189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_3980 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_3980  peptidase M50  100 
 
 		 390 aa  788    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4142  peptidase M50  81.35 
 
 		 380 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.452732 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0595  peptidase M50  78.74 
 
 		 374 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3232  peptidase M50  78.22 
 
 		 392 aa  550  1e-155  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0803  peptidase M50  76.64 
 
 		 380 aa  538  9.999999999999999e-153  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0835  peptidase M50  76.64 
 
 		 380 aa  538  9.999999999999999e-153  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0828  peptidase M50  76.64 
 
 		 380 aa  535  1e-151  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000017367 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3533  peptidase M50  76.38 
 
 		 380 aa  536  1e-151  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0103941  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3275  peptidase M50  77.17 
 
 		 374 aa  532  1e-150  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.01208 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0672  peptidase M50  76.9 
 
 		 389 aa  531  1e-150  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0458569 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3453  peptidase M50  77.17 
 
 		 374 aa  533  1e-150  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.444039  hitchhiker  0.00898971 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3167  peptidase M50  76.9 
 
 		 378 aa  533  1e-150  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0823  hypothetical protein  76.64 
 
 		 374 aa  527  1e-148  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0537  peptidase M50  71.92 
 
 		 378 aa  503  1e-141  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1762  putative peptidase  64.64 
 
 		 360 aa  499  1e-140  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.0051203  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0566  hypothetical protein  69.53 
 
 		 370 aa  496  1e-139  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.221621 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2980  peptidase M50  70.89 
 
 		 393 aa  489  1e-137  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0270746  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0686  peptidase M50  66.23 
 
 		 390 aa  451  1e-125  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.393797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05816  hypothetical protein  63.59 
 
 		 382 aa  427  1e-118  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0483  hypothetical protein  59.89 
 
 		 360 aa  423  1e-117  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000119997  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0786  M50 family peptidase  59.23 
 
 		 344 aa  409  1e-113  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0883958  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000182  Zn-dependent protease  61.48 
 
 		 360 aa  407  1.0000000000000001e-112  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.273834  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3312  gamma-glutamyl phosphate reductase GPR  41.86 
 
 		 364 aa  217  4e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00700873 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3701  peptidase M50  38.57 
 
 		 484 aa  146  5e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3580  peptidase M50  36.12 
 
 		 489 aa  137  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3720  peptidase M50  37.75 
 
 		 485 aa  135  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.115369  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3646  peptidase M50  37.75 
 
 		 485 aa  134  3.9999999999999996e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.415625  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1570  hypothetical protein  35.33 
 
 		 365 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0569959  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1329  membrane metalloprotease  34.78 
 
 		 365 aa  97.1  4e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1465  hypothetical protein  34.78 
 
 		 365 aa  97.1  4e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3843  hypothetical protein  35.87 
 
 		 365 aa  97.4  4e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0912094  hitchhiker  0.00000000235959 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1538  hypothetical protein  34.78 
 
 		 365 aa  97.1  5e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000573699 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1608  hypothetical protein  34.78 
 
 		 365 aa  97.1  5e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000145815  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1502  hypothetical protein  35.87 
 
 		 365 aa  96.7  6e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.191562  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1355  hypothetical protein  34.24 
 
 		 365 aa  96.7  7e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1328  membrane metalloprotease  34.24 
 
 		 365 aa  94.7  3e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.826194  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1370  peptidase M50  33.7 
 
 		 365 aa  94.7  3e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00911747  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2946  peptidase M50  30.26 
 
 		 313 aa  93.6  5e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000715843  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1166  peptidase M50  32.42 
 
 		 366 aa  92.4  1e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.59725  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1818  peptidase M50  31.03 
 
 		 293 aa  88.2  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000422753  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4579  peptidase M50  37.3 
 
 		 305 aa  84.7  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.520288 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2201  peptidase M50  33.58 
 
 		 375 aa  78.6  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4923  peptidase M50  32.75 
 
 		 373 aa  77.4  0.0000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.465017 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0540  peptidase M50  33.73 
 
 		 364 aa  77  0.0000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0613  peptidase M50  30.65 
 
 		 361 aa  75.5  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.190222  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0318  CBS domain-containing protein  30.54 
 
 		 370 aa  72.4  0.00000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.147887  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0558  peptidase M50  28.44 
 
 		 372 aa  70.5  0.00000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.463996  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3626  peptidase M50  29.85 
 
 		 368 aa  70.9  0.00000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.721542 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1988  peptidase M50  32.8 
 
 		 373 aa  70.1  0.00000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.319732 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1483  peptidase M50  33.13 
 
 		 417 aa  68.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.511598  normal  0.569675 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0669  stage IV sporulation protein FB  28.8 
 
 		 286 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000475668  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1457  peptidase M50  33.13 
 
 		 417 aa  68.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49052  predicted protein  30.5 
 
 		 386 aa  68.6  0.0000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.735615  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2396  peptidase M50  30.95 
 
 		 239 aa  67.8  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.311276  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2637  peptidase M50  31.47 
 
 		 378 aa  68.2  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.599853  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1434  CBS domain-containing protein  28.11 
 
 		 336 aa  67.4  0.0000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1032  peptidase M50  30.68 
 
 		 395 aa  67  0.0000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0615226 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2524  hypothetical protein  31.5 
 
 		 241 aa  67  0.0000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0445127  hitchhiker  0.00571488 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2305  peptidase M50  30 
 
 		 362 aa  67  0.0000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00177185  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2595  peptidase M50  27.35 
 
 		 337 aa  66.2  0.0000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2535  peptidase M50  40.91 
 
 		 373 aa  66.2  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.180251  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2136  peptidase M50  33.33 
 
 		 415 aa  65.5  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.821665  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1872  peptidase M50  37.4 
 
 		 373 aa  65.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3165  peptidase M50  32.54 
 
 		 376 aa  65.1  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1449  peptidase M50  30 
 
 		 337 aa  65.5  0.000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0709676 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2124  peptidase M50  30.46 
 
 		 284 aa  64.7  0.000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000917211  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4565  stage IV sporulation protein FB  27.75 
 
 		 286 aa  64.3  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000384784  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1497  peptidase M50  32.54 
 
 		 372 aa  64.3  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.120961  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0459  peptidase M50  30 
 
 		 342 aa  63.9  0.000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0769405  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3191  peptidase M50  37.5 
 
 		 375 aa  63.5  0.000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00586872 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2237  peptidase M50  31.75 
 
 		 359 aa  63.5  0.000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.949585  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1337  peptidase M50  35.77 
 
 		 412 aa  63.2  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3297  peptidase M50  28.9 
 
 		 258 aa  63.2  0.000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.153314  normal  0.569986 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4945  peptidase M50  32.41 
 
 		 241 aa  63.2  0.000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.365281  normal  0.0922667 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3043  peptidase M50  32.41 
 
 		 241 aa  63.2  0.000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.216443  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5323  peptidase M50  32.41 
 
 		 241 aa  63.2  0.000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1797  peptidase M50  34.4 
 
 		 397 aa  63.2  0.000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1185  peptidase M50  30.71 
 
 		 338 aa  62.4  0.00000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0769  protease family protein  31.82 
 
 		 380 aa  61.6  0.00000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000172815  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4180  stage IV sporulation protein FB  27.23 
 
 		 286 aa  61.6  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0869981  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5036  peptidase M50  32.46 
 
 		 413 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.206475 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4580  stage IV sporulation protein FB  27.23 
 
 		 286 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000567867  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4475  peptidase M50  26.92 
 
 		 400 aa  61.6  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.580173  normal  0.145803 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1856  peptidase M50  32.65 
 
 		 377 aa  61.6  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3750  peptidase M50  33.59 
 
 		 372 aa  62  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.69281  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4538  stage IV sporulation protein FB  27.23 
 
 		 286 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.214848  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4344  stage IV sporulation protein FB  27.23 
 
 		 286 aa  61.2  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4678  stage IV sporulation protein FB  27.23 
 
 		 286 aa  61.2  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0277771  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4526  stage IV sporulation protein FB  27.23 
 
 		 286 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.870935 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0155  peptidase M50  35.19 
 
 		 392 aa  61.2  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4191  stage IV sporulation protein FB  26.7 
 
 		 286 aa  60.8  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0947  peptidase M50  35 
 
 		 374 aa  60.8  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1181  peptidase M50  29.94 
 
 		 379 aa  60.8  0.00000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.22871  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_675  protease  32.18 
 
 		 380 aa  60.8  0.00000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000159772  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0694  peptidase M50  32.03 
 
 		 366 aa  60.8  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.232631 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0920  peptidase M50  35 
 
 		 374 aa  60.8  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1815  hypothetical protein  30.38 
 
 		 383 aa  60.5  0.00000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.434017  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0326  peptidase M50  30.16 
 
 		 241 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.264818  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0613  peptidase M50  38.74 
 
 		 380 aa  60.1  0.00000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.750705  normal  0.0786713 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2539  peptidase M50  31.48 
 
 		 293 aa  60.1  0.00000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0160669  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>