More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0149 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_0149  CBS domain containing protein  100 
 
 
377 aa  739    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0113637 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2272  CBS domain-containing protein  59.11 
 
 
384 aa  477  1e-133  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.29511 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0400  CBS domain-containing protein  63.3 
 
 
378 aa  474  1e-132  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0735736  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0613  peptidase M50  59.68 
 
 
377 aa  466  9.999999999999999e-131  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0236174 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1552  CBS domain-containing protein  58.62 
 
 
378 aa  463  1e-129  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.651546  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0289  peptidase M50  41.36 
 
 
393 aa  307  2.0000000000000002e-82  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1032  peptidase M50  44.92 
 
 
395 aa  305  6e-82  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0615226 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2601  peptidase M50  42.51 
 
 
394 aa  295  7e-79  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.603215  normal  0.812434 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0978  hypothetical protein  43.5 
 
 
364 aa  291  2e-77  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1508  peptidase M50  44.24 
 
 
412 aa  285  1.0000000000000001e-75  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2136  peptidase M50  39.11 
 
 
415 aa  283  5.000000000000001e-75  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.821665  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0318  CBS domain-containing protein  38.73 
 
 
370 aa  262  6e-69  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.147887  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1731  peptidase M50  39.49 
 
 
366 aa  239  5.999999999999999e-62  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0406  peptidase M50  35.71 
 
 
380 aa  218  1e-55  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.445518 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1185  peptidase M50  35.9 
 
 
338 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2535  peptidase M50  40.11 
 
 
373 aa  209  4e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.180251  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1449  peptidase M50  35.03 
 
 
337 aa  209  9e-53  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0709676 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0459  peptidase M50  35.17 
 
 
342 aa  207  2e-52  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0769405  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3134  peptidase M50  37.47 
 
 
386 aa  207  3e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3165  peptidase M50  38.14 
 
 
376 aa  206  7e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0832  peptidase M50  35.22 
 
 
370 aa  199  6e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3672  peptidase M50  35.56 
 
 
375 aa  199  9e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1434  CBS domain-containing protein  33.51 
 
 
336 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0170  CBS domain-containing protein  34.75 
 
 
343 aa  193  4e-48  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.356486  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0613  peptidase M50  38.86 
 
 
380 aa  188  1e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.750705  normal  0.0786713 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3626  peptidase M50  33.78 
 
 
368 aa  184  3e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.721542 
 
 
-
 
NC_002936  DET0769  protease family protein  31.11 
 
 
380 aa  178  1e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000172815  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_675  protease  30.85 
 
 
380 aa  178  1e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000159772  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3750  peptidase M50  34.47 
 
 
372 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.69281  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4923  peptidase M50  33.25 
 
 
373 aa  169  6e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.465017 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0695  peptidase M50  31.62 
 
 
379 aa  165  1.0000000000000001e-39  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000836286  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2201  peptidase M50  32.03 
 
 
375 aa  162  1e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11470  Zn-dependent protease  35.06 
 
 
388 aa  156  5.0000000000000005e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.844041 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1747  peptidase M50  29.58 
 
 
370 aa  156  5.0000000000000005e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.951218  normal  0.0691878 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1988  peptidase M50  30.43 
 
 
373 aa  156  7e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.319732 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2488  peptidase M50  29.52 
 
 
383 aa  155  1e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1497  peptidase M50  33.69 
 
 
372 aa  153  4e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.120961  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1011  peptidase M50  33.23 
 
 
404 aa  152  8e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0458  peptidase M50  32.98 
 
 
377 aa  152  1e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0639554  normal  0.134701 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0694  peptidase M50  34.31 
 
 
366 aa  152  1e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.232631 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3157  peptidase M50  30.63 
 
 
382 aa  148  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2620  hypothetical protein  39.51 
 
 
239 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00161745  normal  0.443629 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4785  peptidase M50  29.53 
 
 
373 aa  147  3e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.384856  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3648  peptidase M50  31.17 
 
 
381 aa  145  2e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0203123 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0222  peptidase M50  29.09 
 
 
394 aa  144  2e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3400  peptidase M50  29.95 
 
 
381 aa  144  3e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1291  peptidase M50  29.37 
 
 
366 aa  142  7e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00117198  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2308  peptidase M50  31.15 
 
 
385 aa  142  8e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0540  peptidase M50  29.09 
 
 
364 aa  136  6.0000000000000005e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0116  peptidase M50  30.05 
 
 
365 aa  135  9.999999999999999e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.345861 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12644  hypothetical protein  30.26 
 
 
393 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_680  metallopeptidase, M50 family  37.78 
 
 
371 aa  132  9e-30  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0373838  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0774  M50 family metallopeptidase  29.21 
 
 
370 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0700  peptidase M50  29.12 
 
 
370 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1872  peptidase M50  27.48 
 
 
373 aa  130  3e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1410  peptidase M50  31.66 
 
 
373 aa  130  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.226741  normal  0.248277 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1412  peptidase M50  27.37 
 
 
383 aa  129  8.000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.742384  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3191  peptidase M50  27.71 
 
 
375 aa  129  1.0000000000000001e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00586872 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2355  peptidase M50  31.94 
 
 
396 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0704943  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1457  peptidase M50  28.36 
 
 
417 aa  125  9e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1483  peptidase M50  28.36 
 
 
417 aa  125  9e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.511598  normal  0.569675 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0155  peptidase M50  31.73 
 
 
392 aa  124  2e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1368  peptidase M50  27.88 
 
 
395 aa  123  5e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00624726  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0613  peptidase M50  28.17 
 
 
361 aa  123  5e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.190222  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2627  peptidase M50  30.28 
 
 
405 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5283  peptidase M50  27.6 
 
 
390 aa  117  3.9999999999999997e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2181  hypothetical protein  28.75 
 
 
403 aa  114  2.0000000000000002e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.392153 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1337  peptidase M50  25.51 
 
 
412 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5036  peptidase M50  25.69 
 
 
413 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.206475 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4494  peptidase M50  31.33 
 
 
381 aa  113  5e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0920  peptidase M50  25.38 
 
 
374 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1797  peptidase M50  28.14 
 
 
397 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0947  peptidase M50  25.38 
 
 
374 aa  110  3e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1843  peptidase M50  33.73 
 
 
376 aa  109  8.000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.616528  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1629  hypothetical protein  28.84 
 
 
431 aa  108  1e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1479  peptidase M50  37.43 
 
 
384 aa  106  7e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0658829  normal  0.564629 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1815  hypothetical protein  31.47 
 
 
383 aa  104  2e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.434017  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3381  peptidase M50  28.46 
 
 
396 aa  105  2e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.000039902  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2415  peptidase M50  27.68 
 
 
424 aa  102  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5902  Zn-dependent protease-like protein  32.31 
 
 
362 aa  101  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0267336  normal  0.154235 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0259  peptidase M50  26.89 
 
 
374 aa  99  1e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3297  peptidase M50  33.98 
 
 
258 aa  98.2  2e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.153314  normal  0.569986 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5311  peptidase M50  30.88 
 
 
301 aa  97.8  3e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0783881  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0524  peptidase M50  31.01 
 
 
285 aa  97.8  3e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.311607  hitchhiker  0.00535986 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2539  peptidase M50  35.82 
 
 
293 aa  96.3  8e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0160669  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3922  peptidase M50  26.1 
 
 
385 aa  95.9  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.558191 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2237  peptidase M50  32.46 
 
 
359 aa  94.7  2e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.949585  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1302  CBS domain containing protein  41.18 
 
 
769 aa  95.1  2e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2223  peptidase M50  27.83 
 
 
376 aa  94.4  3e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4475  peptidase M50  26.44 
 
 
400 aa  93.6  5e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.580173  normal  0.145803 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1617  putative protease  30.54 
 
 
286 aa  92.4  1e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2305  peptidase M50  29.41 
 
 
362 aa  90.9  4e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00177185  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0734  hypothetical protein  28.36 
 
 
416 aa  90.5  5e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.168601  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2637  peptidase M50  25.62 
 
 
378 aa  88.2  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.599853  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0669  stage IV sporulation protein FB  33.88 
 
 
286 aa  87.8  3e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000475668  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4538  stage IV sporulation protein FB  32.24 
 
 
286 aa  86.7  6e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.214848  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4580  stage IV sporulation protein FB  32.79 
 
 
286 aa  86.3  8e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000567867  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4180  stage IV sporulation protein FB  33.52 
 
 
286 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0869981  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1465  Cl- channel, voltage-gated family protein  34.23 
 
 
580 aa  85.9  0.000000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05931  Zn-dependent proteases  25.59 
 
 
405 aa  85.9  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.111882  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>