237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2308 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_3157  peptidase M50  94.76 
 
 		 382 aa  676    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2308  peptidase M50  100 
 
 		 385 aa  750    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3626  peptidase M50  39.04 
 
 		 368 aa  228  2e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.721542 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1988  peptidase M50  39.72 
 
 		 373 aa  217  2.9999999999999998e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.319732 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3750  peptidase M50  38.74 
 
 		 372 aa  216  7e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.69281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4923  peptidase M50  37.95 
 
 		 373 aa  213  5.999999999999999e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.465017 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2201  peptidase M50  37.64 
 
 		 375 aa  203  4e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3165  peptidase M50  38.68 
 
 		 376 aa  200  3e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0540  peptidase M50  34.33 
 
 		 364 aa  196  6e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0832  peptidase M50  37.17 
 
 		 370 aa  194  3e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0694  peptidase M50  41.14 
 
 		 366 aa  194  3e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.232631 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1497  peptidase M50  40.49 
 
 		 372 aa  188  1e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.120961  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0459  peptidase M50  31.99 
 
 		 342 aa  176  5e-43  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0769405  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1185  peptidase M50  32 
 
 		 338 aa  176  5e-43  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1449  peptidase M50  31.23 
 
 		 337 aa  171  2e-41  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0709676 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0458  peptidase M50  36.07 
 
 		 377 aa  170  4e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0639554  normal  0.134701 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0978  hypothetical protein  30.65 
 
 		 364 aa  170  5e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2272  CBS domain-containing protein  32.9 
 
 		 384 aa  168  2e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.29511 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0116  peptidase M50  31.91 
 
 		 365 aa  162  1e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.345861 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0170  CBS domain-containing protein  31.92 
 
 		 343 aa  161  2e-38  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.356486  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1552  CBS domain-containing protein  30.91 
 
 		 378 aa  156  6e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.651546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1434  CBS domain-containing protein  32.15 
 
 		 336 aa  153  4e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1731  peptidase M50  30.91 
 
 		 366 aa  149  9e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0149  CBS domain containing protein  31.15 
 
 		 377 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0113637 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0400  CBS domain-containing protein  31.75 
 
 		 378 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0735736  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0613  peptidase M50  31.23 
 
 		 377 aa  146  7.0000000000000006e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0236174 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0289  peptidase M50  30.12 
 
 		 393 aa  142  7e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0318  CBS domain-containing protein  28.16 
 
 		 370 aa  139  1e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.147887  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3297  peptidase M50  37.2 
 
 		 258 aa  137  4e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.153314  normal  0.569986 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0406  peptidase M50  32.8 
 
 		 380 aa  133  6e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.445518 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1032  peptidase M50  29.27 
 
 		 395 aa  132  9e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0615226 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3134  peptidase M50  29.67 
 
 		 386 aa  130  3e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2601  peptidase M50  30.08 
 
 		 394 aa  127  3e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.603215  normal  0.812434 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2136  peptidase M50  29.07 
 
 		 415 aa  127  3e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.821665  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_675  protease  28.28 
 
 		 380 aa  127  4.0000000000000003e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000159772  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0769  protease family protein  28.03 
 
 		 380 aa  122  9.999999999999999e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000172815  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1508  peptidase M50  28.33 
 
 		 412 aa  117  3e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2535  peptidase M50  31.73 
 
 		 373 aa  115  1.0000000000000001e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.180251  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1291  peptidase M50  29.22 
 
 		 366 aa  113  4.0000000000000004e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00117198  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5283  peptidase M50  30.5 
 
 		 390 aa  112  1.0000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0259  peptidase M50  29.87 
 
 		 374 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0695  peptidase M50  29.21 
 
 		 379 aa  110  3e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000836286  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0222  peptidase M50  30.86 
 
 		 394 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0613  peptidase M50  31.83 
 
 		 380 aa  109  7.000000000000001e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.750705  normal  0.0786713 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1011  peptidase M50  30.12 
 
 		 404 aa  107  3e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2620  hypothetical protein  31.82 
 
 		 239 aa  107  4e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00161745  normal  0.443629 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5311  peptidase M50  36.06 
 
 		 301 aa  105  1e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0783881  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3672  peptidase M50  30.79 
 
 		 375 aa  101  2e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0524  peptidase M50  35.42 
 
 		 285 aa  98.6  1e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.311607  hitchhiker  0.00535986 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0947  peptidase M50  28.86 
 
 		 374 aa  98.2  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0920  peptidase M50  28.86 
 
 		 374 aa  98.2  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2488  peptidase M50  27.75 
 
 		 383 aa  97.1  5e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0613  peptidase M50  26.53 
 
 		 361 aa  96.3  8e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.190222  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3329  peptidase M50  35.32 
 
 		 290 aa  95.1  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.014503  normal  0.780198 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1818  peptidase M50  28.94 
 
 		 302 aa  94.7  2e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1617  putative protease  34.98 
 
 		 286 aa  94.7  2e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0155  peptidase M50  30.82 
 
 		 392 aa  95.1  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3648  peptidase M50  28.18 
 
 		 381 aa  94  4e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0203123 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1747  peptidase M50  28.3 
 
 		 370 aa  93.6  5e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.951218  normal  0.0691878 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1843  peptidase M50  30.08 
 
 		 376 aa  93.6  6e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.616528  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1872  peptidase M50  26.28 
 
 		 373 aa  93.2  7e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0700  peptidase M50  33.94 
 
 		 370 aa  92.8  9e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11470  Zn-dependent protease  32.92 
 
 		 388 aa  92.4  1e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.844041 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1797  peptidase M50  30.14 
 
 		 397 aa  92.4  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2539  peptidase M50  37.04 
 
 		 293 aa  92.4  1e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0160669  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0774  M50 family metallopeptidase  34.91 
 
 		 370 aa  91.7  2e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3191  peptidase M50  28.57 
 
 		 375 aa  91.3  3e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00586872 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2223  peptidase M50  34.95 
 
 		 376 aa  89.7  8e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5036  peptidase M50  29.37 
 
 		 413 aa  88.2  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.206475 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1368  peptidase M50  25.97 
 
 		 395 aa  88.2  2e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00624726  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4342  peptidase M50  32.04 
 
 		 291 aa  88.2  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_680  metallopeptidase, M50 family  32.13 
 
 		 371 aa  88.6  2e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0373838  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33078  predicted protein  33.94 
 
 		 315 aa  87.4  3e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.638325  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2181  hypothetical protein  28.61 
 
 		 403 aa  87  5e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.392153 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5902  Zn-dependent protease-like protein  34.48 
 
 		 362 aa  86.7  6e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0267336  normal  0.154235 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2305  peptidase M50  35.86 
 
 		 362 aa  86.3  8e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00177185  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0549  peptidase M50  31.74 
 
 		 293 aa  86.3  8e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00818515  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3381  peptidase M50  28.78 
 
 		 396 aa  85.9  0.000000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.000039902  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4785  peptidase M50  27.56 
 
 		 373 aa  85.1  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.384856  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1337  peptidase M50  28.71 
 
 		 412 aa  85.5  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1456  peptidase M50  26.92 
 
 		 292 aa  84.3  0.000000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4475  peptidase M50  32.23 
 
 		 400 aa  82.8  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.580173  normal  0.145803 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3922  peptidase M50  26.74 
 
 		 385 aa  81.3  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.558191 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2124  peptidase M50  25.9 
 
 		 284 aa  81.3  0.00000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000917211  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4494  peptidase M50  25.86 
 
 		 381 aa  80.5  0.00000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3400  peptidase M50  26.26 
 
 		 381 aa  80.5  0.00000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1410  peptidase M50  29.56 
 
 		 373 aa  80.1  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.226741  normal  0.248277 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4180  stage IV sporulation protein FB  28.51 
 
 		 286 aa  79  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0869981  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0734  hypothetical protein  27.27 
 
 		 416 aa  79.3  0.0000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.168601  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4526  stage IV sporulation protein FB  28.51 
 
 		 286 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.870935 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1479  peptidase M50  31.46 
 
 		 384 aa  79  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0658829  normal  0.564629 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4191  stage IV sporulation protein FB  28.05 
 
 		 286 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4580  stage IV sporulation protein FB  28.51 
 
 		 286 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000567867  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4538  stage IV sporulation protein FB  28.51 
 
 		 286 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.214848  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22130  Zn-dependent protease  33.49 
 
 		 390 aa  77.8  0.0000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.944872  normal  0.942698 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1629  hypothetical protein  28.53 
 
 		 431 aa  77.8  0.0000000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4565  stage IV sporulation protein FB  29.09 
 
 		 286 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000384784  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4344  stage IV sporulation protein FB  28.05 
 
 		 286 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1815  hypothetical protein  33.15 
 
 		 383 aa  77.4  0.0000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.434017  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4678  stage IV sporulation protein FB  28.05 
 
 		 286 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0277771  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>