More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_4923 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_4923  peptidase M50  100 
 
 		 373 aa  745    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.465017 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2201  peptidase M50  71.82 
 
 		 375 aa  527  1e-148  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1988  peptidase M50  54.52 
 
 		 373 aa  419  1e-116  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.319732 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3750  peptidase M50  54.85 
 
 		 372 aa  396  1e-109  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.69281  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1497  peptidase M50  55.56 
 
 		 372 aa  375  1e-103  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.120961  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0694  peptidase M50  55.46 
 
 		 366 aa  367  1e-100  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.232631 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0458  peptidase M50  53.69 
 
 		 377 aa  342  5.999999999999999e-93  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0639554  normal  0.134701 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0540  peptidase M50  48.45 
 
 		 364 aa  330  3e-89  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3626  peptidase M50  48.08 
 
 		 368 aa  288  1e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.721542 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0832  peptidase M50  47.49 
 
 		 370 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3165  peptidase M50  40.93 
 
 		 376 aa  229  4e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3157  peptidase M50  38.61 
 
 		 382 aa  189  5.999999999999999e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2308  peptidase M50  37.95 
 
 		 385 aa  188  1e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1731  peptidase M50  35.53 
 
 		 366 aa  186  8e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0289  peptidase M50  35.45 
 
 		 393 aa  177  2e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0613  peptidase M50  31.84 
 
 		 377 aa  177  3e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0236174 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0116  peptidase M50  34.63 
 
 		 365 aa  174  1.9999999999999998e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.345861 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0170  CBS domain-containing protein  31.52 
 
 		 343 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.356486  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0318  CBS domain-containing protein  32.51 
 
 		 370 aa  172  1e-41  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.147887  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1032  peptidase M50  33.88 
 
 		 395 aa  171  3e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0615226 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0149  CBS domain containing protein  33.16 
 
 		 377 aa  169  8e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0113637 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0459  peptidase M50  33.04 
 
 		 342 aa  168  1e-40  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0769405  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2272  CBS domain-containing protein  31.56 
 
 		 384 aa  167  2e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.29511 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1449  peptidase M50  30.86 
 
 		 337 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0709676 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0978  hypothetical protein  29.62 
 
 		 364 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2601  peptidase M50  34.67 
 
 		 394 aa  163  4.0000000000000004e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.603215  normal  0.812434 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1185  peptidase M50  30.79 
 
 		 338 aa  163  6e-39  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2136  peptidase M50  33.89 
 
 		 415 aa  161  1e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.821665  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1552  CBS domain-containing protein  31.17 
 
 		 378 aa  161  2e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.651546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1508  peptidase M50  35.29 
 
 		 412 aa  160  3e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_675  protease  32.71 
 
 		 380 aa  159  8e-38  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000159772  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0769  protease family protein  32.89 
 
 		 380 aa  157  3e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000172815  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3297  peptidase M50  39.15 
 
 		 258 aa  155  1e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.153314  normal  0.569986 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0406  peptidase M50  30.86 
 
 		 380 aa  153  5.9999999999999996e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.445518 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0400  CBS domain-containing protein  32.89 
 
 		 378 aa  152  8.999999999999999e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0735736  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1434  CBS domain-containing protein  33.55 
 
 		 336 aa  151  2e-35  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3672  peptidase M50  31.56 
 
 		 375 aa  141  1.9999999999999998e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3134  peptidase M50  32.02 
 
 		 386 aa  141  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2535  peptidase M50  32.79 
 
 		 373 aa  133  5e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.180251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0695  peptidase M50  29.47 
 
 		 379 aa  130  5.0000000000000004e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000836286  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4785  peptidase M50  29.13 
 
 		 373 aa  130  5.0000000000000004e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.384856  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11470  Zn-dependent protease  33.44 
 
 		 388 aa  129  6e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.844041 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0613  peptidase M50  31.27 
 
 		 380 aa  129  6e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.750705  normal  0.0786713 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5283  peptidase M50  32.52 
 
 		 390 aa  128  2.0000000000000002e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1291  peptidase M50  30.72 
 
 		 366 aa  125  9e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00117198  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1410  peptidase M50  32.18 
 
 		 373 aa  125  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.226741  normal  0.248277 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0613  peptidase M50  28.65 
 
 		 361 aa  125  2e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.190222  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3191  peptidase M50  25.32 
 
 		 375 aa  124  3e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00586872 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0222  peptidase M50  30.56 
 
 		 394 aa  124  4e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1797  peptidase M50  28.84 
 
 		 397 aa  122  7e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2620  hypothetical protein  34.16 
 
 		 239 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00161745  normal  0.443629 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0155  peptidase M50  33.12 
 
 		 392 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0920  peptidase M50  26.8 
 
 		 374 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2488  peptidase M50  29.06 
 
 		 383 aa  111  2.0000000000000002e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0947  peptidase M50  26.8 
 
 		 374 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1872  peptidase M50  24.28 
 
 		 373 aa  109  7.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2355  peptidase M50  32.29 
 
 		 396 aa  108  1e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0704943  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3381  peptidase M50  27.55 
 
 		 396 aa  109  1e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.000039902  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1337  peptidase M50  27.49 
 
 		 412 aa  109  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0259  peptidase M50  26.92 
 
 		 374 aa  108  2e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3400  peptidase M50  31.97 
 
 		 381 aa  106  7e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3648  peptidase M50  30.71 
 
 		 381 aa  106  8e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0203123 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1011  peptidase M50  28.57 
 
 		 404 aa  105  9e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5036  peptidase M50  30.36 
 
 		 413 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.206475 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2539  peptidase M50  30.15 
 
 		 293 aa  105  2e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0160669  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1483  peptidase M50  26.1 
 
 		 417 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.511598  normal  0.569675 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1457  peptidase M50  26.1 
 
 		 417 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2627  peptidase M50  32.46 
 
 		 405 aa  104  3e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1747  peptidase M50  27.76 
 
 		 370 aa  102  1e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.951218  normal  0.0691878 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5311  peptidase M50  32.84 
 
 		 301 aa  101  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0783881  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1456  peptidase M50  32.06 
 
 		 292 aa  100  5e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1843  peptidase M50  35.53 
 
 		 376 aa  99  1e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.616528  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2181  hypothetical protein  26.81 
 
 		 403 aa  96.7  6e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.392153 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0524  peptidase M50  35 
 
 		 285 aa  95.1  2e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.311607  hitchhiker  0.00535986 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_680  metallopeptidase, M50 family  35.44 
 
 		 371 aa  94.7  2e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0373838  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1412  peptidase M50  28.42 
 
 		 383 aa  94.4  3e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.742384  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5902  Zn-dependent protease-like protein  34.18 
 
 		 362 aa  93.2  7e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0267336  normal  0.154235 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1368  peptidase M50  29.03 
 
 		 395 aa  92.8  8e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00624726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2415  peptidase M50  27.96 
 
 		 424 aa  92.4  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4494  peptidase M50  31.19 
 
 		 381 aa  92  1e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3329  peptidase M50  34.22 
 
 		 290 aa  92.4  1e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.014503  normal  0.780198 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1617  putative protease  35.38 
 
 		 286 aa  92.4  1e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0774  M50 family metallopeptidase  32.7 
 
 		 370 aa  92  2e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0700  peptidase M50  25.48 
 
 		 370 aa  92  2e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2637  peptidase M50  30.74 
 
 		 378 aa  90.5  4e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.599853  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3922  peptidase M50  25.68 
 
 		 385 aa  90.1  5e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.558191 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14160  peptidase M50  29.44 
 
 		 272 aa  89.7  7e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000034797  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1815  hypothetical protein  38.66 
 
 		 383 aa  86.3  8e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.434017  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0786  M50 family peptidase  38.24 
 
 		 344 aa  85.5  0.000000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0883958  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12644  hypothetical protein  27.96 
 
 		 393 aa  85.5  0.000000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0734  hypothetical protein  27.69 
 
 		 416 aa  85.9  0.000000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.168601  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1762  putative peptidase  33.76 
 
 		 360 aa  83.6  0.000000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.0051203  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2237  peptidase M50  38.1 
 
 		 359 aa  83.2  0.000000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.949585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22130  Zn-dependent protease  32.52 
 
 		 390 aa  81.6  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.944872  normal  0.942698 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2305  peptidase M50  37.16 
 
 		 362 aa  81.3  0.00000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00177185  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4475  peptidase M50  25.14 
 
 		 400 aa  81.3  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.580173  normal  0.145803 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4342  peptidase M50  25.32 
 
 		 291 aa  80.5  0.00000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1818  peptidase M50  35.1 
 
 		 302 aa  79  0.0000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0483  hypothetical protein  36.59 
 
 		 360 aa  78.6  0.0000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000119997  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1181  peptidase M50  26.09 
 
 		 379 aa  77.8  0.0000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.22871  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>