More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_0695 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002936  DET0769  protease family protein  83.42 
 
 
380 aa  644    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000172815  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0695  peptidase M50  100 
 
 
379 aa  756    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000836286  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_675  protease  82.63 
 
 
380 aa  640    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000159772  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0222  peptidase M50  41.71 
 
 
394 aa  282  6.000000000000001e-75  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1011  peptidase M50  38.6 
 
 
404 aa  267  2e-70  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2488  peptidase M50  39.12 
 
 
383 aa  252  1e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0774  M50 family metallopeptidase  36.68 
 
 
370 aa  246  4.9999999999999997e-64  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1368  peptidase M50  38.67 
 
 
395 aa  238  9e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00624726  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0700  peptidase M50  35.9 
 
 
370 aa  235  1.0000000000000001e-60  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3191  peptidase M50  36.53 
 
 
375 aa  229  5e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00586872 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_680  metallopeptidase, M50 family  36.19 
 
 
371 aa  224  1e-57  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0373838  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1747  peptidase M50  31.17 
 
 
370 aa  222  9e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.951218  normal  0.0691878 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1291  peptidase M50  35.29 
 
 
366 aa  221  1.9999999999999999e-56  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00117198  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3648  peptidase M50  33.87 
 
 
381 aa  214  9.999999999999999e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0203123 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1872  peptidase M50  34.21 
 
 
373 aa  212  7.999999999999999e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4785  peptidase M50  35.47 
 
 
373 aa  211  2e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.384856  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0318  CBS domain-containing protein  33.25 
 
 
370 aa  207  3e-52  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.147887  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3400  peptidase M50  32.72 
 
 
381 aa  205  1e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0259  peptidase M50  34.25 
 
 
374 aa  204  3e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1797  peptidase M50  32.97 
 
 
397 aa  203  4e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2181  hypothetical protein  35.6 
 
 
403 aa  203  4e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.392153 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0978  hypothetical protein  33.07 
 
 
364 aa  202  6e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1337  peptidase M50  35.31 
 
 
412 aa  202  7e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0155  peptidase M50  35.68 
 
 
392 aa  202  7e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11470  Zn-dependent protease  34.32 
 
 
388 aa  201  1.9999999999999998e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.844041 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5036  peptidase M50  34.22 
 
 
413 aa  200  3e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.206475 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0947  peptidase M50  33.86 
 
 
374 aa  197  3e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0920  peptidase M50  33.86 
 
 
374 aa  197  3e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1032  peptidase M50  33.51 
 
 
395 aa  195  1e-48  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0615226 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3381  peptidase M50  33.24 
 
 
396 aa  194  3e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.000039902  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0613  peptidase M50  32.3 
 
 
377 aa  192  6e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0236174 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1483  peptidase M50  32.9 
 
 
417 aa  187  3e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.511598  normal  0.569675 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1457  peptidase M50  32.9 
 
 
417 aa  187  3e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1552  CBS domain-containing protein  31.36 
 
 
378 aa  186  7e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.651546  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2627  peptidase M50  35.77 
 
 
405 aa  182  8.000000000000001e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1410  peptidase M50  34.58 
 
 
373 aa  181  1e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.226741  normal  0.248277 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1412  peptidase M50  33.85 
 
 
383 aa  180  4e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.742384  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0613  peptidase M50  32.51 
 
 
361 aa  176  6e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.190222  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12644  hypothetical protein  31.69 
 
 
393 aa  176  7e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0400  CBS domain-containing protein  30.36 
 
 
378 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0735736  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3922  peptidase M50  30.83 
 
 
385 aa  173  3.9999999999999995e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.558191 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0149  CBS domain containing protein  31.62 
 
 
377 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0113637 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0289  peptidase M50  30 
 
 
393 aa  171  2e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4494  peptidase M50  32.78 
 
 
381 aa  169  9e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1629  hypothetical protein  30.85 
 
 
431 aa  167  2.9999999999999998e-40  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2355  peptidase M50  31.98 
 
 
396 aa  166  4e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0704943  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2601  peptidase M50  32.05 
 
 
394 aa  166  5e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.603215  normal  0.812434 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1508  peptidase M50  31.51 
 
 
412 aa  166  5e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1731  peptidase M50  30.93 
 
 
366 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05401  Zn-dependent protease  31.83 
 
 
413 aa  164  2.0000000000000002e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0734  hypothetical protein  31.09 
 
 
416 aa  162  6e-39  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.168601  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2272  CBS domain-containing protein  30.53 
 
 
384 aa  161  1e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.29511 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07871  Zn-dependent protease  32.62 
 
 
422 aa  159  6e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3165  peptidase M50  31.94 
 
 
376 aa  156  6e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2136  peptidase M50  30.1 
 
 
415 aa  155  1e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.821665  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5283  peptidase M50  29.18 
 
 
390 aa  153  5.9999999999999996e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0832  peptidase M50  32.53 
 
 
370 aa  151  2e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1988  peptidase M50  31.79 
 
 
373 aa  149  9e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.319732 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3134  peptidase M50  29.13 
 
 
386 aa  149  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2535  peptidase M50  32.17 
 
 
373 aa  147  3e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.180251  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3626  peptidase M50  29.24 
 
 
368 aa  147  4.0000000000000006e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.721542 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1185  peptidase M50  30.91 
 
 
338 aa  145  1e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3672  peptidase M50  29.24 
 
 
375 aa  139  6e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22910  Zn-dependent protease  36.68 
 
 
244 aa  139  6e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.511612  normal  0.351338 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0540  peptidase M50  30.45 
 
 
364 aa  139  1e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4923  peptidase M50  30.26 
 
 
373 aa  137  4e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.465017 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1449  peptidase M50  29.08 
 
 
337 aa  137  4e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0709676 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0406  peptidase M50  30.41 
 
 
380 aa  136  5e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.445518 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0459  peptidase M50  30.29 
 
 
342 aa  136  7.000000000000001e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0769405  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0170  CBS domain-containing protein  30.62 
 
 
343 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.356486  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2201  peptidase M50  30.05 
 
 
375 aa  133  5e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05931  Zn-dependent proteases  28.77 
 
 
405 aa  131  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.111882  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1868  hypothetical protein  29.71 
 
 
396 aa  130  3e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.180278  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3750  peptidase M50  30.03 
 
 
372 aa  129  9.000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.69281  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0613  peptidase M50  33.87 
 
 
380 aa  128  2.0000000000000002e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.750705  normal  0.0786713 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22130  Zn-dependent protease  28.72 
 
 
390 aa  127  3e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.944872  normal  0.942698 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05641  Zn-dependent protease  24.44 
 
 
407 aa  126  7e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.394997  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2223  peptidase M50  29.84 
 
 
376 aa  125  9e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2415  peptidase M50  27.79 
 
 
424 aa  124  3e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2620  hypothetical protein  33.47 
 
 
239 aa  123  6e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00161745  normal  0.443629 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0458  peptidase M50  30.38 
 
 
377 aa  121  1.9999999999999998e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0639554  normal  0.134701 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05941  Zn-dependent proteases  24.17 
 
 
407 aa  120  3.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1815  hypothetical protein  29.79 
 
 
383 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.434017  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1843  peptidase M50  33.67 
 
 
376 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.616528  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5902  Zn-dependent protease-like protein  35.05 
 
 
362 aa  117  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0267336  normal  0.154235 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0116  peptidase M50  27.03 
 
 
365 aa  115  2.0000000000000002e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.345861 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1434  CBS domain-containing protein  28.26 
 
 
336 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1497  peptidase M50  29.84 
 
 
372 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.120961  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4475  peptidase M50  24.86 
 
 
400 aa  112  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.580173  normal  0.145803 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3157  peptidase M50  28.11 
 
 
382 aa  109  6e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0694  peptidase M50  29.24 
 
 
366 aa  109  6e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.232631 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1479  peptidase M50  26.44 
 
 
384 aa  108  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0658829  normal  0.564629 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5311  peptidase M50  34.48 
 
 
301 aa  107  5e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0783881  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2308  peptidase M50  29.21 
 
 
385 aa  106  6e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0538  hypothetical protein  23.55 
 
 
407 aa  103  4e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.428838  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2237  peptidase M50  34.66 
 
 
359 aa  103  6e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.949585  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4885  peptidase M50  28.05 
 
 
397 aa  103  7e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.333233 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06021  Zn-dependent protease  25.48 
 
 
407 aa  102  9e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2637  peptidase M50  28.91 
 
 
378 aa  100  3e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.599853  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3297  peptidase M50  38.1 
 
 
258 aa  100  4e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.153314  normal  0.569986 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>