176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_2980 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_2980  peptidase M50  100 
 
 		 393 aa  791    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0270746  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0537  peptidase M50  75.32 
 
 		 378 aa  536  1e-151  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0595  peptidase M50  73.28 
 
 		 374 aa  511  1e-143  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0803  peptidase M50  72.01 
 
 		 380 aa  502  1e-141  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0828  peptidase M50  72.01 
 
 		 380 aa  503  1e-141  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000017367 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0835  peptidase M50  72.01 
 
 		 380 aa  502  1e-141  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3533  peptidase M50  71.76 
 
 		 380 aa  500  1e-140  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0103941  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3167  peptidase M50  70.74 
 
 		 378 aa  497  1e-139  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3275  peptidase M50  70.23 
 
 		 374 aa  492  9.999999999999999e-139  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.01208 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3453  peptidase M50  70.74 
 
 		 374 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.444039  hitchhiker  0.00898971 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4142  peptidase M50  70.81 
 
 		 380 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.452732 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0823  hypothetical protein  70.74 
 
 		 374 aa  490  1e-137  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0672  peptidase M50  69.72 
 
 		 389 aa  487  1e-136  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0458569 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3980  peptidase M50  70.89 
 
 		 390 aa  485  1e-136  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3232  peptidase M50  69.11 
 
 		 392 aa  473  1e-132  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1762  putative peptidase  60.91 
 
 		 360 aa  471  1.0000000000000001e-131  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.0051203  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0566  hypothetical protein  63.1 
 
 		 370 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.221621 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0686  peptidase M50  62.18 
 
 		 390 aa  428  1e-119  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.393797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000182  Zn-dependent protease  62.6 
 
 		 360 aa  416  9.999999999999999e-116  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.273834  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0483  hypothetical protein  58.64 
 
 		 360 aa  412  1e-114  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000119997  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05816  hypothetical protein  61.32 
 
 		 382 aa  409  1e-113  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0786  M50 family peptidase  57.33 
 
 		 344 aa  401  9.999999999999999e-111  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0883958  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3312  gamma-glutamyl phosphate reductase GPR  38.44 
 
 		 364 aa  207  2e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00700873 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3701  peptidase M50  37.99 
 
 		 484 aa  143  5e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3580  peptidase M50  39.22 
 
 		 489 aa  135  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3720  peptidase M50  39.22 
 
 		 485 aa  135  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.115369  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3646  peptidase M50  39.22 
 
 		 485 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.415625  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1570  hypothetical protein  33.87 
 
 		 365 aa  94  4e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0569959  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1329  membrane metalloprotease  33.87 
 
 		 365 aa  93.6  5e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1465  hypothetical protein  33.87 
 
 		 365 aa  93.6  5e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1608  hypothetical protein  33.87 
 
 		 365 aa  93.6  5e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000145815  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1538  hypothetical protein  33.87 
 
 		 365 aa  93.6  6e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000573699 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1355  hypothetical protein  33.33 
 
 		 365 aa  93.2  7e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3843  hypothetical protein  34.41 
 
 		 365 aa  92.8  9e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0912094  hitchhiker  0.00000000235959 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1328  membrane metalloprotease  33.33 
 
 		 365 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.826194  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1502  hypothetical protein  34.41 
 
 		 365 aa  92  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.191562  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1370  peptidase M50  32.8 
 
 		 365 aa  91.3  3e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00911747  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2946  peptidase M50  27.01 
 
 		 313 aa  88.6  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000715843  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1166  peptidase M50  34.62 
 
 		 366 aa  87.4  4e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.59725  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1818  peptidase M50  30.05 
 
 		 293 aa  83.6  0.000000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000422753  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0540  peptidase M50  31.07 
 
 		 364 aa  80.9  0.00000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4923  peptidase M50  34.62 
 
 		 373 aa  76.6  0.0000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.465017 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4579  peptidase M50  36.72 
 
 		 305 aa  75.9  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.520288 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2201  peptidase M50  33.09 
 
 		 375 aa  75.9  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0558  peptidase M50  29.06 
 
 		 372 aa  72.8  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.463996  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3626  peptidase M50  30 
 
 		 368 aa  72  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.721542 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0318  CBS domain-containing protein  31.74 
 
 		 370 aa  70.9  0.00000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.147887  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1449  peptidase M50  33.58 
 
 		 337 aa  70.1  0.00000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0709676 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2136  peptidase M50  31.82 
 
 		 415 aa  70.1  0.00000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.821665  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1797  peptidase M50  39.2 
 
 		 397 aa  68.9  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1483  peptidase M50  33.01 
 
 		 417 aa  67.8  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.511598  normal  0.569675 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1457  peptidase M50  33.01 
 
 		 417 aa  67.8  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49052  predicted protein  27.43 
 
 		 386 aa  67.4  0.0000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.735615  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0459  peptidase M50  31.39 
 
 		 342 aa  66.6  0.0000000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0769405  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2539  peptidase M50  30.3 
 
 		 293 aa  65.9  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0160669  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0613  peptidase M50  32.52 
 
 		 361 aa  66.2  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.190222  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1497  peptidase M50  29.94 
 
 		 372 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.120961  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1337  peptidase M50  36.59 
 
 		 412 aa  65.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1434  CBS domain-containing protein  29.82 
 
 		 336 aa  65.5  0.000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2305  peptidase M50  30.6 
 
 		 362 aa  64.7  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00177185  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3191  peptidase M50  39.06 
 
 		 375 aa  64.7  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00586872 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1185  peptidase M50  29.93 
 
 		 338 aa  64.3  0.000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1872  peptidase M50  38.21 
 
 		 373 aa  64.7  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0769  protease family protein  33.9 
 
 		 380 aa  64.3  0.000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000172815  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2396  peptidase M50  32.81 
 
 		 239 aa  63.9  0.000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.311276  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2535  peptidase M50  41.82 
 
 		 373 aa  63.9  0.000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.180251  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3750  peptidase M50  29.19 
 
 		 372 aa  63.9  0.000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.69281  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3165  peptidase M50  32.6 
 
 		 376 aa  63.5  0.000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2524  hypothetical protein  32.56 
 
 		 241 aa  62.8  0.000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0445127  hitchhiker  0.00571488 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1032  peptidase M50  33.92 
 
 		 395 aa  62.8  0.00000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0615226 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2237  peptidase M50  30.4 
 
 		 359 aa  62.4  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.949585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1988  peptidase M50  30.23 
 
 		 373 aa  62.8  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.319732 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0694  peptidase M50  30.57 
 
 		 366 aa  62.4  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.232631 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_675  protease  33.33 
 
 		 380 aa  62.8  0.00000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000159772  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2637  peptidase M50  30.88 
 
 		 378 aa  62  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.599853  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1181  peptidase M50  30.57 
 
 		 379 aa  61.2  0.00000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.22871  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5036  peptidase M50  32.61 
 
 		 413 aa  60.8  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.206475 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0669  stage IV sporulation protein FB  27.6 
 
 		 286 aa  60.8  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000475668  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4342  peptidase M50  33.65 
 
 		 291 aa  60.5  0.00000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0289  peptidase M50  31.71 
 
 		 393 aa  60.1  0.00000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3297  peptidase M50  27.59 
 
 		 258 aa  60.1  0.00000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.153314  normal  0.569986 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4292  peptidase M50  28.12 
 
 		 286 aa  59.7  0.00000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0907  peptidase M50  32.03 
 
 		 286 aa  59.3  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1479  peptidase M50  32.52 
 
 		 384 aa  58.9  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0658829  normal  0.564629 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2595  peptidase M50  26.77 
 
 		 337 aa  59.7  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3043  peptidase M50  29.5 
 
 		 241 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.216443  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0613  peptidase M50  38.74 
 
 		 380 aa  59.3  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.750705  normal  0.0786713 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5323  peptidase M50  29.5 
 
 		 241 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0458  peptidase M50  32.53 
 
 		 377 aa  59.7  0.0000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0639554  normal  0.134701 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4945  peptidase M50  29.5 
 
 		 241 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.365281  normal  0.0922667 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0832  peptidase M50  29.37 
 
 		 370 aa  58.5  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2354  peptidase M50  29.17 
 
 		 386 aa  58.9  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.176917 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2124  peptidase M50  27.59 
 
 		 284 aa  58.5  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000917211  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0259  peptidase M50  32.8 
 
 		 374 aa  57.8  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0326  peptidase M50  30.77 
 
 		 241 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.264818  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1731  peptidase M50  28.66 
 
 		 366 aa  57  0.0000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4681  peptidase M50  30.07 
 
 		 241 aa  57  0.0000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.314846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13940  Zn-dependent protease  26.95 
 
 		 379 aa  57  0.0000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.909069 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1856  peptidase M50  31.29 
 
 		 377 aa  57  0.0000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5208  peptidase M50  30.07 
 
 		 241 aa  57  0.0000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.125374 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>