More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1552 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_1552  CBS domain-containing protein  100 
 
 
378 aa  751    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.651546  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2272  CBS domain-containing protein  66.93 
 
 
384 aa  522  1e-147  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.29511 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0400  CBS domain-containing protein  61.27 
 
 
378 aa  461  1e-129  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0735736  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0613  peptidase M50  58.89 
 
 
377 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0236174 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0149  CBS domain containing protein  58.62 
 
 
377 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0113637 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0289  peptidase M50  40.16 
 
 
393 aa  274  2.0000000000000002e-72  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1032  peptidase M50  39.78 
 
 
395 aa  268  8.999999999999999e-71  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0615226 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2136  peptidase M50  39.05 
 
 
415 aa  264  2e-69  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.821665  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0978  hypothetical protein  39.27 
 
 
364 aa  263  3e-69  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2601  peptidase M50  41.19 
 
 
394 aa  260  4e-68  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.603215  normal  0.812434 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1508  peptidase M50  39.41 
 
 
412 aa  256  6e-67  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0318  CBS domain-containing protein  37.7 
 
 
370 aa  243  5e-63  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.147887  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0406  peptidase M50  36.84 
 
 
380 aa  230  3e-59  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.445518 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1731  peptidase M50  38.85 
 
 
366 aa  223  3e-57  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1185  peptidase M50  35.56 
 
 
338 aa  206  7e-52  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1449  peptidase M50  34.76 
 
 
337 aa  202  6e-51  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0709676 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3134  peptidase M50  37.14 
 
 
386 aa  200  3.9999999999999996e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0459  peptidase M50  34.76 
 
 
342 aa  199  7e-50  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0769405  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3672  peptidase M50  34.65 
 
 
375 aa  196  7e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2535  peptidase M50  37.67 
 
 
373 aa  192  7e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.180251  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_675  protease  32.74 
 
 
380 aa  191  2e-47  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000159772  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0769  protease family protein  32.56 
 
 
380 aa  190  2.9999999999999997e-47  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000172815  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3165  peptidase M50  34.72 
 
 
376 aa  188  1e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0613  peptidase M50  36.56 
 
 
380 aa  187  2e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.750705  normal  0.0786713 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1434  CBS domain-containing protein  33.69 
 
 
336 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3626  peptidase M50  33.95 
 
 
368 aa  181  1e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.721542 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0832  peptidase M50  31.81 
 
 
370 aa  176  7e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0695  peptidase M50  31.36 
 
 
379 aa  171  2e-41  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000836286  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3648  peptidase M50  31.97 
 
 
381 aa  168  2e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0203123 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3750  peptidase M50  33.07 
 
 
372 aa  166  8e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.69281  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2488  peptidase M50  30.05 
 
 
383 aa  164  2.0000000000000002e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0170  CBS domain-containing protein  30.85 
 
 
343 aa  162  9e-39  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.356486  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4923  peptidase M50  31.17 
 
 
373 aa  161  2e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.465017 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1747  peptidase M50  28.31 
 
 
370 aa  157  2e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.951218  normal  0.0691878 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0540  peptidase M50  31.62 
 
 
364 aa  152  1e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3400  peptidase M50  29.92 
 
 
381 aa  150  5e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2201  peptidase M50  30.13 
 
 
375 aa  149  6e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0222  peptidase M50  31.51 
 
 
394 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4785  peptidase M50  30.49 
 
 
373 aa  147  4.0000000000000006e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.384856  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1497  peptidase M50  37.62 
 
 
372 aa  145  1e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.120961  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11470  Zn-dependent protease  32.26 
 
 
388 aa  144  2e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.844041 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0458  peptidase M50  31.18 
 
 
377 aa  145  2e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0639554  normal  0.134701 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2620  hypothetical protein  36.65 
 
 
239 aa  144  3e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00161745  normal  0.443629 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0694  peptidase M50  35 
 
 
366 aa  142  8e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.232631 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1011  peptidase M50  30.98 
 
 
404 aa  142  9.999999999999999e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3157  peptidase M50  29.95 
 
 
382 aa  141  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2308  peptidase M50  30.91 
 
 
385 aa  138  1e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1988  peptidase M50  29.79 
 
 
373 aa  139  1e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.319732 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1872  peptidase M50  29.08 
 
 
373 aa  138  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1410  peptidase M50  31.68 
 
 
373 aa  136  5e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.226741  normal  0.248277 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1291  peptidase M50  30.38 
 
 
366 aa  135  1.9999999999999998e-30  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00117198  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1337  peptidase M50  27.3 
 
 
412 aa  134  3e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0774  M50 family metallopeptidase  29.29 
 
 
370 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3191  peptidase M50  29.08 
 
 
375 aa  131  2.0000000000000002e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00586872 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2355  peptidase M50  33.01 
 
 
396 aa  131  3e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0704943  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0700  peptidase M50  28.21 
 
 
370 aa  127  3e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2627  peptidase M50  32.09 
 
 
405 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1368  peptidase M50  25.85 
 
 
395 aa  126  7e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00624726  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0920  peptidase M50  26.84 
 
 
374 aa  123  4e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0947  peptidase M50  26.84 
 
 
374 aa  123  6e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_680  metallopeptidase, M50 family  36.49 
 
 
371 aa  122  7e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0373838  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0116  peptidase M50  27.62 
 
 
365 aa  122  9.999999999999999e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.345861 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1412  peptidase M50  28.5 
 
 
383 aa  121  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.742384  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5283  peptidase M50  28.07 
 
 
390 aa  121  1.9999999999999998e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0155  peptidase M50  33.76 
 
 
392 aa  120  4.9999999999999996e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1457  peptidase M50  28.05 
 
 
417 aa  119  7.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1483  peptidase M50  28.05 
 
 
417 aa  119  7.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.511598  normal  0.569675 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12644  hypothetical protein  26.72 
 
 
393 aa  117  3e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2181  hypothetical protein  27.51 
 
 
403 aa  116  6.9999999999999995e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.392153 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3922  peptidase M50  27.53 
 
 
385 aa  113  6e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.558191 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1797  peptidase M50  28.53 
 
 
397 aa  112  8.000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0613  peptidase M50  27.15 
 
 
361 aa  111  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.190222  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3381  peptidase M50  26.4 
 
 
396 aa  110  3e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.000039902  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5036  peptidase M50  24.81 
 
 
413 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.206475 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4494  peptidase M50  29.19 
 
 
381 aa  107  4e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0524  peptidase M50  29.45 
 
 
285 aa  104  3e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.311607  hitchhiker  0.00535986 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0259  peptidase M50  25.93 
 
 
374 aa  103  4e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1843  peptidase M50  33.07 
 
 
376 aa  103  4e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.616528  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1815  hypothetical protein  34.19 
 
 
383 aa  103  7e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.434017  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1456  peptidase M50  31.17 
 
 
292 aa  101  2e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5311  peptidase M50  33.33 
 
 
301 aa  100  5e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0783881  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2539  peptidase M50  38.04 
 
 
293 aa  95.5  1e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0160669  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1629  hypothetical protein  27.35 
 
 
431 aa  94.7  2e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1479  peptidase M50  37.17 
 
 
384 aa  92.4  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0658829  normal  0.564629 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0734  hypothetical protein  23.97 
 
 
416 aa  92  2e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.168601  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1302  CBS domain containing protein  39.32 
 
 
769 aa  91.7  2e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4475  peptidase M50  25 
 
 
400 aa  89.7  7e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.580173  normal  0.145803 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5902  Zn-dependent protease-like protein  32.94 
 
 
362 aa  88.6  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0267336  normal  0.154235 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3297  peptidase M50  33.75 
 
 
258 aa  89  1e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.153314  normal  0.569986 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1465  Cl- channel, voltage-gated family protein  35.21 
 
 
580 aa  89.4  1e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1617  putative protease  30.33 
 
 
286 aa  87.8  3e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2637  peptidase M50  26.29 
 
 
378 aa  87.4  4e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.599853  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3591  Chloride channel core  36.51 
 
 
875 aa  86.3  8e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0274826 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2237  peptidase M50  29.95 
 
 
359 aa  86.3  9e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.949585  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3428  Polynucleotide adenylyltransferase region  37.84 
 
 
873 aa  85.9  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000799776  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22910  Zn-dependent protease  33.72 
 
 
244 aa  84.3  0.000000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.511612  normal  0.351338 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2305  peptidase M50  25.85 
 
 
362 aa  84  0.000000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00177185  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3329  peptidase M50  33.16 
 
 
290 aa  83.2  0.000000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.014503  normal  0.780198 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2087  Polynucleotide adenylyltransferase region  39.09 
 
 
877 aa  82.8  0.000000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.625204 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05641  Zn-dependent protease  22.48 
 
 
407 aa  82  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.394997  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>