More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_3750 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_3750  peptidase M50  100 
 
 
372 aa  734    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.69281  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1497  peptidase M50  81.44 
 
 
372 aa  534  1e-150  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.120961  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0694  peptidase M50  81.16 
 
 
366 aa  529  1e-149  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.232631 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1988  peptidase M50  57.1 
 
 
373 aa  429  1e-119  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.319732 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2201  peptidase M50  57.5 
 
 
375 aa  398  9.999999999999999e-111  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4923  peptidase M50  54.85 
 
 
373 aa  396  1e-109  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.465017 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0540  peptidase M50  49.86 
 
 
364 aa  356  2.9999999999999997e-97  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0458  peptidase M50  55.03 
 
 
377 aa  349  4e-95  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0639554  normal  0.134701 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3626  peptidase M50  48.9 
 
 
368 aa  282  5.000000000000001e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.721542 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0832  peptidase M50  46.28 
 
 
370 aa  271  2e-71  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3165  peptidase M50  41.53 
 
 
376 aa  239  6.999999999999999e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0978  hypothetical protein  34.84 
 
 
364 aa  192  7e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2308  peptidase M50  38.74 
 
 
385 aa  188  1e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1731  peptidase M50  33.77 
 
 
366 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0318  CBS domain-containing protein  34.81 
 
 
370 aa  183  4.0000000000000006e-45  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.147887  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3157  peptidase M50  37.43 
 
 
382 aa  178  1e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0149  CBS domain containing protein  34.47 
 
 
377 aa  172  5.999999999999999e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0113637 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0170  CBS domain-containing protein  32.54 
 
 
343 aa  171  2e-41  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.356486  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0116  peptidase M50  33.51 
 
 
365 aa  171  3e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.345861 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0613  peptidase M50  33.96 
 
 
377 aa  169  1e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0236174 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1552  CBS domain-containing protein  33.07 
 
 
378 aa  166  6.9999999999999995e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.651546  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0289  peptidase M50  35.83 
 
 
393 aa  165  1.0000000000000001e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1032  peptidase M50  33.65 
 
 
395 aa  163  5.0000000000000005e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0615226 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2601  peptidase M50  36.79 
 
 
394 aa  162  6e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.603215  normal  0.812434 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0613  peptidase M50  37.5 
 
 
380 aa  158  1e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.750705  normal  0.0786713 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2136  peptidase M50  32.42 
 
 
415 aa  157  3e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.821665  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3134  peptidase M50  33.42 
 
 
386 aa  157  4e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0400  CBS domain-containing protein  34.57 
 
 
378 aa  153  4e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0735736  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1508  peptidase M50  35.87 
 
 
412 aa  153  5e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3297  peptidase M50  39.06 
 
 
258 aa  152  1e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.153314  normal  0.569986 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0459  peptidase M50  31 
 
 
342 aa  149  5e-35  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0769405  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1449  peptidase M50  32.51 
 
 
337 aa  149  6e-35  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0709676 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1185  peptidase M50  32.16 
 
 
338 aa  149  8e-35  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2272  CBS domain-containing protein  33.59 
 
 
384 aa  148  2.0000000000000003e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.29511 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2535  peptidase M50  35.64 
 
 
373 aa  147  3e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.180251  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0406  peptidase M50  32.24 
 
 
380 aa  145  1e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.445518 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1434  CBS domain-containing protein  32.99 
 
 
336 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3672  peptidase M50  33.79 
 
 
375 aa  140  3.9999999999999997e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_675  protease  28.72 
 
 
380 aa  136  5e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000159772  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4785  peptidase M50  32.23 
 
 
373 aa  136  5e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.384856  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1410  peptidase M50  35.22 
 
 
373 aa  136  7.000000000000001e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.226741  normal  0.248277 
 
 
-
 
NC_002936  DET0769  protease family protein  29.24 
 
 
380 aa  135  9.999999999999999e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000172815  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0920  peptidase M50  30.45 
 
 
374 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0947  peptidase M50  30.45 
 
 
374 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1872  peptidase M50  29.15 
 
 
373 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3191  peptidase M50  28.4 
 
 
375 aa  128  2.0000000000000002e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00586872 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2620  hypothetical protein  37.71 
 
 
239 aa  126  5e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00161745  normal  0.443629 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1291  peptidase M50  28.86 
 
 
366 aa  126  7e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00117198  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5283  peptidase M50  32.75 
 
 
390 aa  121  1.9999999999999998e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0695  peptidase M50  31.17 
 
 
379 aa  120  3.9999999999999996e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000836286  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0222  peptidase M50  31.47 
 
 
394 aa  120  4.9999999999999996e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1011  peptidase M50  29.97 
 
 
404 aa  119  7.999999999999999e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2488  peptidase M50  29.75 
 
 
383 aa  118  9.999999999999999e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11470  Zn-dependent protease  31.48 
 
 
388 aa  115  2.0000000000000002e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.844041 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12644  hypothetical protein  31.69 
 
 
393 aa  114  3e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0155  peptidase M50  32.9 
 
 
392 aa  113  5e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1337  peptidase M50  30.49 
 
 
412 aa  113  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0613  peptidase M50  29.62 
 
 
361 aa  112  9e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.190222  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5311  peptidase M50  34.23 
 
 
301 aa  110  4.0000000000000004e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0783881  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1797  peptidase M50  28.74 
 
 
397 aa  110  4.0000000000000004e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1747  peptidase M50  30.42 
 
 
370 aa  107  3e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.951218  normal  0.0691878 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0524  peptidase M50  29.28 
 
 
285 aa  105  9e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.311607  hitchhiker  0.00535986 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5036  peptidase M50  28.84 
 
 
413 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.206475 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1843  peptidase M50  30.45 
 
 
376 aa  105  1e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.616528  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1617  putative protease  30.11 
 
 
286 aa  105  1e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1368  peptidase M50  28.21 
 
 
395 aa  104  2e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00624726  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14160  peptidase M50  30.22 
 
 
272 aa  102  8e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000034797  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3648  peptidase M50  29.97 
 
 
381 aa  102  1e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0203123 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3381  peptidase M50  29.5 
 
 
396 aa  101  2e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.000039902  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4580  stage IV sporulation protein FB  30.5 
 
 
286 aa  101  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000567867  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4344  stage IV sporulation protein FB  29.73 
 
 
286 aa  100  4e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4678  stage IV sporulation protein FB  29.73 
 
 
286 aa  100  4e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0277771  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1412  peptidase M50  29.68 
 
 
383 aa  100  4e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.742384  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2539  peptidase M50  28.79 
 
 
293 aa  100  4e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0160669  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4180  stage IV sporulation protein FB  30.12 
 
 
286 aa  100  5e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0869981  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5902  Zn-dependent protease-like protein  37.69 
 
 
362 aa  100  5e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0267336  normal  0.154235 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4526  stage IV sporulation protein FB  30.12 
 
 
286 aa  100  6e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.870935 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4565  stage IV sporulation protein FB  30.12 
 
 
286 aa  99.8  6e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000384784  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4191  stage IV sporulation protein FB  29.73 
 
 
286 aa  98.6  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0669  stage IV sporulation protein FB  30.94 
 
 
286 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000475668  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22130  Zn-dependent protease  35.78 
 
 
390 aa  97.8  3e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.944872  normal  0.942698 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2627  peptidase M50  30.92 
 
 
405 aa  97.4  3e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2181  hypothetical protein  29.28 
 
 
403 aa  96.3  8e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.392153 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3329  peptidase M50  38.42 
 
 
290 aa  96.3  9e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.014503  normal  0.780198 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1457  peptidase M50  26.92 
 
 
417 aa  95.9  9e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1483  peptidase M50  26.92 
 
 
417 aa  95.9  9e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.511598  normal  0.569675 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4538  stage IV sporulation protein FB  30 
 
 
286 aa  95.9  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.214848  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1456  peptidase M50  30 
 
 
292 aa  95.9  1e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0734  hypothetical protein  32.74 
 
 
416 aa  95.5  1e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.168601  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0700  peptidase M50  24.41 
 
 
370 aa  95.5  1e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0259  peptidase M50  28.44 
 
 
374 aa  94.7  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0774  M50 family metallopeptidase  25.41 
 
 
370 aa  94.4  3e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2637  peptidase M50  28.57 
 
 
378 aa  93.6  5e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.599853  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_680  metallopeptidase, M50 family  25.34 
 
 
371 aa  93.6  5e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0373838  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4292  peptidase M50  27.31 
 
 
286 aa  93.2  6e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1181  peptidase M50  31.72 
 
 
379 aa  93.2  7e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.22871  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4342  peptidase M50  33.67 
 
 
291 aa  92.4  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2415  peptidase M50  26.11 
 
 
424 aa  92.4  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3400  peptidase M50  28.75 
 
 
381 aa  91.7  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1815  hypothetical protein  33.07 
 
 
383 aa  91.7  2e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.434017  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>