181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_3312 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_3312  gamma-glutamyl phosphate reductase GPR  100 
 
 		 364 aa  729    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00700873 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1762  putative peptidase  34.91 
 
 		 360 aa  200  3e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.0051203  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0483  hypothetical protein  34.88 
 
 		 360 aa  183  5.0000000000000004e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000119997  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3980  peptidase M50  41.86 
 
 		 390 aa  180  4e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0828  peptidase M50  37.84 
 
 		 380 aa  179  8e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000017367 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3167  peptidase M50  40.46 
 
 		 378 aa  177  2e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0803  peptidase M50  37.54 
 
 		 380 aa  177  4e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0835  peptidase M50  37.54 
 
 		 380 aa  177  4e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3533  peptidase M50  37.54 
 
 		 380 aa  176  6e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0103941  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3232  peptidase M50  37.54 
 
 		 392 aa  176  7e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0823  hypothetical protein  38.51 
 
 		 374 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05816  hypothetical protein  43.16 
 
 		 382 aa  175  9.999999999999999e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2980  peptidase M50  38.44 
 
 		 393 aa  173  3.9999999999999995e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0270746  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0595  peptidase M50  36.07 
 
 		 374 aa  172  6.999999999999999e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0672  peptidase M50  38.2 
 
 		 389 aa  171  1e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0458569 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3453  peptidase M50  37.89 
 
 		 374 aa  171  2e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.444039  hitchhiker  0.00898971 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3275  peptidase M50  37.58 
 
 		 374 aa  170  4e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.01208 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0537  peptidase M50  39.53 
 
 		 378 aa  169  5e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000182  Zn-dependent protease  43.21 
 
 		 360 aa  169  1e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.273834  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0786  M50 family peptidase  40.89 
 
 		 344 aa  167  2e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0883958  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4142  peptidase M50  40.13 
 
 		 380 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.452732 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0566  hypothetical protein  39.26 
 
 		 370 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.221621 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0686  peptidase M50  37.32 
 
 		 390 aa  159  7e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.393797  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3580  peptidase M50  39.46 
 
 		 489 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3720  peptidase M50  39.78 
 
 		 485 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.115369  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3646  peptidase M50  39.78 
 
 		 485 aa  116  6e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.415625  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3701  peptidase M50  33.49 
 
 		 484 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1570  hypothetical protein  36.18 
 
 		 365 aa  103  6e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0569959  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1370  peptidase M50  35.68 
 
 		 365 aa  100  5e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00911747  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1329  membrane metalloprotease  36.2 
 
 		 365 aa  99.4  9e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1465  hypothetical protein  36.2 
 
 		 365 aa  99.4  9e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1355  hypothetical protein  36.2 
 
 		 365 aa  99.4  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1538  hypothetical protein  36.2 
 
 		 365 aa  99.4  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000573699 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3843  hypothetical protein  36.67 
 
 		 365 aa  98.6  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0912094  hitchhiker  0.00000000235959 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1608  hypothetical protein  35.58 
 
 		 365 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000145815  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1502  hypothetical protein  36.67 
 
 		 365 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.191562  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1166  peptidase M50  34.55 
 
 		 366 aa  97.4  3e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.59725  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1328  membrane metalloprotease  35.58 
 
 		 365 aa  97.4  4e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.826194  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2946  peptidase M50  35.21 
 
 		 313 aa  89  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000715843  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4579  peptidase M50  35.43 
 
 		 305 aa  82.4  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.520288 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1818  peptidase M50  28.98 
 
 		 293 aa  80.1  0.00000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000422753  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0832  peptidase M50  33.12 
 
 		 370 aa  73.2  0.000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2396  peptidase M50  31.43 
 
 		 239 aa  73.2  0.000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.311276  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0558  peptidase M50  33.52 
 
 		 372 aa  72.8  0.000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.463996  normal  1 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49052  predicted protein  31.88 
 
 		 386 aa  72.8  0.000000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.735615  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3626  peptidase M50  29.28 
 
 		 368 aa  72.4  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.721542 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2524  hypothetical protein  31.43 
 
 		 241 aa  70.9  0.00000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0445127  hitchhiker  0.00571488 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4945  peptidase M50  28.5 
 
 		 241 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.365281  normal  0.0922667 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4923  peptidase M50  32.53 
 
 		 373 aa  69.7  0.00000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.465017 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2201  peptidase M50  29.41 
 
 		 375 aa  68.6  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3043  peptidase M50  30.28 
 
 		 241 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.216443  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5323  peptidase M50  30.28 
 
 		 241 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1032  peptidase M50  32.74 
 
 		 395 aa  66.6  0.0000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0615226 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0326  peptidase M50  27.46 
 
 		 241 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.264818  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2136  peptidase M50  31.01 
 
 		 415 aa  65.5  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.821665  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4475  peptidase M50  34.72 
 
 		 400 aa  65.5  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.580173  normal  0.145803 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14160  peptidase M50  36.21 
 
 		 272 aa  65.9  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000034797  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0540  peptidase M50  28.46 
 
 		 364 aa  65.5  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4681  peptidase M50  27.98 
 
 		 241 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.314846  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5208  peptidase M50  27.98 
 
 		 241 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.125374 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1988  peptidase M50  27.06 
 
 		 373 aa  65.1  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.319732 
 
 
-
 
NC_002936  DET0774  M50 family metallopeptidase  28.26 
 
 		 370 aa  63.9  0.000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0695  peptidase M50  30.5 
 
 		 379 aa  63.2  0.000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000836286  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1747  peptidase M50  28.03 
 
 		 370 aa  63.2  0.000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.951218  normal  0.0691878 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0170  CBS domain-containing protein  32.67 
 
 		 343 aa  63.2  0.000000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.356486  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0289  peptidase M50  29.75 
 
 		 393 aa  62.4  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3672  peptidase M50  31.48 
 
 		 375 aa  62.4  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0700  peptidase M50  27.72 
 
 		 370 aa  61.2  0.00000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1771  peptidase M50  31.91 
 
 		 247 aa  61.6  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000535238 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_675  protease  32.74 
 
 		 380 aa  61.2  0.00000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000159772  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0769  protease family protein  32.74 
 
 		 380 aa  60.5  0.00000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000172815  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0259  peptidase M50  34.96 
 
 		 374 aa  60.5  0.00000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3750  peptidase M50  26.74 
 
 		 372 aa  60.8  0.00000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.69281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_680  metallopeptidase, M50 family  28.26 
 
 		 371 aa  60.5  0.00000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0373838  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2595  peptidase M50  30.32 
 
 		 337 aa  59.7  0.00000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2535  peptidase M50  35.4 
 
 		 373 aa  59.3  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.180251  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2620  hypothetical protein  28.85 
 
 		 239 aa  58.9  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00161745  normal  0.443629 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1508  peptidase M50  31.25 
 
 		 412 aa  58.9  0.0000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0613  peptidase M50  34.32 
 
 		 377 aa  58.2  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0236174 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3165  peptidase M50  28.91 
 
 		 376 aa  58.2  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1617  putative protease  31.71 
 
 		 286 aa  58.2  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0318  CBS domain-containing protein  29.41 
 
 		 370 aa  58.2  0.0000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.147887  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1185  peptidase M50  28.95 
 
 		 338 aa  58.2  0.0000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1337  peptidase M50  34.23 
 
 		 412 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1449  peptidase M50  30.41 
 
 		 337 aa  58.2  0.0000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0709676 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5036  peptidase M50  30.25 
 
 		 413 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.206475 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5311  peptidase M50  30.77 
 
 		 301 aa  58.2  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0783881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0459  peptidase M50  30.46 
 
 		 342 aa  58.5  0.0000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0769405  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0406  peptidase M50  26.58 
 
 		 380 aa  57.4  0.0000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.445518 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4292  peptidase M50  35.94 
 
 		 286 aa  57  0.0000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2637  peptidase M50  34.17 
 
 		 378 aa  56.6  0.0000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.599853  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2237  peptidase M50  29.41 
 
 		 359 aa  56.2  0.0000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.949585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2305  peptidase M50  29.92 
 
 		 362 aa  55.8  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00177185  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1434  CBS domain-containing protein  34.17 
 
 		 336 aa  55.8  0.000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0669  stage IV sporulation protein FB  32.28 
 
 		 286 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000475668  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4565  stage IV sporulation protein FB  33.07 
 
 		 286 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000384784  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4538  stage IV sporulation protein FB  33.07 
 
 		 286 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.214848  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4580  stage IV sporulation protein FB  33.07 
 
 		 286 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000567867  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22130  Zn-dependent protease  29.01 
 
 		 390 aa  55.5  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.944872  normal  0.942698 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1872  peptidase M50  35.29 
 
 		 373 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>