246 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_11470 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_11470  Zn-dependent protease  100 
 
 
388 aa  750    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.844041 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2627  peptidase M50  51.41 
 
 
405 aa  320  1.9999999999999998e-86  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3648  peptidase M50  49.08 
 
 
381 aa  311  2e-83  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0203123 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2355  peptidase M50  51.55 
 
 
396 aa  299  6e-80  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0704943  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3400  peptidase M50  48.55 
 
 
381 aa  297  3e-79  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0155  peptidase M50  52.97 
 
 
392 aa  291  9e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12644  hypothetical protein  45.92 
 
 
393 aa  268  1e-70  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4494  peptidase M50  48.64 
 
 
381 aa  268  2e-70  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0769  protease family protein  37.4 
 
 
380 aa  233  4.0000000000000004e-60  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000172815  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_675  protease  37.99 
 
 
380 aa  233  4.0000000000000004e-60  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000159772  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1412  peptidase M50  43.85 
 
 
383 aa  227  3e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.742384  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2488  peptidase M50  32.35 
 
 
383 aa  208  1e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0695  peptidase M50  34.47 
 
 
379 aa  203  5e-51  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000836286  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1747  peptidase M50  33.16 
 
 
370 aa  198  1.0000000000000001e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.951218  normal  0.0691878 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1872  peptidase M50  32.43 
 
 
373 aa  191  2e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1337  peptidase M50  35.31 
 
 
412 aa  187  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0978  hypothetical protein  32.89 
 
 
364 aa  183  5.0000000000000004e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5283  peptidase M50  34.62 
 
 
390 aa  178  1e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1291  peptidase M50  32.05 
 
 
366 aa  176  9e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00117198  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1797  peptidase M50  33.16 
 
 
397 aa  175  9.999999999999999e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4785  peptidase M50  31.2 
 
 
373 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.384856  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0222  peptidase M50  33.33 
 
 
394 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3381  peptidase M50  33.53 
 
 
396 aa  173  5e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.000039902  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0289  peptidase M50  32.82 
 
 
393 aa  172  6.999999999999999e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0774  M50 family metallopeptidase  30.39 
 
 
370 aa  172  1e-41  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1011  peptidase M50  32.99 
 
 
404 aa  171  3e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3191  peptidase M50  31.35 
 
 
375 aa  170  4e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00586872 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0700  peptidase M50  30.11 
 
 
370 aa  165  1.0000000000000001e-39  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5036  peptidase M50  29.86 
 
 
413 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.206475 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_680  metallopeptidase, M50 family  29.5 
 
 
371 aa  162  1e-38  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0373838  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0920  peptidase M50  30.25 
 
 
374 aa  162  1e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1368  peptidase M50  33.59 
 
 
395 aa  161  2e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00624726  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0947  peptidase M50  30.25 
 
 
374 aa  161  2e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0259  peptidase M50  33.99 
 
 
374 aa  160  3e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2272  CBS domain-containing protein  32.22 
 
 
384 aa  160  4e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.29511 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1483  peptidase M50  31.83 
 
 
417 aa  159  7e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.511598  normal  0.569675 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1457  peptidase M50  31.83 
 
 
417 aa  159  7e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0149  CBS domain containing protein  35.03 
 
 
377 aa  159  7e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0113637 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0318  CBS domain-containing protein  31.17 
 
 
370 aa  158  2e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.147887  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1410  peptidase M50  33.43 
 
 
373 aa  157  3e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.226741  normal  0.248277 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2181  hypothetical protein  32.71 
 
 
403 aa  155  1e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.392153 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0400  CBS domain-containing protein  33.76 
 
 
378 aa  155  1e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0735736  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2601  peptidase M50  33.33 
 
 
394 aa  154  2.9999999999999998e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.603215  normal  0.812434 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1508  peptidase M50  38.15 
 
 
412 aa  153  5e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0613  peptidase M50  33.13 
 
 
377 aa  151  1e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0236174 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1552  CBS domain-containing protein  30.26 
 
 
378 aa  152  1e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.651546  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3165  peptidase M50  32.23 
 
 
376 aa  151  2e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1032  peptidase M50  35.17 
 
 
395 aa  148  1.0000000000000001e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0615226 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3922  peptidase M50  30.91 
 
 
385 aa  149  1.0000000000000001e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.558191 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2535  peptidase M50  34.81 
 
 
373 aa  146  5e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.180251  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2136  peptidase M50  31.28 
 
 
415 aa  143  4e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.821665  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0613  peptidase M50  37.69 
 
 
380 aa  142  9.999999999999999e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.750705  normal  0.0786713 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0734  hypothetical protein  33.02 
 
 
416 aa  136  8e-31  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.168601  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0406  peptidase M50  36.86 
 
 
380 aa  134  3e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.445518 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4923  peptidase M50  31.69 
 
 
373 aa  134  3e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.465017 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1185  peptidase M50  27.84 
 
 
338 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1731  peptidase M50  29.6 
 
 
366 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1629  hypothetical protein  34.29 
 
 
431 aa  131  2.0000000000000002e-29  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0459  peptidase M50  27.87 
 
 
342 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0769405  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3672  peptidase M50  34.86 
 
 
375 aa  127  5e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22910  Zn-dependent protease  36.44 
 
 
244 aa  126  6e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.511612  normal  0.351338 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1449  peptidase M50  26.23 
 
 
337 aa  126  6e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0709676 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1988  peptidase M50  30.72 
 
 
373 aa  126  8.000000000000001e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.319732 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0613  peptidase M50  32.01 
 
 
361 aa  124  3e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.190222  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1843  peptidase M50  31.72 
 
 
376 aa  123  6e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.616528  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5902  Zn-dependent protease-like protein  30.96 
 
 
362 aa  123  6e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0267336  normal  0.154235 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3134  peptidase M50  31.99 
 
 
386 aa  123  6e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1815  hypothetical protein  33.42 
 
 
383 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.434017  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3750  peptidase M50  31.27 
 
 
372 aa  120  3e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.69281  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3626  peptidase M50  31.29 
 
 
368 aa  120  4.9999999999999996e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.721542 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4475  peptidase M50  29.02 
 
 
400 aa  119  7e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.580173  normal  0.145803 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0170  CBS domain-containing protein  28.62 
 
 
343 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.356486  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2305  peptidase M50  33.02 
 
 
362 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00177185  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2201  peptidase M50  31.3 
 
 
375 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05401  Zn-dependent protease  30.75 
 
 
413 aa  114  3e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1434  CBS domain-containing protein  27.94 
 
 
336 aa  113  5e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2637  peptidase M50  29.37 
 
 
378 aa  110  3e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.599853  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1868  hypothetical protein  28.21 
 
 
396 aa  108  2e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.180278  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0540  peptidase M50  30 
 
 
364 aa  108  2e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2415  peptidase M50  30.36 
 
 
424 aa  107  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05931  Zn-dependent proteases  28.44 
 
 
405 aa  107  4e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.111882  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07871  Zn-dependent protease  32.81 
 
 
422 aa  106  5e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1479  peptidase M50  44.13 
 
 
384 aa  106  6e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0658829  normal  0.564629 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0694  peptidase M50  30.77 
 
 
366 aa  105  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.232631 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1497  peptidase M50  30.83 
 
 
372 aa  105  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.120961  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05641  Zn-dependent protease  22.39 
 
 
407 aa  103  5e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.394997  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2223  peptidase M50  34.06 
 
 
376 aa  102  9e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2620  hypothetical protein  33.2 
 
 
239 aa  102  1e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00161745  normal  0.443629 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22130  Zn-dependent protease  31.41 
 
 
390 aa  101  2e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.944872  normal  0.942698 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0832  peptidase M50  30.25 
 
 
370 aa  101  2e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0458  peptidase M50  27.86 
 
 
377 aa  100  4e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0639554  normal  0.134701 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0116  peptidase M50  28.65 
 
 
365 aa  99  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.345861 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2237  peptidase M50  48.59 
 
 
359 aa  99  1e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.949585  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0524  peptidase M50  31.93 
 
 
285 aa  97.4  4e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.311607  hitchhiker  0.00535986 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05941  Zn-dependent proteases  21.67 
 
 
407 aa  95.9  1e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13940  Zn-dependent protease  30.75 
 
 
379 aa  94.4  3e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.909069 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1914  peptidase M50  29.9 
 
 
387 aa  91.7  2e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000446293 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2052  hypothetical protein  30.42 
 
 
431 aa  91.7  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.618886  normal  0.624101 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1627  putative transmembrane alanine and leucine rich protein  30.36 
 
 
440 aa  90.5  4e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11840  Zn-dependent protease  31.09 
 
 
375 aa  89.7  8e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0392218  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>