More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3626 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_3626  peptidase M50  100 
 
 
368 aa  738    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.721542 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0832  peptidase M50  52.62 
 
 
370 aa  320  3e-86  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2201  peptidase M50  49.17 
 
 
375 aa  312  5.999999999999999e-84  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1988  peptidase M50  47.96 
 
 
373 aa  307  2.0000000000000002e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.319732 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4923  peptidase M50  48.08 
 
 
373 aa  301  1e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.465017 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0540  peptidase M50  46.81 
 
 
364 aa  300  2e-80  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3750  peptidase M50  48.9 
 
 
372 aa  300  2e-80  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.69281  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1497  peptidase M50  47.5 
 
 
372 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.120961  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0694  peptidase M50  47.78 
 
 
366 aa  269  5.9999999999999995e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.232631 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3165  peptidase M50  44.53 
 
 
376 aa  262  8e-69  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0458  peptidase M50  43.85 
 
 
377 aa  248  1e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0639554  normal  0.134701 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3157  peptidase M50  38.87 
 
 
382 aa  219  7.999999999999999e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2308  peptidase M50  39.57 
 
 
385 aa  215  9.999999999999999e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2272  CBS domain-containing protein  36.34 
 
 
384 aa  203  4e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.29511 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1552  CBS domain-containing protein  33.95 
 
 
378 aa  196  5.000000000000001e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.651546  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0149  CBS domain containing protein  33.51 
 
 
377 aa  191  1e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0113637 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0318  CBS domain-containing protein  32.51 
 
 
370 aa  187  4e-46  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.147887  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0613  peptidase M50  33.6 
 
 
377 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0236174 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0116  peptidase M50  36.41 
 
 
365 aa  181  2.9999999999999997e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.345861 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0289  peptidase M50  33.17 
 
 
393 aa  177  2e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1508  peptidase M50  34.69 
 
 
412 aa  175  9.999999999999999e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0978  hypothetical protein  30.99 
 
 
364 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2136  peptidase M50  32.88 
 
 
415 aa  174  2.9999999999999996e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.821665  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1032  peptidase M50  33.33 
 
 
395 aa  171  1e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0615226 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0400  CBS domain-containing protein  35.22 
 
 
378 aa  171  3e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0735736  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1731  peptidase M50  34.33 
 
 
366 aa  168  2e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0769  protease family protein  30.89 
 
 
380 aa  166  4e-40  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000172815  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_675  protease  29.95 
 
 
380 aa  166  4e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000159772  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2601  peptidase M50  32.26 
 
 
394 aa  165  1.0000000000000001e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.603215  normal  0.812434 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0406  peptidase M50  34.62 
 
 
380 aa  164  2.0000000000000002e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.445518 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1449  peptidase M50  31.43 
 
 
337 aa  161  2e-38  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0709676 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1185  peptidase M50  30.57 
 
 
338 aa  160  2e-38  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0459  peptidase M50  30.92 
 
 
342 aa  159  5e-38  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0769405  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0170  CBS domain-containing protein  29.8 
 
 
343 aa  156  6e-37  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.356486  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3134  peptidase M50  33.42 
 
 
386 aa  149  7e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1011  peptidase M50  32.14 
 
 
404 aa  147  3e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1747  peptidase M50  29.37 
 
 
370 aa  143  5e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.951218  normal  0.0691878 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3297  peptidase M50  37.55 
 
 
258 aa  143  5e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.153314  normal  0.569986 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0695  peptidase M50  28.46 
 
 
379 aa  142  8e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000836286  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1434  CBS domain-containing protein  32.09 
 
 
336 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3672  peptidase M50  35.53 
 
 
375 aa  140  3.9999999999999997e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0613  peptidase M50  33.15 
 
 
380 aa  138  1e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.750705  normal  0.0786713 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0222  peptidase M50  31.79 
 
 
394 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1337  peptidase M50  30.14 
 
 
412 aa  136  5e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3400  peptidase M50  30.85 
 
 
381 aa  135  9.999999999999999e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5283  peptidase M50  32.08 
 
 
390 aa  134  3e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3648  peptidase M50  32.3 
 
 
381 aa  132  7.999999999999999e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0203123 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4785  peptidase M50  32.43 
 
 
373 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.384856  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2535  peptidase M50  32.49 
 
 
373 aa  132  1.0000000000000001e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.180251  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5036  peptidase M50  29.56 
 
 
413 aa  130  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.206475 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1872  peptidase M50  29.79 
 
 
373 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1410  peptidase M50  31.97 
 
 
373 aa  124  3e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.226741  normal  0.248277 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11470  Zn-dependent protease  30.67 
 
 
388 aa  124  3e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.844041 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1291  peptidase M50  26.03 
 
 
366 aa  124  3e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00117198  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3191  peptidase M50  27.96 
 
 
375 aa  123  5e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00586872 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1797  peptidase M50  30.66 
 
 
397 aa  120  3e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2488  peptidase M50  27.69 
 
 
383 aa  120  3e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3381  peptidase M50  31.77 
 
 
396 aa  120  4.9999999999999996e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.000039902  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1483  peptidase M50  26.68 
 
 
417 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.511598  normal  0.569675 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1457  peptidase M50  26.68 
 
 
417 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0920  peptidase M50  29.23 
 
 
374 aa  116  6e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2620  hypothetical protein  34.19 
 
 
239 aa  116  6.9999999999999995e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00161745  normal  0.443629 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0613  peptidase M50  29.09 
 
 
361 aa  116  7.999999999999999e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.190222  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0947  peptidase M50  29.23 
 
 
374 aa  115  8.999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2627  peptidase M50  30.05 
 
 
405 aa  114  3e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2539  peptidase M50  43.09 
 
 
293 aa  114  4.0000000000000004e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0160669  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1368  peptidase M50  26.13 
 
 
395 aa  112  7.000000000000001e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00624726  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4494  peptidase M50  29.58 
 
 
381 aa  111  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0259  peptidase M50  26.02 
 
 
374 aa  110  3e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5311  peptidase M50  36.32 
 
 
301 aa  110  5e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0783881  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1815  hypothetical protein  33.77 
 
 
383 aa  107  3e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.434017  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0734  hypothetical protein  30.9 
 
 
416 aa  107  4e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.168601  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5902  Zn-dependent protease-like protein  30 
 
 
362 aa  106  6e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0267336  normal  0.154235 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2181  hypothetical protein  28.27 
 
 
403 aa  105  9e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.392153 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1843  peptidase M50  36.28 
 
 
376 aa  105  1e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.616528  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1617  putative protease  33.72 
 
 
286 aa  105  1e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1412  peptidase M50  29.17 
 
 
383 aa  102  1e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.742384  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1629  hypothetical protein  34.84 
 
 
431 aa  100  3e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4475  peptidase M50  33.05 
 
 
400 aa  101  3e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.580173  normal  0.145803 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_680  metallopeptidase, M50 family  26.84 
 
 
371 aa  99.8  7e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0373838  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2237  peptidase M50  28.95 
 
 
359 aa  98.6  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.949585  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3922  peptidase M50  28.57 
 
 
385 aa  98.2  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.558191 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0155  peptidase M50  30.23 
 
 
392 aa  96.7  6e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2305  peptidase M50  35.2 
 
 
362 aa  95.5  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00177185  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22130  Zn-dependent protease  37.04 
 
 
390 aa  95.5  1e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.944872  normal  0.942698 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2415  peptidase M50  28.32 
 
 
424 aa  94.7  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0774  M50 family metallopeptidase  29.46 
 
 
370 aa  94.4  3e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1479  peptidase M50  35.39 
 
 
384 aa  94.4  3e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0658829  normal  0.564629 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3329  peptidase M50  37.17 
 
 
290 aa  94  4e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.014503  normal  0.780198 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1818  peptidase M50  30.71 
 
 
302 aa  92  2e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2355  peptidase M50  31.27 
 
 
396 aa  91.7  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0704943  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2354  peptidase M50  44.1 
 
 
386 aa  92  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.176917 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0524  peptidase M50  38.56 
 
 
285 aa  91.7  2e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.311607  hitchhiker  0.00535986 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14160  peptidase M50  31.74 
 
 
272 aa  90.9  3e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000034797  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12644  hypothetical protein  28 
 
 
393 aa  90.1  5e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0700  peptidase M50  31.46 
 
 
370 aa  88.6  2e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07871  Zn-dependent protease  32.64 
 
 
422 aa  85.9  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1914  peptidase M50  28.09 
 
 
387 aa  84.7  0.000000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000446293 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1456  peptidase M50  33 
 
 
292 aa  83.2  0.000000000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2223  peptidase M50  32.12 
 
 
376 aa  81.6  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>