More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0978 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0978  hypothetical protein  100 
 
 
364 aa  728    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1731  peptidase M50  55.43 
 
 
366 aa  393  1e-108  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0318  CBS domain-containing protein  47.97 
 
 
370 aa  358  7e-98  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.147887  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2620  hypothetical protein  67.1 
 
 
239 aa  325  9e-88  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00161745  normal  0.443629 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0149  CBS domain containing protein  43.5 
 
 
377 aa  297  3e-79  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0113637 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0613  peptidase M50  42.11 
 
 
377 aa  286  5e-76  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0236174 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2272  CBS domain-containing protein  41.71 
 
 
384 aa  282  6.000000000000001e-75  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.29511 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1552  CBS domain-containing protein  39.32 
 
 
378 aa  277  2e-73  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.651546  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0400  CBS domain-containing protein  40.84 
 
 
378 aa  276  5e-73  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0735736  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0289  peptidase M50  38.58 
 
 
393 aa  275  1.0000000000000001e-72  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2601  peptidase M50  39.47 
 
 
394 aa  271  2e-71  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.603215  normal  0.812434 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1032  peptidase M50  39.52 
 
 
395 aa  271  2e-71  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0615226 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1449  peptidase M50  43.21 
 
 
337 aa  262  6e-69  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0709676 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1185  peptidase M50  41.83 
 
 
338 aa  259  7e-68  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0459  peptidase M50  42.94 
 
 
342 aa  258  1e-67  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0769405  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2136  peptidase M50  36.74 
 
 
415 aa  253  4.0000000000000004e-66  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.821665  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1508  peptidase M50  38.56 
 
 
412 aa  237  3e-61  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1434  CBS domain-containing protein  39.83 
 
 
336 aa  225  9e-58  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3134  peptidase M50  37.7 
 
 
386 aa  223  4e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_675  protease  34.67 
 
 
380 aa  218  1e-55  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000159772  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0170  CBS domain-containing protein  38.78 
 
 
343 aa  218  1e-55  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.356486  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2535  peptidase M50  38.5 
 
 
373 aa  218  2e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.180251  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0769  protease family protein  34.4 
 
 
380 aa  215  9e-55  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000172815  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0406  peptidase M50  35.01 
 
 
380 aa  215  9.999999999999999e-55  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.445518 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0613  peptidase M50  38.15 
 
 
380 aa  204  1e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.750705  normal  0.0786713 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1988  peptidase M50  34.68 
 
 
373 aa  201  9.999999999999999e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.319732 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3750  peptidase M50  34.84 
 
 
372 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.69281  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1011  peptidase M50  31.71 
 
 
404 aa  194  3e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3672  peptidase M50  33.42 
 
 
375 aa  193  4e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1747  peptidase M50  31.56 
 
 
370 aa  192  7e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.951218  normal  0.0691878 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0695  peptidase M50  33.07 
 
 
379 aa  190  2.9999999999999997e-47  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000836286  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2488  peptidase M50  32.79 
 
 
383 aa  182  6e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0832  peptidase M50  33.89 
 
 
370 aa  181  1e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3400  peptidase M50  30.03 
 
 
381 aa  178  1e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3648  peptidase M50  30.29 
 
 
381 aa  176  4e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0203123 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3165  peptidase M50  33.51 
 
 
376 aa  176  8e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11470  Zn-dependent protease  32.18 
 
 
388 aa  175  9.999999999999999e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.844041 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1497  peptidase M50  36.16 
 
 
372 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.120961  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0694  peptidase M50  37.01 
 
 
366 aa  172  1e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.232631 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2201  peptidase M50  31.06 
 
 
375 aa  171  2e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0458  peptidase M50  34.18 
 
 
377 aa  171  2e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0639554  normal  0.134701 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4923  peptidase M50  29.62 
 
 
373 aa  169  6e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.465017 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0222  peptidase M50  30.65 
 
 
394 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3626  peptidase M50  31.63 
 
 
368 aa  164  3e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.721542 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0116  peptidase M50  30.32 
 
 
365 aa  163  4.0000000000000004e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.345861 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1368  peptidase M50  29.12 
 
 
395 aa  162  6e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00624726  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1291  peptidase M50  32.36 
 
 
366 aa  158  2e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00117198  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2308  peptidase M50  30.65 
 
 
385 aa  156  5.0000000000000005e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2627  peptidase M50  30.43 
 
 
405 aa  156  6e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3157  peptidase M50  30.11 
 
 
382 aa  155  1e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12644  hypothetical protein  30.67 
 
 
393 aa  154  2e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0540  peptidase M50  29 
 
 
364 aa  151  1e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1337  peptidase M50  26.32 
 
 
412 aa  146  5e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0155  peptidase M50  30.59 
 
 
392 aa  145  1e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4494  peptidase M50  30.56 
 
 
381 aa  144  2e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1797  peptidase M50  28.68 
 
 
397 aa  144  3e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4785  peptidase M50  26.91 
 
 
373 aa  144  3e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.384856  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1872  peptidase M50  27.56 
 
 
373 aa  144  3e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0947  peptidase M50  27.94 
 
 
374 aa  141  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0920  peptidase M50  27.94 
 
 
374 aa  142  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2355  peptidase M50  29.52 
 
 
396 aa  139  4.999999999999999e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0704943  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1843  peptidase M50  29.37 
 
 
376 aa  138  1e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.616528  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1412  peptidase M50  29.29 
 
 
383 aa  138  1e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.742384  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5283  peptidase M50  27.23 
 
 
390 aa  138  2e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2181  hypothetical protein  27.37 
 
 
403 aa  137  3.0000000000000003e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.392153 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3191  peptidase M50  27.11 
 
 
375 aa  136  7.000000000000001e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00586872 
 
 
-
 
NC_002936  DET0774  M50 family metallopeptidase  27.75 
 
 
370 aa  135  8e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0700  peptidase M50  26.06 
 
 
370 aa  135  9.999999999999999e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5036  peptidase M50  26.68 
 
 
413 aa  135  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.206475 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_680  metallopeptidase, M50 family  31.5 
 
 
371 aa  132  7.999999999999999e-30  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0373838  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1483  peptidase M50  27.37 
 
 
417 aa  130  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.511598  normal  0.569675 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1410  peptidase M50  29.07 
 
 
373 aa  130  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.226741  normal  0.248277 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3381  peptidase M50  26.26 
 
 
396 aa  130  4.0000000000000003e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.000039902  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1457  peptidase M50  27.37 
 
 
417 aa  130  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0613  peptidase M50  27.87 
 
 
361 aa  129  7.000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.190222  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1815  hypothetical protein  28.88 
 
 
383 aa  127  3e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.434017  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0259  peptidase M50  27.39 
 
 
374 aa  126  5e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3297  peptidase M50  32.67 
 
 
258 aa  122  9.999999999999999e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.153314  normal  0.569986 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5902  Zn-dependent protease-like protein  28.84 
 
 
362 aa  118  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0267336  normal  0.154235 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2415  peptidase M50  28.72 
 
 
424 aa  119  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2637  peptidase M50  24.87 
 
 
378 aa  116  6e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.599853  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22130  Zn-dependent protease  28.75 
 
 
390 aa  115  8.999999999999998e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.944872  normal  0.942698 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1629  hypothetical protein  29.49 
 
 
431 aa  115  8.999999999999998e-25  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3922  peptidase M50  26.46 
 
 
385 aa  115  1.0000000000000001e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.558191 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0734  hypothetical protein  26.78 
 
 
416 aa  114  2.0000000000000002e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.168601  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2223  peptidase M50  28.65 
 
 
376 aa  114  4.0000000000000004e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0524  peptidase M50  28.3 
 
 
285 aa  114  4.0000000000000004e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.311607  hitchhiker  0.00535986 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5311  peptidase M50  28.9 
 
 
301 aa  113  5e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0783881  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1479  peptidase M50  33.33 
 
 
384 aa  110  3e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0658829  normal  0.564629 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22910  Zn-dependent protease  31.73 
 
 
244 aa  107  2e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.511612  normal  0.351338 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4342  peptidase M50  28.09 
 
 
291 aa  95.1  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1617  putative protease  30.88 
 
 
286 aa  94.7  2e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1456  peptidase M50  28.88 
 
 
292 aa  94.7  2e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13940  Zn-dependent protease  29.62 
 
 
379 aa  93.2  6e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.909069 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2305  peptidase M50  32.32 
 
 
362 aa  92  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00177185  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1868  hypothetical protein  27.24 
 
 
396 aa  92  2e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.180278  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05931  Zn-dependent proteases  25.66 
 
 
405 aa  91.7  2e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.111882  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4885  peptidase M50  24.84 
 
 
397 aa  91.3  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.333233 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4475  peptidase M50  24.06 
 
 
400 aa  91.3  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.580173  normal  0.145803 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07871  Zn-dependent protease  35.24 
 
 
422 aa  90.9  3e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>