220 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1617 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_1617  putative protease  100 
 
 
286 aa  565  1e-160  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3329  peptidase M50  38.21 
 
 
290 aa  187  1e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.014503  normal  0.780198 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2539  peptidase M50  39.64 
 
 
293 aa  186  4e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0160669  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0524  peptidase M50  34.63 
 
 
285 aa  172  5.999999999999999e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.311607  hitchhiker  0.00535986 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1456  peptidase M50  34.27 
 
 
292 aa  153  4e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2124  peptidase M50  30.32 
 
 
284 aa  149  6e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000917211  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14160  peptidase M50  34.81 
 
 
272 aa  138  8.999999999999999e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000034797  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4342  peptidase M50  32.65 
 
 
291 aa  136  4e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0549  peptidase M50  33.08 
 
 
293 aa  117  1.9999999999999998e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00818515  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0459  peptidase M50  32.67 
 
 
342 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0769405  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1185  peptidase M50  31.9 
 
 
338 aa  113  3e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1449  peptidase M50  31.54 
 
 
337 aa  112  5e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0709676 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0170  CBS domain-containing protein  31.79 
 
 
343 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.356486  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1818  peptidase M50  31.62 
 
 
302 aa  111  2.0000000000000002e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3165  peptidase M50  29.24 
 
 
376 aa  107  2e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1434  CBS domain-containing protein  33.86 
 
 
336 aa  107  2e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3750  peptidase M50  30.11 
 
 
372 aa  105  7e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.69281  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0774  M50 family metallopeptidase  34.45 
 
 
370 aa  104  1e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3626  peptidase M50  35.35 
 
 
368 aa  103  5e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.721542 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_680  metallopeptidase, M50 family  32 
 
 
371 aa  101  2e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0373838  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0669  stage IV sporulation protein FB  31.43 
 
 
286 aa  99.8  5e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000475668  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1988  peptidase M50  27.64 
 
 
373 aa  99.4  7e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.319732 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2305  peptidase M50  32.83 
 
 
362 aa  99  9e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00177185  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1291  peptidase M50  37.67 
 
 
366 aa  98.6  1e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00117198  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0700  peptidase M50  37.43 
 
 
370 aa  98.6  1e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4475  peptidase M50  27.99 
 
 
400 aa  95.9  6e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.580173  normal  0.145803 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0694  peptidase M50  28.72 
 
 
366 aa  94.7  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.232631 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0978  hypothetical protein  30.88 
 
 
364 aa  94.7  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2201  peptidase M50  31.3 
 
 
375 aa  94.4  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5036  peptidase M50  39.61 
 
 
413 aa  94  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.206475 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2620  hypothetical protein  31.33 
 
 
239 aa  94  3e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00161745  normal  0.443629 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1497  peptidase M50  29.05 
 
 
372 aa  94  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.120961  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5311  peptidase M50  37.36 
 
 
301 aa  94  3e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0783881  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0149  CBS domain containing protein  30.54 
 
 
377 aa  93.2  5e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0113637 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1747  peptidase M50  35.8 
 
 
370 aa  92.4  8e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.951218  normal  0.0691878 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4923  peptidase M50  35.38 
 
 
373 aa  92.4  8e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.465017 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1843  peptidase M50  28.12 
 
 
376 aa  92  9e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.616528  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1815  hypothetical protein  28.57 
 
 
383 aa  92  1e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.434017  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3297  peptidase M50  33.12 
 
 
258 aa  91.7  1e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.153314  normal  0.569986 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4565  stage IV sporulation protein FB  29.52 
 
 
286 aa  92  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000384784  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0318  CBS domain-containing protein  34.03 
 
 
370 aa  92  1e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.147887  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2272  CBS domain-containing protein  32.42 
 
 
384 aa  91.7  1e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.29511 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0613  peptidase M50  35.16 
 
 
377 aa  90.9  2e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0236174 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1011  peptidase M50  35.4 
 
 
404 aa  90.1  4e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2547  peptidase M50  24.81 
 
 
301 aa  89.7  5e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000136347  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0540  peptidase M50  31.34 
 
 
364 aa  89  8e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0832  peptidase M50  37.06 
 
 
370 aa  88.6  1e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_675  protease  33.91 
 
 
380 aa  88.6  1e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000159772  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1629  hypothetical protein  31.97 
 
 
431 aa  88.6  1e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1368  peptidase M50  36.61 
 
 
395 aa  88.6  1e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00624726  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0769  protease family protein  33.33 
 
 
380 aa  87.4  2e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000172815  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1552  CBS domain-containing protein  30.33 
 
 
378 aa  87.8  2e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.651546  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1731  peptidase M50  37.14 
 
 
366 aa  87.4  2e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1508  peptidase M50  37.96 
 
 
412 aa  87  3e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4191  stage IV sporulation protein FB  28.1 
 
 
286 aa  86.7  5e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0098  peptidase M50  23.74 
 
 
269 aa  85.9  6e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4580  stage IV sporulation protein FB  27.62 
 
 
286 aa  85.9  6e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000567867  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3381  peptidase M50  34.27 
 
 
396 aa  85.5  8e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.000039902  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4180  stage IV sporulation protein FB  27.62 
 
 
286 aa  85.5  9e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0869981  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1032  peptidase M50  32.46 
 
 
395 aa  85.5  9e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0615226 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4292  peptidase M50  27.62 
 
 
286 aa  85.5  9e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4344  stage IV sporulation protein FB  27.62 
 
 
286 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1797  peptidase M50  31.63 
 
 
397 aa  85.1  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4678  stage IV sporulation protein FB  27.62 
 
 
286 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0277771  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0400  CBS domain-containing protein  38.73 
 
 
378 aa  85.1  0.000000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0735736  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4526  stage IV sporulation protein FB  27.62 
 
 
286 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.870935 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1914  peptidase M50  26.21 
 
 
387 aa  84  0.000000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000446293 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3134  peptidase M50  33.91 
 
 
386 aa  84.3  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1457  peptidase M50  30.88 
 
 
417 aa  84.7  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2535  peptidase M50  33.85 
 
 
373 aa  84.7  0.000000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.180251  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1483  peptidase M50  30.88 
 
 
417 aa  84.7  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.511598  normal  0.569675 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4785  peptidase M50  31.66 
 
 
373 aa  84  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.384856  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1479  peptidase M50  38.27 
 
 
384 aa  84  0.000000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0658829  normal  0.564629 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0695  peptidase M50  35.4 
 
 
379 aa  83.6  0.000000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000836286  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4538  stage IV sporulation protein FB  27.62 
 
 
286 aa  83.2  0.000000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.214848  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0259  peptidase M50  33.84 
 
 
374 aa  83.6  0.000000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0458  peptidase M50  31.11 
 
 
377 aa  82.8  0.000000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0639554  normal  0.134701 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1872  peptidase M50  34.18 
 
 
373 aa  82.4  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0734  hypothetical protein  31.47 
 
 
416 aa  82.4  0.000000000000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.168601  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2389  M50 family peptidase  24.5 
 
 
284 aa  82  0.000000000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2488  peptidase M50  32.91 
 
 
383 aa  82.4  0.000000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1483  peptidase M50  31.19 
 
 
365 aa  82  0.000000000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13940  Zn-dependent protease  27.94 
 
 
379 aa  81.6  0.00000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.909069 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2415  peptidase M50  24.7 
 
 
424 aa  82  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3191  peptidase M50  30.26 
 
 
375 aa  80.9  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00586872 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1337  peptidase M50  37.24 
 
 
412 aa  81.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1410  peptidase M50  31.98 
 
 
373 aa  80.1  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.226741  normal  0.248277 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16220  Zn-dependent protease  33.5 
 
 
395 aa  80.9  0.00000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.276827  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0406  peptidase M50  31.82 
 
 
380 aa  80.5  0.00000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.445518 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0289  peptidase M50  34.16 
 
 
393 aa  80.5  0.00000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2308  peptidase M50  32.35 
 
 
385 aa  80.5  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2181  hypothetical protein  30.85 
 
 
403 aa  80.1  0.00000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.392153 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2101  M50 family peptidase  23.98 
 
 
284 aa  79.7  0.00000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00808635  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3157  peptidase M50  31.37 
 
 
382 aa  79.3  0.00000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0920  peptidase M50  34.01 
 
 
374 aa  79  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0947  peptidase M50  34.01 
 
 
374 aa  79  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0222  peptidase M50  31.05 
 
 
394 aa  78.2  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2136  peptidase M50  34.56 
 
 
415 aa  79  0.0000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.821665  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3648  peptidase M50  30.15 
 
 
381 aa  78.2  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0203123 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2601  peptidase M50  28.97 
 
 
394 aa  77.8  0.0000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.603215  normal  0.812434 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>