183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2977 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_2977  peptidase M50  100 
 
 
378 aa  698    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00144349  hitchhiker  0.00562837 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22130  Zn-dependent protease  42.82 
 
 
390 aa  252  6e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.944872  normal  0.942698 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2223  peptidase M50  42.94 
 
 
376 aa  236  6e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5902  Zn-dependent protease-like protein  32.33 
 
 
362 aa  145  9e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0267336  normal  0.154235 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1815  hypothetical protein  35.48 
 
 
383 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.434017  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1843  peptidase M50  33.42 
 
 
376 aa  139  7e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.616528  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1914  peptidase M50  30.85 
 
 
387 aa  132  7.999999999999999e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000446293 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1483  peptidase M50  38.92 
 
 
365 aa  125  1e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2637  peptidase M50  30.05 
 
 
378 aa  123  5e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.599853  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4475  peptidase M50  30.75 
 
 
400 aa  119  7e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.580173  normal  0.145803 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2415  peptidase M50  30.63 
 
 
424 aa  118  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4885  peptidase M50  30.19 
 
 
397 aa  117  3e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.333233 
 
 
-
 
NC_002936  DET0769  protease family protein  42.86 
 
 
380 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000172815  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_675  protease  42.64 
 
 
380 aa  112  7.000000000000001e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000159772  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2237  peptidase M50  33.33 
 
 
359 aa  110  4.0000000000000004e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.949585  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1479  peptidase M50  34.85 
 
 
384 aa  110  5e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0658829  normal  0.564629 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2633  peptidase M50  30.25 
 
 
405 aa  110  6e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.962625  normal  0.303399 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1291  peptidase M50  22.94 
 
 
366 aa  109  8.000000000000001e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00117198  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1368  peptidase M50  34.58 
 
 
395 aa  109  8.000000000000001e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00624726  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0259  peptidase M50  36.73 
 
 
374 aa  107  4e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0774  M50 family metallopeptidase  33.99 
 
 
370 aa  105  9e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2305  peptidase M50  30.73 
 
 
362 aa  105  1e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00177185  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0695  peptidase M50  43.15 
 
 
379 aa  103  4e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000836286  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20920  Zn-dependent protease  40.22 
 
 
380 aa  103  6e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.961375 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_680  metallopeptidase, M50 family  33.99 
 
 
371 aa  103  6e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0373838  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11470  Zn-dependent protease  48.67 
 
 
388 aa  102  1e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.844041 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2535  peptidase M50  55.96 
 
 
373 aa  100  4e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.180251  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5036  peptidase M50  36.36 
 
 
413 aa  100  6e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.206475 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0700  peptidase M50  32.51 
 
 
370 aa  99.8  7e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1337  peptidase M50  37.99 
 
 
412 aa  99.8  8e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0222  peptidase M50  35.71 
 
 
394 aa  98.2  2e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1181  peptidase M50  28.45 
 
 
379 aa  97.8  3e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.22871  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1747  peptidase M50  33.85 
 
 
370 aa  97.1  5e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.951218  normal  0.0691878 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5311  peptidase M50  43.15 
 
 
301 aa  95.9  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0783881  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3191  peptidase M50  26.22 
 
 
375 aa  95.5  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00586872 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13940  Zn-dependent protease  33.48 
 
 
379 aa  95.5  1e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.909069 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0155  peptidase M50  49.17 
 
 
392 aa  95.1  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2354  peptidase M50  33.04 
 
 
386 aa  94.4  3e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.176917 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2181  hypothetical protein  36.55 
 
 
403 aa  93.6  5e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.392153 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3400  peptidase M50  38.38 
 
 
381 aa  93.6  5e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1872  peptidase M50  38.5 
 
 
373 aa  92.4  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1629  hypothetical protein  34.3 
 
 
431 aa  92  1e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3648  peptidase M50  39.09 
 
 
381 aa  92.4  1e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0203123 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2627  peptidase M50  39.77 
 
 
405 aa  92.4  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0734  hypothetical protein  36.45 
 
 
416 aa  91.7  2e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.168601  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5283  peptidase M50  33.33 
 
 
390 aa  91.7  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2006  peptidase M50  40 
 
 
376 aa  92  2e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.223407  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0947  peptidase M50  35.98 
 
 
374 aa  90.9  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0920  peptidase M50  35.98 
 
 
374 aa  91.3  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0978  hypothetical protein  36.13 
 
 
364 aa  90.1  6e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1483  peptidase M50  32.84 
 
 
417 aa  88.6  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.511598  normal  0.569675 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1797  peptidase M50  37.44 
 
 
397 aa  89  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3381  peptidase M50  35.1 
 
 
396 aa  89  1e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.000039902  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2244  peptidase M50  37.75 
 
 
373 aa  89  1e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.830349  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0318  CBS domain-containing protein  43.08 
 
 
370 aa  89  1e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.147887  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1457  peptidase M50  32.84 
 
 
417 aa  88.6  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1011  peptidase M50  27.14 
 
 
404 aa  88.2  2e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1617  putative protease  40 
 
 
286 aa  88.6  2e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2488  peptidase M50  34.17 
 
 
383 aa  87.8  3e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0613  peptidase M50  54.55 
 
 
380 aa  87  5e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.750705  normal  0.0786713 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1032  peptidase M50  38.56 
 
 
395 aa  86.7  6e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0615226 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11840  Zn-dependent protease  32.44 
 
 
375 aa  85.5  0.000000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0392218  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4785  peptidase M50  37.3 
 
 
373 aa  84.7  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.384856  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1731  peptidase M50  35.62 
 
 
366 aa  84.7  0.000000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3134  peptidase M50  43.24 
 
 
386 aa  84.7  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2171  peptidase M50  36.92 
 
 
403 aa  84.3  0.000000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.121465  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0170  CBS domain-containing protein  33.12 
 
 
343 aa  84.3  0.000000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.356486  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1856  peptidase M50  41.62 
 
 
377 aa  84.3  0.000000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1410  peptidase M50  36.71 
 
 
373 aa  84  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.226741  normal  0.248277 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2136  peptidase M50  38.73 
 
 
415 aa  83.6  0.000000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.821665  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1552  CBS domain-containing protein  28.66 
 
 
378 aa  83.6  0.000000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.651546  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2601  peptidase M50  39.19 
 
 
394 aa  83.2  0.000000000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.603215  normal  0.812434 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0149  CBS domain containing protein  34.25 
 
 
377 aa  81.6  0.00000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0113637 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3626  peptidase M50  36.71 
 
 
368 aa  81.6  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.721542 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3297  peptidase M50  35.92 
 
 
258 aa  80.5  0.00000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.153314  normal  0.569986 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1508  peptidase M50  41.22 
 
 
412 aa  80.5  0.00000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0400  CBS domain-containing protein  34.41 
 
 
378 aa  80.1  0.00000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0735736  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0613  peptidase M50  34.41 
 
 
361 aa  79.7  0.00000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.190222  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3922  peptidase M50  34.95 
 
 
385 aa  79.7  0.00000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.558191 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0289  peptidase M50  35.06 
 
 
393 aa  79  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3750  peptidase M50  37.16 
 
 
372 aa  77.4  0.0000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.69281  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22910  Zn-dependent protease  34.01 
 
 
244 aa  77.8  0.0000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.511612  normal  0.351338 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0406  peptidase M50  42.98 
 
 
380 aa  77.8  0.0000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.445518 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0540  peptidase M50  37.59 
 
 
364 aa  77  0.0000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16220  Zn-dependent protease  30.86 
 
 
395 aa  75.9  0.000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.276827  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3165  peptidase M50  30.57 
 
 
376 aa  75.9  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1988  peptidase M50  36.36 
 
 
373 aa  74.7  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.319732 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2272  CBS domain-containing protein  34.06 
 
 
384 aa  73.6  0.000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.29511 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1412  peptidase M50  48.28 
 
 
383 aa  73.6  0.000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.742384  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3329  peptidase M50  36.76 
 
 
290 aa  73.2  0.000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.014503  normal  0.780198 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3672  peptidase M50  36.42 
 
 
375 aa  73.2  0.000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14160  peptidase M50  39.23 
 
 
272 aa  72.8  0.000000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000034797  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1868  hypothetical protein  34.59 
 
 
396 aa  72  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.180278  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05931  Zn-dependent proteases  34.59 
 
 
405 aa  72  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.111882  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4923  peptidase M50  38.13 
 
 
373 aa  72  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.465017 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2620  hypothetical protein  31.45 
 
 
239 aa  71.6  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00161745  normal  0.443629 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2201  peptidase M50  35.04 
 
 
375 aa  71.6  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2355  peptidase M50  38.73 
 
 
396 aa  71.6  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0704943  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0613  peptidase M50  30.05 
 
 
377 aa  70.9  0.00000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0236174 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0524  peptidase M50  34.91 
 
 
285 aa  71.2  0.00000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.311607  hitchhiker  0.00535986 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>