188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1818 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_1818  peptidase M50  100 
 
 		 293 aa  586  1e-166  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000422753  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2946  peptidase M50  41.67 
 
 		 313 aa  212  5.999999999999999e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000715843  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2396  peptidase M50  38.3 
 
 		 239 aa  169  6e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.311276  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2524  hypothetical protein  39.74 
 
 		 241 aa  168  1e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0445127  hitchhiker  0.00571488 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1771  peptidase M50  40.38 
 
 		 247 aa  155  9e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000535238 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3043  peptidase M50  38.26 
 
 		 241 aa  151  1e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.216443  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5323  peptidase M50  38.26 
 
 		 241 aa  151  1e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1166  peptidase M50  37.04 
 
 		 366 aa  150  2e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.59725  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1608  hypothetical protein  39.52 
 
 		 365 aa  150  3e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000145815  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1570  hypothetical protein  39.05 
 
 		 365 aa  149  5e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0569959  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1329  membrane metalloprotease  38.84 
 
 		 365 aa  149  5e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1370  peptidase M50  39.52 
 
 		 365 aa  149  5e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00911747  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1538  hypothetical protein  38.84 
 
 		 365 aa  149  6e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000573699 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1355  hypothetical protein  38.84 
 
 		 365 aa  149  7e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3843  hypothetical protein  39.05 
 
 		 365 aa  148  8e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0912094  hitchhiker  0.00000000235959 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1502  hypothetical protein  39.05 
 
 		 365 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.191562  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1465  hypothetical protein  38.39 
 
 		 365 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4945  peptidase M50  38.26 
 
 		 241 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.365281  normal  0.0922667 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0326  peptidase M50  38.26 
 
 		 241 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.264818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4681  peptidase M50  37.39 
 
 		 241 aa  146  5e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.314846  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5208  peptidase M50  37.39 
 
 		 241 aa  146  5e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.125374 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1328  membrane metalloprotease  37.95 
 
 		 365 aa  144  1e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.826194  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4579  peptidase M50  36.89 
 
 		 305 aa  132  5e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.520288 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2595  peptidase M50  34.3 
 
 		 337 aa  110  4.0000000000000004e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49052  predicted protein  33.83 
 
 		 386 aa  109  5e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.735615  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3701  peptidase M50  38.1 
 
 		 484 aa  99.4  6e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0483  hypothetical protein  26.24 
 
 		 360 aa  93.2  5e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000119997  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1762  putative peptidase  28.29 
 
 		 360 aa  90.5  3e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.0051203  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0786  M50 family peptidase  29.85 
 
 		 344 aa  83.2  0.000000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0883958  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3720  peptidase M50  35.71 
 
 		 485 aa  80.5  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.115369  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3646  peptidase M50  35.71 
 
 		 485 aa  80.1  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.415625  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3580  peptidase M50  35.71 
 
 		 489 aa  80.1  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3312  gamma-glutamyl phosphate reductase GPR  28.98 
 
 		 364 aa  80.1  0.00000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00700873 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0566  hypothetical protein  30.85 
 
 		 370 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.221621 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0558  peptidase M50  32.67 
 
 		 372 aa  72.8  0.000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.463996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0595  peptidase M50  29.61 
 
 		 374 aa  68.9  0.00000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0686  peptidase M50  29.69 
 
 		 390 aa  68.6  0.0000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.393797  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0537  peptidase M50  31.46 
 
 		 378 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3232  peptidase M50  30.88 
 
 		 392 aa  65.5  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3167  peptidase M50  33.33 
 
 		 378 aa  65.1  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3980  peptidase M50  35.1 
 
 		 390 aa  65.5  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000182  Zn-dependent protease  30.23 
 
 		 360 aa  65.1  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.273834  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4142  peptidase M50  33.11 
 
 		 380 aa  65.1  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.452732 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0828  peptidase M50  32.81 
 
 		 380 aa  63.5  0.000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000017367 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4475  peptidase M50  33.06 
 
 		 400 aa  63.2  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.580173  normal  0.145803 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3453  peptidase M50  31.76 
 
 		 374 aa  63.2  0.000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.444039  hitchhiker  0.00898971 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3533  peptidase M50  32.81 
 
 		 380 aa  63.2  0.000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0103941  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0803  peptidase M50  32.81 
 
 		 380 aa  63.2  0.000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0835  peptidase M50  32.81 
 
 		 380 aa  63.2  0.000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3275  peptidase M50  31.76 
 
 		 374 aa  63.2  0.000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.01208 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0672  peptidase M50  31.76 
 
 		 389 aa  62.4  0.000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0458569 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2980  peptidase M50  32.73 
 
 		 393 aa  62  0.00000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0270746  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0823  hypothetical protein  32.14 
 
 		 374 aa  61.2  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0978  hypothetical protein  32.8 
 
 		 364 aa  61.2  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2201  peptidase M50  27.06 
 
 		 375 aa  60.8  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3626  peptidase M50  31.16 
 
 		 368 aa  59.7  0.00000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.721542 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1731  peptidase M50  34.48 
 
 		 366 aa  59.3  0.00000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5283  peptidase M50  31.75 
 
 		 390 aa  59.3  0.00000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0459  peptidase M50  27.08 
 
 		 342 aa  58.9  0.00000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0769405  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1032  peptidase M50  27.59 
 
 		 395 aa  58.9  0.00000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0615226 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2535  peptidase M50  34.55 
 
 		 373 aa  58.9  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.180251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1185  peptidase M50  27.13 
 
 		 338 aa  58.5  0.0000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0613  peptidase M50  30.28 
 
 		 361 aa  58.9  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.190222  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13940  Zn-dependent protease  32.5 
 
 		 379 aa  58.2  0.0000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.909069 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0170  CBS domain-containing protein  28.93 
 
 		 343 aa  57.8  0.0000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.356486  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2620  hypothetical protein  33.33 
 
 		 239 aa  57.4  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00161745  normal  0.443629 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0318  CBS domain-containing protein  27.78 
 
 		 370 aa  57.4  0.0000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.147887  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0774  M50 family metallopeptidase  39.13 
 
 		 370 aa  57  0.0000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0613  peptidase M50  31.53 
 
 		 380 aa  56.6  0.0000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.750705  normal  0.0786713 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0700  peptidase M50  36.21 
 
 		 370 aa  56.6  0.0000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0549  peptidase M50  34.86 
 
 		 293 aa  56.6  0.0000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00818515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1988  peptidase M50  28.15 
 
 		 373 aa  56.6  0.0000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.319732 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22130  Zn-dependent protease  31.9 
 
 		 390 aa  56.2  0.0000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.944872  normal  0.942698 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1449  peptidase M50  27.27 
 
 		 337 aa  56.2  0.0000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0709676 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_680  metallopeptidase, M50 family  39.13 
 
 		 371 aa  56.2  0.0000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0373838  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1434  CBS domain-containing protein  29.87 
 
 		 336 aa  56.2  0.0000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1508  peptidase M50  29.13 
 
 		 412 aa  55.8  0.0000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0155  peptidase M50  33.33 
 
 		 392 aa  55.8  0.0000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3134  peptidase M50  30.47 
 
 		 386 aa  55.8  0.0000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2136  peptidase M50  26.02 
 
 		 415 aa  55.5  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.821665  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2633  peptidase M50  36.75 
 
 		 405 aa  55.5  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.962625  normal  0.303399 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3165  peptidase M50  27.78 
 
 		 376 aa  55.5  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4923  peptidase M50  28 
 
 		 373 aa  55.1  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.465017 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1296  peptidase M50  31.03 
 
 		 381 aa  54.3  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05816  hypothetical protein  27.43 
 
 		 382 aa  54.3  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4885  peptidase M50  31.15 
 
 		 397 aa  53.5  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.333233 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3329  peptidase M50  32 
 
 		 290 aa  53.1  0.000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.014503  normal  0.780198 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1552  CBS domain-containing protein  31.78 
 
 		 378 aa  53.1  0.000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.651546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2272  CBS domain-containing protein  31.01 
 
 		 384 aa  52.8  0.000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.29511 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2124  peptidase M50  34.21 
 
 		 284 aa  52.8  0.000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000917211  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3672  peptidase M50  28.93 
 
 		 375 aa  52.4  0.000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1514  peptidase M50  26.63 
 
 		 392 aa  52.4  0.000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0317  peptidase M50  27.97 
 
 		 186 aa  52.4  0.000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2389  M50 family peptidase  30.08 
 
 		 284 aa  52  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2547  peptidase M50  30.51 
 
 		 301 aa  51.6  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000136347  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1617  putative protease  34.48 
 
 		 286 aa  51.6  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2637  peptidase M50  29.05 
 
 		 378 aa  51.6  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.599853  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2223  peptidase M50  33.88 
 
 		 376 aa  52  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1446  peptidase M50  28.21 
 
 		 550 aa  52  0.00001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5036  peptidase M50  29.63 
 
 		 413 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.206475 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>