145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1683 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_1683  peptidase M50  100 
 
 
623 aa  1216    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.200321  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3477  peptidase M50  48.45 
 
 
607 aa  535  1e-150  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1508  peptidase M50  49.43 
 
 
612 aa  499  1e-140  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1973  peptidase M50  47.39 
 
 
603 aa  494  9.999999999999999e-139  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.246801  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1292  peptidase M50  44.84 
 
 
587 aa  419  1e-116  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.894825  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0083  peptidase M50  38.03 
 
 
616 aa  293  8e-78  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0248  peptidase M50  29.52 
 
 
584 aa  209  1e-52  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.0000000000540477  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0172  peptidase M50  35.25 
 
 
518 aa  138  3.0000000000000003e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3114  sterol-regulatory element-binding protein intramembrane protease  29.97 
 
 
598 aa  136  9.999999999999999e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.896096  normal  0.810156 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1942  peptidase M50  31.02 
 
 
432 aa  134  3.9999999999999996e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.718786 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0503  peptidase M50  35.52 
 
 
443 aa  125  3e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1487  hypothetical protein  38.3 
 
 
441 aa  124  5e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000349158  normal  0.0156065 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1215  peptidase M50  30.4 
 
 
430 aa  114  5e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.285104  normal  0.0156035 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0964  peptidase M50  31.84 
 
 
459 aa  109  1e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0314  peptidase M50  27.86 
 
 
512 aa  101  4e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2160  peptidase M50  27.66 
 
 
362 aa  82.4  0.00000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.000514306 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1066  peptidase M50  24.9 
 
 
364 aa  73.2  0.00000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.754644  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0481  putative membrane-associated zinc metalloprotease  29.69 
 
 
355 aa  72.4  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0864  peptidase M50  30.15 
 
 
380 aa  68.2  0.0000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0845  peptidase M50  30.96 
 
 
418 aa  67.8  0.0000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.450162  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0370  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  27.27 
 
 
345 aa  66.6  0.000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_314  membrane-associated zinc metalloprotease  24.2 
 
 
345 aa  65.5  0.000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1705  membrane-associated zinc metalloprotease  26.89 
 
 
353 aa  65.1  0.000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1696  peptidase M50  30.57 
 
 
509 aa  64.7  0.000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.156328 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2238  peptidase M50  32.49 
 
 
502 aa  63.9  0.000000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.577346  normal  0.574396 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0618  peptidase M50  30.96 
 
 
502 aa  62.4  0.00000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0352  peptidase M50  25.36 
 
 
345 aa  62.4  0.00000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0107  peptidase M50  23.43 
 
 
398 aa  61.2  0.00000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000498394 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1169  peptidase M50  29.91 
 
 
375 aa  58.5  0.0000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0616  putative membrane-associated zinc metalloprotease  32.61 
 
 
339 aa  58.9  0.0000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0263  zinc metallopeptidase RseP  27.66 
 
 
450 aa  57.8  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0154737  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0245  zinc metallopeptidase RseP  27.66 
 
 
450 aa  57.8  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.249878 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0261  zinc metallopeptidase RseP  27.66 
 
 
450 aa  57.8  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.522145 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0248  zinc metallopeptidase RseP  27.66 
 
 
450 aa  57.8  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1257  peptidase RseP  28.24 
 
 
355 aa  57.8  0.0000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000258691  hitchhiker  0.00178972 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0245  zinc metallopeptidase RseP  27.23 
 
 
450 aa  57.8  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00582579  normal  0.54526 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2914  membrane-associated zinc metalloprotease  29.61 
 
 
354 aa  56.6  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.123834 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0222  peptidase M50  42.11 
 
 
394 aa  56.6  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0717  peptidase M50  29.18 
 
 
497 aa  57  0.000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0570  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  24.38 
 
 
451 aa  55.5  0.000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0114456  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1589  membrane-associated zinc metalloprotease  29.89 
 
 
375 aa  55.5  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0178  zinc metallopeptidase RseP  27.06 
 
 
450 aa  54.7  0.000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000111428  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0180  zinc metallopeptidase RseP  27.06 
 
 
450 aa  54.7  0.000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000271457  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0169  zinc metallopeptidase RseP  26.39 
 
 
450 aa  53.9  0.000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000438283  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2117  putative membrane-associated zinc metalloprotease  28.49 
 
 
354 aa  53.9  0.000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00174  zinc metallopeptidase  26.61 
 
 
450 aa  53.5  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0881068  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3427  membrane-associated zinc metalloprotease  26.61 
 
 
450 aa  53.5  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000034207  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1011  peptidase M50  36.78 
 
 
404 aa  53.5  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0186  zinc metallopeptidase RseP  26.61 
 
 
450 aa  53.5  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000411751  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1856  peptidase RseP  24.59 
 
 
454 aa  53.9  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1506  peptidase M50  28.57 
 
 
375 aa  53.5  0.00001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2749  membrane-associated zinc metalloprotease  27.57 
 
 
354 aa  53.1  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1490  membrane-associated zinc metalloprotease  23.74 
 
 
453 aa  53.1  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1380  peptidase M50  25.64 
 
 
388 aa  53.5  0.00001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.338907  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0587  membrane-associated zinc metalloprotease  28.25 
 
 
347 aa  53.1  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00173  hypothetical protein  26.61 
 
 
450 aa  53.5  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.131717  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3484  zinc metallopeptidase RseP  26.61 
 
 
450 aa  53.1  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00175231  normal  0.0731606 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0187  zinc metallopeptidase RseP  26.94 
 
 
450 aa  53.1  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000756829  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1166  membrane-associated zinc metalloprotease  26.67 
 
 
454 aa  53.1  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.351032  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1665  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  27.68 
 
 
335 aa  52.8  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3134  peptidase M50  50.88 
 
 
386 aa  52  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1782  membrane-associated zinc metalloprotease  30.6 
 
 
377 aa  52  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.5938 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0664  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  25.61 
 
 
455 aa  51.6  0.00004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.399038  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1174  peptidase M50  28.38 
 
 
375 aa  52  0.00004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1530  peptidase RseP  25.38 
 
 
457 aa  51.6  0.00005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00980857 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1492  membrane-associated zinc metalloprotease  29.33 
 
 
354 aa  51.6  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00685355 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4510  putative Zinc metalloprotease  25.11 
 
 
383 aa  51.2  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.229371  normal  0.52884 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1405  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  29.13 
 
 
345 aa  50.8  0.00008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1387  peptidase RseP  25.98 
 
 
379 aa  50.8  0.00008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0493232  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17140  putative membrane-associated zinc metalloprotease  24.61 
 
 
450 aa  50.8  0.00008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1731  peptidase M50  48.98 
 
 
366 aa  50.4  0.00009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1914  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  28.44 
 
 
355 aa  50.4  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1709  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  24.62 
 
 
457 aa  50.4  0.0001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.550772  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1969  putative membrane-associated zinc metalloprotease  29.83 
 
 
347 aa  50.1  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0700  peptidase M50  35.64 
 
 
370 aa  50.1  0.0001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0781  peptidase M50  28.12 
 
 
375 aa  50.1  0.0001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.605878  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2488  peptidase M50  36.49 
 
 
383 aa  48.9  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2308  peptidase M50  37.66 
 
 
385 aa  49.3  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1797  putative membrane-associated zinc metalloprotease  23.35 
 
 
479 aa  49.3  0.0002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.88903  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1947  putative membrane-associated zinc metalloprotease  26.52 
 
 
335 aa  48.9  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3158  zinc metallopeptidase RseP  25.61 
 
 
451 aa  48.5  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00293978  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1844  hypothetical protein  22.49 
 
 
452 aa  48.5  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000001193  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1490  RIP metalloprotease RseP  25.59 
 
 
450 aa  48.5  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2535  peptidase M50  52 
 
 
373 aa  48.5  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.180251  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1161  putative membrane-associated zinc metalloprotease  32.95 
 
 
347 aa  48.5  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.472937  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1552  CBS domain-containing protein  36.9 
 
 
378 aa  47.8  0.0006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.651546  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0534  peptidase M50  25.97 
 
 
388 aa  47.4  0.0007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000573099  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2040  membrane-associated zinc metalloprotease  33.33 
 
 
417 aa  47.4  0.0007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1786  membrane-associated zinc metalloprotease  24.59 
 
 
337 aa  47.4  0.0008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.250325  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0774  M50 family metallopeptidase  48 
 
 
370 aa  46.6  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2821  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  23.9 
 
 
383 aa  47  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.370481  normal  0.544468 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2590  peptidase RseP  23.08 
 
 
466 aa  46.6  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0359861  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2701  peptidase RseP  20.49 
 
 
456 aa  47  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000971838  hitchhiker  0.00353487 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1785  putative membrane-associated zinc metalloprotease  24.24 
 
 
367 aa  46.6  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3998  putative membrane-associated zinc metalloprotease  27.05 
 
 
441 aa  47  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.434108 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0714  zinc metallopeptidase RseP  26.32 
 
 
450 aa  47.4  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000864253  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0613  peptidase M50  67.57 
 
 
380 aa  47  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.750705  normal  0.0786713 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3176  membrane-associated zinc metalloprotease  35.63 
 
 
444 aa  47  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.836726 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3157  peptidase M50  37.84 
 
 
382 aa  46.6  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_675  protease  35.29 
 
 
380 aa  46.6  0.001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000159772  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>