205 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1815 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_1815  hypothetical protein  100 
 
 
383 aa  746    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.434017  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1843  peptidase M50  57.49 
 
 
376 aa  384  1e-105  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.616528  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1479  peptidase M50  55.26 
 
 
384 aa  372  1e-102  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0658829  normal  0.564629 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5902  Zn-dependent protease-like protein  57.85 
 
 
362 aa  361  1e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0267336  normal  0.154235 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2415  peptidase M50  46.23 
 
 
424 aa  321  9.999999999999999e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2637  peptidase M50  46.46 
 
 
378 aa  308  1.0000000000000001e-82  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.599853  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2305  peptidase M50  49.31 
 
 
362 aa  293  3e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00177185  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4475  peptidase M50  38.4 
 
 
400 aa  255  1.0000000000000001e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.580173  normal  0.145803 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1181  peptidase M50  41.35 
 
 
379 aa  245  9e-64  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.22871  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4885  peptidase M50  37.19 
 
 
397 aa  218  2e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.333233 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1914  peptidase M50  34.29 
 
 
387 aa  207  2e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000446293 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2633  peptidase M50  36.93 
 
 
405 aa  204  2e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.962625  normal  0.303399 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2237  peptidase M50  41.36 
 
 
359 aa  199  5e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.949585  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1856  peptidase M50  40.96 
 
 
377 aa  195  9e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1483  peptidase M50  39.01 
 
 
365 aa  194  3e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2354  peptidase M50  37.82 
 
 
386 aa  184  3e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.176917 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2223  peptidase M50  37.84 
 
 
376 aa  182  1e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22130  Zn-dependent protease  35.16 
 
 
390 aa  179  1e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.944872  normal  0.942698 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20920  Zn-dependent protease  36.34 
 
 
380 aa  172  9e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.961375 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2171  peptidase M50  36.32 
 
 
403 aa  166  9e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.121465  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2006  peptidase M50  38.03 
 
 
376 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.223407  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3191  peptidase M50  28.61 
 
 
375 aa  162  1e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00586872 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5036  peptidase M50  37.31 
 
 
413 aa  160  3e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.206475 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0259  peptidase M50  29.21 
 
 
374 aa  160  4e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4785  peptidase M50  35.83 
 
 
373 aa  159  6e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.384856  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2244  peptidase M50  37.85 
 
 
373 aa  156  5.0000000000000005e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.830349  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1872  peptidase M50  30.25 
 
 
373 aa  155  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0920  peptidase M50  29.33 
 
 
374 aa  155  1e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0947  peptidase M50  29.33 
 
 
374 aa  155  1e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1410  peptidase M50  35.48 
 
 
373 aa  153  4e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.226741  normal  0.248277 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2181  hypothetical protein  41.56 
 
 
403 aa  151  2e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.392153 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1797  peptidase M50  37.96 
 
 
397 aa  145  2e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3381  peptidase M50  36.4 
 
 
396 aa  142  7e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.000039902  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16220  Zn-dependent protease  31.71 
 
 
395 aa  142  7e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.276827  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13940  Zn-dependent protease  32.65 
 
 
379 aa  143  7e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.909069 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1483  peptidase M50  34.94 
 
 
417 aa  142  7e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.511598  normal  0.569675 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1457  peptidase M50  34.94 
 
 
417 aa  142  7e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11840  Zn-dependent protease  36.16 
 
 
375 aa  142  9.999999999999999e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0392218  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3922  peptidase M50  30.34 
 
 
385 aa  140  3e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.558191 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1337  peptidase M50  38.49 
 
 
412 aa  139  7.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0978  hypothetical protein  28.69 
 
 
364 aa  137  4e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0769  protease family protein  30.99 
 
 
380 aa  137  5e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000172815  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0222  peptidase M50  32.13 
 
 
394 aa  136  5e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1291  peptidase M50  27.32 
 
 
366 aa  136  6.0000000000000005e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00117198  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0774  M50 family metallopeptidase  30.21 
 
 
370 aa  135  9.999999999999999e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1368  peptidase M50  35.06 
 
 
395 aa  134  1.9999999999999998e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00624726  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_675  protease  30.63 
 
 
380 aa  133  5e-30  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000159772  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1629  hypothetical protein  32.87 
 
 
431 aa  128  1.0000000000000001e-28  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11470  Zn-dependent protease  35.31 
 
 
388 aa  125  9e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.844041 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0734  hypothetical protein  34.67 
 
 
416 aa  125  1e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.168601  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0318  CBS domain-containing protein  28.21 
 
 
370 aa  125  1e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.147887  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2488  peptidase M50  29.64 
 
 
383 aa  124  2e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_680  metallopeptidase, M50 family  28.49 
 
 
371 aa  124  2e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0373838  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2977  peptidase M50  35.31 
 
 
378 aa  124  3e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00144349  hitchhiker  0.00562837 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0700  peptidase M50  29.14 
 
 
370 aa  123  5e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1747  peptidase M50  30.11 
 
 
370 aa  120  4.9999999999999996e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.951218  normal  0.0691878 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0695  peptidase M50  29.79 
 
 
379 aa  119  7.999999999999999e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000836286  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3648  peptidase M50  30.63 
 
 
381 aa  116  6e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0203123 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2136  peptidase M50  27.47 
 
 
415 aa  115  1.0000000000000001e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.821665  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1508  peptidase M50  33.83 
 
 
412 aa  115  2.0000000000000002e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5283  peptidase M50  29.85 
 
 
390 aa  114  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3400  peptidase M50  30.93 
 
 
381 aa  114  3e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0289  peptidase M50  27.16 
 
 
393 aa  114  4.0000000000000004e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1011  peptidase M50  34.54 
 
 
404 aa  113  6e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2620  hypothetical protein  32.51 
 
 
239 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00161745  normal  0.443629 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0149  CBS domain containing protein  30.58 
 
 
377 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0113637 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0406  peptidase M50  31.19 
 
 
380 aa  110  5e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.445518 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1032  peptidase M50  30.77 
 
 
395 aa  108  2e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0615226 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1552  CBS domain-containing protein  34.19 
 
 
378 aa  108  2e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.651546  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1731  peptidase M50  26.9 
 
 
366 aa  106  6e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2272  CBS domain-containing protein  36.87 
 
 
384 aa  106  7e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.29511 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3626  peptidase M50  29.97 
 
 
368 aa  106  9e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.721542 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3672  peptidase M50  30.95 
 
 
375 aa  105  2e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05401  Zn-dependent protease  28.95 
 
 
413 aa  103  5e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3134  peptidase M50  28.5 
 
 
386 aa  102  9e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0832  peptidase M50  39.22 
 
 
370 aa  101  2e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0613  peptidase M50  35.02 
 
 
377 aa  101  3e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0236174 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3750  peptidase M50  33.07 
 
 
372 aa  100  4e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.69281  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2627  peptidase M50  30.19 
 
 
405 aa  99.8  6e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1617  putative protease  28.57 
 
 
286 aa  99.4  9e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3165  peptidase M50  27.78 
 
 
376 aa  98.6  1e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0613  peptidase M50  35.12 
 
 
361 aa  99  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.190222  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2201  peptidase M50  28.77 
 
 
375 aa  98.6  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12644  hypothetical protein  43.89 
 
 
393 aa  98.2  2e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2601  peptidase M50  26.48 
 
 
394 aa  97.4  4e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.603215  normal  0.812434 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05931  Zn-dependent proteases  37.11 
 
 
405 aa  96.3  9e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.111882  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2535  peptidase M50  39.9 
 
 
373 aa  95.5  1e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.180251  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1497  peptidase M50  38.46 
 
 
372 aa  95.5  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.120961  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1988  peptidase M50  36.25 
 
 
373 aa  95.5  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.319732 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0400  CBS domain-containing protein  29.36 
 
 
378 aa  95.1  2e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0735736  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0694  peptidase M50  30.14 
 
 
366 aa  93.6  5e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.232631 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0540  peptidase M50  36.6 
 
 
364 aa  91.3  2e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1199  peptidase M50  29.18 
 
 
369 aa  91.7  2e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0242729  normal  0.16524 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1412  peptidase M50  34.2 
 
 
383 aa  92  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.742384  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0155  peptidase M50  38.8 
 
 
392 aa  91.3  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22910  Zn-dependent protease  40.79 
 
 
244 aa  91.3  2e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.511612  normal  0.351338 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4923  peptidase M50  26.1 
 
 
373 aa  91.3  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.465017 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07871  Zn-dependent protease  41.58 
 
 
422 aa  89.7  8e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1868  hypothetical protein  26.8 
 
 
396 aa  89.4  1e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.180278  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4494  peptidase M50  31.37 
 
 
381 aa  89  1e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>