105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_49052 on replicon NC_011688
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011688  PHATRDRAFT_49052  predicted protein  100 
 
 
386 aa  778    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.735615  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2946  peptidase M50  37.73 
 
 
313 aa  134  3e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000715843  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4579  peptidase M50  38.43 
 
 
305 aa  130  4.0000000000000003e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.520288 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3043  peptidase M50  38.29 
 
 
241 aa  122  9e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.216443  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5323  peptidase M50  38.29 
 
 
241 aa  122  9e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4681  peptidase M50  38.74 
 
 
241 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.314846  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4945  peptidase M50  38.29 
 
 
241 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.365281  normal  0.0922667 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5208  peptidase M50  38.74 
 
 
241 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.125374 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0326  peptidase M50  38.29 
 
 
241 aa  121  3e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.264818  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2396  peptidase M50  39.09 
 
 
239 aa  120  4.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.311276  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2524  hypothetical protein  40.29 
 
 
241 aa  120  6e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0445127  hitchhiker  0.00571488 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1818  peptidase M50  33.83 
 
 
293 aa  119  7e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000422753  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1771  peptidase M50  42.58 
 
 
247 aa  119  7.999999999999999e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000535238 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1166  peptidase M50  35.03 
 
 
366 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.59725  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1370  peptidase M50  35.45 
 
 
365 aa  116  6e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00911747  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1355  hypothetical protein  32.84 
 
 
365 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1329  membrane metalloprotease  32.84 
 
 
365 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1608  hypothetical protein  32.84 
 
 
365 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000145815  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1502  hypothetical protein  33.33 
 
 
365 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.191562  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3843  hypothetical protein  33.33 
 
 
365 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0912094  hitchhiker  0.00000000235959 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1538  hypothetical protein  32.84 
 
 
365 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000573699 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1570  hypothetical protein  34.39 
 
 
365 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0569959  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1328  membrane metalloprotease  32.34 
 
 
365 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.826194  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1465  hypothetical protein  32.84 
 
 
365 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2595  peptidase M50  30.23 
 
 
337 aa  87  5e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3580  peptidase M50  36.11 
 
 
489 aa  82.4  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3720  peptidase M50  36.11 
 
 
485 aa  82.8  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.115369  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3646  peptidase M50  35.56 
 
 
485 aa  81.3  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.415625  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1762  putative peptidase  24.89 
 
 
360 aa  76.6  0.0000000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.0051203  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0483  hypothetical protein  29.8 
 
 
360 aa  75.1  0.000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000119997  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3312  gamma-glutamyl phosphate reductase GPR  31.88 
 
 
364 aa  74.7  0.000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00700873 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3701  peptidase M50  33.49 
 
 
484 aa  74.3  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0786  M50 family peptidase  28.87 
 
 
344 aa  72.4  0.00000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0883958  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1032  peptidase M50  30.2 
 
 
395 aa  58.5  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0615226 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0558  peptidase M50  38.46 
 
 
372 aa  57.8  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.463996  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0566  hypothetical protein  28.65 
 
 
370 aa  57.4  0.0000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.221621 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2223  peptidase M50  40 
 
 
376 aa  57  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0672  peptidase M50  29.81 
 
 
389 aa  55.1  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0458569 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3533  peptidase M50  29.81 
 
 
380 aa  55.1  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0103941  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3232  peptidase M50  28.06 
 
 
392 aa  55.5  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0803  peptidase M50  29.81 
 
 
380 aa  55.1  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05816  hypothetical protein  27.47 
 
 
382 aa  55.5  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0835  peptidase M50  29.81 
 
 
380 aa  55.1  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0828  peptidase M50  29.81 
 
 
380 aa  55.1  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000017367 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3453  peptidase M50  29.19 
 
 
374 aa  53.5  0.000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.444039  hitchhiker  0.00898971 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3275  peptidase M50  29.19 
 
 
374 aa  53.5  0.000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.01208 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3167  peptidase M50  30.49 
 
 
378 aa  53.5  0.000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0823  hypothetical protein  30.5 
 
 
374 aa  52.8  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2201  peptidase M50  24.28 
 
 
375 aa  52.4  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4142  peptidase M50  30.12 
 
 
380 aa  52.8  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.452732 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1508  peptidase M50  29.32 
 
 
412 aa  52.8  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2136  peptidase M50  30.71 
 
 
415 aa  52.8  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.821665  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0537  peptidase M50  27.81 
 
 
378 aa  51.6  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3980  peptidase M50  30.32 
 
 
390 aa  52  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2980  peptidase M50  28.49 
 
 
393 aa  51.2  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0270746  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0595  peptidase M50  30.16 
 
 
374 aa  51.2  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3626  peptidase M50  29.71 
 
 
368 aa  51.6  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.721542 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2389  M50 family peptidase  28.83 
 
 
284 aa  50.8  0.00004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000182  Zn-dependent protease  25.41 
 
 
360 aa  50.8  0.00004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.273834  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05641  Zn-dependent protease  27.27 
 
 
407 aa  50.1  0.00006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.394997  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2637  peptidase M50  25.6 
 
 
378 aa  49.3  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.599853  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0686  peptidase M50  26.34 
 
 
390 aa  49.3  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.393797  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4923  peptidase M50  24.28 
 
 
373 aa  48.9  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.465017 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1731  peptidase M50  28.07 
 
 
366 aa  48.5  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1988  peptidase M50  24.72 
 
 
373 aa  48.5  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.319732 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5311  peptidase M50  34.21 
 
 
301 aa  48.1  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0783881  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0613  peptidase M50  31.25 
 
 
380 aa  47.8  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.750705  normal  0.0786713 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1523  peptidase M50  28.57 
 
 
423 aa  47.4  0.0004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.379776  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1617  putative protease  30.91 
 
 
286 aa  47.4  0.0005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2237  peptidase M50  31.97 
 
 
359 aa  47  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.949585  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3672  peptidase M50  26.95 
 
 
375 aa  47.4  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0289  peptidase M50  28.78 
 
 
393 aa  47  0.0006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2354  peptidase M50  31.9 
 
 
386 aa  46.6  0.0008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.176917 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1291  peptidase M50  25.32 
 
 
366 aa  46.6  0.0008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00117198  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05941  Zn-dependent proteases  25.58 
 
 
407 aa  46.2  0.0009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0318  CBS domain-containing protein  26.98 
 
 
370 aa  45.8  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.147887  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0695  peptidase M50  30.84 
 
 
379 aa  45.8  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000836286  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1337  peptidase M50  31.25 
 
 
412 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22130  Zn-dependent protease  31.58 
 
 
390 aa  45.8  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.944872  normal  0.942698 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_675  protease  26.8 
 
 
380 aa  46.2  0.001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000159772  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0769  protease family protein  27.45 
 
 
380 aa  45.1  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000172815  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1815  hypothetical protein  26.03 
 
 
383 aa  45.1  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.434017  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2535  peptidase M50  30.28 
 
 
373 aa  45.1  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.180251  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1185  peptidase M50  28.44 
 
 
338 aa  44.7  0.002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11470  Zn-dependent protease  28.87 
 
 
388 aa  45.1  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.844041 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0734  hypothetical protein  30.99 
 
 
416 aa  44.7  0.003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.168601  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1843  peptidase M50  29.36 
 
 
376 aa  44.7  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.616528  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3191  peptidase M50  27.34 
 
 
375 aa  44.7  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00586872 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1449  peptidase M50  27.62 
 
 
337 aa  44.7  0.003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0709676 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3297  peptidase M50  26.72 
 
 
258 aa  44.7  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.153314  normal  0.569986 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0540  peptidase M50  29.27 
 
 
364 aa  44.7  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1410  peptidase M50  30.56 
 
 
373 aa  44.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.226741  normal  0.248277 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2601  peptidase M50  27.93 
 
 
394 aa  44.7  0.003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.603215  normal  0.812434 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2305  peptidase M50  31.75 
 
 
362 aa  44.7  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00177185  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0978  hypothetical protein  29.46 
 
 
364 aa  44.3  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4785  peptidase M50  27.34 
 
 
373 aa  44.3  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.384856  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4976  peptidase M50  30.19 
 
 
505 aa  44.3  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0459  peptidase M50  27.62 
 
 
342 aa  43.9  0.005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0769405  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0524  peptidase M50  23.67 
 
 
285 aa  43.9  0.005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.311607  hitchhiker  0.00535986 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5036  peptidase M50  32.43 
 
 
413 aa  43.5  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.206475 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>