More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_1497 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_1497  peptidase M50  100 
 
 
372 aa  724    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.120961  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0694  peptidase M50  92.05 
 
 
366 aa  610  1e-173  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.232631 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3750  peptidase M50  81.44 
 
 
372 aa  578  1e-164  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.69281  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1988  peptidase M50  59.34 
 
 
373 aa  426  1e-118  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.319732 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2201  peptidase M50  59.19 
 
 
375 aa  410  1e-113  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4923  peptidase M50  56.67 
 
 
373 aa  403  1e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.465017 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0458  peptidase M50  59.04 
 
 
377 aa  359  5e-98  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0639554  normal  0.134701 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0540  peptidase M50  51.25 
 
 
364 aa  356  2.9999999999999997e-97  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3626  peptidase M50  48.06 
 
 
368 aa  284  2.0000000000000002e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.721542 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0832  peptidase M50  48.75 
 
 
370 aa  280  3e-74  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3165  peptidase M50  40.68 
 
 
376 aa  228  1e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2308  peptidase M50  39.57 
 
 
385 aa  194  3e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1731  peptidase M50  36.07 
 
 
366 aa  189  5.999999999999999e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0978  hypothetical protein  36.13 
 
 
364 aa  188  1e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3157  peptidase M50  38.44 
 
 
382 aa  184  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0318  CBS domain-containing protein  34.89 
 
 
370 aa  179  8e-44  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.147887  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0170  CBS domain-containing protein  31.75 
 
 
343 aa  171  2e-41  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.356486  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0149  CBS domain containing protein  34.65 
 
 
377 aa  171  2e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0113637 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1552  CBS domain-containing protein  38.49 
 
 
378 aa  169  6e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.651546  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0289  peptidase M50  38.83 
 
 
393 aa  167  2e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2601  peptidase M50  35.23 
 
 
394 aa  166  6.9999999999999995e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.603215  normal  0.812434 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0116  peptidase M50  34.82 
 
 
365 aa  163  5.0000000000000005e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.345861 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1032  peptidase M50  36.56 
 
 
395 aa  160  2e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0615226 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0613  peptidase M50  36.51 
 
 
377 aa  159  8e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0236174 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2272  CBS domain-containing protein  33.95 
 
 
384 aa  157  2e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.29511 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1449  peptidase M50  34.52 
 
 
337 aa  155  1e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0709676 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2136  peptidase M50  33.24 
 
 
415 aa  154  2e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.821665  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0459  peptidase M50  33.81 
 
 
342 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0769405  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1185  peptidase M50  33.81 
 
 
338 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0613  peptidase M50  38.08 
 
 
380 aa  151  2e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.750705  normal  0.0786713 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1508  peptidase M50  37.11 
 
 
412 aa  149  1.0000000000000001e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1434  CBS domain-containing protein  34.59 
 
 
336 aa  147  3e-34  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3672  peptidase M50  34.07 
 
 
375 aa  145  1e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3297  peptidase M50  38.16 
 
 
258 aa  145  1e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.153314  normal  0.569986 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0400  CBS domain-containing protein  34.2 
 
 
378 aa  145  1e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0735736  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2535  peptidase M50  35.99 
 
 
373 aa  143  6e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.180251  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0406  peptidase M50  36.3 
 
 
380 aa  142  9.999999999999999e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.445518 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3134  peptidase M50  32.88 
 
 
386 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2620  hypothetical protein  36.75 
 
 
239 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00161745  normal  0.443629 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2488  peptidase M50  32.5 
 
 
383 aa  127  2.0000000000000002e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_675  protease  29.3 
 
 
380 aa  127  4.0000000000000003e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000159772  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0769  protease family protein  28.84 
 
 
380 aa  124  2e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000172815  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1291  peptidase M50  29.55 
 
 
366 aa  122  7e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00117198  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0222  peptidase M50  31.49 
 
 
394 aa  122  7e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1410  peptidase M50  33.44 
 
 
373 aa  122  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.226741  normal  0.248277 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5283  peptidase M50  32.23 
 
 
390 aa  120  4.9999999999999996e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4785  peptidase M50  30.13 
 
 
373 aa  118  9.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.384856  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0920  peptidase M50  29.49 
 
 
374 aa  117  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0947  peptidase M50  29.49 
 
 
374 aa  117  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1872  peptidase M50  27.48 
 
 
373 aa  116  6e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0695  peptidase M50  29.84 
 
 
379 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000836286  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11470  Zn-dependent protease  33.44 
 
 
388 aa  115  2.0000000000000002e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.844041 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3191  peptidase M50  27.76 
 
 
375 aa  114  4.0000000000000004e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00586872 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0155  peptidase M50  34.19 
 
 
392 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1337  peptidase M50  29.97 
 
 
412 aa  110  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0524  peptidase M50  30.79 
 
 
285 aa  110  3e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.311607  hitchhiker  0.00535986 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0613  peptidase M50  29.21 
 
 
361 aa  109  6e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.190222  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12644  hypothetical protein  31.93 
 
 
393 aa  107  2e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5036  peptidase M50  29.35 
 
 
413 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.206475 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2539  peptidase M50  30.71 
 
 
293 aa  107  2e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0160669  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1617  putative protease  30.87 
 
 
286 aa  108  2e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1011  peptidase M50  29.07 
 
 
404 aa  107  3e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1456  peptidase M50  31.33 
 
 
292 aa  106  7e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3329  peptidase M50  32.09 
 
 
290 aa  105  2e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.014503  normal  0.780198 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1818  peptidase M50  30.29 
 
 
302 aa  104  2e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5311  peptidase M50  34.96 
 
 
301 aa  103  4e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0783881  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1797  peptidase M50  28.99 
 
 
397 aa  103  5e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1747  peptidase M50  29.19 
 
 
370 aa  100  3e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.951218  normal  0.0691878 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1843  peptidase M50  36.08 
 
 
376 aa  99  1e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.616528  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5902  Zn-dependent protease-like protein  37.44 
 
 
362 aa  96.3  7e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0267336  normal  0.154235 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14160  peptidase M50  28.99 
 
 
272 aa  95.9  1e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000034797  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3381  peptidase M50  28.15 
 
 
396 aa  95.9  1e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.000039902  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4538  stage IV sporulation protein FB  34.3 
 
 
286 aa  93.6  4e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.214848  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0734  hypothetical protein  30.48 
 
 
416 aa  94  4e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.168601  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1483  peptidase M50  25.94 
 
 
417 aa  94  4e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.511598  normal  0.569675 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1457  peptidase M50  25.94 
 
 
417 aa  94  4e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4580  stage IV sporulation protein FB  34.88 
 
 
286 aa  93.6  5e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000567867  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4344  stage IV sporulation protein FB  27.1 
 
 
286 aa  93.2  6e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4678  stage IV sporulation protein FB  27.1 
 
 
286 aa  93.2  6e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0277771  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4180  stage IV sporulation protein FB  27.48 
 
 
286 aa  93.2  7e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0869981  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1815  hypothetical protein  42.14 
 
 
383 aa  92.4  1e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.434017  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4526  stage IV sporulation protein FB  27.48 
 
 
286 aa  92.4  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.870935 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4494  peptidase M50  32.83 
 
 
381 aa  91.7  2e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4342  peptidase M50  33.04 
 
 
291 aa  91.3  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2355  peptidase M50  31.65 
 
 
396 aa  91.7  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0704943  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4191  stage IV sporulation protein FB  34.3 
 
 
286 aa  91.3  3e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1368  peptidase M50  33.33 
 
 
395 aa  90.9  3e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00624726  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4292  peptidase M50  27.13 
 
 
286 aa  90.9  3e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4565  stage IV sporulation protein FB  32.22 
 
 
286 aa  90.5  4e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000384784  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0669  stage IV sporulation protein FB  33.76 
 
 
286 aa  89.4  9e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000475668  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0259  peptidase M50  27.81 
 
 
374 aa  88.6  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1629  hypothetical protein  30.67 
 
 
431 aa  87.4  4e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1181  peptidase M50  29.2 
 
 
379 aa  86.7  7e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.22871  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0774  M50 family metallopeptidase  25.61 
 
 
370 aa  85.5  0.000000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3648  peptidase M50  29.68 
 
 
381 aa  85.9  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0203123 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2627  peptidase M50  28.68 
 
 
405 aa  85.5  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2415  peptidase M50  26.65 
 
 
424 aa  85.1  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22130  Zn-dependent protease  29.9 
 
 
390 aa  85.1  0.000000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.944872  normal  0.942698 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2237  peptidase M50  39.58 
 
 
359 aa  84.3  0.000000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.949585  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1412  peptidase M50  32.11 
 
 
383 aa  84.3  0.000000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.742384  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>