296 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0458 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_0458  peptidase M50  100 
 
 
377 aa  738    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0639554  normal  0.134701 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3750  peptidase M50  55.03 
 
 
372 aa  380  1e-104  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.69281  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4923  peptidase M50  53.69 
 
 
373 aa  370  1e-101  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.465017 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2201  peptidase M50  50.67 
 
 
375 aa  364  2e-99  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1497  peptidase M50  57.91 
 
 
372 aa  360  3e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.120961  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1988  peptidase M50  49.33 
 
 
373 aa  354  1e-96  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.319732 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0694  peptidase M50  57.06 
 
 
366 aa  352  5.9999999999999994e-96  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.232631 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0540  peptidase M50  45.4 
 
 
364 aa  304  2.0000000000000002e-81  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3626  peptidase M50  44.93 
 
 
368 aa  260  3e-68  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.721542 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0832  peptidase M50  49.59 
 
 
370 aa  255  1.0000000000000001e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3165  peptidase M50  41.32 
 
 
376 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1731  peptidase M50  35.65 
 
 
366 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0978  hypothetical protein  34.54 
 
 
364 aa  189  8e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0318  CBS domain-containing protein  34.77 
 
 
370 aa  181  2e-44  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.147887  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1032  peptidase M50  34.97 
 
 
395 aa  176  6e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0615226 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2308  peptidase M50  36.34 
 
 
385 aa  174  2.9999999999999996e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0116  peptidase M50  35.31 
 
 
365 aa  173  5e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.345861 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3157  peptidase M50  35.54 
 
 
382 aa  173  5e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0149  CBS domain containing protein  33.94 
 
 
377 aa  172  5.999999999999999e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0113637 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0289  peptidase M50  36.05 
 
 
393 aa  172  7.999999999999999e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0170  CBS domain-containing protein  32.32 
 
 
343 aa  171  2e-41  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.356486  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2601  peptidase M50  33.25 
 
 
394 aa  166  5.9999999999999996e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.603215  normal  0.812434 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0613  peptidase M50  32.44 
 
 
377 aa  166  6.9999999999999995e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0236174 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2272  CBS domain-containing protein  33.68 
 
 
384 aa  166  6.9999999999999995e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.29511 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1185  peptidase M50  34.57 
 
 
338 aa  166  6.9999999999999995e-40  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0459  peptidase M50  33.43 
 
 
342 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0769405  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1449  peptidase M50  34 
 
 
337 aa  162  1e-38  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0709676 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2136  peptidase M50  32.58 
 
 
415 aa  161  2e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.821665  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1508  peptidase M50  34.7 
 
 
412 aa  159  6e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0769  protease family protein  30.81 
 
 
380 aa  158  2e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000172815  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1552  CBS domain-containing protein  31.22 
 
 
378 aa  157  2e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.651546  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_675  protease  30.56 
 
 
380 aa  154  2.9999999999999998e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000159772  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0400  CBS domain-containing protein  33.86 
 
 
378 aa  153  4e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0735736  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1434  CBS domain-containing protein  32.95 
 
 
336 aa  146  6e-34  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3672  peptidase M50  32.78 
 
 
375 aa  142  9.999999999999999e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3134  peptidase M50  33.33 
 
 
386 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3297  peptidase M50  36.92 
 
 
258 aa  140  4.999999999999999e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.153314  normal  0.569986 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0406  peptidase M50  34.05 
 
 
380 aa  137  4e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.445518 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1291  peptidase M50  26.74 
 
 
366 aa  133  3.9999999999999996e-30  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00117198  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2535  peptidase M50  34.69 
 
 
373 aa  133  5e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.180251  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0695  peptidase M50  30.38 
 
 
379 aa  132  6.999999999999999e-30  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000836286  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2620  hypothetical protein  43.35 
 
 
239 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00161745  normal  0.443629 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2488  peptidase M50  28.07 
 
 
383 aa  129  8.000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0613  peptidase M50  33.9 
 
 
380 aa  128  2.0000000000000002e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.750705  normal  0.0786713 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5036  peptidase M50  28.83 
 
 
413 aa  119  6e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.206475 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1011  peptidase M50  29.18 
 
 
404 aa  119  9e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1872  peptidase M50  30.21 
 
 
373 aa  119  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4785  peptidase M50  29.14 
 
 
373 aa  118  9.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.384856  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5283  peptidase M50  32.89 
 
 
390 aa  115  8.999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11470  Zn-dependent protease  29.25 
 
 
388 aa  113  5e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.844041 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0920  peptidase M50  29.03 
 
 
374 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0947  peptidase M50  29.35 
 
 
374 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1797  peptidase M50  28.89 
 
 
397 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5311  peptidase M50  38.19 
 
 
301 aa  111  3e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0783881  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0613  peptidase M50  28.53 
 
 
361 aa  110  3e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.190222  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1747  peptidase M50  30.87 
 
 
370 aa  108  1e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.951218  normal  0.0691878 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2539  peptidase M50  34.23 
 
 
293 aa  109  1e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0160669  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0222  peptidase M50  28.57 
 
 
394 aa  108  1e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12644  hypothetical protein  31.1 
 
 
393 aa  109  1e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3329  peptidase M50  31.31 
 
 
290 aa  105  1e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.014503  normal  0.780198 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1457  peptidase M50  26.35 
 
 
417 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1483  peptidase M50  26.35 
 
 
417 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.511598  normal  0.569675 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2415  peptidase M50  25.47 
 
 
424 aa  104  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3191  peptidase M50  27.06 
 
 
375 aa  103  7e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00586872 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3381  peptidase M50  28.37 
 
 
396 aa  102  1e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.000039902  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1617  putative protease  30.25 
 
 
286 aa  102  1e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0155  peptidase M50  31.25 
 
 
392 aa  101  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14160  peptidase M50  30.31 
 
 
272 aa  100  3e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000034797  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2355  peptidase M50  32.63 
 
 
396 aa  100  4e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0704943  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1410  peptidase M50  29.95 
 
 
373 aa  100  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.226741  normal  0.248277 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1368  peptidase M50  28.81 
 
 
395 aa  100  5e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00624726  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4494  peptidase M50  31.59 
 
 
381 aa  99.8  8e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4342  peptidase M50  31.84 
 
 
291 aa  99  1e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2627  peptidase M50  29.8 
 
 
405 aa  98.6  1e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0259  peptidase M50  28.02 
 
 
374 aa  99  1e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1337  peptidase M50  27.25 
 
 
412 aa  99  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1456  peptidase M50  29.33 
 
 
292 aa  98.2  2e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2181  hypothetical protein  28.25 
 
 
403 aa  96.7  6e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.392153 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_680  metallopeptidase, M50 family  31.73 
 
 
371 aa  96.7  7e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0373838  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0774  M50 family metallopeptidase  25.54 
 
 
370 aa  95.5  1e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0524  peptidase M50  27.34 
 
 
285 aa  94.7  2e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.311607  hitchhiker  0.00535986 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1843  peptidase M50  30.43 
 
 
376 aa  95.1  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.616528  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0700  peptidase M50  30.77 
 
 
370 aa  94.4  3e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1412  peptidase M50  30.24 
 
 
383 aa  92  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.742384  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2637  peptidase M50  28.07 
 
 
378 aa  90.5  4e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.599853  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4475  peptidase M50  28.92 
 
 
400 aa  89  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.580173  normal  0.145803 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5902  Zn-dependent protease-like protein  42.28 
 
 
362 aa  89  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0267336  normal  0.154235 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1818  peptidase M50  31.92 
 
 
302 aa  88.6  2e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3922  peptidase M50  30.45 
 
 
385 aa  85.1  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.558191 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2237  peptidase M50  29.88 
 
 
359 aa  84.7  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.949585  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3648  peptidase M50  28.53 
 
 
381 aa  84.3  0.000000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0203123 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1815  hypothetical protein  28.39 
 
 
383 aa  84  0.000000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.434017  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1914  peptidase M50  24.86 
 
 
387 aa  84  0.000000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000446293 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1629  hypothetical protein  28.44 
 
 
431 aa  83.2  0.000000000000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22130  Zn-dependent protease  28.92 
 
 
390 aa  82.8  0.00000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.944872  normal  0.942698 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0734  hypothetical protein  32.8 
 
 
416 aa  82  0.00000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.168601  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2305  peptidase M50  32.66 
 
 
362 aa  81.3  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00177185  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3400  peptidase M50  35.35 
 
 
381 aa  80.5  0.00000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4565  stage IV sporulation protein FB  29.22 
 
 
286 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000384784  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1479  peptidase M50  33.53 
 
 
384 aa  79.3  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0658829  normal  0.564629 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>