198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_2389 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_2389  M50 family peptidase  100 
 
 
284 aa  551  1e-156  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2101  M50 family peptidase  95.42 
 
 
284 aa  524  1e-148  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00808635  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0524  peptidase M50  24.44 
 
 
285 aa  108  9.000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.311607  hitchhiker  0.00535986 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14160  peptidase M50  26.95 
 
 
272 aa  89.7  4e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000034797  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2547  peptidase M50  27.55 
 
 
301 aa  87.4  2e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000136347  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1456  peptidase M50  23.64 
 
 
292 aa  85.9  6e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4342  peptidase M50  22.83 
 
 
291 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0098  peptidase M50  27.48 
 
 
269 aa  84.3  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1617  putative protease  24.5 
 
 
286 aa  82  0.000000000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2539  peptidase M50  23.87 
 
 
293 aa  78.6  0.0000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0160669  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1818  peptidase M50  23.72 
 
 
302 aa  76.6  0.0000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2415  peptidase M50  23.62 
 
 
424 aa  75.9  0.0000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4292  peptidase M50  28.93 
 
 
286 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4180  stage IV sporulation protein FB  29.44 
 
 
286 aa  73.2  0.000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0869981  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3329  peptidase M50  22.26 
 
 
290 aa  72.8  0.000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.014503  normal  0.780198 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4526  stage IV sporulation protein FB  28.93 
 
 
286 aa  72.8  0.000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.870935 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4565  stage IV sporulation protein FB  27.41 
 
 
286 aa  72.4  0.000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000384784  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4580  stage IV sporulation protein FB  28.93 
 
 
286 aa  72.4  0.000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000567867  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4538  stage IV sporulation protein FB  27.14 
 
 
286 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.214848  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4191  stage IV sporulation protein FB  28.43 
 
 
286 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3672  peptidase M50  28.8 
 
 
375 aa  71.6  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0613  peptidase M50  27.84 
 
 
377 aa  72  0.00000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0236174 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3134  peptidase M50  23.47 
 
 
386 aa  72  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0774  M50 family metallopeptidase  26.83 
 
 
370 aa  71.2  0.00000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4344  stage IV sporulation protein FB  28.93 
 
 
286 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5311  peptidase M50  28.83 
 
 
301 aa  70.9  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0783881  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4678  stage IV sporulation protein FB  28.93 
 
 
286 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0277771  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1988  peptidase M50  21.77 
 
 
373 aa  70.9  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.319732 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1032  peptidase M50  21.88 
 
 
395 aa  71.2  0.00000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0615226 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0669  stage IV sporulation protein FB  28.28 
 
 
286 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000475668  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3750  peptidase M50  26.32 
 
 
372 aa  69.7  0.00000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.69281  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2272  CBS domain-containing protein  29.05 
 
 
384 aa  69.3  0.00000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.29511 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1872  peptidase M50  26.41 
 
 
373 aa  68.9  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2201  peptidase M50  26.57 
 
 
375 aa  68.6  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2124  peptidase M50  21.96 
 
 
284 aa  68.2  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000917211  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0907  peptidase M50  25.97 
 
 
286 aa  68.9  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0400  CBS domain-containing protein  25.2 
 
 
378 aa  68.2  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0735736  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1815  hypothetical protein  35.19 
 
 
383 aa  67  0.0000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.434017  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3161  peptidase M50  27.22 
 
 
286 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000495345  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3626  peptidase M50  27.95 
 
 
368 aa  67  0.0000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.721542 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1843  peptidase M50  27.86 
 
 
376 aa  66.2  0.0000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.616528  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0318  CBS domain-containing protein  24.16 
 
 
370 aa  66.2  0.0000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.147887  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0695  peptidase M50  30.77 
 
 
379 aa  66.2  0.0000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000836286  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3297  peptidase M50  31.33 
 
 
258 aa  66.2  0.0000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.153314  normal  0.569986 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2223  peptidase M50  31.13 
 
 
376 aa  65.9  0.0000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_680  metallopeptidase, M50 family  29.89 
 
 
371 aa  65.5  0.0000000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0373838  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1291  peptidase M50  30.97 
 
 
366 aa  65.1  0.000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00117198  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0700  peptidase M50  29.25 
 
 
370 aa  65.1  0.000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1449  peptidase M50  25.51 
 
 
337 aa  64.7  0.000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0709676 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0459  peptidase M50  23.2 
 
 
342 aa  64.3  0.000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0769405  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0920  peptidase M50  27.5 
 
 
374 aa  63.5  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0947  peptidase M50  27.5 
 
 
374 aa  63.5  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0149  CBS domain containing protein  28.08 
 
 
377 aa  63.2  0.000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0113637 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0406  peptidase M50  24.74 
 
 
380 aa  63.2  0.000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.445518 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1747  peptidase M50  31.14 
 
 
370 aa  62.8  0.000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.951218  normal  0.0691878 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0170  CBS domain-containing protein  25.91 
 
 
343 aa  62.8  0.000000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.356486  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2620  hypothetical protein  27.93 
 
 
239 aa  62.4  0.000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00161745  normal  0.443629 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5902  Zn-dependent protease-like protein  33.96 
 
 
362 aa  62.8  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0267336  normal  0.154235 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0978  hypothetical protein  25.16 
 
 
364 aa  62.4  0.000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3165  peptidase M50  21.76 
 
 
376 aa  62.4  0.000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1185  peptidase M50  23.71 
 
 
338 aa  62.4  0.000000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2543  peptidase M50  25.85 
 
 
287 aa  62  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000176554  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2136  peptidase M50  26.06 
 
 
415 aa  61.6  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.821665  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1552  CBS domain-containing protein  28.73 
 
 
378 aa  61.6  0.00000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.651546  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0769  protease family protein  26.46 
 
 
380 aa  61.2  0.00000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000172815  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1497  peptidase M50  28.47 
 
 
372 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.120961  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2305  peptidase M50  25.16 
 
 
362 aa  60.8  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00177185  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1479  peptidase M50  31.71 
 
 
384 aa  60.8  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0658829  normal  0.564629 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_675  protease  27.23 
 
 
380 aa  60.5  0.00000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000159772  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0832  peptidase M50  21.65 
 
 
370 aa  60.5  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5036  peptidase M50  27.48 
 
 
413 aa  60.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.206475 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0549  peptidase M50  22.57 
 
 
293 aa  60.1  0.00000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00818515  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4923  peptidase M50  25.64 
 
 
373 aa  60.1  0.00000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.465017 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2601  peptidase M50  20.3 
 
 
394 aa  59.7  0.00000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.603215  normal  0.812434 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1508  peptidase M50  23.13 
 
 
412 aa  59.7  0.00000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3922  peptidase M50  33.33 
 
 
385 aa  59.7  0.00000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.558191 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1410  peptidase M50  24.8 
 
 
373 aa  59.3  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.226741  normal  0.248277 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1731  peptidase M50  27.93 
 
 
366 aa  58.9  0.00000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0540  peptidase M50  24.68 
 
 
364 aa  58.5  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4785  peptidase M50  26.34 
 
 
373 aa  58.2  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.384856  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16220  Zn-dependent protease  22.02 
 
 
395 aa  58.9  0.0000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.276827  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11470  Zn-dependent protease  27.33 
 
 
388 aa  58.5  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.844041 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0222  peptidase M50  24.61 
 
 
394 aa  58.9  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2237  peptidase M50  25.19 
 
 
359 aa  58.2  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.949585  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0613  peptidase M50  32.11 
 
 
361 aa  58.5  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.190222  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2535  peptidase M50  26.15 
 
 
373 aa  57.8  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.180251  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1337  peptidase M50  30.06 
 
 
412 aa  57.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20920  Zn-dependent protease  29.13 
 
 
380 aa  57.8  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.961375 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0289  peptidase M50  22.61 
 
 
393 aa  58.2  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0694  peptidase M50  27.08 
 
 
366 aa  57  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.232631 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2488  peptidase M50  26.9 
 
 
383 aa  57.4  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5283  peptidase M50  22.26 
 
 
390 aa  57  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3191  peptidase M50  29.89 
 
 
375 aa  56.6  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00586872 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0830  peptidase M50  31.94 
 
 
199 aa  56.6  0.0000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4579  peptidase M50  29.08 
 
 
305 aa  56.2  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.520288 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13940  Zn-dependent protease  24.32 
 
 
379 aa  55.5  0.0000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.909069 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0259  peptidase M50  23.57 
 
 
374 aa  55.1  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1457  peptidase M50  30.22 
 
 
417 aa  55.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1483  peptidase M50  30.22 
 
 
417 aa  55.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.511598  normal  0.569675 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2354  peptidase M50  25.2 
 
 
386 aa  55.5  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.176917 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>