194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_0483 on replicon NC_009456
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009456  VC0395_0483  hypothetical protein  100 
 
 		 360 aa  733    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000119997  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1762  putative peptidase  69.17 
 
 		 360 aa  534  1e-150  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.0051203  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05816  hypothetical protein  66.94 
 
 		 382 aa  440  9.999999999999999e-123  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000182  Zn-dependent protease  66.39 
 
 		 360 aa  431  1e-119  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.273834  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0672  peptidase M50  62.37 
 
 		 389 aa  415  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0458569 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3453  peptidase M50  62.63 
 
 		 374 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.444039  hitchhiker  0.00898971 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0595  peptidase M50  61.5 
 
 		 374 aa  415  9.999999999999999e-116  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3275  peptidase M50  63.17 
 
 		 374 aa  412  1e-114  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.01208 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4142  peptidase M50  61.38 
 
 		 380 aa  414  1e-114  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.452732 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0823  hypothetical protein  63.44 
 
 		 374 aa  409  1e-113  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3232  peptidase M50  61.81 
 
 		 392 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0537  peptidase M50  59.26 
 
 		 378 aa  402  1e-111  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0566  hypothetical protein  59.89 
 
 		 370 aa  398  9.999999999999999e-111  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.221621 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0686  peptidase M50  56.87 
 
 		 390 aa  399  9.999999999999999e-111  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.393797  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0828  peptidase M50  61.07 
 
 		 380 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000017367 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3980  peptidase M50  59.89 
 
 		 390 aa  398  9.999999999999999e-111  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0835  peptidase M50  60.8 
 
 		 380 aa  397  1e-109  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3533  peptidase M50  60.8 
 
 		 380 aa  397  1e-109  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0103941  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3167  peptidase M50  61.66 
 
 		 378 aa  396  1e-109  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0803  peptidase M50  60.8 
 
 		 380 aa  397  1e-109  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2980  peptidase M50  58.52 
 
 		 393 aa  392  1e-108  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0270746  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0786  M50 family peptidase  56.52 
 
 		 344 aa  372  1e-102  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0883958  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3312  gamma-glutamyl phosphate reductase GPR  34.88 
 
 		 364 aa  191  2e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00700873 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3701  peptidase M50  38.86 
 
 		 484 aa  151  2e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3580  peptidase M50  39.82 
 
 		 489 aa  142  8e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3720  peptidase M50  39.91 
 
 		 485 aa  139  8.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.115369  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3646  peptidase M50  40 
 
 		 485 aa  138  1e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.415625  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1570  hypothetical protein  39.57 
 
 		 365 aa  99.4  9e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0569959  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1329  membrane metalloprotease  34.97 
 
 		 365 aa  97.8  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1465  hypothetical protein  34.97 
 
 		 365 aa  97.8  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1608  hypothetical protein  34.97 
 
 		 365 aa  97.8  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000145815  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1538  hypothetical protein  34.97 
 
 		 365 aa  97.8  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000573699 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1166  peptidase M50  39.57 
 
 		 366 aa  98.2  2e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.59725  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1355  hypothetical protein  34.43 
 
 		 365 aa  97.4  3e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3843  hypothetical protein  35.52 
 
 		 365 aa  97.8  3e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0912094  hitchhiker  0.00000000235959 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1502  hypothetical protein  35.52 
 
 		 365 aa  97.1  4e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.191562  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1328  membrane metalloprotease  34.43 
 
 		 365 aa  95.9  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.826194  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1370  peptidase M50  37.41 
 
 		 365 aa  95.5  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00911747  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1818  peptidase M50  24.61 
 
 		 293 aa  94  4e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000422753  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4579  peptidase M50  40 
 
 		 305 aa  92.4  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.520288 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2946  peptidase M50  30.63 
 
 		 313 aa  87  4e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000715843  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0540  peptidase M50  36.14 
 
 		 364 aa  80.1  0.00000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4923  peptidase M50  36.59 
 
 		 373 aa  78.2  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.465017 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3626  peptidase M50  32.87 
 
 		 368 aa  77  0.0000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.721542 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2201  peptidase M50  32.84 
 
 		 375 aa  75.1  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0558  peptidase M50  35.2 
 
 		 372 aa  75.1  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.463996  normal  1 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49052  predicted protein  25.86 
 
 		 386 aa  73.9  0.000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.735615  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2396  peptidase M50  34.13 
 
 		 239 aa  73.6  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.311276  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2595  peptidase M50  31.71 
 
 		 337 aa  72  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3191  peptidase M50  35.71 
 
 		 375 aa  71.6  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00586872 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2524  hypothetical protein  33.33 
 
 		 241 aa  70.9  0.00000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0445127  hitchhiker  0.00571488 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2305  peptidase M50  32.09 
 
 		 362 aa  70.5  0.00000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00177185  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1797  peptidase M50  35.4 
 
 		 397 aa  69.7  0.00000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1872  peptidase M50  37.68 
 
 		 373 aa  69.3  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3165  peptidase M50  32.28 
 
 		 376 aa  69.3  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2136  peptidase M50  34.15 
 
 		 415 aa  69.3  0.0000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.821665  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2535  peptidase M50  39.47 
 
 		 373 aa  68.2  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.180251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2237  peptidase M50  33.6 
 
 		 359 aa  68.6  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.949585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1449  peptidase M50  34.82 
 
 		 337 aa  68.6  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0709676 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1988  peptidase M50  32.81 
 
 		 373 aa  67.8  0.0000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.319732 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0459  peptidase M50  30.41 
 
 		 342 aa  67.8  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0769405  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1483  peptidase M50  32.12 
 
 		 417 aa  67.4  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.511598  normal  0.569675 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1457  peptidase M50  32.12 
 
 		 417 aa  67.4  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0318  CBS domain-containing protein  31.5 
 
 		 370 aa  67  0.0000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.147887  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2539  peptidase M50  31.48 
 
 		 293 aa  66.6  0.0000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0160669  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4292  peptidase M50  31.61 
 
 		 286 aa  66.2  0.0000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3043  peptidase M50  30.94 
 
 		 241 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.216443  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5323  peptidase M50  30.94 
 
 		 241 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1185  peptidase M50  30.77 
 
 		 338 aa  65.9  0.000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4945  peptidase M50  30.94 
 
 		 241 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.365281  normal  0.0922667 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1337  peptidase M50  32.95 
 
 		 412 aa  65.1  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0613  peptidase M50  31.03 
 
 		 361 aa  64.7  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.190222  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1771  peptidase M50  30.4 
 
 		 247 aa  63.9  0.000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000535238 
 
 
-
 
NC_002936  DET0769  protease family protein  30 
 
 		 380 aa  63.2  0.000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000172815  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_675  protease  29.55 
 
 		 380 aa  63.2  0.000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000159772  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0170  CBS domain-containing protein  31.22 
 
 		 343 aa  63.2  0.000000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.356486  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0259  peptidase M50  29.27 
 
 		 374 aa  62.8  0.000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0326  peptidase M50  30.22 
 
 		 241 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.264818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4681  peptidase M50  30.22 
 
 		 241 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.314846  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5208  peptidase M50  30.22 
 
 		 241 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.125374 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0155  peptidase M50  36.11 
 
 		 392 aa  61.2  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2543  peptidase M50  31.71 
 
 		 287 aa  61.2  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000176554  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5036  peptidase M50  31.82 
 
 		 413 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.206475 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3750  peptidase M50  31.03 
 
 		 372 aa  62  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.69281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0613  peptidase M50  39.64 
 
 		 380 aa  60.8  0.00000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.750705  normal  0.0786713 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0920  peptidase M50  33.15 
 
 		 374 aa  60.8  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4342  peptidase M50  31.2 
 
 		 291 aa  60.8  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0947  peptidase M50  33.15 
 
 		 374 aa  60.8  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4538  stage IV sporulation protein FB  30.26 
 
 		 286 aa  60.8  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.214848  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2354  peptidase M50  31.67 
 
 		 386 aa  60.5  0.00000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.176917 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22130  Zn-dependent protease  30.25 
 
 		 390 aa  60.1  0.00000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.944872  normal  0.942698 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1497  peptidase M50  31.58 
 
 		 372 aa  60.1  0.00000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.120961  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1479  peptidase M50  30.6 
 
 		 384 aa  60.1  0.00000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0658829  normal  0.564629 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4565  stage IV sporulation protein FB  28.27 
 
 		 286 aa  60.1  0.00000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000384784  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1434  CBS domain-containing protein  31.2 
 
 		 336 aa  59.7  0.00000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2637  peptidase M50  30.08 
 
 		 378 aa  59.7  0.00000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.599853  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0669  stage IV sporulation protein FB  27.75 
 
 		 286 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000475668  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4526  stage IV sporulation protein FB  28.87 
 
 		 286 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.870935 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3161  peptidase M50  29.94 
 
 		 286 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000495345  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4580  stage IV sporulation protein FB  29.17 
 
 		 286 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000567867  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>