143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_3043 on replicon NC_008061
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008061  Bcen_3043  peptidase M50  100 
 
 
241 aa  482  1e-135  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.216443  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5323  peptidase M50  100 
 
 
241 aa  482  1e-135  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4945  peptidase M50  98.76 
 
 
241 aa  477  1e-134  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.365281  normal  0.0922667 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0326  peptidase M50  96.68 
 
 
241 aa  471  1e-132  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.264818  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4681  peptidase M50  93.75 
 
 
241 aa  457  9.999999999999999e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.314846  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5208  peptidase M50  93.75 
 
 
241 aa  457  9.999999999999999e-129  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.125374 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2396  peptidase M50  66.95 
 
 
239 aa  343  2e-93  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.311276  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2524  hypothetical protein  67.26 
 
 
241 aa  324  8.000000000000001e-88  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0445127  hitchhiker  0.00571488 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1771  peptidase M50  65.25 
 
 
247 aa  295  4e-79  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000535238 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2946  peptidase M50  46.61 
 
 
313 aa  198  6e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000715843  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4579  peptidase M50  40.38 
 
 
305 aa  153  2e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.520288 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1818  peptidase M50  38.26 
 
 
293 aa  151  8e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000422753  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1166  peptidase M50  36.11 
 
 
366 aa  126  3e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.59725  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1329  membrane metalloprotease  37.31 
 
 
365 aa  124  9e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1608  hypothetical protein  37.31 
 
 
365 aa  124  9e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000145815  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3843  hypothetical protein  37.37 
 
 
365 aa  124  9e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0912094  hitchhiker  0.00000000235959 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1570  hypothetical protein  37.82 
 
 
365 aa  124  1e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0569959  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1355  hypothetical protein  37.31 
 
 
365 aa  124  1e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1465  hypothetical protein  37.31 
 
 
365 aa  124  1e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1538  hypothetical protein  37.31 
 
 
365 aa  124  1e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000573699 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1370  peptidase M50  37.82 
 
 
365 aa  123  3e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00911747  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1502  hypothetical protein  37.31 
 
 
365 aa  123  3e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.191562  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1328  membrane metalloprotease  36.79 
 
 
365 aa  122  4e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.826194  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49052  predicted protein  43.45 
 
 
386 aa  110  2.0000000000000002e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.735615  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2595  peptidase M50  40 
 
 
337 aa  100  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3701  peptidase M50  35.2 
 
 
484 aa  75.5  0.0000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0786  M50 family peptidase  32.88 
 
 
344 aa  70.9  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0883958  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3580  peptidase M50  35.54 
 
 
489 aa  67.8  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3312  gamma-glutamyl phosphate reductase GPR  30.28 
 
 
364 aa  67.4  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00700873 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3720  peptidase M50  35.54 
 
 
485 aa  67.4  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.115369  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3646  peptidase M50  35.54 
 
 
485 aa  66.6  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.415625  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0483  hypothetical protein  30.94 
 
 
360 aa  64.7  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000119997  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3626  peptidase M50  35.88 
 
 
368 aa  64.3  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.721542 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1762  putative peptidase  30.71 
 
 
360 aa  64.3  0.000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.0051203  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0558  peptidase M50  35.29 
 
 
372 aa  62  0.000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.463996  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2201  peptidase M50  31.62 
 
 
375 aa  61.2  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4923  peptidase M50  35.2 
 
 
373 aa  61.6  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.465017 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0686  peptidase M50  31.54 
 
 
390 aa  58.9  0.00000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.393797  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3165  peptidase M50  29.24 
 
 
376 aa  58.5  0.00000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1988  peptidase M50  34.09 
 
 
373 aa  57.8  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.319732 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3750  peptidase M50  35.83 
 
 
372 aa  58.2  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.69281  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1296  peptidase M50  26.95 
 
 
381 aa  57.4  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1508  peptidase M50  36.29 
 
 
412 aa  56.6  0.0000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0694  peptidase M50  30.41 
 
 
366 aa  56.6  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.232631 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2136  peptidase M50  31.33 
 
 
415 aa  55.1  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.821665  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0566  hypothetical protein  32.41 
 
 
370 aa  54.7  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.221621 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1731  peptidase M50  33.04 
 
 
366 aa  53.9  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1446  peptidase M50  34.62 
 
 
550 aa  54.3  0.000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1497  peptidase M50  34.75 
 
 
372 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.120961  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0318  CBS domain-containing protein  31.71 
 
 
370 aa  53.5  0.000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.147887  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0406  peptidase M50  32.5 
 
 
380 aa  53.5  0.000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.445518 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3232  peptidase M50  33.79 
 
 
392 aa  53.1  0.000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4885  peptidase M50  34.4 
 
 
397 aa  53.1  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.333233 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0908  zinc protease  33.33 
 
 
422 aa  52.8  0.000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00811957  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2383  peptidase M50  27.22 
 
 
383 aa  52.4  0.000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.796244 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2601  peptidase M50  31.86 
 
 
394 aa  52.4  0.000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.603215  normal  0.812434 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0289  peptidase M50  35.04 
 
 
393 aa  52.4  0.000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0540  peptidase M50  33.61 
 
 
364 aa  52  0.000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0672  peptidase M50  33.1 
 
 
389 aa  51.2  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0458569 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3672  peptidase M50  32.74 
 
 
375 aa  51.6  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0613  peptidase M50  34.91 
 
 
380 aa  51.2  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.750705  normal  0.0786713 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3275  peptidase M50  32.41 
 
 
374 aa  50.8  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.01208 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3453  peptidase M50  32.41 
 
 
374 aa  50.4  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.444039  hitchhiker  0.00898971 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0823  hypothetical protein  32.41 
 
 
374 aa  50.1  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0613  peptidase M50  30.16 
 
 
377 aa  50.1  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0236174 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0170  CBS domain-containing protein  30 
 
 
343 aa  50.1  0.00003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.356486  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2272  CBS domain-containing protein  29.45 
 
 
384 aa  50.4  0.00003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.29511 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2060  peptidase M50  31.82 
 
 
364 aa  49.7  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1747  peptidase M50  28.46 
 
 
370 aa  49.7  0.00004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.951218  normal  0.0691878 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1514  peptidase M50  23.98 
 
 
392 aa  49.7  0.00005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1032  peptidase M50  33.86 
 
 
395 aa  49.3  0.00005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0615226 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3533  peptidase M50  32.68 
 
 
380 aa  49.3  0.00006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0103941  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0828  peptidase M50  32.68 
 
 
380 aa  49.3  0.00006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000017367 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1977  peptidase M50  23.78 
 
 
378 aa  48.9  0.00006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3329  peptidase M50  34.48 
 
 
290 aa  48.9  0.00007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.014503  normal  0.780198 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0803  peptidase M50  32.68 
 
 
380 aa  48.9  0.00007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0835  peptidase M50  32.68 
 
 
380 aa  48.9  0.00007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0769  protease family protein  34.48 
 
 
380 aa  48.1  0.0001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000172815  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0258  peptidase M50  38.46 
 
 
397 aa  48.5  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3400  peptidase M50  36.11 
 
 
381 aa  48.1  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0595  peptidase M50  30.22 
 
 
374 aa  48.1  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4142  peptidase M50  32.41 
 
 
380 aa  48.1  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.452732 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0524  peptidase M50  30.16 
 
 
285 aa  47.8  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.311607  hitchhiker  0.00535986 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_675  protease  35.34 
 
 
380 aa  48.1  0.0001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000159772  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4325  peptidase M50  39.44 
 
 
315 aa  47.4  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1617  putative protease  32.43 
 
 
286 aa  47.8  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1552  CBS domain-containing protein  29.86 
 
 
378 aa  47.4  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.651546  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4461  peptidase M50  39.44 
 
 
315 aa  47.4  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.204257  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33462  predicted protein  27.07 
 
 
684 aa  47.4  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4480  peptidase M50  39.44 
 
 
315 aa  47.8  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.948254  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0719  zinc metalloprotease  25.64 
 
 
369 aa  47  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0832  peptidase M50  31.19 
 
 
370 aa  47  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5617  peptidase M50  32.53 
 
 
399 aa  47  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22910  Zn-dependent protease  29.84 
 
 
244 aa  47  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.511612  normal  0.351338 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3980  peptidase M50  32.41 
 
 
390 aa  47  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2535  peptidase M50  31.13 
 
 
373 aa  46.6  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.180251  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0149  CBS domain containing protein  30.09 
 
 
377 aa  46.2  0.0004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0113637 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11470  Zn-dependent protease  33.33 
 
 
388 aa  46.6  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.844041 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0400  CBS domain-containing protein  27.33 
 
 
378 aa  46.2  0.0005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0735736  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3167  peptidase M50  31.54 
 
 
378 aa  45.8  0.0005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>