43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2052 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_2052  hypothetical protein  100 
 
 		 431 aa  783    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.618886  normal  0.624101 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1627  putative transmembrane alanine and leucine rich protein  60.54 
 
 		 440 aa  437  1e-121  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12644  hypothetical protein  33.76 
 
 		 393 aa  124  3e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3648  peptidase M50  31.45 
 
 		 381 aa  124  4e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0203123 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3400  peptidase M50  30.05 
 
 		 381 aa  112  9e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1412  peptidase M50  31.99 
 
 		 383 aa  108  2e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.742384  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11470  Zn-dependent protease  30.92 
 
 		 388 aa  101  3e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.844041 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2627  peptidase M50  29.7 
 
 		 405 aa  96.7  8e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0155  peptidase M50  29.58 
 
 		 392 aa  89.4  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_675  protease  25.21 
 
 		 380 aa  79.7  0.00000000000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000159772  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0769  protease family protein  24.93 
 
 		 380 aa  79.3  0.0000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000172815  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5283  peptidase M50  29.9 
 
 		 390 aa  73.9  0.000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0695  peptidase M50  26.16 
 
 		 379 aa  73.6  0.000000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000836286  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0222  peptidase M50  28.46 
 
 		 394 aa  68.2  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2355  peptidase M50  30.75 
 
 		 396 aa  68.2  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0704943  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4785  peptidase M50  25.07 
 
 		 373 aa  67.4  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.384856  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1747  peptidase M50  21.41 
 
 		 370 aa  66.6  0.0000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.951218  normal  0.0691878 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2488  peptidase M50  23.11 
 
 		 383 aa  66.2  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3191  peptidase M50  25 
 
 		 375 aa  64.7  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00586872 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1872  peptidase M50  23.08 
 
 		 373 aa  63.5  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22910  Zn-dependent protease  30.28 
 
 		 244 aa  62.4  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.511612  normal  0.351338 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0259  peptidase M50  23.77 
 
 		 374 aa  60.8  0.00000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1483  peptidase M50  24.94 
 
 		 417 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.511598  normal  0.569675 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1457  peptidase M50  24.94 
 
 		 417 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4494  peptidase M50  31.63 
 
 		 381 aa  57  0.0000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1368  peptidase M50  28 
 
 		 395 aa  55.8  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00624726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0947  peptidase M50  22.31 
 
 		 374 aa  54.7  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0774  M50 family metallopeptidase  21.89 
 
 		 370 aa  54.3  0.000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0920  peptidase M50  22.31 
 
 		 374 aa  53.1  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1797  peptidase M50  24.8 
 
 		 397 aa  53.5  0.000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3381  peptidase M50  23.56 
 
 		 396 aa  52.8  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.000039902  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_680  metallopeptidase, M50 family  23.61 
 
 		 371 aa  52  0.00002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0373838  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1410  peptidase M50  25.59 
 
 		 373 aa  50.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.226741  normal  0.248277 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1011  peptidase M50  24.88 
 
 		 404 aa  50.1  0.00009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0700  peptidase M50  23.44 
 
 		 370 aa  49.7  0.0001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3165  peptidase M50  26.72 
 
 		 376 aa  48.9  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0978  hypothetical protein  22.74 
 
 		 364 aa  48.1  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5036  peptidase M50  22.93 
 
 		 413 aa  47.8  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.206475 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1337  peptidase M50  23.5 
 
 		 412 aa  47.4  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1032  peptidase M50  30.42 
 
 		 395 aa  47  0.0006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0615226 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2181  hypothetical protein  27.11 
 
 		 403 aa  45.1  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.392153 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3922  peptidase M50  24.15 
 
 		 385 aa  43.5  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.558191 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1988  peptidase M50  28.84 
 
 		 373 aa  43.5  0.008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.319732 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>