187 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1199 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_1199  peptidase M50  100 
 
 		 369 aa  715    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0242729  normal  0.16524 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1483  peptidase M50  33.87 
 
 		 365 aa  127  5e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13940  Zn-dependent protease  31.11 
 
 		 379 aa  123  5e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.909069 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11840  Zn-dependent protease  37.35 
 
 		 375 aa  118  1.9999999999999998e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0392218  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1914  peptidase M50  29.17 
 
 		 387 aa  112  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000446293 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2006  peptidase M50  31.95 
 
 		 376 aa  109  8.000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.223407  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5902  Zn-dependent protease-like protein  33.33 
 
 		 362 aa  109  9.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0267336  normal  0.154235 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16220  Zn-dependent protease  31.98 
 
 		 395 aa  108  1e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.276827  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_675  protease  27.51 
 
 		 380 aa  107  4e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000159772  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0769  protease family protein  27.22 
 
 		 380 aa  104  2e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000172815  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2237  peptidase M50  33.99 
 
 		 359 aa  104  3e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.949585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22130  Zn-dependent protease  30.92 
 
 		 390 aa  101  2e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.944872  normal  0.942698 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1479  peptidase M50  34.62 
 
 		 384 aa  99.4  8e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0658829  normal  0.564629 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4475  peptidase M50  30.04 
 
 		 400 aa  99  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.580173  normal  0.145803 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_680  metallopeptidase, M50 family  26.51 
 
 		 371 aa  98.6  1e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0373838  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20920  Zn-dependent protease  26.92 
 
 		 380 aa  98.2  2e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.961375 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2223  peptidase M50  30.56 
 
 		 376 aa  96.3  7e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1815  hypothetical protein  29.77 
 
 		 383 aa  96.3  8e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.434017  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4785  peptidase M50  26.72 
 
 		 373 aa  94.7  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.384856  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0774  M50 family metallopeptidase  28.31 
 
 		 370 aa  90.9  3e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1181  peptidase M50  28.3 
 
 		 379 aa  90.5  4e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.22871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0700  peptidase M50  27.43 
 
 		 370 aa  89.7  8e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2244  peptidase M50  28.25 
 
 		 373 aa  89.4  9e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.830349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0259  peptidase M50  26.92 
 
 		 374 aa  89.4  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2354  peptidase M50  32.06 
 
 		 386 aa  88.6  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.176917 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2181  hypothetical protein  29.93 
 
 		 403 aa  87.8  3e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.392153 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2171  peptidase M50  28.77 
 
 		 403 aa  87.4  4e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.121465  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2415  peptidase M50  28.07 
 
 		 424 aa  86.7  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2305  peptidase M50  40 
 
 		 362 aa  86.3  8e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00177185  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1856  peptidase M50  28.71 
 
 		 377 aa  85.9  0.000000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2637  peptidase M50  27.14 
 
 		 378 aa  84.3  0.000000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.599853  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1843  peptidase M50  30.12 
 
 		 376 aa  84.7  0.000000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.616528  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1337  peptidase M50  34.46 
 
 		 412 aa  84.3  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5036  peptidase M50  30.9 
 
 		 413 aa  84  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.206475 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3626  peptidase M50  29.37 
 
 		 368 aa  84  0.000000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.721542 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3191  peptidase M50  36.07 
 
 		 375 aa  81.6  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00586872 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3400  peptidase M50  30 
 
 		 381 aa  81.6  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2633  peptidase M50  27.5 
 
 		 405 aa  80.1  0.00000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.962625  normal  0.303399 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0920  peptidase M50  25.16 
 
 		 374 aa  80.1  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3648  peptidase M50  28.87 
 
 		 381 aa  80.1  0.00000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0203123 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1872  peptidase M50  27.8 
 
 		 373 aa  79.7  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0947  peptidase M50  25.16 
 
 		 374 aa  79.3  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1457  peptidase M50  31.48 
 
 		 417 aa  79.3  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1483  peptidase M50  31.48 
 
 		 417 aa  79.3  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.511598  normal  0.569675 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1797  peptidase M50  31.65 
 
 		 397 aa  77.4  0.0000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0695  peptidase M50  24.52 
 
 		 379 aa  77  0.0000000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000836286  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0734  hypothetical protein  25.53 
 
 		 416 aa  76.6  0.0000000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.168601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0222  peptidase M50  27.51 
 
 		 394 aa  76.6  0.0000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1185  peptidase M50  31.79 
 
 		 338 aa  76.6  0.0000000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2620  hypothetical protein  33.33 
 
 		 239 aa  75.9  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00161745  normal  0.443629 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1629  hypothetical protein  27.64 
 
 		 431 aa  75.1  0.000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2535  peptidase M50  37.59 
 
 		 373 aa  75.5  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.180251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2201  peptidase M50  30 
 
 		 375 aa  75.5  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2539  peptidase M50  36.2 
 
 		 293 aa  75.1  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0160669  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1449  peptidase M50  28.37 
 
 		 337 aa  75.5  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0709676 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4342  peptidase M50  27.55 
 
 		 291 aa  74.3  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3750  peptidase M50  37.07 
 
 		 372 aa  74.3  0.000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.69281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0483  hypothetical protein  35.38 
 
 		 360 aa  74.3  0.000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000119997  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0459  peptidase M50  31.13 
 
 		 342 aa  74.3  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0769405  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22910  Zn-dependent protease  32.28 
 
 		 244 aa  74.3  0.000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.511612  normal  0.351338 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0540  peptidase M50  27.36 
 
 		 364 aa  73.9  0.000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0613  peptidase M50  28.86 
 
 		 377 aa  73.2  0.000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0236174 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3922  peptidase M50  30.22 
 
 		 385 aa  73.2  0.000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.558191 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11470  Zn-dependent protease  35 
 
 		 388 aa  73.2  0.000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.844041 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0978  hypothetical protein  27.92 
 
 		 364 aa  73.2  0.000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1617  putative protease  34.06 
 
 		 286 aa  72.8  0.000000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5283  peptidase M50  31.18 
 
 		 390 aa  72.8  0.000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0318  CBS domain-containing protein  24.65 
 
 		 370 aa  72.4  0.00000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.147887  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0170  CBS domain-containing protein  22.49 
 
 		 343 aa  72  0.00000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.356486  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4885  peptidase M50  25.48 
 
 		 397 aa  72  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.333233 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1291  peptidase M50  23.86 
 
 		 366 aa  72.4  0.00000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00117198  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3381  peptidase M50  31.65 
 
 		 396 aa  70.9  0.00000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.000039902  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2488  peptidase M50  23.76 
 
 		 383 aa  70.5  0.00000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1011  peptidase M50  30.48 
 
 		 404 aa  70.1  0.00000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4923  peptidase M50  33.1 
 
 		 373 aa  70.1  0.00000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.465017 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2627  peptidase M50  34.21 
 
 		 405 aa  68.9  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3329  peptidase M50  43.27 
 
 		 290 aa  68.9  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.014503  normal  0.780198 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3672  peptidase M50  36.36 
 
 		 375 aa  68.6  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3165  peptidase M50  34.11 
 
 		 376 aa  67.4  0.0000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0832  peptidase M50  33.58 
 
 		 370 aa  67.4  0.0000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3297  peptidase M50  29.05 
 
 		 258 aa  67.4  0.0000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.153314  normal  0.569986 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1434  CBS domain-containing protein  30.3 
 
 		 336 aa  67  0.0000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3134  peptidase M50  38.84 
 
 		 386 aa  67  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2272  CBS domain-containing protein  30.65 
 
 		 384 aa  67  0.0000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.29511 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2977  peptidase M50  29.28 
 
 		 378 aa  67  0.0000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00144349  hitchhiker  0.00562837 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1410  peptidase M50  32.09 
 
 		 373 aa  65.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.226741  normal  0.248277 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1988  peptidase M50  28.64 
 
 		 373 aa  65.9  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.319732 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1747  peptidase M50  26.91 
 
 		 370 aa  65.9  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.951218  normal  0.0691878 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1552  CBS domain-containing protein  32.7 
 
 		 378 aa  64.7  0.000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.651546  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1497  peptidase M50  32.14 
 
 		 372 aa  64.3  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.120961  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0613  peptidase M50  39.55 
 
 		 380 aa  63.9  0.000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.750705  normal  0.0786713 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4494  peptidase M50  29.67 
 
 		 381 aa  63.5  0.000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1731  peptidase M50  25.94 
 
 		 366 aa  63.5  0.000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0400  CBS domain-containing protein  32.9 
 
 		 378 aa  63.2  0.000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0735736  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1762  putative peptidase  31.54 
 
 		 360 aa  63.5  0.000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.0051203  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1368  peptidase M50  26.78 
 
 		 395 aa  62.8  0.000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00624726  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0786  M50 family peptidase  31.16 
 
 		 344 aa  62.8  0.000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0883958  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0458  peptidase M50  40.17 
 
 		 377 aa  62.8  0.000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0639554  normal  0.134701 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0613  peptidase M50  29.56 
 
 		 361 aa  62.8  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.190222  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0694  peptidase M50  33.62 
 
 		 366 aa  62.4  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.232631 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>