170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1856 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_1856  peptidase M50  100 
 
 		 377 aa  707    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1914  peptidase M50  40.63 
 
 		 387 aa  228  1e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000446293 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1843  peptidase M50  41.82 
 
 		 376 aa  217  2.9999999999999998e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.616528  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2305  peptidase M50  42.82 
 
 		 362 aa  212  7e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00177185  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2415  peptidase M50  37.53 
 
 		 424 aa  206  6e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20920  Zn-dependent protease  41.25 
 
 		 380 aa  203  5e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.961375 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1815  hypothetical protein  40.63 
 
 		 383 aa  202  6e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.434017  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5902  Zn-dependent protease-like protein  39.19 
 
 		 362 aa  202  6e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0267336  normal  0.154235 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2637  peptidase M50  38.07 
 
 		 378 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.599853  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1483  peptidase M50  40.53 
 
 		 365 aa  198  1.0000000000000001e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1479  peptidase M50  40.48 
 
 		 384 aa  185  9e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0658829  normal  0.564629 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2006  peptidase M50  41.11 
 
 		 376 aa  180  4e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.223407  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1181  peptidase M50  38.42 
 
 		 379 aa  179  7e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.22871  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2244  peptidase M50  44.82 
 
 		 373 aa  176  6e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.830349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4475  peptidase M50  32.91 
 
 		 400 aa  166  8e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.580173  normal  0.145803 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2171  peptidase M50  37.99 
 
 		 403 aa  165  1.0000000000000001e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.121465  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13940  Zn-dependent protease  32.68 
 
 		 379 aa  155  2e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.909069 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11840  Zn-dependent protease  38.79 
 
 		 375 aa  144  3e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0392218  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2237  peptidase M50  37.16 
 
 		 359 aa  137  3.0000000000000003e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.949585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4885  peptidase M50  31.69 
 
 		 397 aa  135  9.999999999999999e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.333233 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2633  peptidase M50  31.77 
 
 		 405 aa  134  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.962625  normal  0.303399 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4785  peptidase M50  31.33 
 
 		 373 aa  133  6e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.384856  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16220  Zn-dependent protease  33.68 
 
 		 395 aa  132  1.0000000000000001e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.276827  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22130  Zn-dependent protease  35.34 
 
 		 390 aa  127  2.0000000000000002e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.944872  normal  0.942698 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2181  hypothetical protein  30.77 
 
 		 403 aa  125  1e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.392153 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5036  peptidase M50  34.3 
 
 		 413 aa  125  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.206475 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1457  peptidase M50  30.17 
 
 		 417 aa  124  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1483  peptidase M50  30.17 
 
 		 417 aa  124  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.511598  normal  0.569675 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2354  peptidase M50  35.62 
 
 		 386 aa  124  2e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.176917 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1410  peptidase M50  33.86 
 
 		 373 aa  120  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.226741  normal  0.248277 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1872  peptidase M50  27.86 
 
 		 373 aa  116  6.9999999999999995e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1797  peptidase M50  29.97 
 
 		 397 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2223  peptidase M50  34.7 
 
 		 376 aa  115  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3381  peptidase M50  29.16 
 
 		 396 aa  114  3e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.000039902  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0920  peptidase M50  26.72 
 
 		 374 aa  114  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0947  peptidase M50  26.72 
 
 		 374 aa  114  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1337  peptidase M50  30.18 
 
 		 412 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3191  peptidase M50  25.64 
 
 		 375 aa  112  1.0000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00586872 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0613  peptidase M50  40.55 
 
 		 361 aa  106  5e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.190222  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_680  metallopeptidase, M50 family  25.77 
 
 		 371 aa  102  1e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0373838  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3922  peptidase M50  25.95 
 
 		 385 aa  102  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.558191 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0259  peptidase M50  26.74 
 
 		 374 aa  101  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0222  peptidase M50  29.76 
 
 		 394 aa  101  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0769  protease family protein  25.72 
 
 		 380 aa  100  3e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000172815  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3400  peptidase M50  32.23 
 
 		 381 aa  99.8  6e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_675  protease  25.19 
 
 		 380 aa  99  1e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000159772  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3648  peptidase M50  40 
 
 		 381 aa  97.4  3e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0203123 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1629  hypothetical protein  38.19 
 
 		 431 aa  97.1  4e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5283  peptidase M50  34.27 
 
 		 390 aa  97.1  5e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0613  peptidase M50  27.33 
 
 		 377 aa  96.7  6e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0236174 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0734  hypothetical protein  31.58 
 
 		 416 aa  96.3  9e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.168601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0695  peptidase M50  25.52 
 
 		 379 aa  95.5  1e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000836286  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0774  M50 family metallopeptidase  24.22 
 
 		 370 aa  95.1  2e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2488  peptidase M50  33.76 
 
 		 383 aa  95.1  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0700  peptidase M50  30.12 
 
 		 370 aa  94.4  3e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1199  peptidase M50  33.72 
 
 		 369 aa  93.6  5e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0242729  normal  0.16524 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1291  peptidase M50  23.26 
 
 		 366 aa  93.6  5e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00117198  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0149  CBS domain containing protein  31.74 
 
 		 377 aa  92  2e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0113637 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2627  peptidase M50  29.92 
 
 		 405 aa  90.9  3e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1747  peptidase M50  25.46 
 
 		 370 aa  88.6  2e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.951218  normal  0.0691878 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1552  CBS domain-containing protein  25.99 
 
 		 378 aa  88.2  2e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.651546  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0318  CBS domain-containing protein  25.45 
 
 		 370 aa  87  5e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.147887  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2977  peptidase M50  39.46 
 
 		 378 aa  86.3  8e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00144349  hitchhiker  0.00562837 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2272  CBS domain-containing protein  28.57 
 
 		 384 aa  85.9  0.000000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.29511 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0978  hypothetical protein  28.63 
 
 		 364 aa  83.2  0.000000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1368  peptidase M50  30.12 
 
 		 395 aa  82.8  0.00000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00624726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11470  Zn-dependent protease  28.92 
 
 		 388 aa  80.9  0.00000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.844041 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1032  peptidase M50  27.5 
 
 		 395 aa  80.9  0.00000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0615226 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2620  hypothetical protein  29.76 
 
 		 239 aa  79.3  0.00000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00161745  normal  0.443629 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3165  peptidase M50  31.43 
 
 		 376 aa  77.4  0.0000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0400  CBS domain-containing protein  31.8 
 
 		 378 aa  76.6  0.0000000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0735736  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2355  peptidase M50  32.82 
 
 		 396 aa  75.1  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0704943  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0289  peptidase M50  29.44 
 
 		 393 aa  75.1  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1449  peptidase M50  30.53 
 
 		 337 aa  74.7  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0709676 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1011  peptidase M50  24.55 
 
 		 404 aa  74.7  0.000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1731  peptidase M50  25 
 
 		 366 aa  74.3  0.000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4923  peptidase M50  29.74 
 
 		 373 aa  74.3  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.465017 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1508  peptidase M50  30.39 
 
 		 412 aa  74.3  0.000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05401  Zn-dependent protease  28.35 
 
 		 413 aa  72  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2136  peptidase M50  28.32 
 
 		 415 aa  72  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.821665  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1988  peptidase M50  26.49 
 
 		 373 aa  71.2  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.319732 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0459  peptidase M50  29.02 
 
 		 342 aa  70.9  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0769405  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2201  peptidase M50  30.73 
 
 		 375 aa  70.5  0.00000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0540  peptidase M50  28.36 
 
 		 364 aa  70.9  0.00000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1617  putative protease  27.11 
 
 		 286 aa  70.5  0.00000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2601  peptidase M50  34.9 
 
 		 394 aa  70.5  0.00000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.603215  normal  0.812434 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07871  Zn-dependent protease  38.92 
 
 		 422 aa  70.1  0.00000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3750  peptidase M50  36.36 
 
 		 372 aa  70.1  0.00000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.69281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1185  peptidase M50  26.2 
 
 		 338 aa  69.7  0.00000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0155  peptidase M50  41.18 
 
 		 392 aa  69.3  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3626  peptidase M50  38.36 
 
 		 368 aa  69.3  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.721542 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0613  peptidase M50  37.66 
 
 		 380 aa  68.2  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.750705  normal  0.0786713 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2539  peptidase M50  34.39 
 
 		 293 aa  67.8  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0160669  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0406  peptidase M50  33.33 
 
 		 380 aa  67.4  0.0000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.445518 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1762  putative peptidase  29.7 
 
 		 360 aa  67.4  0.0000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.0051203  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05931  Zn-dependent proteases  31.63 
 
 		 405 aa  67.4  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.111882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0483  hypothetical protein  33.82 
 
 		 360 aa  67  0.0000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000119997  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2535  peptidase M50  35.61 
 
 		 373 aa  66.2  0.0000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.180251  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0786  M50 family peptidase  30.37 
 
 		 344 aa  65.1  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0883958  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3134  peptidase M50  30.03 
 
 		 386 aa  65.1  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>