175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_20920 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_20920  Zn-dependent protease  100 
 
 
380 aa  726    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.961375 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1483  peptidase M50  44.89 
 
 
365 aa  256  4e-67  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2006  peptidase M50  40.96 
 
 
376 aa  220  3e-56  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.223407  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1914  peptidase M50  37.2 
 
 
387 aa  215  9.999999999999999e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000446293 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2244  peptidase M50  42.39 
 
 
373 aa  188  2e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.830349  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1856  peptidase M50  40.73 
 
 
377 aa  186  5e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1815  hypothetical protein  35.26 
 
 
383 aa  177  4e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.434017  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2637  peptidase M50  36.19 
 
 
378 aa  177  4e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.599853  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5902  Zn-dependent protease-like protein  35.04 
 
 
362 aa  167  2.9999999999999998e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0267336  normal  0.154235 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11840  Zn-dependent protease  42.28 
 
 
375 aa  164  3e-39  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0392218  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2415  peptidase M50  31.69 
 
 
424 aa  154  2.9999999999999998e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2305  peptidase M50  38.03 
 
 
362 aa  152  8e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00177185  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13940  Zn-dependent protease  35.86 
 
 
379 aa  152  8e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.909069 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1843  peptidase M50  33.33 
 
 
376 aa  150  3e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.616528  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2171  peptidase M50  35.74 
 
 
403 aa  148  1.0000000000000001e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.121465  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1479  peptidase M50  35.92 
 
 
384 aa  147  3e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0658829  normal  0.564629 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16220  Zn-dependent protease  37.85 
 
 
395 aa  143  5e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.276827  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1181  peptidase M50  33.52 
 
 
379 aa  139  1e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.22871  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4475  peptidase M50  31.88 
 
 
400 aa  136  7.000000000000001e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.580173  normal  0.145803 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2223  peptidase M50  37.55 
 
 
376 aa  122  9.999999999999999e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3191  peptidase M50  26.91 
 
 
375 aa  120  3.9999999999999996e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00586872 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1797  peptidase M50  28.8 
 
 
397 aa  120  4.9999999999999996e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2181  hypothetical protein  35.74 
 
 
403 aa  119  6e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.392153 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4885  peptidase M50  28.31 
 
 
397 aa  118  9.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.333233 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5036  peptidase M50  32.35 
 
 
413 aa  117  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.206475 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22130  Zn-dependent protease  33.93 
 
 
390 aa  116  6e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.944872  normal  0.942698 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3381  peptidase M50  26.42 
 
 
396 aa  115  2.0000000000000002e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.000039902  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1483  peptidase M50  34.54 
 
 
417 aa  113  6e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.511598  normal  0.569675 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1457  peptidase M50  34.54 
 
 
417 aa  113  6e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1337  peptidase M50  35.42 
 
 
412 aa  113  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4785  peptidase M50  29.81 
 
 
373 aa  110  3e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.384856  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1872  peptidase M50  33.62 
 
 
373 aa  110  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0259  peptidase M50  26.57 
 
 
374 aa  109  6e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2354  peptidase M50  32.64 
 
 
386 aa  108  1e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.176917 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2237  peptidase M50  32.53 
 
 
359 aa  108  2e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.949585  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0920  peptidase M50  31.44 
 
 
374 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0947  peptidase M50  24.93 
 
 
374 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2633  peptidase M50  29.83 
 
 
405 aa  104  2e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.962625  normal  0.303399 
 
 
-
 
NC_002936  DET0769  protease family protein  26.67 
 
 
380 aa  101  3e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000172815  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1410  peptidase M50  29.55 
 
 
373 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.226741  normal  0.248277 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22910  Zn-dependent protease  36.28 
 
 
244 aa  100  4e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.511612  normal  0.351338 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_675  protease  27.83 
 
 
380 aa  99.8  7e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000159772  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2488  peptidase M50  27.8 
 
 
383 aa  99.4  9e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1011  peptidase M50  30.22 
 
 
404 aa  99  1e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1199  peptidase M50  28.03 
 
 
369 aa  98.2  2e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0242729  normal  0.16524 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2977  peptidase M50  40.22 
 
 
378 aa  97.4  4e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00144349  hitchhiker  0.00562837 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0222  peptidase M50  28.57 
 
 
394 aa  94.4  3e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3922  peptidase M50  25.86 
 
 
385 aa  94.4  3e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.558191 
 
 
-
 
NC_002936  DET0774  M50 family metallopeptidase  25.5 
 
 
370 aa  92.4  1e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0734  hypothetical protein  29.06 
 
 
416 aa  92  2e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.168601  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0700  peptidase M50  22.09 
 
 
370 aa  91.7  2e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0613  peptidase M50  35.9 
 
 
361 aa  91.3  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.190222  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1747  peptidase M50  24.39 
 
 
370 aa  90.9  3e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.951218  normal  0.0691878 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1629  hypothetical protein  28.16 
 
 
431 aa  89.4  9e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0695  peptidase M50  29.76 
 
 
379 aa  89  1e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000836286  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1291  peptidase M50  29.12 
 
 
366 aa  89.4  1e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00117198  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_680  metallopeptidase, M50 family  29.28 
 
 
371 aa  87.8  3e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0373838  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0978  hypothetical protein  25.49 
 
 
364 aa  87.4  4e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4494  peptidase M50  30.43 
 
 
381 aa  86.3  8e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2620  hypothetical protein  28.87 
 
 
239 aa  85.9  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00161745  normal  0.443629 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2355  peptidase M50  35.48 
 
 
396 aa  84.7  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0704943  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0155  peptidase M50  39.55 
 
 
392 aa  84.3  0.000000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11470  Zn-dependent protease  29.1 
 
 
388 aa  84.3  0.000000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.844041 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5283  peptidase M50  29.49 
 
 
390 aa  84  0.000000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2627  peptidase M50  34.86 
 
 
405 aa  82  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1368  peptidase M50  31.9 
 
 
395 aa  82.4  0.00000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00624726  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2535  peptidase M50  38.81 
 
 
373 aa  81.6  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.180251  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3400  peptidase M50  27.23 
 
 
381 aa  82  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3134  peptidase M50  31.46 
 
 
386 aa  80.1  0.00000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0170  CBS domain-containing protein  22.75 
 
 
343 aa  79  0.0000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.356486  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12644  hypothetical protein  37.84 
 
 
393 aa  77.8  0.0000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05401  Zn-dependent protease  29.25 
 
 
413 aa  77.8  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3648  peptidase M50  25.51 
 
 
381 aa  76.3  0.0000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0203123 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05931  Zn-dependent proteases  29.33 
 
 
405 aa  75.5  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.111882  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0524  peptidase M50  30.1 
 
 
285 aa  75.9  0.000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.311607  hitchhiker  0.00535986 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0613  peptidase M50  28.65 
 
 
377 aa  74.3  0.000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0236174 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1868  hypothetical protein  30.67 
 
 
396 aa  73.6  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.180278  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1617  putative protease  30.77 
 
 
286 aa  73.6  0.000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0318  CBS domain-containing protein  28.16 
 
 
370 aa  73.9  0.000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.147887  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0613  peptidase M50  37.78 
 
 
380 aa  73.2  0.000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.750705  normal  0.0786713 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2272  CBS domain-containing protein  29.28 
 
 
384 aa  72  0.00000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.29511 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2136  peptidase M50  31.76 
 
 
415 aa  72  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.821665  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0400  CBS domain-containing protein  30.77 
 
 
378 aa  71.2  0.00000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0735736  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1456  peptidase M50  40 
 
 
292 aa  70.9  0.00000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3750  peptidase M50  32.08 
 
 
372 aa  70.5  0.00000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.69281  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1508  peptidase M50  34.17 
 
 
412 aa  69.3  0.0000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2201  peptidase M50  33.08 
 
 
375 aa  68.9  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1185  peptidase M50  22.02 
 
 
338 aa  68.9  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1449  peptidase M50  22.89 
 
 
337 aa  69.3  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0709676 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1988  peptidase M50  30.97 
 
 
373 aa  68.9  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.319732 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1731  peptidase M50  29.86 
 
 
366 aa  68.2  0.0000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1497  peptidase M50  33.96 
 
 
372 aa  67.8  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.120961  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1412  peptidase M50  37.57 
 
 
383 aa  67  0.0000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.742384  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3329  peptidase M50  36.72 
 
 
290 aa  67  0.0000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.014503  normal  0.780198 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2601  peptidase M50  27.32 
 
 
394 aa  67  0.0000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.603215  normal  0.812434 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1032  peptidase M50  29.58 
 
 
395 aa  66.6  0.0000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0615226 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5311  peptidase M50  27.91 
 
 
301 aa  64.3  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0783881  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4342  peptidase M50  27.59 
 
 
291 aa  64.7  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0540  peptidase M50  27.39 
 
 
364 aa  64.7  0.000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07871  Zn-dependent protease  33.84 
 
 
422 aa  64.3  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>