163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2171 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_2171  peptidase M50  100 
 
 
403 aa  795    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.121465  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1914  peptidase M50  70.05 
 
 
387 aa  508  1e-143  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000446293 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11840  Zn-dependent protease  41.32 
 
 
375 aa  229  5e-59  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0392218  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1483  peptidase M50  38.12 
 
 
365 aa  216  8e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5902  Zn-dependent protease-like protein  36.74 
 
 
362 aa  215  9.999999999999999e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0267336  normal  0.154235 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2637  peptidase M50  34.05 
 
 
378 aa  208  2e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.599853  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1479  peptidase M50  37.8 
 
 
384 aa  202  9.999999999999999e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0658829  normal  0.564629 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2006  peptidase M50  38.74 
 
 
376 aa  199  7e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.223407  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1815  hypothetical protein  35.79 
 
 
383 aa  196  9e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.434017  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2415  peptidase M50  34.54 
 
 
424 aa  191  2e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1843  peptidase M50  34.97 
 
 
376 aa  191  2e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.616528  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2305  peptidase M50  36.99 
 
 
362 aa  190  4e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00177185  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2244  peptidase M50  38.71 
 
 
373 aa  188  2e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.830349  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1856  peptidase M50  37.47 
 
 
377 aa  186  5e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13940  Zn-dependent protease  36.42 
 
 
379 aa  179  1e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.909069 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20920  Zn-dependent protease  32.72 
 
 
380 aa  173  3.9999999999999995e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.961375 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4475  peptidase M50  30.26 
 
 
400 aa  173  5e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.580173  normal  0.145803 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22130  Zn-dependent protease  32.87 
 
 
390 aa  157  4e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.944872  normal  0.942698 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2237  peptidase M50  36.33 
 
 
359 aa  152  1e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.949585  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1181  peptidase M50  30.31 
 
 
379 aa  148  1.0000000000000001e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.22871  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16220  Zn-dependent protease  36.82 
 
 
395 aa  138  2e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.276827  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2223  peptidase M50  33.6 
 
 
376 aa  134  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2354  peptidase M50  32.75 
 
 
386 aa  133  5e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.176917 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4885  peptidase M50  30.52 
 
 
397 aa  123  5e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.333233 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3191  peptidase M50  27.06 
 
 
375 aa  121  1.9999999999999998e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00586872 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0920  peptidase M50  29.19 
 
 
374 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0947  peptidase M50  28.93 
 
 
374 aa  120  3e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1337  peptidase M50  29.41 
 
 
412 aa  116  8.999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2633  peptidase M50  27.99 
 
 
405 aa  112  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.962625  normal  0.303399 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1797  peptidase M50  29.13 
 
 
397 aa  110  5e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3381  peptidase M50  26.27 
 
 
396 aa  109  7.000000000000001e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.000039902  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1872  peptidase M50  28.35 
 
 
373 aa  109  8.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1368  peptidase M50  29.71 
 
 
395 aa  106  7e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00624726  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3648  peptidase M50  29.43 
 
 
381 aa  105  1e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0203123 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_680  metallopeptidase, M50 family  28.71 
 
 
371 aa  105  2e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0373838  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0259  peptidase M50  24.93 
 
 
374 aa  104  3e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4785  peptidase M50  27.12 
 
 
373 aa  104  3e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.384856  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5036  peptidase M50  28.04 
 
 
413 aa  103  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.206475 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1199  peptidase M50  28.02 
 
 
369 aa  103  7e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0242729  normal  0.16524 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0700  peptidase M50  29.14 
 
 
370 aa  103  7e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5283  peptidase M50  35.02 
 
 
390 aa  102  9e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0774  M50 family metallopeptidase  27.48 
 
 
370 aa  102  1e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3922  peptidase M50  27.22 
 
 
385 aa  101  3e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.558191 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1410  peptidase M50  30.52 
 
 
373 aa  99.8  7e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.226741  normal  0.248277 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2181  hypothetical protein  28.61 
 
 
403 aa  99.4  1e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.392153 
 
 
-
 
NC_002936  DET0769  protease family protein  25.97 
 
 
380 aa  98.6  2e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000172815  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3400  peptidase M50  28.46 
 
 
381 aa  97.8  3e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_675  protease  25.95 
 
 
380 aa  97.4  4e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000159772  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2488  peptidase M50  28.48 
 
 
383 aa  97.1  5e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0222  peptidase M50  34.63 
 
 
394 aa  95.5  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1483  peptidase M50  27 
 
 
417 aa  95.1  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.511598  normal  0.569675 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1457  peptidase M50  27 
 
 
417 aa  95.1  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2977  peptidase M50  36.87 
 
 
378 aa  91.7  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00144349  hitchhiker  0.00562837 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1291  peptidase M50  34.54 
 
 
366 aa  91.7  2e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00117198  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22910  Zn-dependent protease  35.18 
 
 
244 aa  88.2  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.511612  normal  0.351338 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0318  CBS domain-containing protein  24.08 
 
 
370 aa  86.7  8e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.147887  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0695  peptidase M50  25.19 
 
 
379 aa  84.3  0.000000000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000836286  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5311  peptidase M50  31.84 
 
 
301 aa  83.6  0.000000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0783881  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11470  Zn-dependent protease  28.91 
 
 
388 aa  83.2  0.000000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.844041 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0978  hypothetical protein  30.52 
 
 
364 aa  82.4  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2627  peptidase M50  28.65 
 
 
405 aa  81.6  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1747  peptidase M50  32.96 
 
 
370 aa  81.3  0.00000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.951218  normal  0.0691878 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1617  putative protease  34.01 
 
 
286 aa  80.9  0.00000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12644  hypothetical protein  37.25 
 
 
393 aa  80.9  0.00000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2136  peptidase M50  25.16 
 
 
415 aa  80.9  0.00000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.821665  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4494  peptidase M50  30.53 
 
 
381 aa  80.5  0.00000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1185  peptidase M50  27.67 
 
 
338 aa  80.5  0.00000000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0734  hypothetical protein  34.63 
 
 
416 aa  80.1  0.00000000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.168601  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2535  peptidase M50  34.13 
 
 
373 aa  80.5  0.00000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.180251  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2539  peptidase M50  29.26 
 
 
293 aa  79.7  0.00000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0160669  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1032  peptidase M50  25.51 
 
 
395 aa  79.3  0.0000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0615226 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2355  peptidase M50  31.83 
 
 
396 aa  79  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0704943  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0613  peptidase M50  27.24 
 
 
377 aa  78.6  0.0000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0236174 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3750  peptidase M50  29.29 
 
 
372 aa  77.8  0.0000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.69281  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1629  hypothetical protein  34.17 
 
 
431 aa  77.4  0.0000000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3297  peptidase M50  30.88 
 
 
258 aa  77.4  0.0000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.153314  normal  0.569986 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1449  peptidase M50  27.04 
 
 
337 aa  77  0.0000000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0709676 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2620  hypothetical protein  33.94 
 
 
239 aa  75.1  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00161745  normal  0.443629 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0613  peptidase M50  29.1 
 
 
380 aa  75.1  0.000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.750705  normal  0.0786713 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1011  peptidase M50  26.54 
 
 
404 aa  74.7  0.000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1508  peptidase M50  35.17 
 
 
412 aa  74.7  0.000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0155  peptidase M50  28.93 
 
 
392 aa  73.9  0.000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0459  peptidase M50  28.11 
 
 
342 aa  73.6  0.000000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0769405  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14160  peptidase M50  28.74 
 
 
272 aa  73.2  0.000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000034797  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0613  peptidase M50  31.02 
 
 
361 aa  72.8  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.190222  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0832  peptidase M50  29.92 
 
 
370 aa  72.4  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3134  peptidase M50  25 
 
 
386 aa  71.6  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05401  Zn-dependent protease  31.79 
 
 
413 aa  72  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0524  peptidase M50  30.19 
 
 
285 aa  71.2  0.00000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.311607  hitchhiker  0.00535986 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1412  peptidase M50  33.33 
 
 
383 aa  70.1  0.00000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.742384  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1868  hypothetical protein  37.41 
 
 
396 aa  69.3  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.180278  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05931  Zn-dependent proteases  37.41 
 
 
405 aa  69.3  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.111882  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0149  CBS domain containing protein  28.86 
 
 
377 aa  68.2  0.0000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0113637 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0400  CBS domain-containing protein  31.02 
 
 
378 aa  67.8  0.0000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0735736  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1497  peptidase M50  33.33 
 
 
372 aa  67.8  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.120961  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2124  peptidase M50  25.64 
 
 
284 aa  67  0.0000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000917211  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0694  peptidase M50  34.48 
 
 
366 aa  67  0.0000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.232631 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3626  peptidase M50  28.42 
 
 
368 aa  66.6  0.0000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.721542 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0170  CBS domain-containing protein  24.18 
 
 
343 aa  66.6  0.0000000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.356486  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2272  CBS domain-containing protein  24.83 
 
 
384 aa  66.6  0.0000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.29511 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>