185 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_3232 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_3232  peptidase M50  100 
 
 		 392 aa  793    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4142  peptidase M50  79.53 
 
 		 380 aa  564  1e-160  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.452732 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3980  peptidase M50  78.48 
 
 		 390 aa  550  1e-155  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3453  peptidase M50  79.41 
 
 		 374 aa  545  1e-154  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.444039  hitchhiker  0.00898971 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3275  peptidase M50  79.41 
 
 		 374 aa  544  1e-153  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.01208 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0672  peptidase M50  78.88 
 
 		 389 aa  542  1e-153  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0458569 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0595  peptidase M50  77.54 
 
 		 374 aa  543  1e-153  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0823  hypothetical protein  78.61 
 
 		 374 aa  535  1e-151  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0828  peptidase M50  79.26 
 
 		 380 aa  536  1e-151  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000017367 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0566  hypothetical protein  77.32 
 
 		 370 aa  535  1e-151  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.221621 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3533  peptidase M50  78.99 
 
 		 380 aa  535  1e-151  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0103941  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0803  peptidase M50  79.26 
 
 		 380 aa  537  1e-151  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0835  peptidase M50  79.26 
 
 		 380 aa  537  1e-151  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3167  peptidase M50  78.34 
 
 		 378 aa  534  1e-150  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0537  peptidase M50  72.75 
 
 		 378 aa  501  1e-141  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1762  putative peptidase  65.93 
 
 		 360 aa  491  1e-137  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.0051203  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2980  peptidase M50  69.11 
 
 		 393 aa  477  1e-133  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0270746  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0686  peptidase M50  65.87 
 
 		 390 aa  449  1e-125  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.393797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0483  hypothetical protein  61.69 
 
 		 360 aa  431  1e-119  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000119997  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05816  hypothetical protein  63.95 
 
 		 382 aa  425  1e-118  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0786  M50 family peptidase  62.93 
 
 		 344 aa  422  1e-117  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0883958  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000182  Zn-dependent protease  65.93 
 
 		 360 aa  420  1e-116  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.273834  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3312  gamma-glutamyl phosphate reductase GPR  39.04 
 
 		 364 aa  214  2.9999999999999995e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00700873 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3701  peptidase M50  32.53 
 
 		 484 aa  149  9e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3580  peptidase M50  31.72 
 
 		 489 aa  137  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3720  peptidase M50  37.75 
 
 		 485 aa  135  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.115369  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3646  peptidase M50  37.75 
 
 		 485 aa  134  3e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.415625  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1570  hypothetical protein  35.48 
 
 		 365 aa  102  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0569959  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1329  membrane metalloprotease  34.95 
 
 		 365 aa  101  3e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1465  hypothetical protein  34.95 
 
 		 365 aa  101  3e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1538  hypothetical protein  34.95 
 
 		 365 aa  100  3e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000573699 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1608  hypothetical protein  34.95 
 
 		 365 aa  101  3e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000145815  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1355  hypothetical protein  34.41 
 
 		 365 aa  100  4e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3843  hypothetical protein  34.95 
 
 		 365 aa  99.8  7e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0912094  hitchhiker  0.00000000235959 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1328  membrane metalloprotease  34.41 
 
 		 365 aa  99  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.826194  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1502  hypothetical protein  34.95 
 
 		 365 aa  99.4  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.191562  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1370  peptidase M50  33.87 
 
 		 365 aa  99  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00911747  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1166  peptidase M50  34.07 
 
 		 366 aa  94  4e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.59725  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1818  peptidase M50  28.52 
 
 		 293 aa  89.7  8e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000422753  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2946  peptidase M50  29.38 
 
 		 313 aa  83.6  0.000000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000715843  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4579  peptidase M50  36.69 
 
 		 305 aa  80.1  0.00000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.520288 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0540  peptidase M50  34.52 
 
 		 364 aa  75.1  0.000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4923  peptidase M50  34.31 
 
 		 373 aa  74.3  0.000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.465017 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2201  peptidase M50  33.82 
 
 		 375 aa  73.9  0.000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49052  predicted protein  28.65 
 
 		 386 aa  72.4  0.00000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.735615  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1449  peptidase M50  32.33 
 
 		 337 aa  71.6  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0709676 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2396  peptidase M50  33.33 
 
 		 239 aa  71.2  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.311276  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2595  peptidase M50  30.77 
 
 		 337 aa  71.2  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1988  peptidase M50  31.38 
 
 		 373 aa  70.9  0.00000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.319732 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1434  CBS domain-containing protein  29.19 
 
 		 336 aa  70.1  0.00000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0318  CBS domain-containing protein  31.95 
 
 		 370 aa  69.7  0.00000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.147887  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0459  peptidase M50  31.58 
 
 		 342 aa  69.7  0.00000000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0769405  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3043  peptidase M50  33.79 
 
 		 241 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.216443  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5323  peptidase M50  33.79 
 
 		 241 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4945  peptidase M50  33.79 
 
 		 241 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.365281  normal  0.0922667 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0558  peptidase M50  35.71 
 
 		 372 aa  68.9  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.463996  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2524  hypothetical protein  32.56 
 
 		 241 aa  68.6  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0445127  hitchhiker  0.00571488 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2136  peptidase M50  33.33 
 
 		 415 aa  68.2  0.0000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.821665  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1185  peptidase M50  30.08 
 
 		 338 aa  67  0.0000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3626  peptidase M50  29.1 
 
 		 368 aa  66.6  0.0000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.721542 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1872  peptidase M50  37.4 
 
 		 373 aa  66.6  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4342  peptidase M50  31.71 
 
 		 291 aa  66.2  0.0000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0613  peptidase M50  27.64 
 
 		 361 aa  66.2  0.0000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.190222  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4292  peptidase M50  28.34 
 
 		 286 aa  66.2  0.0000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1483  peptidase M50  31.1 
 
 		 417 aa  65.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.511598  normal  0.569675 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0326  peptidase M50  31.75 
 
 		 241 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.264818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3191  peptidase M50  38.21 
 
 		 375 aa  66.2  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00586872 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1457  peptidase M50  31.1 
 
 		 417 aa  65.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1497  peptidase M50  31.75 
 
 		 372 aa  64.3  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.120961  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2305  peptidase M50  29.85 
 
 		 362 aa  64.3  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00177185  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2237  peptidase M50  31.2 
 
 		 359 aa  64.7  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.949585  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4681  peptidase M50  30.95 
 
 		 241 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.314846  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5208  peptidase M50  30.95 
 
 		 241 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.125374 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2637  peptidase M50  30.77 
 
 		 378 aa  63.2  0.000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.599853  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1797  peptidase M50  34.92 
 
 		 397 aa  63.2  0.000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2539  peptidase M50  30.25 
 
 		 293 aa  63.2  0.000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0160669  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1479  peptidase M50  31.71 
 
 		 384 aa  62.8  0.000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0658829  normal  0.564629 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1337  peptidase M50  34.96 
 
 		 412 aa  62.4  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2535  peptidase M50  37.17 
 
 		 373 aa  62.4  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.180251  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1771  peptidase M50  28.87 
 
 		 247 aa  62.8  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000535238 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3750  peptidase M50  32.31 
 
 		 372 aa  62  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.69281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5902  Zn-dependent protease-like protein  27.33 
 
 		 362 aa  61.6  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0267336  normal  0.154235 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3165  peptidase M50  30.06 
 
 		 376 aa  62  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1181  peptidase M50  33.59 
 
 		 379 aa  62  0.00000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.22871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0694  peptidase M50  31.75 
 
 		 366 aa  62  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.232631 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1856  peptidase M50  34.27 
 
 		 377 aa  62  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5036  peptidase M50  30.98 
 
 		 413 aa  61.2  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.206475 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3297  peptidase M50  27.75 
 
 		 258 aa  61.2  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.153314  normal  0.569986 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2124  peptidase M50  32.14 
 
 		 284 aa  61.2  0.00000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000917211  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0613  peptidase M50  38.74 
 
 		 380 aa  60.8  0.00000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.750705  normal  0.0786713 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0947  peptidase M50  34.59 
 
 		 374 aa  60.5  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2627  peptidase M50  33.9 
 
 		 405 aa  60.5  0.00000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0920  peptidase M50  34.59 
 
 		 374 aa  60.5  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0669  stage IV sporulation protein FB  27.27 
 
 		 286 aa  59.7  0.00000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000475668  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0734  hypothetical protein  29.31 
 
 		 416 aa  59.7  0.00000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.168601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4475  peptidase M50  27.56 
 
 		 400 aa  59.7  0.00000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.580173  normal  0.145803 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1032  peptidase M50  32.28 
 
 		 395 aa  59.7  0.00000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0615226 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3381  peptidase M50  33.33 
 
 		 396 aa  58.9  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.000039902  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0978  hypothetical protein  28.07 
 
 		 364 aa  59.3  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0155  peptidase M50  35.19 
 
 		 392 aa  59.7  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>