52.8  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1348  putative membrane-associated zinc metalloprotease  25.28 
 
 
428 aa  52.8  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.264026  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2118  peptidase M50  23.86 
 
 
408 aa  53.1  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.435784  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1086  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  23.42 
 
 
372 aa  52.4  0.00002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.147315  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1665  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  24.83 
 
 
335 aa  52  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1174  peptidase M50  31.65 
 
 
375 aa  52  0.00002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3643  putative membrane-associated zinc metalloprotease  26.5 
 
 
418 aa  52  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0616  putative membrane-associated zinc metalloprotease  25.69 
 
 
339 aa  52.4  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0596  membrane-associated zinc metalloprotease  24.04 
 
 
337 aa  52  0.00002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0932  membrane-associated zinc metalloprotease  24.54 
 
 
342 aa  52.4  0.00002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.115167  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1705  membrane-associated zinc metalloprotease  25.55 
 
 
353 aa  52  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1148  membrane-associated zinc metalloprotease  25.37 
 
 
419 aa  51.6  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0330483  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3861  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  25.61 
 
 
420 aa  50.4  0.00006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3561  membrane-associated zinc metalloprotease  25.96 
 
 
420 aa  50.1  0.00007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3579  membrane-associated zinc metalloprotease  25.96 
 
 
420 aa  50.1  0.00007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1947  putative membrane-associated zinc metalloprotease  24.34 
 
 
335 aa  50.1  0.00007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3867  putative membrane-associated zinc metalloprotease  25.61 
 
 
418 aa  50.4  0.00007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.18687  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3832  putative membrane-associated zinc metalloprotease  25.96 
 
 
418 aa  50.4  0.00007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.5484300000000005e-61 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0890  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  25.16 
 
 
343 aa  49.3  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000919526  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0717  peptidase M50  42.86 
 
 
497 aa  49.7  0.0001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3671  membrane-associated zinc metalloprotease  25.61 
 
 
420 aa  48.9  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.199531  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3958  membrane-associated zinc metalloprotease  25.61 
 
 
420 aa  48.9  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1192  protease Do  31.33 
 
 
493 aa  48.5  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0123913  normal  0.0156708 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3243  protease Do  35.21 
 
 
488 aa  48.5  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0128556 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1426  membrane-associated zinc metalloprotease  22.77 
 
 
422 aa  48.9  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.191575  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12885  transmembrane protein  24.65 
 
 
404 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.769587 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1653  putative membrane-associated zinc metalloprotease  23.41 
 
 
332 aa  48.1  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0225  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  40 
 
 
365 aa  47.8  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0645  peptidase  32.1 
 
 
509 aa  47.8  0.0004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.146477 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3918  putative membrane-associated zinc metalloprotease  25.61 
 
 
418 aa  47.8  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.419375  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1786  membrane-associated zinc metalloprotease  24.26 
 
 
337 aa  47.4  0.0005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.250325  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1731  peptidase M50  36.25 
 
 
366 aa  47.4  0.0006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1186  HtrA2 peptidase  37.5 
 
 
597 aa  47.4  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.934322  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1960  membrane-associated zinc metalloprotease  25.63 
 
 
348 aa  47  0.0007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.346364  normal  0.305152 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2261  peptidase M50  23.12 
 
 
412 aa  46.6  0.0008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.240439  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1121  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  23.95 
 
 
351 aa  46.2  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0347872  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0618  peptidase M50  28.33 
 
 
502 aa  46.2  0.001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0352  peptidase M50  24.04 
 
 
345 aa  45.8  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0689  peptidase M50  23.64 
 
 
376 aa  46.2  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000148024  hitchhiker  3.25567e-17 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1589  membrane-associated zinc metalloprotease  26.83 
 
 
375 aa  45.8  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0534  2-alkenal reductase  37.33 
 
 
395 aa  46.2  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0370  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  24.84 
 
 
345 aa  45.4  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1914  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  23.61 
 
 
355 aa  45.4  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0829  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  24.41 
 
 
428 aa  45.4  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0029507  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2024  peptidase S1C, Do  27.84 
 
 
473 aa  45.4  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.115837  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1749  peptidase S1C, Do  29.58 
 
 
473 aa  45.4  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1988  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  37.68 
 
 
347 aa  45.8  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.968187  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3233  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  35.38 
 
 
398 aa  45.4  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2117  putative membrane-associated zinc metalloprotease  25.5 
 
 
354 aa  45.4  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0120  membrane-associated zinc metalloprotease  23.67 
 
 
453 aa  45.8  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0929  protease Do  34.92 
 
 
473 aa  45.8  0.002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000572701  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1326  RIP metalloprotease RasP  25.26 
 
 
418 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000504967 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3400  peptidase M50  37.5 
 
 
381 aa  45.1  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1135  RIP metalloprotease RseP  25.15 
 
 
370 aa  44.7  0.003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3648  peptidase M50  37.5 
 
 
381 aa  45.1  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0203123 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1181  membrane-associated zinc metalloprotease  23.95 
 
 
351 aa  45.1  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1444  PDZ/DHR/GLGF domain protein  37.7 
 
 
379 aa  44.7  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1257  peptidase RseP  23.62 
 
 
355 aa  44.3  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000258691  hitchhiker  0.00178972 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2299  peptidase M50  34.62 
 
 
226 aa  44.3  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1782  membrane-associated zinc metalloprotease  25.85 
 
 
377 aa  44.7  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.5938 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7315  membrane-associated Zn-dependent protease 1- like protein  25.64 
 
 
431 aa  44.3  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2091  peptidase S1C, Do  29.7 
 
 
464 aa  43.9  0.005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2903  protease Do  37.66 
 
 
505 aa  44.3  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.580104  normal  0.459508 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1249  membrane-associated zinc metalloprotease  23.95 
 
 
351 aa  43.9  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0540521  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>