181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_4494 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_4494  peptidase M50  100 
 
 		 381 aa  726    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3648  peptidase M50  55.07 
 
 		 381 aa  327  3e-88  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0203123 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3400  peptidase M50  53.97 
 
 		 381 aa  318  1e-85  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11470  Zn-dependent protease  48.64 
 
 		 388 aa  276  3e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.844041 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2355  peptidase M50  51.23 
 
 		 396 aa  275  7e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0704943  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12644  hypothetical protein  45.24 
 
 		 393 aa  267  2e-70  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2627  peptidase M50  43.72 
 
 		 405 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1412  peptidase M50  44.96 
 
 		 383 aa  243  6e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.742384  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0155  peptidase M50  46.24 
 
 		 392 aa  231  1e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2488  peptidase M50  35.93 
 
 		 383 aa  228  1e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1747  peptidase M50  34.9 
 
 		 370 aa  213  5.999999999999999e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.951218  normal  0.0691878 
 
 
-
 
NC_002936  DET0769  protease family protein  34.89 
 
 		 380 aa  207  3e-52  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000172815  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_675  protease  34.44 
 
 		 380 aa  205  1e-51  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000159772  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0222  peptidase M50  37.32 
 
 		 394 aa  199  1.0000000000000001e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0695  peptidase M50  33.06 
 
 		 379 aa  191  2e-47  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000836286  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0978  hypothetical protein  31.72 
 
 		 364 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1011  peptidase M50  32.8 
 
 		 404 aa  180  2.9999999999999997e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0774  M50 family metallopeptidase  31.87 
 
 		 370 aa  176  6e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1291  peptidase M50  29.81 
 
 		 366 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00117198  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0259  peptidase M50  32.68 
 
 		 374 aa  171  2e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_680  metallopeptidase, M50 family  29.78 
 
 		 371 aa  171  2e-41  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0373838  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4785  peptidase M50  32.05 
 
 		 373 aa  168  1e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.384856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0700  peptidase M50  30.52 
 
 		 370 aa  168  1e-40  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1872  peptidase M50  31.61 
 
 		 373 aa  166  5.9999999999999996e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0318  CBS domain-containing protein  32.81 
 
 		 370 aa  162  1e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.147887  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1368  peptidase M50  33.51 
 
 		 395 aa  160  4e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00624726  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1731  peptidase M50  30.77 
 
 		 366 aa  155  9e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0289  peptidase M50  32.99 
 
 		 393 aa  154  2e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3191  peptidase M50  28.95 
 
 		 375 aa  154  2.9999999999999998e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00586872 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0920  peptidase M50  29.89 
 
 		 374 aa  152  1e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1410  peptidase M50  31.83 
 
 		 373 aa  150  3e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.226741  normal  0.248277 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0947  peptidase M50  29.62 
 
 		 374 aa  150  3e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1337  peptidase M50  30.48 
 
 		 412 aa  149  8e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5036  peptidase M50  34.2 
 
 		 413 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.206475 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1797  peptidase M50  31.48 
 
 		 397 aa  147  3e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2601  peptidase M50  32.17 
 
 		 394 aa  144  3e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.603215  normal  0.812434 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0613  peptidase M50  30.89 
 
 		 377 aa  142  7e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0236174 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2535  peptidase M50  39.23 
 
 		 373 aa  142  7e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.180251  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5283  peptidase M50  33.85 
 
 		 390 aa  142  9.999999999999999e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1457  peptidase M50  27.91 
 
 		 417 aa  142  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1483  peptidase M50  27.91 
 
 		 417 aa  142  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.511598  normal  0.569675 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1032  peptidase M50  33.33 
 
 		 395 aa  141  1.9999999999999998e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0615226 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3922  peptidase M50  30.71 
 
 		 385 aa  141  1.9999999999999998e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.558191 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3165  peptidase M50  32.28 
 
 		 376 aa  140  3e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2136  peptidase M50  32.27 
 
 		 415 aa  140  4.999999999999999e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.821665  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3381  peptidase M50  30.43 
 
 		 396 aa  139  6e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.000039902  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2181  hypothetical protein  29.54 
 
 		 403 aa  139  8.999999999999999e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.392153 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1185  peptidase M50  29.3 
 
 		 338 aa  137  4e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1552  CBS domain-containing protein  29.43 
 
 		 378 aa  137  4e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.651546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1508  peptidase M50  36.18 
 
 		 412 aa  137  4e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1449  peptidase M50  29.03 
 
 		 337 aa  136  7.000000000000001e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0709676 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0149  CBS domain containing protein  29.97 
 
 		 377 aa  134  3e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0113637 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0832  peptidase M50  32.7 
 
 		 370 aa  134  3e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0459  peptidase M50  29.57 
 
 		 342 aa  134  3e-30  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0769405  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22910  Zn-dependent protease  38.79 
 
 		 244 aa  133  5e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.511612  normal  0.351338 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2272  CBS domain-containing protein  30.59 
 
 		 384 aa  132  1.0000000000000001e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.29511 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0170  CBS domain-containing protein  29.97 
 
 		 343 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.356486  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1843  peptidase M50  31.1 
 
 		 376 aa  129  8.000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.616528  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3626  peptidase M50  33.74 
 
 		 368 aa  127  2.0000000000000002e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.721542 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0406  peptidase M50  35.74 
 
 		 380 aa  128  2.0000000000000002e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.445518 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0734  hypothetical protein  30.81 
 
 		 416 aa  126  6e-28  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.168601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05401  Zn-dependent protease  32.33 
 
 		 413 aa  126  8.000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0613  peptidase M50  37.69 
 
 		 380 aa  125  1e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.750705  normal  0.0786713 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1629  hypothetical protein  32.18 
 
 		 431 aa  125  2e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1914  peptidase M50  30.91 
 
 		 387 aa  120  3e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000446293 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0613  peptidase M50  31.01 
 
 		 361 aa  120  3e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.190222  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0400  CBS domain-containing protein  29.67 
 
 		 378 aa  119  7.999999999999999e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0735736  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3134  peptidase M50  30.93 
 
 		 386 aa  119  7.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1988  peptidase M50  36.19 
 
 		 373 aa  118  9.999999999999999e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.319732 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2620  hypothetical protein  31.38 
 
 		 239 aa  117  5e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00161745  normal  0.443629 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2415  peptidase M50  31.38 
 
 		 424 aa  116  6e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1479  peptidase M50  32.81 
 
 		 384 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0658829  normal  0.564629 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2637  peptidase M50  34.76 
 
 		 378 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.599853  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0540  peptidase M50  29.65 
 
 		 364 aa  115  1.0000000000000001e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3672  peptidase M50  30.61 
 
 		 375 aa  115  2.0000000000000002e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5902  Zn-dependent protease-like protein  30.24 
 
 		 362 aa  114  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0267336  normal  0.154235 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4923  peptidase M50  32.88 
 
 		 373 aa  114  3e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.465017 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1815  hypothetical protein  31.86 
 
 		 383 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.434017  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3750  peptidase M50  30.31 
 
 		 372 aa  108  1e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.69281  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0458  peptidase M50  34.23 
 
 		 377 aa  107  2e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0639554  normal  0.134701 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1434  CBS domain-containing protein  29.3 
 
 		 336 aa  108  2e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2223  peptidase M50  32.03 
 
 		 376 aa  106  6e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2201  peptidase M50  30.98 
 
 		 375 aa  103  6e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4885  peptidase M50  30.7 
 
 		 397 aa  99.4  9e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.333233 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20920  Zn-dependent protease  30.2 
 
 		 380 aa  99  1e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.961375 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2305  peptidase M50  31.27 
 
 		 362 aa  99  1e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00177185  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1497  peptidase M50  33.13 
 
 		 372 aa  97.8  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.120961  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05641  Zn-dependent protease  22.36 
 
 		 407 aa  96.7  6e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.394997  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1868  hypothetical protein  26.23 
 
 		 396 aa  95.5  1e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.180278  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0116  peptidase M50  29.35 
 
 		 365 aa  95.5  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.345861 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0524  peptidase M50  33.19 
 
 		 285 aa  95.9  1e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.311607  hitchhiker  0.00535986 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05931  Zn-dependent proteases  26.03 
 
 		 405 aa  94.4  3e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.111882  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07871  Zn-dependent protease  33.79 
 
 		 422 aa  94.4  3e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3157  peptidase M50  28.8 
 
 		 382 aa  94  4e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1483  peptidase M50  31.96 
 
 		 365 aa  94  4e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4475  peptidase M50  28.11 
 
 		 400 aa  93.2  7e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.580173  normal  0.145803 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0694  peptidase M50  31.99 
 
 		 366 aa  92.4  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.232631 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11840  Zn-dependent protease  39.06 
 
 		 375 aa  91.7  2e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0392218  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2308  peptidase M50  27.97 
 
 		 385 aa  91.7  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2633  peptidase M50  30.96 
 
 		 405 aa  87.4  3e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.962625  normal  0.303399 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>