More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_3165 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_3165  peptidase M50  100 
 
 
376 aa  743    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3750  peptidase M50  41.53 
 
 
372 aa  258  9e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.69281  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3626  peptidase M50  44.8 
 
 
368 aa  254  1.0000000000000001e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.721542 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2201  peptidase M50  41.48 
 
 
375 aa  245  9.999999999999999e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4923  peptidase M50  41.21 
 
 
373 aa  241  1e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.465017 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0832  peptidase M50  43.05 
 
 
370 aa  241  1e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1988  peptidase M50  39.42 
 
 
373 aa  233  3e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.319732 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0540  peptidase M50  37.87 
 
 
364 aa  229  5e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0458  peptidase M50  41.32 
 
 
377 aa  226  7e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0639554  normal  0.134701 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1497  peptidase M50  40.26 
 
 
372 aa  222  9.999999999999999e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.120961  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0694  peptidase M50  40.98 
 
 
366 aa  220  3e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.232631 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0149  CBS domain containing protein  38.14 
 
 
377 aa  211  2e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0113637 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1552  CBS domain-containing protein  34.72 
 
 
378 aa  202  9.999999999999999e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.651546  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0289  peptidase M50  35.82 
 
 
393 aa  197  2.0000000000000003e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1185  peptidase M50  35.39 
 
 
338 aa  196  8.000000000000001e-49  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2601  peptidase M50  36.27 
 
 
394 aa  194  2e-48  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.603215  normal  0.812434 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0613  peptidase M50  35.2 
 
 
377 aa  193  3e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0236174 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3157  peptidase M50  37.21 
 
 
382 aa  192  7e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2136  peptidase M50  36.14 
 
 
415 aa  192  8e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.821665  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1449  peptidase M50  35.56 
 
 
337 aa  191  2e-47  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0709676 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0459  peptidase M50  39.74 
 
 
342 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0769405  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2272  CBS domain-containing protein  34.76 
 
 
384 aa  190  2.9999999999999997e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.29511 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2308  peptidase M50  36.15 
 
 
385 aa  187  2e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0318  CBS domain-containing protein  33.33 
 
 
370 aa  186  4e-46  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.147887  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1032  peptidase M50  35.45 
 
 
395 aa  185  1.0000000000000001e-45  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0615226 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0400  CBS domain-containing protein  36.27 
 
 
378 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0735736  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0170  CBS domain-containing protein  36.26 
 
 
343 aa  184  3e-45  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.356486  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0978  hypothetical protein  33.51 
 
 
364 aa  181  2e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1508  peptidase M50  34.84 
 
 
412 aa  177  4e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1434  CBS domain-containing protein  36.34 
 
 
336 aa  169  9e-41  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0769  protease family protein  31.79 
 
 
380 aa  168  1e-40  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000172815  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3134  peptidase M50  33.25 
 
 
386 aa  167  4e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_675  protease  31.28 
 
 
380 aa  165  1.0000000000000001e-39  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000159772  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1731  peptidase M50  32.89 
 
 
366 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0116  peptidase M50  32.72 
 
 
365 aa  157  2e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.345861 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3672  peptidase M50  33.42 
 
 
375 aa  157  3e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0695  peptidase M50  31.77 
 
 
379 aa  153  5.9999999999999996e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000836286  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11470  Zn-dependent protease  32.89 
 
 
388 aa  152  1e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.844041 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1291  peptidase M50  29.6 
 
 
366 aa  149  7e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00117198  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0406  peptidase M50  33.85 
 
 
380 aa  149  9e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.445518 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3297  peptidase M50  37.39 
 
 
258 aa  143  5e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.153314  normal  0.569986 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0222  peptidase M50  31.45 
 
 
394 aa  142  8e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0613  peptidase M50  36.25 
 
 
380 aa  142  9e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.750705  normal  0.0786713 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2620  hypothetical protein  37.25 
 
 
239 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00161745  normal  0.443629 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2535  peptidase M50  34.94 
 
 
373 aa  140  3e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.180251  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4785  peptidase M50  29.37 
 
 
373 aa  137  3.0000000000000003e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.384856  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2488  peptidase M50  32.62 
 
 
383 aa  135  9.999999999999999e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1410  peptidase M50  33.24 
 
 
373 aa  134  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.226741  normal  0.248277 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4494  peptidase M50  31.22 
 
 
381 aa  130  3e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2627  peptidase M50  31 
 
 
405 aa  129  9.000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1872  peptidase M50  29.8 
 
 
373 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1747  peptidase M50  29.65 
 
 
370 aa  129  1.0000000000000001e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.951218  normal  0.0691878 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3648  peptidase M50  30.83 
 
 
381 aa  125  1e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0203123 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3191  peptidase M50  28.64 
 
 
375 aa  120  3e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00586872 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0259  peptidase M50  30.25 
 
 
374 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5283  peptidase M50  29.72 
 
 
390 aa  119  6e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1011  peptidase M50  29.37 
 
 
404 aa  119  7.999999999999999e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0155  peptidase M50  32.48 
 
 
392 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3400  peptidase M50  29.53 
 
 
381 aa  116  6.9999999999999995e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5311  peptidase M50  35.92 
 
 
301 aa  115  2.0000000000000002e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0783881  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1617  putative protease  30.39 
 
 
286 aa  112  9e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2415  peptidase M50  27.95 
 
 
424 aa  111  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1412  peptidase M50  29.29 
 
 
383 aa  110  5e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.742384  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1797  peptidase M50  31.15 
 
 
397 aa  108  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5036  peptidase M50  33.08 
 
 
413 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.206475 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2355  peptidase M50  31.31 
 
 
396 aa  107  4e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0704943  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12644  hypothetical protein  28.13 
 
 
393 aa  107  5e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2539  peptidase M50  34.5 
 
 
293 aa  106  6e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0160669  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0700  peptidase M50  26.01 
 
 
370 aa  105  1e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3381  peptidase M50  30.05 
 
 
396 aa  103  4e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.000039902  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0613  peptidase M50  33.23 
 
 
361 aa  103  4e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.190222  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1368  peptidase M50  30.43 
 
 
395 aa  103  6e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00624726  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1843  peptidase M50  28.5 
 
 
376 aa  103  6e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.616528  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0774  M50 family metallopeptidase  34.7 
 
 
370 aa  102  1e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0947  peptidase M50  27.41 
 
 
374 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0920  peptidase M50  27.41 
 
 
374 aa  101  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14160  peptidase M50  31.8 
 
 
272 aa  100  4e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000034797  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_680  metallopeptidase, M50 family  33.18 
 
 
371 aa  99  1e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0373838  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0524  peptidase M50  33.19 
 
 
285 aa  98.6  2e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.311607  hitchhiker  0.00535986 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0734  hypothetical protein  27.56 
 
 
416 aa  98.6  2e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.168601  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3329  peptidase M50  28.95 
 
 
290 aa  97.8  3e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.014503  normal  0.780198 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1629  hypothetical protein  26.7 
 
 
431 aa  96.7  6e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4342  peptidase M50  33.05 
 
 
291 aa  96.7  6e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1815  hypothetical protein  30.63 
 
 
383 aa  95.9  1e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.434017  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2305  peptidase M50  27.7 
 
 
362 aa  92.4  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00177185  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4885  peptidase M50  28.08 
 
 
397 aa  91.7  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.333233 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2223  peptidase M50  29.19 
 
 
376 aa  90.5  4e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1456  peptidase M50  29.74 
 
 
292 aa  90.5  5e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1483  peptidase M50  33.01 
 
 
417 aa  88.2  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.511598  normal  0.569675 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1337  peptidase M50  26.65 
 
 
412 aa  88.2  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1457  peptidase M50  33.01 
 
 
417 aa  88.2  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5902  Zn-dependent protease-like protein  27.15 
 
 
362 aa  87.4  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0267336  normal  0.154235 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4475  peptidase M50  32.58 
 
 
400 aa  87  5e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.580173  normal  0.145803 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1483  peptidase M50  26.61 
 
 
365 aa  84.7  0.000000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4344  stage IV sporulation protein FB  23.95 
 
 
286 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4678  stage IV sporulation protein FB  23.95 
 
 
286 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0277771  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4526  stage IV sporulation protein FB  24.33 
 
 
286 aa  84  0.000000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.870935 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2181  hypothetical protein  28.46 
 
 
403 aa  84  0.000000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.392153 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4580  stage IV sporulation protein FB  26.44 
 
 
286 aa  84  0.000000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000567867  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2637  peptidase M50  25 
 
 
378 aa  83.6  0.000000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.599853  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>