190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET0774 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002936  DET0774  M50 family metallopeptidase  100 
 
 
370 aa  751    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0700  peptidase M50  81.67 
 
 
370 aa  626  1e-178  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_680  metallopeptidase, M50 family  81.67 
 
 
371 aa  622  1e-177  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0373838  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0769  protease family protein  35.69 
 
 
380 aa  240  2.9999999999999997e-62  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000172815  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_675  protease  35.42 
 
 
380 aa  239  6.999999999999999e-62  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000159772  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0695  peptidase M50  36.68 
 
 
379 aa  227  2e-58  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000836286  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0222  peptidase M50  34.15 
 
 
394 aa  211  1e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1747  peptidase M50  33.33 
 
 
370 aa  202  9.999999999999999e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.951218  normal  0.0691878 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2488  peptidase M50  33.98 
 
 
383 aa  191  1e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1011  peptidase M50  33.42 
 
 
404 aa  191  2e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1797  peptidase M50  33.43 
 
 
397 aa  186  4e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0259  peptidase M50  28.84 
 
 
374 aa  182  1e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5036  peptidase M50  37.45 
 
 
413 aa  181  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.206475 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3191  peptidase M50  30.99 
 
 
375 aa  177  2e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00586872 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4785  peptidase M50  32.56 
 
 
373 aa  175  9.999999999999999e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.384856  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1872  peptidase M50  30.96 
 
 
373 aa  175  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3381  peptidase M50  30.69 
 
 
396 aa  174  1.9999999999999998e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.000039902  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1337  peptidase M50  33.04 
 
 
412 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0920  peptidase M50  32.85 
 
 
374 aa  173  5e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0947  peptidase M50  32.56 
 
 
374 aa  172  1e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2181  hypothetical protein  34.13 
 
 
403 aa  171  2e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.392153 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1457  peptidase M50  30.81 
 
 
417 aa  166  6.9999999999999995e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1483  peptidase M50  30.81 
 
 
417 aa  166  6.9999999999999995e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.511598  normal  0.569675 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1368  peptidase M50  30.03 
 
 
395 aa  164  2.0000000000000002e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00624726  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1410  peptidase M50  32.58 
 
 
373 aa  164  3e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.226741  normal  0.248277 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1291  peptidase M50  29.12 
 
 
366 aa  161  1e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00117198  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12644  hypothetical protein  29.79 
 
 
393 aa  156  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11470  Zn-dependent protease  30.39 
 
 
388 aa  156  5.0000000000000005e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.844041 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3648  peptidase M50  30.17 
 
 
381 aa  156  5.0000000000000005e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0203123 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0155  peptidase M50  30.47 
 
 
392 aa  150  3e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3400  peptidase M50  29.68 
 
 
381 aa  149  9e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2272  CBS domain-containing protein  29.63 
 
 
384 aa  147  3e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.29511 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2627  peptidase M50  30.75 
 
 
405 aa  142  7e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1412  peptidase M50  30.28 
 
 
383 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.742384  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5283  peptidase M50  31.65 
 
 
390 aa  140  3e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3922  peptidase M50  28.21 
 
 
385 aa  138  2e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.558191 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1843  peptidase M50  39.09 
 
 
376 aa  136  6.0000000000000005e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.616528  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22910  Zn-dependent protease  33.48 
 
 
244 aa  135  9e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.511612  normal  0.351338 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2136  peptidase M50  29.32 
 
 
415 aa  133  3.9999999999999996e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.821665  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0978  hypothetical protein  31.89 
 
 
364 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0318  CBS domain-containing protein  27.23 
 
 
370 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.147887  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1552  CBS domain-containing protein  29.29 
 
 
378 aa  131  2.0000000000000002e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.651546  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0289  peptidase M50  26.32 
 
 
393 aa  129  9.000000000000001e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0613  peptidase M50  28.49 
 
 
377 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0236174 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2355  peptidase M50  31.5 
 
 
396 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0704943  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0400  CBS domain-containing protein  25.27 
 
 
378 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0735736  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0149  CBS domain containing protein  29.21 
 
 
377 aa  125  9e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0113637 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2415  peptidase M50  32.57 
 
 
424 aa  125  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4494  peptidase M50  31.04 
 
 
381 aa  124  2e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1815  hypothetical protein  37.69 
 
 
383 aa  124  4e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.434017  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5902  Zn-dependent protease-like protein  35.05 
 
 
362 aa  123  6e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0267336  normal  0.154235 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1032  peptidase M50  25.96 
 
 
395 aa  122  8e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0615226 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0613  peptidase M50  27.79 
 
 
361 aa  122  9.999999999999999e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.190222  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1479  peptidase M50  32.54 
 
 
384 aa  119  6e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0658829  normal  0.564629 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0734  hypothetical protein  34.41 
 
 
416 aa  117  1.9999999999999998e-25  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.168601  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2535  peptidase M50  28.78 
 
 
373 aa  116  5e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.180251  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0406  peptidase M50  30.73 
 
 
380 aa  116  7.999999999999999e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.445518 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05401  Zn-dependent protease  29.85 
 
 
413 aa  115  8.999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1629  hypothetical protein  28.44 
 
 
431 aa  115  1.0000000000000001e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1508  peptidase M50  25.52 
 
 
412 aa  115  2.0000000000000002e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3134  peptidase M50  36.61 
 
 
386 aa  113  6e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1185  peptidase M50  27.84 
 
 
338 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0459  peptidase M50  26.88 
 
 
342 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0769405  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2305  peptidase M50  33.5 
 
 
362 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00177185  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1868  hypothetical protein  29.6 
 
 
396 aa  109  7.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.180278  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2601  peptidase M50  26.35 
 
 
394 aa  109  8.000000000000001e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.603215  normal  0.812434 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05931  Zn-dependent proteases  28.35 
 
 
405 aa  108  2e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.111882  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1449  peptidase M50  25.51 
 
 
337 aa  108  2e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0709676 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3672  peptidase M50  27.88 
 
 
375 aa  107  3e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07871  Zn-dependent protease  31.23 
 
 
422 aa  106  6e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2620  hypothetical protein  28.81 
 
 
239 aa  105  2e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00161745  normal  0.443629 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1617  putative protease  34.45 
 
 
286 aa  104  2e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2223  peptidase M50  28.53 
 
 
376 aa  102  8e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1731  peptidase M50  27.18 
 
 
366 aa  102  8e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2633  peptidase M50  31.68 
 
 
405 aa  102  1e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.962625  normal  0.303399 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2637  peptidase M50  32.84 
 
 
378 aa  102  1e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.599853  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3165  peptidase M50  35.21 
 
 
376 aa  101  2e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1914  peptidase M50  27.18 
 
 
387 aa  99.8  6e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000446293 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1434  CBS domain-containing protein  28.61 
 
 
336 aa  99.4  8e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0116  peptidase M50  28.26 
 
 
365 aa  99  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.345861 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0170  CBS domain-containing protein  38.06 
 
 
343 aa  98.2  2e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.356486  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05641  Zn-dependent protease  23.53 
 
 
407 aa  97.8  3e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.394997  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22130  Zn-dependent protease  24.47 
 
 
390 aa  97.4  3e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.944872  normal  0.942698 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2237  peptidase M50  37.24 
 
 
359 aa  96.3  8e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.949585  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05941  Zn-dependent proteases  23.37 
 
 
407 aa  95.1  2e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3750  peptidase M50  25.41 
 
 
372 aa  94.4  3e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.69281  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2006  peptidase M50  32.24 
 
 
376 aa  92.8  9e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.223407  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4885  peptidase M50  24.34 
 
 
397 aa  92.8  9e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.333233 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2201  peptidase M50  31.28 
 
 
375 aa  92  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5311  peptidase M50  35 
 
 
301 aa  91.3  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0783881  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4923  peptidase M50  32.7 
 
 
373 aa  92  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.465017 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0524  peptidase M50  30.2 
 
 
285 aa  91.7  2e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.311607  hitchhiker  0.00535986 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2539  peptidase M50  39.07 
 
 
293 aa  90.1  5e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0160669  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0540  peptidase M50  27.52 
 
 
364 aa  89.7  7e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4475  peptidase M50  27.67 
 
 
400 aa  89.7  7e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.580173  normal  0.145803 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1181  peptidase M50  26.71 
 
 
379 aa  89  1e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.22871  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13940  Zn-dependent protease  29.92 
 
 
379 aa  88.2  2e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.909069 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0538  hypothetical protein  24.51 
 
 
407 aa  88.2  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.428838  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2354  peptidase M50  34.78 
 
 
386 aa  88.6  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.176917 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14160  peptidase M50  34.21 
 
 
272 aa  87.4  3e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000034797  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>