182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_3167 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_3167  peptidase M50  100 
 
 
378 aa  763    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3533  peptidase M50  89.21 
 
 
380 aa  632  1e-180  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0103941  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0803  peptidase M50  89.47 
 
 
380 aa  633  1e-180  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0835  peptidase M50  89.47 
 
 
380 aa  633  1e-180  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0828  peptidase M50  89.21 
 
 
380 aa  630  1e-179  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000017367 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0672  peptidase M50  87 
 
 
389 aa  620  1e-177  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0458569 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3275  peptidase M50  87.17 
 
 
374 aa  617  1e-175  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.01208 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3453  peptidase M50  87.43 
 
 
374 aa  616  1e-175  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.444039  hitchhiker  0.00898971 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0823  hypothetical protein  86.9 
 
 
374 aa  613  9.999999999999999e-175  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0595  peptidase M50  78.13 
 
 
374 aa  543  1e-153  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3232  peptidase M50  78.34 
 
 
392 aa  534  1e-150  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3980  peptidase M50  76.9 
 
 
390 aa  532  1e-150  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4142  peptidase M50  76.58 
 
 
380 aa  533  1e-150  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.452732 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0566  hypothetical protein  74.34 
 
 
370 aa  526  1e-148  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.221621 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0537  peptidase M50  75.13 
 
 
378 aa  512  1e-144  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2980  peptidase M50  70.74 
 
 
393 aa  501  1e-141  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0270746  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1762  putative peptidase  63.17 
 
 
360 aa  484  1e-135  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.0051203  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0686  peptidase M50  65.78 
 
 
390 aa  439  9.999999999999999e-123  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.393797  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05816  hypothetical protein  64.89 
 
 
382 aa  422  1e-117  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000182  Zn-dependent protease  64.52 
 
 
360 aa  421  1e-116  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.273834  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0483  hypothetical protein  61.43 
 
 
360 aa  418  1e-116  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000119997  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0786  M50 family peptidase  60.39 
 
 
344 aa  401  9.999999999999999e-111  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0883958  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3312  gamma-glutamyl phosphate reductase GPR  40.88 
 
 
364 aa  213  2.9999999999999995e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00700873 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3701  peptidase M50  35.98 
 
 
484 aa  136  6.0000000000000005e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3580  peptidase M50  34.35 
 
 
489 aa  130  3e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3720  peptidase M50  36.63 
 
 
485 aa  130  6e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.115369  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3646  peptidase M50  36.63 
 
 
485 aa  129  8.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.415625  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1570  hypothetical protein  33.7 
 
 
365 aa  92  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0569959  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3843  hypothetical protein  34.24 
 
 
365 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0912094  hitchhiker  0.00000000235959 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1329  membrane metalloprotease  33.15 
 
 
365 aa  91.3  3e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1538  hypothetical protein  33.15 
 
 
365 aa  90.9  3e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000573699 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1608  hypothetical protein  33.15 
 
 
365 aa  90.9  3e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000145815  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1465  hypothetical protein  33.15 
 
 
365 aa  90.9  3e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1502  hypothetical protein  34.24 
 
 
365 aa  90.9  3e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.191562  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1355  hypothetical protein  32.61 
 
 
365 aa  90.5  5e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1328  membrane metalloprotease  32.61 
 
 
365 aa  88.6  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.826194  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1370  peptidase M50  32.07 
 
 
365 aa  88.2  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00911747  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1818  peptidase M50  30.31 
 
 
293 aa  87.8  3e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000422753  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1166  peptidase M50  36.43 
 
 
366 aa  86.7  7e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.59725  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4579  peptidase M50  37.06 
 
 
305 aa  84  0.000000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.520288 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4923  peptidase M50  32.74 
 
 
373 aa  81.3  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.465017 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2946  peptidase M50  28.84 
 
 
313 aa  79.3  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000715843  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1872  peptidase M50  37.11 
 
 
373 aa  78.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2201  peptidase M50  33.58 
 
 
375 aa  76.6  0.0000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0540  peptidase M50  32.76 
 
 
364 aa  75.9  0.000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3191  peptidase M50  38.36 
 
 
375 aa  73.9  0.000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00586872 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0318  CBS domain-containing protein  31.14 
 
 
370 aa  73.6  0.000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.147887  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1457  peptidase M50  30.99 
 
 
417 aa  71.2  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1483  peptidase M50  30.99 
 
 
417 aa  71.2  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.511598  normal  0.569675 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0947  peptidase M50  36.48 
 
 
374 aa  70.5  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0920  peptidase M50  36.48 
 
 
374 aa  70.5  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1797  peptidase M50  36 
 
 
397 aa  67.8  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3165  peptidase M50  33.13 
 
 
376 aa  67.8  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49052  predicted protein  29.81 
 
 
386 aa  67.8  0.0000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.735615  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2396  peptidase M50  31.78 
 
 
239 aa  67.4  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.311276  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0558  peptidase M50  26.63 
 
 
372 aa  67  0.0000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.463996  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1988  peptidase M50  29.79 
 
 
373 aa  67  0.0000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.319732 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3626  peptidase M50  28.24 
 
 
368 aa  66.2  0.0000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.721542 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1434  CBS domain-containing protein  29.35 
 
 
336 aa  66.2  0.0000000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1181  peptidase M50  31.03 
 
 
379 aa  66.2  0.0000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.22871  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2305  peptidase M50  29.79 
 
 
362 aa  65.9  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00177185  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3750  peptidase M50  33.33 
 
 
372 aa  66.2  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.69281  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2535  peptidase M50  40 
 
 
373 aa  65.9  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.180251  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2524  hypothetical protein  31.01 
 
 
241 aa  64.7  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0445127  hitchhiker  0.00571488 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3297  peptidase M50  29.48 
 
 
258 aa  65.1  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.153314  normal  0.569986 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1449  peptidase M50  31.97 
 
 
337 aa  65.1  0.000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0709676 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1032  peptidase M50  32.08 
 
 
395 aa  64.7  0.000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0615226 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2136  peptidase M50  34.15 
 
 
415 aa  64.3  0.000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.821665  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5036  peptidase M50  31.54 
 
 
413 aa  62.8  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.206475 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1497  peptidase M50  29.94 
 
 
372 aa  62.8  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.120961  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0289  peptidase M50  30.73 
 
 
393 aa  62.4  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3043  peptidase M50  31.54 
 
 
241 aa  62  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.216443  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5323  peptidase M50  31.54 
 
 
241 aa  62  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2539  peptidase M50  31.68 
 
 
293 aa  62.4  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0160669  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2237  peptidase M50  29.6 
 
 
359 aa  62.8  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.949585  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0459  peptidase M50  30.61 
 
 
342 aa  62.4  0.00000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0769405  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1337  peptidase M50  37.4 
 
 
412 aa  62  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4945  peptidase M50  31.54 
 
 
241 aa  62  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.365281  normal  0.0922667 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0613  peptidase M50  29.21 
 
 
361 aa  61.6  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.190222  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2124  peptidase M50  31.87 
 
 
284 aa  61.2  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000917211  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0613  peptidase M50  38.74 
 
 
380 aa  61.2  0.00000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.750705  normal  0.0786713 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0326  peptidase M50  31.54 
 
 
241 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.264818  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0694  peptidase M50  29.94 
 
 
366 aa  60.8  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.232631 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1291  peptidase M50  32.45 
 
 
366 aa  60.5  0.00000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00117198  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1185  peptidase M50  29.25 
 
 
338 aa  60.1  0.00000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0170  CBS domain-containing protein  30.23 
 
 
343 aa  59.7  0.00000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.356486  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1479  peptidase M50  31.71 
 
 
384 aa  59.7  0.00000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0658829  normal  0.564629 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0734  hypothetical protein  27.78 
 
 
416 aa  58.9  0.0000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.168601  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2595  peptidase M50  26.37 
 
 
337 aa  58.9  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4681  peptidase M50  30.77 
 
 
241 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.314846  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5208  peptidase M50  30.77 
 
 
241 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.125374 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2637  peptidase M50  30.14 
 
 
378 aa  58.9  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.599853  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1856  peptidase M50  33.83 
 
 
377 aa  58.9  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0669  stage IV sporulation protein FB  27.23 
 
 
286 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000475668  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4785  peptidase M50  35.97 
 
 
373 aa  58.2  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.384856  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1629  hypothetical protein  28.92 
 
 
431 aa  58.2  0.0000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1410  peptidase M50  37.58 
 
 
373 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.226741  normal  0.248277 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4475  peptidase M50  26.21 
 
 
400 aa  57.8  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.580173  normal  0.145803 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0458  peptidase M50  31.61 
 
 
377 aa  57.8  0.0000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0639554  normal  0.134701 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4342  peptidase M50  29.45 
 
 
291 aa  57.8  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>