38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1627 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1627  putative transmembrane alanine and leucine rich protein  100 
 
 		 440 aa  828    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2052  hypothetical protein  60.54 
 
 		 431 aa  411  1e-113  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.618886  normal  0.624101 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3648  peptidase M50  30.75 
 
 		 381 aa  120  3.9999999999999996e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0203123 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12644  hypothetical protein  33.06 
 
 		 393 aa  110  5e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3400  peptidase M50  29.67 
 
 		 381 aa  101  3e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2627  peptidase M50  28.77 
 
 		 405 aa  95.9  1e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11470  Zn-dependent protease  31.52 
 
 		 388 aa  91.7  2e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.844041 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1412  peptidase M50  30.24 
 
 		 383 aa  89.4  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.742384  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0769  protease family protein  25.26 
 
 		 380 aa  84.7  0.000000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000172815  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0155  peptidase M50  30.66 
 
 		 392 aa  82  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_675  protease  25 
 
 		 380 aa  81.3  0.00000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000159772  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0695  peptidase M50  24.55 
 
 		 379 aa  75.9  0.000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000836286  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4785  peptidase M50  27.88 
 
 		 373 aa  72  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.384856  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2355  peptidase M50  30.85 
 
 		 396 aa  69.7  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0704943  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22910  Zn-dependent protease  30.98 
 
 		 244 aa  65.5  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.511612  normal  0.351338 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5283  peptidase M50  31.51 
 
 		 390 aa  65.5  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0259  peptidase M50  24.5 
 
 		 374 aa  64.7  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1368  peptidase M50  27.23 
 
 		 395 aa  63.9  0.000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00624726  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4494  peptidase M50  33.78 
 
 		 381 aa  60.5  0.00000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0222  peptidase M50  22.66 
 
 		 394 aa  59.7  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1011  peptidase M50  25.39 
 
 		 404 aa  58.9  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1747  peptidase M50  21.09 
 
 		 370 aa  57.4  0.0000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.951218  normal  0.0691878 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1797  peptidase M50  26.47 
 
 		 397 aa  57.4  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0947  peptidase M50  25.26 
 
 		 374 aa  57  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0920  peptidase M50  25.26 
 
 		 374 aa  56.6  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3381  peptidase M50  27.23 
 
 		 396 aa  55.1  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.000039902  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1337  peptidase M50  26.12 
 
 		 412 aa  54.7  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0978  hypothetical protein  23.17 
 
 		 364 aa  53.1  0.000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1410  peptidase M50  29.02 
 
 		 373 aa  50.8  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.226741  normal  0.248277 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1872  peptidase M50  21.69 
 
 		 373 aa  51.2  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3191  peptidase M50  25.85 
 
 		 375 aa  50.8  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00586872 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0540  peptidase M50  28.06 
 
 		 364 aa  49.3  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1032  peptidase M50  29.76 
 
 		 395 aa  47.4  0.0005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0615226 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2181  hypothetical protein  27.96 
 
 		 403 aa  47  0.0007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.392153 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0170  CBS domain-containing protein  21.74 
 
 		 343 aa  45.8  0.001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.356486  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3922  peptidase M50  22.64 
 
 		 385 aa  45.4  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.558191 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3626  peptidase M50  28.57 
 
 		 368 aa  45.1  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.721542 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1508  peptidase M50  28.2 
 
 		 412 aa  43.9  0.006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>