183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_16220 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_16220  Zn-dependent protease  100 
 
 
395 aa  734    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.276827  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1843  peptidase M50  35.09 
 
 
376 aa  165  2.0000000000000002e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.616528  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1914  peptidase M50  33.77 
 
 
387 aa  162  9e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000446293 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1815  hypothetical protein  32.47 
 
 
383 aa  147  4.0000000000000006e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.434017  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4475  peptidase M50  31.66 
 
 
400 aa  147  4.0000000000000006e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.580173  normal  0.145803 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5902  Zn-dependent protease-like protein  31.35 
 
 
362 aa  140  3.9999999999999997e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0267336  normal  0.154235 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2637  peptidase M50  32.36 
 
 
378 aa  139  1e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.599853  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13940  Zn-dependent protease  33.85 
 
 
379 aa  135  9.999999999999999e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.909069 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1479  peptidase M50  31.41 
 
 
384 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0658829  normal  0.564629 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1483  peptidase M50  34.44 
 
 
365 aa  133  6.999999999999999e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2305  peptidase M50  33.42 
 
 
362 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00177185  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11840  Zn-dependent protease  41.76 
 
 
375 aa  130  4.0000000000000003e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0392218  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2415  peptidase M50  29.34 
 
 
424 aa  130  6e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20920  Zn-dependent protease  32.37 
 
 
380 aa  127  3e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.961375 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1181  peptidase M50  32.38 
 
 
379 aa  124  2e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.22871  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1856  peptidase M50  33.42 
 
 
377 aa  123  5e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2006  peptidase M50  34.91 
 
 
376 aa  122  9.999999999999999e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.223407  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2244  peptidase M50  35.05 
 
 
373 aa  118  1.9999999999999998e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.830349  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2354  peptidase M50  32.47 
 
 
386 aa  112  8.000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.176917 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2237  peptidase M50  33.33 
 
 
359 aa  110  4.0000000000000004e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.949585  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2171  peptidase M50  38.74 
 
 
403 aa  107  4e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.121465  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4885  peptidase M50  28.8 
 
 
397 aa  102  8e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.333233 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4785  peptidase M50  30.3 
 
 
373 aa  97.1  4e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.384856  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1872  peptidase M50  25.12 
 
 
373 aa  96.3  9e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2633  peptidase M50  30.03 
 
 
405 aa  93.2  6e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.962625  normal  0.303399 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0259  peptidase M50  25.2 
 
 
374 aa  93.6  6e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2181  hypothetical protein  33.93 
 
 
403 aa  92.4  1e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.392153 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5036  peptidase M50  32.56 
 
 
413 aa  90.9  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.206475 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1629  hypothetical protein  31.01 
 
 
431 aa  88.2  2e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3191  peptidase M50  24.05 
 
 
375 aa  87.8  3e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00586872 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1199  peptidase M50  32.24 
 
 
369 aa  87.4  4e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0242729  normal  0.16524 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_680  metallopeptidase, M50 family  24.38 
 
 
371 aa  83.6  0.000000000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0373838  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0700  peptidase M50  33.54 
 
 
370 aa  83.6  0.000000000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3165  peptidase M50  32.97 
 
 
376 aa  82.4  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1617  putative protease  32.07 
 
 
286 aa  81.6  0.00000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1410  peptidase M50  33.68 
 
 
373 aa  80.9  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.226741  normal  0.248277 
 
 
-
 
NC_002936  DET0774  M50 family metallopeptidase  34 
 
 
370 aa  80.9  0.00000000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1457  peptidase M50  28.69 
 
 
417 aa  80.5  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1483  peptidase M50  28.69 
 
 
417 aa  80.5  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.511598  normal  0.569675 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0734  hypothetical protein  30.22 
 
 
416 aa  80.5  0.00000000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.168601  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2535  peptidase M50  39.42 
 
 
373 aa  79.3  0.00000000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.180251  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2488  peptidase M50  33.33 
 
 
383 aa  77.8  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1032  peptidase M50  39.73 
 
 
395 aa  77.4  0.0000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0615226 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2539  peptidase M50  38.56 
 
 
293 aa  77.4  0.0000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0160669  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0222  peptidase M50  35.58 
 
 
394 aa  77  0.0000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1337  peptidase M50  30.73 
 
 
412 aa  77  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3134  peptidase M50  31.75 
 
 
386 aa  76.6  0.0000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1449  peptidase M50  30.82 
 
 
337 aa  76.3  0.0000000000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0709676 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1185  peptidase M50  30.82 
 
 
338 aa  75.5  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0459  peptidase M50  30.82 
 
 
342 aa  75.9  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0769405  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0769  protease family protein  34.16 
 
 
380 aa  74.7  0.000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000172815  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0947  peptidase M50  26.36 
 
 
374 aa  74.7  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0920  peptidase M50  26.36 
 
 
374 aa  74.7  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3750  peptidase M50  32.52 
 
 
372 aa  74.3  0.000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.69281  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1508  peptidase M50  33.33 
 
 
412 aa  73.6  0.000000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0170  CBS domain-containing protein  30.41 
 
 
343 aa  73.6  0.000000000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.356486  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1368  peptidase M50  30.24 
 
 
395 aa  72.4  0.00000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00624726  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0400  CBS domain-containing protein  34.25 
 
 
378 aa  72.8  0.00000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0735736  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0613  peptidase M50  35.26 
 
 
361 aa  72.4  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.190222  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1552  CBS domain-containing protein  37.16 
 
 
378 aa  71.6  0.00000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.651546  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1797  peptidase M50  30.21 
 
 
397 aa  71.2  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_675  protease  33.54 
 
 
380 aa  71.2  0.00000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000159772  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22130  Zn-dependent protease  33.89 
 
 
390 aa  70.9  0.00000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.944872  normal  0.942698 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2601  peptidase M50  32.18 
 
 
394 aa  70.5  0.00000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.603215  normal  0.812434 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0149  CBS domain containing protein  34.56 
 
 
377 aa  70.1  0.00000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0113637 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1497  peptidase M50  33.57 
 
 
372 aa  69.3  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.120961  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5311  peptidase M50  39.47 
 
 
301 aa  68.9  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0783881  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1747  peptidase M50  28.41 
 
 
370 aa  69.3  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.951218  normal  0.0691878 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0613  peptidase M50  38.52 
 
 
380 aa  68.6  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.750705  normal  0.0786713 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2272  CBS domain-containing protein  36.3 
 
 
384 aa  68.6  0.0000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.29511 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0694  peptidase M50  34.97 
 
 
366 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.232631 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1011  peptidase M50  28.42 
 
 
404 aa  68.2  0.0000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0098  peptidase M50  27.22 
 
 
269 aa  67.8  0.0000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2620  hypothetical protein  31.72 
 
 
239 aa  67  0.0000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00161745  normal  0.443629 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12644  hypothetical protein  33.69 
 
 
393 aa  67.4  0.0000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3297  peptidase M50  31.41 
 
 
258 aa  67  0.0000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.153314  normal  0.569986 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0978  hypothetical protein  29.09 
 
 
364 aa  66.2  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2136  peptidase M50  34.25 
 
 
415 aa  65.9  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.821665  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0524  peptidase M50  34.43 
 
 
285 aa  65.5  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.311607  hitchhiker  0.00535986 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0613  peptidase M50  33.78 
 
 
377 aa  65.1  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0236174 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3329  peptidase M50  32.85 
 
 
290 aa  64.7  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.014503  normal  0.780198 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0695  peptidase M50  34.92 
 
 
379 aa  65.1  0.000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000836286  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1291  peptidase M50  23.36 
 
 
366 aa  65.1  0.000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00117198  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3381  peptidase M50  26.38 
 
 
396 aa  64.3  0.000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.000039902  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0832  peptidase M50  37.78 
 
 
370 aa  63.9  0.000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3922  peptidase M50  33.59 
 
 
385 aa  63.5  0.000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.558191 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2223  peptidase M50  34.03 
 
 
376 aa  63.9  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3626  peptidase M50  36.31 
 
 
368 aa  63.5  0.000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.721542 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1818  peptidase M50  35.75 
 
 
302 aa  63.2  0.000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4494  peptidase M50  37.9 
 
 
381 aa  63.2  0.000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0289  peptidase M50  32.02 
 
 
393 aa  62.8  0.000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22910  Zn-dependent protease  31.79 
 
 
244 aa  62.8  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.511612  normal  0.351338 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11470  Zn-dependent protease  29.38 
 
 
388 aa  62.8  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.844041 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2124  peptidase M50  32.26 
 
 
284 aa  62  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000917211  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2201  peptidase M50  29.55 
 
 
375 aa  61.6  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0406  peptidase M50  32.18 
 
 
380 aa  61.6  0.00000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.445518 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14160  peptidase M50  26.62 
 
 
272 aa  60.8  0.00000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000034797  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0540  peptidase M50  30.77 
 
 
364 aa  60.5  0.00000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1434  CBS domain-containing protein  30.88 
 
 
336 aa  60.5  0.00000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1456  peptidase M50  26.52 
 
 
292 aa  60.5  0.00000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>