196 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2223 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_2223  peptidase M50  100 
 
 
376 aa  699    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22130  Zn-dependent protease  62.33 
 
 
390 aa  420  1e-116  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.944872  normal  0.942698 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2415  peptidase M50  37.31 
 
 
424 aa  186  4e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2977  peptidase M50  42.66 
 
 
378 aa  186  5e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00144349  hitchhiker  0.00562837 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1815  hypothetical protein  37.3 
 
 
383 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.434017  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1843  peptidase M50  37.4 
 
 
376 aa  171  2e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.616528  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5902  Zn-dependent protease-like protein  36.9 
 
 
362 aa  162  6e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0267336  normal  0.154235 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1914  peptidase M50  31.98 
 
 
387 aa  150  4e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000446293 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2637  peptidase M50  33.78 
 
 
378 aa  147  3e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.599853  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2305  peptidase M50  35.91 
 
 
362 aa  146  7.0000000000000006e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00177185  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4885  peptidase M50  34.36 
 
 
397 aa  142  7e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.333233 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0259  peptidase M50  30.96 
 
 
374 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1479  peptidase M50  36.69 
 
 
384 aa  132  7.999999999999999e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0658829  normal  0.564629 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1483  peptidase M50  34.44 
 
 
365 aa  132  1.0000000000000001e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1181  peptidase M50  32.96 
 
 
379 aa  126  7e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.22871  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1872  peptidase M50  42.69 
 
 
373 aa  125  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1291  peptidase M50  26.4 
 
 
366 aa  125  1e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00117198  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3191  peptidase M50  37.61 
 
 
375 aa  124  2e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00586872 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5036  peptidase M50  39.22 
 
 
413 aa  124  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.206475 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4475  peptidase M50  30.03 
 
 
400 aa  124  3e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.580173  normal  0.145803 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_675  protease  29.32 
 
 
380 aa  124  3e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000159772  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0769  protease family protein  29.06 
 
 
380 aa  123  6e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000172815  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0695  peptidase M50  29.84 
 
 
379 aa  122  8e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000836286  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2488  peptidase M50  29.77 
 
 
383 aa  122  9.999999999999999e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0947  peptidase M50  30.73 
 
 
374 aa  122  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0920  peptidase M50  30.73 
 
 
374 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1629  hypothetical protein  29.72 
 
 
431 aa  121  1.9999999999999998e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0222  peptidase M50  34.64 
 
 
394 aa  120  4.9999999999999996e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2633  peptidase M50  31.54 
 
 
405 aa  118  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.962625  normal  0.303399 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20920  Zn-dependent protease  40.93 
 
 
380 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.961375 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2244  peptidase M50  41.7 
 
 
373 aa  117  3.9999999999999997e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.830349  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11840  Zn-dependent protease  35.58 
 
 
375 aa  116  6.9999999999999995e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0392218  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1337  peptidase M50  43.18 
 
 
412 aa  115  8.999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0978  hypothetical protein  28.11 
 
 
364 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1368  peptidase M50  39.06 
 
 
395 aa  115  1.0000000000000001e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00624726  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1032  peptidase M50  39.73 
 
 
395 aa  115  1.0000000000000001e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0615226 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1797  peptidase M50  30.56 
 
 
397 aa  113  4.0000000000000004e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4785  peptidase M50  40.23 
 
 
373 aa  113  7.000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.384856  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1457  peptidase M50  31.06 
 
 
417 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3922  peptidase M50  29.95 
 
 
385 aa  112  1.0000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.558191 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1483  peptidase M50  31.06 
 
 
417 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.511598  normal  0.569675 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1410  peptidase M50  37.39 
 
 
373 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.226741  normal  0.248277 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0734  hypothetical protein  29.29 
 
 
416 aa  111  2.0000000000000002e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.168601  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2237  peptidase M50  35.28 
 
 
359 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.949585  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13940  Zn-dependent protease  33.22 
 
 
379 aa  110  4.0000000000000004e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.909069 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2136  peptidase M50  34.54 
 
 
415 aa  109  8.000000000000001e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.821665  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3381  peptidase M50  29.87 
 
 
396 aa  107  3e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.000039902  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2171  peptidase M50  33.51 
 
 
403 aa  107  5e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.121465  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0774  M50 family metallopeptidase  28.93 
 
 
370 aa  106  8e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3648  peptidase M50  32.18 
 
 
381 aa  105  1e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0203123 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2181  hypothetical protein  30.83 
 
 
403 aa  104  2e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.392153 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5283  peptidase M50  38.4 
 
 
390 aa  104  3e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0700  peptidase M50  28.77 
 
 
370 aa  102  1e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0613  peptidase M50  29.76 
 
 
377 aa  101  2e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0236174 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1508  peptidase M50  45.24 
 
 
412 aa  101  3e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_680  metallopeptidase, M50 family  26.23 
 
 
371 aa  100  5e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0373838  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3400  peptidase M50  31.64 
 
 
381 aa  100  5e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1856  peptidase M50  34.36 
 
 
377 aa  99.4  1e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11470  Zn-dependent protease  33.54 
 
 
388 aa  98.2  2e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.844041 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1731  peptidase M50  28.43 
 
 
366 aa  97.1  4e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2006  peptidase M50  33.42 
 
 
376 aa  95.5  1e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.223407  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2354  peptidase M50  33.06 
 
 
386 aa  95.9  1e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.176917 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05931  Zn-dependent proteases  27.27 
 
 
405 aa  94.7  2e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.111882  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0289  peptidase M50  34.42 
 
 
393 aa  95.1  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0149  CBS domain containing protein  27.91 
 
 
377 aa  94.4  3e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0113637 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1412  peptidase M50  35.03 
 
 
383 aa  94.4  3e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.742384  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1868  hypothetical protein  27.12 
 
 
396 aa  93.2  7e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.180278  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3134  peptidase M50  36.27 
 
 
386 aa  92.8  8e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2535  peptidase M50  37.17 
 
 
373 aa  92  1e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.180251  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22910  Zn-dependent protease  41.88 
 
 
244 aa  92.4  1e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.511612  normal  0.351338 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1747  peptidase M50  32.49 
 
 
370 aa  90.9  3e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.951218  normal  0.0691878 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0613  peptidase M50  34.41 
 
 
380 aa  90.9  3e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.750705  normal  0.0786713 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3672  peptidase M50  27.94 
 
 
375 aa  90.5  4e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0832  peptidase M50  33.51 
 
 
370 aa  90.5  5e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0613  peptidase M50  35.92 
 
 
361 aa  90.1  5e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.190222  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2620  hypothetical protein  31.33 
 
 
239 aa  89.4  9e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00161745  normal  0.443629 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07871  Zn-dependent protease  44.1 
 
 
422 aa  89  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2601  peptidase M50  34.02 
 
 
394 aa  88.2  2e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.603215  normal  0.812434 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3165  peptidase M50  30.73 
 
 
376 aa  87.8  3e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0540  peptidase M50  29.02 
 
 
364 aa  85.5  0.000000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0318  CBS domain-containing protein  25.92 
 
 
370 aa  84.7  0.000000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.147887  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1185  peptidase M50  28.97 
 
 
338 aa  84.3  0.000000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0459  peptidase M50  28.9 
 
 
342 aa  84  0.000000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0769405  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3626  peptidase M50  32.84 
 
 
368 aa  83.6  0.000000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.721542 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0155  peptidase M50  35.75 
 
 
392 aa  83.2  0.000000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0170  CBS domain-containing protein  32.28 
 
 
343 aa  83.2  0.000000000000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.356486  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2201  peptidase M50  28.62 
 
 
375 aa  82.8  0.000000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1449  peptidase M50  30.08 
 
 
337 aa  83.2  0.000000000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0709676 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1199  peptidase M50  29.5 
 
 
369 aa  82.8  0.000000000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0242729  normal  0.16524 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2308  peptidase M50  33.2 
 
 
385 aa  82.4  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1011  peptidase M50  31.31 
 
 
404 aa  81.3  0.00000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3750  peptidase M50  31.5 
 
 
372 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.69281  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0524  peptidase M50  38.19 
 
 
285 aa  81.3  0.00000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.311607  hitchhiker  0.00535986 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2272  CBS domain-containing protein  25.44 
 
 
384 aa  81.3  0.00000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.29511 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3157  peptidase M50  34.84 
 
 
382 aa  80.9  0.00000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05401  Zn-dependent protease  29.02 
 
 
413 aa  80.5  0.00000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0406  peptidase M50  29.18 
 
 
380 aa  79  0.0000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.445518 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3297  peptidase M50  33.33 
 
 
258 aa  78.2  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.153314  normal  0.569986 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1988  peptidase M50  36.91 
 
 
373 aa  77.4  0.0000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.319732 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4494  peptidase M50  32.03 
 
 
381 aa  76.3  0.0000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>