More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_675 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET0769  protease family protein  98.42 
 
 		 380 aa  754    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000172815  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_675  protease  100 
 
 		 380 aa  764    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000159772  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0695  peptidase M50  82.63 
 
 		 379 aa  616  1e-175  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000836286  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0222  peptidase M50  41 
 
 		 394 aa  286  2.9999999999999996e-76  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1011  peptidase M50  37.88 
 
 		 404 aa  271  2e-71  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2488  peptidase M50  38.96 
 
 		 383 aa  258  1e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1368  peptidase M50  38.54 
 
 		 395 aa  248  2e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00624726  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0774  M50 family metallopeptidase  35.42 
 
 		 370 aa  239  8e-62  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1291  peptidase M50  36.41 
 
 		 366 aa  231  1e-59  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00117198  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1747  peptidase M50  32.43 
 
 		 370 aa  228  1e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.951218  normal  0.0691878 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3191  peptidase M50  37.14 
 
 		 375 aa  228  2e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00586872 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0700  peptidase M50  35.39 
 
 		 370 aa  228  2e-58  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3648  peptidase M50  36.15 
 
 		 381 aa  224  2e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0203123 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3400  peptidase M50  35.96 
 
 		 381 aa  224  3e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1872  peptidase M50  35.37 
 
 		 373 aa  223  4e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_680  metallopeptidase, M50 family  34.24 
 
 		 371 aa  219  7e-56  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0373838  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11470  Zn-dependent protease  36.66 
 
 		 388 aa  218  1e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.844041 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4785  peptidase M50  37.53 
 
 		 373 aa  218  2e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.384856  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1797  peptidase M50  33.68 
 
 		 397 aa  214  9.999999999999999e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1337  peptidase M50  35.99 
 
 		 412 aa  214  2.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0978  hypothetical protein  34.4 
 
 		 364 aa  211  3e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3381  peptidase M50  33.68 
 
 		 396 aa  209  6e-53  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.000039902  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0155  peptidase M50  37.1 
 
 		 392 aa  209  7e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0318  CBS domain-containing protein  34.79 
 
 		 370 aa  209  8e-53  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.147887  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0259  peptidase M50  35.71 
 
 		 374 aa  207  3e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5036  peptidase M50  33.16 
 
 		 413 aa  203  4e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.206475 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0947  peptidase M50  33.42 
 
 		 374 aa  201  3e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0920  peptidase M50  33.42 
 
 		 374 aa  200  3e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1032  peptidase M50  33.33 
 
 		 395 aa  198  1.0000000000000001e-49  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0615226 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2181  hypothetical protein  34.11 
 
 		 403 aa  195  9e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.392153 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0613  peptidase M50  31.78 
 
 		 377 aa  191  2e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0236174 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1552  CBS domain-containing protein  32.74 
 
 		 378 aa  191  2e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.651546  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1412  peptidase M50  35.19 
 
 		 383 aa  191  2e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.742384  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2627  peptidase M50  35.32 
 
 		 405 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1410  peptidase M50  34.32 
 
 		 373 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.226741  normal  0.248277 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12644  hypothetical protein  32.73 
 
 		 393 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1483  peptidase M50  32.15 
 
 		 417 aa  183  5.0000000000000004e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.511598  normal  0.569675 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1457  peptidase M50  32.15 
 
 		 417 aa  183  5.0000000000000004e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1508  peptidase M50  32.81 
 
 		 412 aa  182  8.000000000000001e-45  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0289  peptidase M50  31.57 
 
 		 393 aa  181  1e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2355  peptidase M50  34.32 
 
 		 396 aa  180  2.9999999999999997e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0704943  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3922  peptidase M50  30.45 
 
 		 385 aa  179  1e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.558191 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0400  CBS domain-containing protein  32.32 
 
 		 378 aa  172  5.999999999999999e-42  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0735736  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0149  CBS domain containing protein  30.85 
 
 		 377 aa  171  1e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0113637 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0613  peptidase M50  31.61 
 
 		 361 aa  171  2e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.190222  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4494  peptidase M50  34.17 
 
 		 381 aa  169  6e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2601  peptidase M50  32.63 
 
 		 394 aa  169  7e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.603215  normal  0.812434 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2136  peptidase M50  30.14 
 
 		 415 aa  168  2e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.821665  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1731  peptidase M50  31.83 
 
 		 366 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1629  hypothetical protein  32.42 
 
 		 431 aa  162  1e-38  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2272  CBS domain-containing protein  31.22 
 
 		 384 aa  160  2e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.29511 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0734  hypothetical protein  32.96 
 
 		 416 aa  161  2e-38  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.168601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05401  Zn-dependent protease  32.58 
 
 		 413 aa  161  2e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4923  peptidase M50  32.71 
 
 		 373 aa  159  8e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.465017 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2535  peptidase M50  33.6 
 
 		 373 aa  158  1e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.180251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3134  peptidase M50  29.58 
 
 		 386 aa  159  1e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3626  peptidase M50  29.69 
 
 		 368 aa  157  3e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.721542 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3165  peptidase M50  30.77 
 
 		 376 aa  156  6e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5283  peptidase M50  31.8 
 
 		 390 aa  154  2e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3672  peptidase M50  30.91 
 
 		 375 aa  152  1e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1185  peptidase M50  30.73 
 
 		 338 aa  150  5e-35  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2201  peptidase M50  30.63 
 
 		 375 aa  147  3e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0832  peptidase M50  32.27 
 
 		 370 aa  147  3e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1988  peptidase M50  31.22 
 
 		 373 aa  146  6e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.319732 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0613  peptidase M50  35.68 
 
 		 380 aa  145  8.000000000000001e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.750705  normal  0.0786713 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0170  CBS domain-containing protein  31.44 
 
 		 343 aa  144  2e-33  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.356486  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0540  peptidase M50  30.32 
 
 		 364 aa  145  2e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22910  Zn-dependent protease  36.84 
 
 		 244 aa  143  4e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.511612  normal  0.351338 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07871  Zn-dependent protease  31.38 
 
 		 422 aa  142  8e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0406  peptidase M50  31.12 
 
 		 380 aa  142  9.999999999999999e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.445518 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1449  peptidase M50  30.08 
 
 		 337 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0709676 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0459  peptidase M50  30.65 
 
 		 342 aa  140  3e-32  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0769405  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3750  peptidase M50  28.72 
 
 		 372 aa  136  5e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.69281  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0458  peptidase M50  30.56 
 
 		 377 aa  130  5.0000000000000004e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0639554  normal  0.134701 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05641  Zn-dependent protease  24.93 
 
 		 407 aa  127  3e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.394997  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05931  Zn-dependent proteases  29.48 
 
 		 405 aa  127  3e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.111882  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0116  peptidase M50  28.76 
 
 		 365 aa  126  7e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.345861 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2415  peptidase M50  28.91 
 
 		 424 aa  124  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1843  peptidase M50  36.73 
 
 		 376 aa  124  2e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.616528  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5902  Zn-dependent protease-like protein  34.55 
 
 		 362 aa  124  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0267336  normal  0.154235 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2620  hypothetical protein  34.04 
 
 		 239 aa  124  3e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00161745  normal  0.443629 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05941  Zn-dependent proteases  25.48 
 
 		 407 aa  124  3e-27  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1868  hypothetical protein  28.77 
 
 		 396 aa  123  5e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.180278  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22130  Zn-dependent protease  39.02 
 
 		 390 aa  122  7e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.944872  normal  0.942698 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1434  CBS domain-containing protein  30.73 
 
 		 336 aa  122  7e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1815  hypothetical protein  30.31 
 
 		 383 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.434017  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2223  peptidase M50  30.6 
 
 		 376 aa  120  3.9999999999999996e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4475  peptidase M50  27.01 
 
 		 400 aa  119  7.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.580173  normal  0.145803 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3157  peptidase M50  29.04 
 
 		 382 aa  119  9.999999999999999e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1497  peptidase M50  28.57 
 
 		 372 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.120961  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1479  peptidase M50  36.67 
 
 		 384 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0658829  normal  0.564629 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5311  peptidase M50  35.15 
 
 		 301 aa  110  3e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0783881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2308  peptidase M50  28.28 
 
 		 385 aa  110  3e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0694  peptidase M50  28.73 
 
 		 366 aa  110  5e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.232631 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2237  peptidase M50  34.66 
 
 		 359 aa  108  1e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.949585  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06021  Zn-dependent protease  26.24 
 
 		 407 aa  107  3e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0538  hypothetical protein  24.11 
 
 		 407 aa  106  5e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.428838  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2305  peptidase M50  32.68 
 
 		 362 aa  106  6e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00177185  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1181  peptidase M50  30.45 
 
 		 379 aa  104  3e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.22871  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2637  peptidase M50  27.45 
 
 		 378 aa  104  3e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.599853  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>