189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1843 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_1843  peptidase M50  100 
 
 
376 aa  729    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.616528  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5902  Zn-dependent protease-like protein  71.7 
 
 
362 aa  473  1e-132  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0267336  normal  0.154235 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2415  peptidase M50  54.15 
 
 
424 aa  384  1e-105  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1815  hypothetical protein  57.49 
 
 
383 aa  362  6e-99  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.434017  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2305  peptidase M50  55.28 
 
 
362 aa  351  1e-95  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00177185  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1479  peptidase M50  54.28 
 
 
384 aa  324  1e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0658829  normal  0.564629 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2637  peptidase M50  48.09 
 
 
378 aa  311  2e-83  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.599853  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1181  peptidase M50  48.49 
 
 
379 aa  271  2e-71  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.22871  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4885  peptidase M50  41.83 
 
 
397 aa  260  3e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.333233 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4475  peptidase M50  40.44 
 
 
400 aa  251  2e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.580173  normal  0.145803 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2633  peptidase M50  41.27 
 
 
405 aa  237  2e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.962625  normal  0.303399 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1914  peptidase M50  34.69 
 
 
387 aa  195  1e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000446293 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1856  peptidase M50  41.02 
 
 
377 aa  190  4e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2237  peptidase M50  39.32 
 
 
359 aa  189  7e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.949585  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1483  peptidase M50  36.01 
 
 
365 aa  180  2.9999999999999997e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2354  peptidase M50  38.63 
 
 
386 aa  178  1e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.176917 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0259  peptidase M50  30.71 
 
 
374 aa  168  1e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2223  peptidase M50  37.95 
 
 
376 aa  164  2.0000000000000002e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5036  peptidase M50  37.97 
 
 
413 aa  163  4.0000000000000004e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.206475 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22130  Zn-dependent protease  36.29 
 
 
390 aa  163  5.0000000000000005e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.944872  normal  0.942698 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4785  peptidase M50  37.19 
 
 
373 aa  159  8e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.384856  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2244  peptidase M50  39.12 
 
 
373 aa  156  6e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.830349  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16220  Zn-dependent protease  33.67 
 
 
395 aa  154  2e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.276827  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1410  peptidase M50  38.11 
 
 
373 aa  149  6e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.226741  normal  0.248277 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2171  peptidase M50  32.79 
 
 
403 aa  149  1.0000000000000001e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.121465  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3191  peptidase M50  28.35 
 
 
375 aa  148  2.0000000000000003e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00586872 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0978  hypothetical protein  29.89 
 
 
364 aa  145  1e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_680  metallopeptidase, M50 family  31.05 
 
 
371 aa  144  2e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0373838  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20920  Zn-dependent protease  33.33 
 
 
380 aa  144  2e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.961375 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1337  peptidase M50  42.19 
 
 
412 aa  144  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0700  peptidase M50  30.65 
 
 
370 aa  144  3e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2181  hypothetical protein  30.22 
 
 
403 aa  143  5e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.392153 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0920  peptidase M50  30.34 
 
 
374 aa  143  6e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0947  peptidase M50  29.79 
 
 
374 aa  143  6e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3381  peptidase M50  32.6 
 
 
396 aa  142  9.999999999999999e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.000039902  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0318  CBS domain-containing protein  32.17 
 
 
370 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.147887  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1872  peptidase M50  29.77 
 
 
373 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1629  hypothetical protein  34.68 
 
 
431 aa  140  3e-32  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1457  peptidase M50  36.8 
 
 
417 aa  140  3e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1483  peptidase M50  36.8 
 
 
417 aa  140  3e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.511598  normal  0.569675 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13940  Zn-dependent protease  33.12 
 
 
379 aa  140  4.999999999999999e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.909069 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1291  peptidase M50  35.54 
 
 
366 aa  139  7e-32  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00117198  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1797  peptidase M50  39.49 
 
 
397 aa  137  2e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1368  peptidase M50  33.89 
 
 
395 aa  137  2e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00624726  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11840  Zn-dependent protease  36.13 
 
 
375 aa  138  2e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0392218  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0222  peptidase M50  36.11 
 
 
394 aa  137  4e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0774  M50 family metallopeptidase  39.09 
 
 
370 aa  136  6.0000000000000005e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2488  peptidase M50  30.43 
 
 
383 aa  134  3.9999999999999996e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2006  peptidase M50  32.41 
 
 
376 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.223407  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3922  peptidase M50  28.34 
 
 
385 aa  130  3e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.558191 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1032  peptidase M50  29.79 
 
 
395 aa  127  3e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0615226 
 
 
-
 
NC_002936  DET0769  protease family protein  37.24 
 
 
380 aa  125  1e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000172815  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1747  peptidase M50  23.98 
 
 
370 aa  125  1e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.951218  normal  0.0691878 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0734  hypothetical protein  33.06 
 
 
416 aa  125  1e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.168601  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_675  protease  36.73 
 
 
380 aa  124  2e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000159772  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3400  peptidase M50  30.98 
 
 
381 aa  124  2e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2620  hypothetical protein  36.44 
 
 
239 aa  123  6e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00161745  normal  0.443629 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3648  peptidase M50  31.47 
 
 
381 aa  122  9e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0203123 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5283  peptidase M50  31.79 
 
 
390 aa  122  9.999999999999999e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2601  peptidase M50  28.83 
 
 
394 aa  120  4.9999999999999996e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.603215  normal  0.812434 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1508  peptidase M50  28.76 
 
 
412 aa  120  4.9999999999999996e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3134  peptidase M50  32.18 
 
 
386 aa  119  9e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1731  peptidase M50  30.22 
 
 
366 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0289  peptidase M50  27.53 
 
 
393 aa  115  1.0000000000000001e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11470  Zn-dependent protease  32.25 
 
 
388 aa  115  1.0000000000000001e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.844041 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1185  peptidase M50  29.54 
 
 
338 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05401  Zn-dependent protease  34.43 
 
 
413 aa  111  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0613  peptidase M50  31.32 
 
 
380 aa  110  4.0000000000000004e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.750705  normal  0.0786713 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2136  peptidase M50  28.32 
 
 
415 aa  110  5e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.821665  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1011  peptidase M50  31.08 
 
 
404 aa  108  1e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2535  peptidase M50  31.45 
 
 
373 aa  108  1e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.180251  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0170  CBS domain-containing protein  27.95 
 
 
343 aa  108  2e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.356486  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0149  CBS domain containing protein  31.6 
 
 
377 aa  108  2e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0113637 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0613  peptidase M50  30.93 
 
 
377 aa  107  4e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0236174 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3750  peptidase M50  30.77 
 
 
372 aa  107  4e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.69281  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0695  peptidase M50  24.66 
 
 
379 aa  107  4e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000836286  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1449  peptidase M50  27.59 
 
 
337 aa  106  5e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0709676 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3165  peptidase M50  29.29 
 
 
376 aa  106  6e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1552  CBS domain-containing protein  27.78 
 
 
378 aa  106  7e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.651546  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0613  peptidase M50  37 
 
 
361 aa  105  9e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.190222  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2977  peptidase M50  32.43 
 
 
378 aa  104  2e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00144349  hitchhiker  0.00562837 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2627  peptidase M50  39.01 
 
 
405 aa  104  2e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0459  peptidase M50  28.23 
 
 
342 aa  104  2e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0769405  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3626  peptidase M50  30.24 
 
 
368 aa  103  3e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.721542 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12644  hypothetical protein  32.61 
 
 
393 aa  103  4e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4494  peptidase M50  31.02 
 
 
381 aa  102  1e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05931  Zn-dependent proteases  39.9 
 
 
405 aa  102  1e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.111882  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07871  Zn-dependent protease  44.6 
 
 
422 aa  101  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1868  hypothetical protein  32.87 
 
 
396 aa  100  4e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.180278  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4923  peptidase M50  35.53 
 
 
373 aa  99  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.465017 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0540  peptidase M50  27.95 
 
 
364 aa  97.4  3e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0832  peptidase M50  36.36 
 
 
370 aa  97.8  3e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5311  peptidase M50  35.75 
 
 
301 aa  95.5  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0783881  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1617  putative protease  28.44 
 
 
286 aa  95.5  1e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1412  peptidase M50  30.4 
 
 
383 aa  95.5  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.742384  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1497  peptidase M50  40.27 
 
 
372 aa  94.4  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.120961  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05641  Zn-dependent protease  21.56 
 
 
407 aa  94  3e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.394997  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0694  peptidase M50  41.61 
 
 
366 aa  94  4e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.232631 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2272  CBS domain-containing protein  32.94 
 
 
384 aa  93.6  5e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.29511 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0155  peptidase M50  30.49 
 
 
392 aa  93.2  7e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>